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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-11-16 |
Mechanisms of stretch-mediated skin expansion at single-cell resolution
2020-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2555-7
PMID:32728211
|
研究论文 | 本研究通过开发小鼠模型,在单细胞分辨率下探究了拉伸如何通过调控表皮干细胞和基底祖细胞的活性来介导皮肤扩张 | 首次在单细胞分辨率下揭示拉伸诱导皮肤扩张的机制,结合克隆分析、定量建模和单细胞RNA测序的多学科方法 | 研究基于小鼠模型,在人类皮肤中的适用性需要进一步验证 | 阐明机械力在体内对表皮细胞行为的影响机制 | 小鼠皮肤表皮细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、克隆分析、定量建模、转录组分析、染色质分析 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-05 |
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.005
PMID:33207244
|
研究论文 | 本研究通过分析胰腺组织中SARS-CoV-2进入因子ACE2的表达模式,探讨COVID-19与糖尿病之间的潜在关联 | 首次系统评估了人类胰腺在整个生命周期中ACE2的表达分布,并结合COVID-19患者胰腺组织验证了SARS-CoV-2的感染特征 | 内分泌细胞中ACE2的mRNA表达罕见,且病毒核衣壳蛋白主要局限于导管,限制了病毒直接感染内分泌细胞的证据 | 探究SARS-CoV-2感染是否通过ACE2直接感染胰腺内分泌细胞导致糖尿病发生 | 正常器官捐献者的胰腺组织和COVID-19患者的胰腺组织 | 数字病理学 | COVID-19, 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 蛋白质印迹法, 免疫定位 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 五个公共单细胞RNA测序数据集和多个人类胰腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2024-08-09 |
The Transcriptome of Hepatic Fibrosis Revealed by Single-Cell RNA Sequencing
2020-05, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.31155
PMID:32017148
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Drosophila Voltage-Gated Sodium Channels Are Only Expressed in Active Neurons and Are Localized to Distal Axonal Initial Segment-like Domains
2020-10-14, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0142-20.2020
PMID:32928889
|
研究论文 | 本研究通过标记果蝇中唯一的电压门控钠通道Para,揭示了其在神经元中的表达模式和亚细胞定位 | 首次发现果蝇钠通道仅表达于活跃神经元,并定位于轴突远端起始段样结构 | 研究主要聚焦果蝇模型,在其它无脊椎动物中的普适性需要进一步验证 | 探究无脊椎神经元中动作电位的起始位置和钠通道的表达特征 | 果蝇胚胎期、幼虫期和成年期中枢神经系统神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 全细胞膜片钳电生理记录, 基因标记技术 | NA | 基因表达数据, 电生理记录数据, 转录组数据 | 果蝇第三龄幼虫全脑单细胞转录组图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Effective single-cell clustering through ensemble feature selection and similarity measurements
2020-08, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 提出一种基于集成特征选择和相似性测量的有效单细胞聚类算法 | 通过集成特征选择和多种特征采样方法构建细胞间相似性网络,提高单细胞聚类准确性 | NA | 开发准确可靠的单细胞聚类计算方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于网络的聚类算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Interactions of Monocytes, HIV, and ART Identified by an Innovative scRNAseq Pipeline: Pathways to Reservoirs and HIV-Associated Comorbidities
2020-07-28, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.01037-20
PMID:32723919
|
研究论文 | 开发了一种创新的单细胞RNA测序流程,用于同时检测HIV和宿主转录本,研究成熟单核细胞中HIV病毒库的形成机制 | 开发了能够同时检测HIV病毒和宿主转录本的单细胞RNA测序新方法 | NA | 研究HIV病毒库在抗逆转录病毒治疗下的持续存在机制及HIV相关并发症 | 人类成熟单核细胞(CD14+CD16+) | 单细胞测序分析 | HIV/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Deep learning-based cell composition analysis from tissue expression profiles
2020-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aba2619
PMID:32832661
|
研究论文 | 开发了一种基于深度学习的细胞解卷积工具Scaden,用于从组织表达谱中推断细胞组成 | 使用深度神经网络直接从基因表达信息进行细胞解卷积,无需复杂数据预处理和特征选择,对偏差和噪声具有鲁棒性 | NA | 开发一种能够准确推断组织样本中细胞组成的计算方法 | 人类和小鼠的组织表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq,微阵列 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
scClassify: sample size estimation and multiscale classification of cells using single and multiple reference
2020-06, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20199389
PMID:32567229
|
研究论文 | 开发了一个基于集成学习和细胞类型层次结构的多尺度分类框架scClassify,用于单细胞RNA测序数据的自动细胞类型识别 | 提出了样本量估计方法和多参考数据集联合分类能力,在114对参考和测试数据上表现优于其他监督分类方法 | NA | 开发单细胞RNA测序数据的自动细胞类型识别方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习,多尺度分类框架 | 单细胞RNA测序数据 | 114对参考和测试数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
The liver as an immunological barrier redefined by single-cell analysis
2020-06, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13193
PMID:32176810
|
综述 | 通过单细胞分析技术重新定义肝脏作为免疫屏障的功能 | 应用单细胞RNA测序技术揭示肝脏免疫细胞网络的特殊适应性 | NA | 总结单细胞技术如何推进对肝脏免疫屏障功能的理解 | 小鼠和人类肝脏中的免疫细胞 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Linked optical and gene expression profiling of single cells at high-throughput
2020-02-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-01958-9
PMID:32093753
|
研究论文 | 开发了一种高通量平台,能够同时进行单细胞光学分析和基因表达谱分析 | 首次实现了高通量的单细胞光学与基因表达关联分析,突破了现有方法的通量限制 | 未提及具体的技术验证样本数量或应用范围的局限性 | 开发多模态单细胞分析平台,实现光学特征与基因表达的关联分析 | 单细胞 | 单细胞分析技术 | NA | 单细胞RNA测序,荧光成像 | NA | 基因表达数据,荧光图像数据 | 数千个细胞(单次实验) | NA | 单细胞RNA-seq,光学分析 | NA | 高通量单细胞光学与基因表达关联分析平台 |
| 11 | 2025-10-06 |
Realistic in silico generation and augmentation of single-cell RNA-seq data using generative adversarial networks
2020-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14018-z
PMID:31919373
|
研究论文 | 提出使用条件单细胞生成对抗网络(cscGAN)来真实生成单细胞RNA-seq数据 | 首次将条件生成对抗网络应用于单细胞RNA-seq数据的生成和增强,能够学习复杂的基因间非线性依赖关系 | 未提及具体的数据集规模和验证方法的局限性 | 解决生物医学研究中样本数量不足的问题,提高分析结果的稳健性和可重复性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | GAN, cscGAN | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Sources of variation in cell-type RNA-Seq profiles
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0239495
PMID:32956417
|
研究论文 | 研究细胞类型RNA测序谱变异来源及其对细胞比例反卷积方法的影响 | 系统评估了实验室间技术变异、组织来源和测序方法对细胞类型基因表达谱的影响,首次量化了这些因素对细胞比例反卷积的混淆效应 | 仅分析了公开可用的B细胞和T细胞数据集,未涵盖其他细胞类型 | 识别影响细胞类型特异性基因表达谱变异的主要因素 | B细胞和T细胞 | 生物信息学 | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开可用的bulk和单细胞RNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | UMI-based单细胞RNA测序 |
| 13 | 2024-08-09 |
Correction to: Prioritizing Candidates of Post-Myocardial Infarction Heart Failure Using Plasma Proteomics and Single-Cell Transcriptomics
2020-Oct-13, Circulation
IF:35.5Q1
DOI:10.1161/CIR.0000000000000926
PMID:33044854
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-10-06 |
Defining the Teratoma as a Model for Multi-lineage Human Development
2020-11-25, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.10.018
PMID:33152263
|
研究论文 | 本研究将畸胎瘤确立为研究人类多谱系发育过程的模型平台 | 首次系统论证畸胎瘤作为多谱系发育模型的可行性,并展示了其在全组织功能遗传筛选和组织工程中的应用潜力 | 研究仅基于4个细胞系产生的23个畸胎瘤,样本来源相对有限 | 探索畸胎瘤作为研究人类发育过程的模型平台 | 畸胎瘤中的细胞类型和发育过程 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因敲除筛选, 微RNA调控 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 179,632个细胞,来自4个细胞系产生的23个畸胎瘤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Iterative transfer learning with neural network for clustering and cell type classification in single-cell RNA-seq analysis
2020-Oct, Nature machine intelligence
IF:18.8Q1
DOI:10.1038/s42256-020-00233-7
PMID:33817554
|
研究论文 | 开发了一种用于单细胞RNA测序分析的迭代迁移学习算法ItClust,用于细胞聚类和细胞类型分类 | 结合了监督细胞类型分类算法的思想,同时利用目标数据信息确保对仅存在于目标数据中的细胞具有分类敏感性 | 性能可能仍受源数据质量影响,对新型细胞类型的分类能力未明确说明 | 提高单细胞RNA测序分析中细胞聚类和细胞类型分类的准确性 | 来自不同物种和组织的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 来自不同物种和组织的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Biological insights from multi-omic analysis of 31 genomic risk loci for adult hearing difficulty
2020-09, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1009025
PMID:32986727
|
研究论文 | 通过多组学分析31个与成人听力困难相关的基因组风险位点,揭示新的风险基因和调控机制 | 首次通过整合GWAS元分析、表观基因组学和单细胞转录组学方法,识别了8个新的听力困难风险位点,并发现耳蜗上皮细胞在听力损伤中的重要作用 | 研究主要基于英国生物银行的自报听力数据,且动物实验使用小鼠模型,结果向人类转化需进一步验证 | 探索年龄相关性听力损伤的遗传基础和分子机制 | 成人听力困难相关的基因组风险位点和耳蜗细胞 | 基因组学 | 年龄相关性听力损伤 | GWAS元分析, mRNA-seq, ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 最多330,759名英国生物银行参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial target in glioblastoma
2020-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0694-x
PMID:31873309
|
研究论文 | 通过免疫分析识别CD73作为胶质母细胞瘤的联合治疗靶点 | 发现胶质母细胞瘤中存在独特的CD73巨噬细胞群体,并证明靶向CD73可增强免疫检查点疗法的抗肿瘤免疫反应 | 研究样本量相对有限(94例患者),且动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证 | 探索肿瘤特异性免疫调节靶点以改善免疫检查点治疗效果 | 94例代表五种不同癌症类型的患者,包括胶质母细胞瘤、前列腺癌和结直肠癌 | 免疫肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,质谱流式细胞数据 | 94例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
The cellular basis of distinct thirst modalities
2020-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2821-8
PMID:33057193
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了哺乳动物大脑中不同口渴模式的细胞基础 | 首次使用刺激-细胞类型映射方法识别了介导不同类型口渴的特异性神经元组合 | NA | 探索大脑中不同口渴模式的编码机制 | 哺乳动物大脑终板室周器官的神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 光遗传学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Single-Nucleus RNA-Sequencing Profiling of Mouse Lung. Reduced Dissociation Bias and Improved Rare Cell-Type Detection Compared with Single-Cell RNA Sequencing
2020-12, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2020-0095MA
PMID:32804550
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研究论文 | 本研究开发了适用于小鼠肺组织的单核RNA测序方案,并与单细胞RNA测序进行比较分析 | 首次建立了肺组织单核RNA测序方案,解决了传统单细胞测序中的解离偏差问题,提高了稀有细胞类型的检测能力 | 研究仅针对小鼠肺组织,尚未验证在其他物种或组织类型中的适用性 | 比较单核RNA测序与单细胞RNA测序在肺组织研究中的性能差异 | 小鼠肺组织细胞和细胞核 | 单细胞组学 | NA | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组测序数据 | 16,110个单核转录组和11,934个单细胞转录组 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 20 | 2025-10-06 |
Tau Pathology Drives Dementia Risk-Associated Gene Networks toward Chronic Inflammatory States and Immunosuppression
2020-11-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.108398
PMID:33207193
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研究论文 | 通过系统功能基因组学分析揭示了tau病理驱动痴呆风险基因网络向慢性炎症状态和免疫抑制发展的机制 | 发现了小胶质细胞免疫通路的复杂时间轨迹,识别了从小鼠到人类保守的基因共表达模块NAct和NSupp | 研究主要基于死后脑组织样本,可能无法完全反映疾病发展过程中的动态变化 | 理解神经免疫相关基因和通路在神经退行性疾病病理生理学中的作用 | 纯化的小胶质细胞和来自小鼠及人类AD、FTD、PSP疾病的脑组织 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 功能基因组学分析、化学遗传学、单细胞测序 | 基因共表达网络分析 | 基因组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |