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当前共找到 1659 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-14 |
Prokaryotic single-cell RNA sequencing by in situ combinatorial indexing
2020-10, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-020-0729-6
PMID:32451472
|
研究论文 | 介绍了一种通过原位组合索引进行原核生物单细胞RNA测序的新方法PETRI-seq | 克服了原核生物低mRNA丰度、缺乏polyA尾和细胞壁厚等技术障碍，实现了低成本、高通量的原核生物单细胞转录组分析 | 未提及具体局限性，但可能包括对特定细菌种类的适用性需进一步验证 | 开发一种可用于原核生物单细胞转录组测序的实用技术 | 大肠杆菌和金黄色葡萄球菌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数万个细胞（单次实验） | NA | 单细胞RNA测序 | PETRI-seq | PETRI-seq基于原位组合索引技术 |
| 2 | 2026-05-31 |
Multiomic Analysis of Subtype Evolution and Heterogeneity in High-Grade Serous Ovarian Carcinoma
2020-10-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-20-0521
PMID:32747365
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研究论文 | 通过多组学分析揭示高级别浆液性卵巢癌亚型进化与异质性 | 采用绝对拷贝数分析与基因表达的新型整合分析方法，并结合单细胞测序，挑战了传统离散转录组亚型分类，提出连续肿瘤发展模型 | 未明确提及研究局限性 | 解析高级别浆液性卵巢癌亚型进化时序及其与肿瘤纯度、倍性、亚克隆性的关系，评估亚型作为治疗靶点的适用性 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤样本及六例独立肿瘤的单细胞数据 | 机器学习 | 卵巢癌 | 绝对拷贝数分析、基因表达分析、单细胞测序 | 连续肿瘤发展模型 | 基因表达数据、拷贝数数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集及六例独立肿瘤的42,000个肿瘤细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-29 |
Epigenetic regulation of the PGE2 pathway modulates macrophage phenotype in normal and pathologic wound repair
2020-09-03, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.138443
PMID:32879137
|
研究论文 | 本研究揭示了PGE2通路的表观遗传调控在正常和病理伤口修复中调节巨噬细胞表型的机制 | 首次证明TGF-β诱导的miRNA29b通过抑制DNA甲基转移酶3b介导的Cox-2启动子高甲基化来增加COX-2/PGE2的产生，并发现混合谱系白血病1（MLL1）上调cPLA2表达驱动COX-2/PGE2通路；同时开发了靶向巨噬细胞的纳米疗法以改善糖尿病伤口修复 | 未提及具体局限性 | 研究PGE2通路在伤口巨噬细胞中的表观遗传调控机制及其在糖尿病伤口修复中的作用 | 人类和小鼠伤口巨噬细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠伤口组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于人类伤口组织分析 |
| 4 | 2026-05-28 |
In vitro characterization of the human segmentation clock
2020-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1885-9
PMID:31915384
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研究论文 | 在体外表征人类分节时钟，发现人类前体节中胚层细胞再现分节时钟的振荡，且其周期是小鼠的两倍 | 首次在人类体外模型中鉴定出分节时钟的存在，并揭示其振荡周期比小鼠长两倍，同时发现FGF信号调控振荡的相位和周期，扩展了经典'时钟与波前'模型 | 研究主要基于体外细胞模型，可能无法完全反映体内复杂环境；振荡机制的具体分子细节尚需进一步探索 | 验证人类是否存在与模式生物类似的分节时钟，并比较其与小鼠的差异 | 人类和小鼠的前体节中胚层体外分化细胞 | 数字病理学 | 脊椎分节缺陷所致疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠体外前体节中胚层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 5 | 2026-05-23 |
Detection of chemotherapy-resistant patient-derived acute lymphoblastic leukemia clones in murine xenografts using cellular barcodes
2020-11, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.09.188
PMID:32946982
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研究论文 | 利用细胞条码追踪小鼠异种移植模型中化疗耐药的患者来源急性淋巴细胞白血病克隆 | 首次使用细胞条码技术追踪化疗介导的选择性压力下数百个患者来源白血病克隆的体内竞争动力学，并鉴定出甲氨蝶呤耐药克隆 | 仅在小鼠模型中验证，未在患者体内直接检测；未整合单细胞测序技术进行深度表征 | 开发和测试细胞条码分析方法，用于早期检测治疗耐药白血病克隆，以预防复发 | 患者来源的急性淋巴细胞白血病（ALL）细胞和SupB15细胞系 | 机器学习 | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞条码分析 | NA | 序列数据 | NSG小鼠，具体数量未提及；分析数百个克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2026-05-20 |
A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with severe COVID-19
2020-07, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0944-y
PMID:32514174
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析重症COVID-19患者外周血单个核细胞，构建外周免疫反应细胞图谱 | 首次绘制重症COVID-19患者外周血单个核细胞的单细胞图谱，揭示中性粒细胞与浆母细胞在急性呼吸衰竭患者中的密切关联 | 样本量较小（7名患者和6名健康对照），需进一步验证发现的普适性 | 阐明重症COVID-19中外周免疫细胞导致免疫病理或保护性免疫的分子通路 | 重症COVID-19患者外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7名COVID-19住院患者（其中4名患急性呼吸窘迫综合征）和6名健康对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 7 | 2026-05-20 |
Cell-to-Cell Variation in Defective Virus Expression and Effects on Host Responses during Influenza Virus Infection
2020-01-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02880-19
PMID:31937643
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析甲型流感病毒感染过程中缺陷病毒表达及宿主反应的细胞间差异 | 首次在单细胞水平系统揭示缺陷病毒基因组（DVGs）通过干扰病毒复制和激发先天免疫反应调节宿主转录变异的双重机制 | 未明确说明当前研究的局限性 | 阐明流感病毒感染中病毒转录与宿主反应的细胞间变异机制 | 人类A549细胞和原代支气管上皮细胞 | natural language processing | 流感病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多时间点采集的细胞样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 8 | 2026-05-12 |
Cigarette Smoke Exposure and Inflammatory Signaling Increase the Expression of the SARS-CoV-2 Receptor ACE2 in the Respiratory Tract
2020-06-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.05.012
PMID:32425701
|
研究论文 | 本研究揭示香烟暴露通过上调ACE2表达增加SARS-CoV-2感染风险，并发现ACE2是干扰素刺激基因 | 首次从单细胞水平阐明香烟暴露通过扩增分泌细胞群上调ACE2的机制，并证实ACE2作为干扰素刺激基因可能形成正反馈循环促进病毒传播 | 未明确说明 | 探究香烟暴露对SARS-CoV-2受体ACE2在呼吸道表达的影响及调控机制 | 啮齿动物和人类呼吸道组织样本 | 机器学习和数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 涉及啮齿动物和人类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 9 | 2026-05-11 |
Longitudinal Multi-omics Analyses Identify Responses of Megakaryocytes, Erythroid Cells, and Plasmablasts as Hallmarks of Severe COVID-19
2020-12-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2020.11.017
PMID:33296687
|
研究论文 | 通过对14名患者的多时间点样本进行纵向多组学分析，鉴定了严重COVID-19中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的反应特征 | 首次通过纵向多组学方法揭示严重COVID-19中巨核细胞、红细胞和浆母细胞的动态变化及其与疾病预后的关联 | 样本量较小（14名患者），可能限制结果的普适性；主要基于外周血分析，未涉及组织水平的验证 | 理解严重COVID-19疾病轨迹相关的细胞特征，为开发生物标志物和靶向治疗提供依据 | COVID-19患者的外周血样本，包括浆母细胞、巨核细胞和红细胞 | 机器学习 | COVID-19 | RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据, DNA甲基化组数据, 单细胞转录组数据 | 14名患者，共采集多达5个时间点的外周血样本，包括超过358,000个单细胞 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 批量ATAC-seq | Illumina NovaSeq | Illumina NovaSeq用于批量转录组和甲基化组测序，单细胞转录组测序采用10x Chromium平台 |
| 10 | 2026-05-05 |
Single-Cell Sequencing of Developing Human Gut Reveals Transcriptional Links to Childhood Crohn's Disease
2020-12-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.11.010
PMID:33290721
|
研究论文 | 通过单细胞测序绘制人类肠道发育图谱，揭示与儿童克罗恩病的转录联系 | 首次在单细胞水平解析6-10周人类胚胎肠道发育，发现与LGR5阳性的干细胞不同的循环上皮前体细胞，并揭示克罗恩病中胎儿转录因子的重新激活 | 未提及 | 解析人类肠道发育过程中的细胞图谱，并探索其与儿童克罗恩病的关联 | 6-10周人类胚胎肠道组织及儿童克罗恩病上皮组织 | 单细胞组学 | 儿童克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6-10周人类胚胎肠道样本及儿童克罗恩病与健康对照上皮样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 11 | 2026-05-05 |
Optimized workflow for single-cell transcriptomics on infectious diseases including COVID-19
2020-12-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2020.100233
PMID:33377120
|
研究论文 | 为包括COVID-19在内的传染病单细胞转录组学提供优化工作流程 | 提出了一套完整且安全的工作流程，涵盖从细胞分离到数据分析的全过程，采用基于微孔的BD Rhapsody平台处理潜在感染性样本 | 未提及其局限性 | 开发适用于传染病样本的单细胞RNA测序安全实验方案 | 传染病（包括COVID-19）患者的血液样本 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | 基于微孔的BD Rhapsody平台 |
| 12 | 2026-05-03 |
Translocation of Viable Gut Microbiota to Mesenteric Adipose Drives Formation of Creeping Fat in Humans
2020-10-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.09.009
PMID:32991841
|
研究论文 | 本文探讨了克罗恩病中活的肠道微生物向肠系膜脂肪组织的易位如何驱动“爬行脂肪”的形成 | 首次发现肠道内特定菌群（如无害梭菌）能够存活并易位至肠系膜脂肪组织，进而诱导爬行脂肪的形成，揭示了微生物易位在CD肠外表现中的中心作用 | 未明确提及研究局限性 | 探究克罗恩病中微生物易位是否为爬行脂肪形成的关键信号 | 克罗恩病患者回肠手术切除标本中的黏膜相关肠道菌群及肠系膜脂肪组织 | 机器学习 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及克罗恩病患者回肠手术切除标本及无菌小鼠实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 13 | 2026-05-03 |
Mapping developmental trajectories and subtype diversity of normal and glaucomatous human retinal ganglion cells by single-cell transcriptome analysis
2020-10-01, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3238
PMID:32557945
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析描绘正常和青光眼人类视网膜神经节细胞的发育轨迹和亚型多样性 | 利用疾病在培养皿中的干细胞模型，结合单细胞转录组分析，揭示SIX6风险等位基因对RGC发育轨迹和亚型组成的影响，并确定mTOR和Notch信号通路的失调机制 | 未提及具体局限性 | 研究青光眼患者RGC对变性的发育易感性，为治疗策略提供依据 | SIX6风险等位基因原发性开角型青光眼患者特异性及对照人类视网膜神经节细胞（hRGCs） | 单细胞转录组学 | 青光眼 | 单细胞转录组分析 | 干细胞模型（疾病在培养皿中） | 单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-01 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Dissects the Replicating Process of Pancreatic Beta Cells in Partial Pancreatectomy Model
2020-Dec-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2020.101774
PMID:33294783
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析部分胰腺切除模型中胰腺β细胞的复制过程 | 首次在单细胞水平揭示部分胰腺切除后β细胞复制过程中的转录动态，并识别出具有高表达细胞增殖标志物的复制β细胞簇 | 未明确说明局限性 | 阐明成年胰腺β细胞在损伤后复制过程中的转录变化 | 小鼠胰腺β细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰腺组织，包括部分胰腺切除和对照样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 15 | 2026-04-30 |
Multilineage murine stem cells generate complex organoids to model distal lung development and disease
2020-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019103476
PMID:32985719
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研究论文 | 建立了三维鼠支气管肺泡类器官模型，模拟远端肺发育和疾病 | 首次通过FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养，实现了高度分支的三维结构生成，并结合单细胞RNA测序和电镜验证细胞组成，支持巨噬细胞植入和病毒建模 | 未提及体外模型与体内环境的完全对应性及长期培养稳定性 | 建立复杂类器官模型以研究远端肺发育、感染和再生过程 | 小鼠支气管肺泡干细胞和肺驻留间充质细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、荧光成像、电子显微镜 | 三维类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-04-30 |
Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104063
PMID:32790115
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research paper | 通过对五例三阴性乳腺癌进行单细胞RNA测序，揭示了肿瘤基质中成纤维细胞和血管周细胞的异质性及其与免疫逃逸的关联 | 首次描绘了三阴性乳腺癌中两种癌症相关成纤维细胞和两种血管周样细胞亚群，并揭示了它们与细胞毒性T细胞功能障碍和排斥的强相关性 | 未明确说明局限性 | 探究人类三阴性乳腺癌中肿瘤基质的细胞异质性及其与免疫逃逸的关系 | 五例三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本 | machine learning | lung cancer | NA | NA | 文本和测序数据 | 5例三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-04-30 |
A Widespread Neurogenic Potential of Neocortical Astrocytes Is Induced by Injury
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.006
PMID:32758425
|
研究论文 | 研究发现，当Notch信号被阻断时，大脑皮层星形胶质细胞在损伤后能够产生新的神经元，并揭示了其分子调控机制 | 首次证明Notch信号缺陷的星形胶质细胞在损伤后可转变为神经干细胞样状态并启动神经发生程序，且成功将星形胶质细胞神经发生与反应性胶质增生在单细胞水平上解耦 | 仅在小鼠模型中验证，且神经发生效率较低，仅少数预激活的星形胶质细胞在损伤后启动神经发生程序 | 阐明非神经源性脑区星形胶质细胞在损伤后产生新神经元的分子调控机制 | 小鼠大脑皮层星形胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 18 | 2026-04-30 |
Endothelial, pericyte and tumor cell expression in glioblastoma identifies fibroblast activation protein (FAP) as an excellent target for immunotherapy
2020, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.1191
PMID:33082953
|
研究论文 | 研究确认成纤维细胞活化蛋白（FAP）作为胶质母细胞瘤免疫治疗新靶点，并详细分析其在肿瘤血管内皮细胞、周细胞及肿瘤细胞中的表达情况 | 首次通过多模态分析揭示FAP在胶质母细胞瘤的血管内皮细胞和周细胞上显著表达，而非正常组织血管，提出FAP可作为同时靶向肿瘤细胞及血管网络的理想免疫治疗抗原 | 未提及具体临床试验验证或体内功能研究，且儿童脑肿瘤样本的泛癌表达分析可能局限于已公开转录组数据集 | 验证FAP作为胶质母细胞瘤免疫治疗抗原的可行性，并明确其细胞定位与表达特征 | 人类胶质母细胞瘤组织样本、正常脑组织、胶质瘤神经干细胞（GNS）培养物、健康星形胶质细胞和神经元培养物及多个儿科脑肿瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 免疫染色、流式细胞术、单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 组织切片、细胞培养物、单细胞测序数据 | 包含多个胶质母细胞瘤患者组织样本及公开转录组数据集，具体数字未明确说明 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序试剂盒及Illumina NovaSeq测序平台 |
| 19 | 2026-04-29 |
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.005
PMID:33207244
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研究论文 | 研究了新冠病毒（SARS-CoV-2）进入因子在正常人胰腺和COVID-19患者胰腺中的表达 | 首次在蛋白质和mRNA水平系统验证ACE2在胰腺不同细胞类型的表达分布，并结合COVID-19病例显示病毒主要感染导管而非内分泌细胞 | 仅基于公开的scRNA-seq数据集和有限数量的COVID-19病例样本，可能无法完全代表临床异质性 | 探究SARS-CoV-2进入因子ACE2在胰腺中的表达模式及其与COVID-19相关糖尿病的潜在关联 | 正常人胰腺组织（跨不同年龄段）和COVID-19患者胰腺组织 | 机器学习和数字病理学 | COVID-19相关糖尿病 | 单细胞RNA测序、荧光原位杂交、western blotting、免疫定位 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像 | 5个公开scRNA-seq胰腺数据集及不同年龄段正常人和COVID-19病例的胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2026-04-27 |
Defective Sec61α1 underlies a novel cause of autosomal dominant severe congenital neutropenia
2020-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.03.034
PMID:32325141
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研究论文 | 发现SEC61A1基因的c.A275G;p.Q92R错义突变是导致常染色体显性遗传重症先天性中性粒细胞减少症的新病因 | 首次发现SEC61A1基因突变可导致重症先天性中性粒细胞减少症，扩展了SEC61A1相关疾病的表型谱，并揭示了未折叠蛋白反应失调作为潜在机制 | 仅基于一名患者的病例研究，样本量有限，需要更多病例验证 | 扩展SEC61A1介导的疾病谱系，将其与常染色体显性遗传重症先天性中性粒细胞减少症联系起来 | 一名父母非近亲婚配的比利时重症先天性中性粒细胞减少症患者及其CD34+细胞和HL-60细胞 | 自然语言处理 | 重症先天性中性粒细胞减少症 | 全外显子组测序、Western blotting、Ca2+通量测定、HL-60细胞分化、原代CD34细胞体外分化、定量PCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、钙离子流数据、蛋白质表达数据 | 1例患者及其骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |