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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-20 |
[Research frontiers in precision therapy for liver cancer]
2020-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文综述了肝细胞癌精准治疗的研究前沿，涵盖早期诊断生物标志物、精准肝脏手术、分子靶向治疗、免疫治疗及多组学分析等方面的进展 | 系统整合了肝细胞癌精准治疗领域的最新研究前沿，包括新型血清生物标志物（蛋白质、miRNA、cfDNA甲基化）、放射与计算技术进步推动的精准肝脏手术、新型分子靶向治疗与免疫治疗及其联合方案、多组学整合分析以及单细胞测序和基因组编辑等技术创新 | 肝细胞癌具有高度异质性和治疗难治性，深入理解疾病生物学和开发新疗法仍是未被满足的医疗需求 | 总结肝细胞癌精准治疗领域的研究前沿与最新进展，探讨未来治疗突破方向 | 肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序，基因组编辑，cfDNA甲基化检测，多组学分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-09 |
Genomic Analysis of Circulating Tumor Cells at the Single-Cell Level
2020-06, The Journal of molecular diagnostics : JMD
DOI:10.1016/j.jmoldx.2020.02.013
PMID:32247862
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研究论文 | 本文评估了四种单细胞全基因组扩增/测序流程用于循环肿瘤细胞基因组分析，并展示了其在非小细胞肺癌患者中的应用 | 首次对四种单细胞WGA方法（PCR法、MDA法、杂交法）结合NGS进行全面比较，并验证MALBAC结合低深度全基因组测序在拷贝数变异分析中的优越性 | 所有评估的单细胞测序流程在突变检测方面均未达到足够的灵敏度和特异性，无法满足临床应用要求 | 评估单细胞水平循环肿瘤细胞基因组分析的全基因组扩增和测序流程，并探索其临床诊断和治疗监测的应用潜力 | 循环肿瘤细胞（CTCs），来自四名鳞状非小细胞肺癌患者的单个CTCs | 基因组学 | 非小细胞肺癌 | 全基因组扩增（WGA），下一代测序（NGS），全外显子测序，低深度全基因组测序 | NA | 基因组测序数据 | 四名非小细胞肺癌患者的循环肿瘤细胞 | NA | 低深度全基因组测序，全外显子测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-08-17 |
Approaches for integrating heterogeneous RNA-seq data reveal cross-talk between microbes and genes in asthmatic patients
2020-06-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-02033-z
PMID:32571363
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研究论文 | 本研究开发了一个整合降维与统计建模的流程，用于分析哮喘患者痰液样本中复杂的异质性RNA-seq数据，并揭示微生物与基因之间的相互关系 | 提出LDA-link方法，通过降维LDA主题将微生物与基因连接，并利用单细胞RNA-seq和显微镜验证，能发现已知和新颖的微生物-基因关联 | 未明确提及局限性 | 处理痰液RNA-seq数据的异质性，并探索哮喘患者中微生物与基因的相互作用 | 哮喘患者的痰液样本 | 自然语言处理, 机器学习和数字病理学 | 哮喘 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LDA（潜在狄利克雷分配） | 转录组测序数据 | 未明确提及样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-08-17 |
Profiling APOL1 Nephropathy Risk Variants in Genome-Edited Kidney Organoids with Single-Cell Transcriptomics
2020-Mar, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/kid.0000422019
PMID:32656538
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析基因编辑的人肾类器官，揭示APOL1风险变异对不同肾单位细胞类型的影响 | 首次结合无足迹CRISPR-Cas9基因编辑和单细胞RNA测序，在人类肾类器官中直接敲入APOL1高风险G1变异，以研究其在多种肾细胞类型中的病理效应 | 类器官模型可能无法完全复制人类肾脏的复杂生理环境，且APOL1表达仅在细胞因子诱导后出现，可能限制了某些条件下的研究 | 探究APOL1风险变异在肾类器官不同细胞类型中的病理生理机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的肾类器官，包括肾小球上皮细胞、近端小管、远端小管和内皮细胞 | 单细胞基因组学 | APOL1肾病 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9基因编辑 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明（涉及多个类器官样本，具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-08-11 |
Integrated Single-Cell Transcriptomics and Chromatin Accessibility Analysis Reveals Regulators of Mammary Epithelial Cell Identity
2020-10-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108273
PMID:33086071
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，重建了小鼠乳腺上皮细胞系统的细胞类型及其基因调控特征 | 首次以无偏方式整合单细胞转录组和染色质可及性数据，定义了分泌型腔上皮细胞内的连续分化状态，并鉴定出与特定细胞类型和分化状态相关的顺式和反式调控元件 | 研究基于小鼠模型，可能无法完全反映人类乳腺上皮细胞的调控机制，且未涉及体内功能验证 | 揭示乳腺上皮细胞身份和分化相关的调控元件，为理解乳腺癌中染色质可及性变化提供参考 | 小鼠乳腺上皮细胞系统 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序和单细胞染色质可及性分析 | 无监督聚类和整合分析（未指定具体模型） | 单细胞转录组数据和单细胞染色质可及性数据 | 小鼠乳腺组织样本（具体数量未在摘要中提供） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-08-07 |
Adaptable haemodynamic endothelial cells for organogenesis and tumorigenesis
2020-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2712-z
PMID:32908310
|
研究论文 | 本研究展示了通过短暂激活胚胎限制性转录因子ETV2，将成熟人类内皮细胞重置为适应性血管生成细胞，构建可灌注且可塑的血管网络，为器官发生和肿瘤发生提供生理平台。 | 创新点在于通过ETV2瞬时激活和特定三维基质培养，恢复内皮细胞的适应性，实现血管网络的自组装，无需生物打印支架，并创建了名为“器官-血管网络”的平台，可直接与类器官相互作用。 | 局限性可能包括体内长期稳定性、潜在免疫原性、以及对特定组织类型的适应性尚需进一步验证。 | 旨在开发一种适应性血管内皮细胞平台，用于器官发生和肿瘤发生研究，促进代谢、免疫和理化研究及筛选。 | 研究对象为成熟人类内皮细胞，以及多种三维培养系统中的细胞，包括胰腺胰岛、脱细胞大鼠肠道和人类结肠类器官（健康和癌性）。 | 数字病理学 | 癌症（结肠癌） | 单细胞RNA测序、表观遗传学分析 | 三维细胞培养模型、类器官、微流控系统 | 基因表达数据、表观遗传数据、图像 | 人类内皮细胞、人类胰岛、大鼠肠道、人类结肠类器官（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 7 | 2026-08-07 |
Progenitor identification and SARS-CoV-2 infection in long-term human distal lung organoid cultures
2020-Jul-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2020.07.27.212076
PMID:32743583
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研究论文 | 开发了一种无需饲养层、化学成分明确的人远端肺类器官培养系统，并利用该系统鉴定了基底细胞的功能异质性，同时建立了SARS-CoV-2感染的体外模型 | 首次建立了从单个成人肺泡上皮II型（AT2）或基底细胞克隆衍生的人远端肺类器官培养系统，并发现基底细胞中存在TNFRSF12A亚群具有显著增强的克隆形成能力，此外通过翻转类器官极性实现了对SARS-CoV-2的感染建模 | 未能观察到单纯由俱乐部细胞组成的类器官，且未对体内细胞行为进行谱系追踪验证 | 建立人远端肺类器官培养系统，以研究干细胞鉴定和COVID-19相关肺部疾病 | 人远端肺的肺泡上皮II型（AT2）细胞和基底细胞 | 类器官培养、单细胞测序 | COVID-19肺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞分选（FACS）、类器官培养、SARS-CoV-2感染实验 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据、类器官图像 | 人肺组织样本（具体数量未明确） | 未明确指定，可能包括10x Genomics（用于scRNA-seq） | 单细胞RNA-seq | 可能是10x Chromium（推测，基于scRNA-seq），具体未明确 | 未提供具体配置细节 |
| 8 | 2026-07-14 |
Prokaryotic single-cell RNA sequencing by in situ combinatorial indexing
2020-10, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-020-0729-6
PMID:32451472
|
研究论文 | 介绍了一种通过原位组合索引进行原核生物单细胞RNA测序的新方法PETRI-seq | 克服了原核生物低mRNA丰度、缺乏polyA尾和细胞壁厚等技术障碍，实现了低成本、高通量的原核生物单细胞转录组分析 | 未提及具体局限性，但可能包括对特定细菌种类的适用性需进一步验证 | 开发一种可用于原核生物单细胞转录组测序的实用技术 | 大肠杆菌和金黄色葡萄球菌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数万个细胞（单次实验） | NA | 单细胞RNA测序 | PETRI-seq | PETRI-seq基于原位组合索引技术 |
| 9 | 2026-05-31 |
Multiomic Analysis of Subtype Evolution and Heterogeneity in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2020-10-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0521
PMID:32747365
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研究论文 | 通过多组学分析揭示高级别浆液性卵巢癌亚型进化与异质性 | 采用绝对拷贝数分析与基因表达的新型整合分析方法，并结合单细胞测序，挑战了传统离散转录组亚型分类，提出连续肿瘤发展模型 | 未明确提及研究局限性 | 解析高级别浆液性卵巢癌亚型进化时序及其与肿瘤纯度、倍性、亚克隆性的关系，评估亚型作为治疗靶点的适用性 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤样本及六例独立肿瘤的单细胞数据 | 机器学习 | 卵巢癌 | 绝对拷贝数分析、基因表达分析、单细胞测序 | 连续肿瘤发展模型 | 基因表达数据、拷贝数数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集及六例独立肿瘤的42,000个肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-05-29 |
Epigenetic regulation of the PGE2 pathway modulates macrophage phenotype in normal and pathologic wound repair
2020-09-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.138443
PMID:32879137
|
研究论文 | 本研究揭示了PGE2通路的表观遗传调控在正常和病理伤口修复中调节巨噬细胞表型的机制 | 首次证明TGF-β诱导的miRNA29b通过抑制DNA甲基转移酶3b介导的Cox-2启动子高甲基化来增加COX-2/PGE2的产生，并发现混合谱系白血病1（MLL1）上调cPLA2表达驱动COX-2/PGE2通路；同时开发了靶向巨噬细胞的纳米疗法以改善糖尿病伤口修复 | 未提及具体局限性 | 研究PGE2通路在伤口巨噬细胞中的表观遗传调控机制及其在糖尿病伤口修复中的作用 | 人类和小鼠伤口巨噬细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠伤口组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于人类伤口组织分析 |
| 11 | 2026-05-28 |
In vitro characterization of the human segmentation clock
2020-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1885-9
PMID:31915384
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研究论文 | 在体外表征人类分节时钟，发现人类前体节中胚层细胞再现分节时钟的振荡，且其周期是小鼠的两倍 | 首次在人类体外模型中鉴定出分节时钟的存在，并揭示其振荡周期比小鼠长两倍，同时发现FGF信号调控振荡的相位和周期，扩展了经典'时钟与波前'模型 | 研究主要基于体外细胞模型，可能无法完全反映体内复杂环境；振荡机制的具体分子细节尚需进一步探索 | 验证人类是否存在与模式生物类似的分节时钟，并比较其与小鼠的差异 | 人类和小鼠的前体节中胚层体外分化细胞 | 数字病理学 | 脊椎分节缺陷所致疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠体外前体节中胚层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 12 | 2026-05-23 |
Detection of chemotherapy-resistant patient-derived acute lymphoblastic leukemia clones in murine xenografts using cellular barcodes
2020-11, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.09.188
PMID:32946982
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研究论文 | 利用细胞条码追踪小鼠异种移植模型中化疗耐药的患者来源急性淋巴细胞白血病克隆 | 首次使用细胞条码技术追踪化疗介导的选择性压力下数百个患者来源白血病克隆的体内竞争动力学，并鉴定出甲氨蝶呤耐药克隆 | 仅在小鼠模型中验证，未在患者体内直接检测；未整合单细胞测序技术进行深度表征 | 开发和测试细胞条码分析方法，用于早期检测治疗耐药白血病克隆，以预防复发 | 患者来源的急性淋巴细胞白血病（ALL）细胞和SupB15细胞系 | 机器学习 | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞条码分析 | NA | 序列数据 | NSG小鼠，具体数量未提及；分析数百个克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-05-20 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with severe COVID-19
2020-07, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0944-y
PMID:32514174
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析重症COVID-19患者外周血单个核细胞，构建外周免疫反应细胞图谱 | 首次绘制重症COVID-19患者外周血单个核细胞的单细胞图谱，揭示中性粒细胞与浆母细胞在急性呼吸衰竭患者中的密切关联 | 样本量较小（7名患者和6名健康对照），需进一步验证发现的普适性 | 阐明重症COVID-19中外周免疫细胞导致免疫病理或保护性免疫的分子通路 | 重症COVID-19患者外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7名COVID-19住院患者（其中4名患急性呼吸窘迫综合征）和6名健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 14 | 2026-05-20 |
Cell-to-Cell Variation in Defective Virus Expression and Effects on Host Responses during Influenza Virus Infection
2020-01-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02880-19
PMID:31937643
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析甲型流感病毒感染过程中缺陷病毒表达及宿主反应的细胞间差异 | 首次在单细胞水平系统揭示缺陷病毒基因组（DVGs）通过干扰病毒复制和激发先天免疫反应调节宿主转录变异的双重机制 | 未明确说明当前研究的局限性 | 阐明流感病毒感染中病毒转录与宿主反应的细胞间变异机制 | 人类A549细胞和原代支气管上皮细胞 | natural language processing | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多时间点采集的细胞样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 15 | 2026-05-12 |
Cigarette Smoke Exposure and Inflammatory Signaling Increase the Expression of the SARS-CoV-2 Receptor ACE2 in the Respiratory Tract
2020-06-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.05.012
PMID:32425701
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研究论文 | 本研究揭示香烟暴露通过上调ACE2表达增加SARS-CoV-2感染风险，并发现ACE2是干扰素刺激基因 | 首次从单细胞水平阐明香烟暴露通过扩增分泌细胞群上调ACE2的机制，并证实ACE2作为干扰素刺激基因可能形成正反馈循环促进病毒传播 | 未明确说明 | 探究香烟暴露对SARS-CoV-2受体ACE2在呼吸道表达的影响及调控机制 | 啮齿动物和人类呼吸道组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 涉及啮齿动物和人类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 16 | 2026-05-11 |
Longitudinal Multi-omics Analyses Identify Responses of Megakaryocytes, Erythroid Cells, and Plasmablasts as Hallmarks of Severe COVID-19
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.017
PMID:33296687
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研究论文 | 通过对14名患者的多时间点样本进行纵向多组学分析，鉴定了严重COVID-19中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的反应特征 | 首次通过纵向多组学方法揭示严重COVID-19中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的动态变化及其与疾病预后的关联 | 样本量较小（14名患者），可能限制结果的普适性；主要基于外周血分析，未涉及组织水平的验证 | 理解严重COVID-19疾病轨迹相关的细胞特征，为开发生物标志物和靶向治疗提供依据 | COVID-19患者的外周血样本，包括浆母细胞、巨核细胞和红细胞 | 机器学习 | COVID-19 | RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, DNA甲基化组数据, 单细胞转录组数据 | 14名患者，共采集多达5个时间点的外周血样本，包括超过358,000个单细胞 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 批量ATAC-seq | Illumina NovaSeq | Illumina NovaSeq用于批量转录组和甲基化组测序，单细胞转录组测序采用10x Chromium平台 |
| 17 | 2026-05-05 |
Single-Cell Sequencing of Developing Human Gut Reveals Transcriptional Links to Childhood Crohn's Disease
2020-12-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.11.010
PMID:33290721
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研究论文 | 通过单细胞测序绘制人类肠道发育图谱，揭示与儿童克罗恩病的转录联系 | 首次在单细胞水平解析6-10周人类胚胎肠道发育，发现与LGR5阳性的干细胞不同的循环上皮前体细胞，并揭示克罗恩病中胎儿转录因子的重新激活 | 未提及 | 解析人类肠道发育过程中的细胞图谱，并探索其与儿童克罗恩病的关联 | 6-10周人类胚胎肠道组织及儿童克罗恩病上皮组织 | 单细胞组学 | 儿童克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6-10周人类胚胎肠道样本及儿童克罗恩病与健康对照上皮样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 18 | 2026-05-05 |
Optimized workflow for single-cell transcriptomics on infectious diseases including COVID-19
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100233
PMID:33377120
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研究论文 | 为包括COVID-19在内的传染病单细胞转录组学提供优化工作流程 | 提出了一套完整且安全的工作流程，涵盖从细胞分离到数据分析的全过程，采用基于微孔的BD Rhapsody平台处理潜在感染性样本 | 未提及其局限性 | 开发适用于传染病样本的单细胞RNA测序安全实验方案 | 传染病（包括COVID-19）患者的血液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | 基于微孔的BD Rhapsody平台 |
| 19 | 2026-05-03 |
Translocation of Viable Gut Microbiota to Mesenteric Adipose Drives Formation of Creeping Fat in Humans
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.009
PMID:32991841
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研究论文 | 本文探讨了克罗恩病中活的肠道微生物向肠系膜脂肪组织的易位如何驱动“爬行脂肪”的形成 | 首次发现肠道内特定菌群（如无害梭菌）能够存活并易位至肠系膜脂肪组织，进而诱导爬行脂肪的形成，揭示了微生物易位在CD肠外表现中的中心作用 | 未明确提及研究局限性 | 探究克罗恩病中微生物易位是否为爬行脂肪形成的关键信号 | 克罗恩病患者回肠手术切除标本中的黏膜相关肠道菌群及肠系膜脂肪组织 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及克罗恩病患者回肠手术切除标本及无菌小鼠实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 20 | 2026-05-03 |
Mapping developmental trajectories and subtype diversity of normal and glaucomatous human retinal ganglion cells by single-cell transcriptome analysis
2020-10-01, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3238
PMID:32557945
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析描绘正常和青光眼人类视网膜神经节细胞的发育轨迹和亚型多样性 | 利用疾病在培养皿中的干细胞模型，结合单细胞转录组分析，揭示SIX6风险等位基因对RGC发育轨迹和亚型组成的影响，并确定mTOR和Notch信号通路的失调机制 | 未提及具体局限性 | 研究青光眼患者RGC对变性的发育易感性，为治疗策略提供依据 | SIX6风险等位基因原发性开角型青光眼患者特异性及对照人类视网膜神经节细胞（hRGCs） | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞转录组分析 | 干细胞模型（疾病在培养皿中） | 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |