单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing in Human Genital Infections
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_17
PMID:32949402
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的应用 | 单细胞测序技术为研究药物抗性克隆、细胞间变异、获得性药物抗性突变、病原体在不同感染阶段的转录多样性、识别稀有细胞类型以及研究生殖器感染病原体的不同细胞状态提供了新的可能性 | 本文讨论了单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的局限性和挑战 | 探讨单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的应用及其局限性 | 人类生殖器感染及其相关病原体 | NA | 生殖器感染 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-09 |
Values of Single-Cell RNA Sequencing in Development of Cerebral Cortex
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_19
PMID:32949404
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究大脑皮层细胞复杂性、集群和特定功能中的应用 | 本文提出了将scRNA-seq扩展到单个神经元细胞的代谢谱，并整合转录组与分子和功能表型，以深入理解大脑发育和疾病发生的分子机制 | 大脑样本易受干扰和混杂因素影响，需要开发更先进的计算系统生物学方法来克服单细胞信号检测中的固有干扰和技术差异 | 研究单细胞RNA测序在理解大脑皮层发育和神经疾病发病机制中的应用 | 大脑皮层细胞的异质性和转录组变化 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 163 | 2024-08-09 |
scTree: An R package to generate antibody-compatible classifiers from single-cell sequencing data
2020, Journal of open source software
DOI:10.21105/joss.02061
PMID:32954206
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研究论文 | 介绍了一个名为scTree的R包，用于从单细胞测序数据中生成抗体兼容的分类器 | scTree工具旨在为使用R编程语言和scRNA-seq分析程序的生物学家提供一组最小的基因，以便用于下游实验 | NA | 开发一个工具，帮助生物学家从单细胞测序数据中选择用于下游实验的最小基因集 | 单细胞RNA测序数据中的基因选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 164 | 2024-08-09 |
Ischemia Reperfusion Injury Triggers CXCL13 Release and B-Cell Recruitment After Allogenic Kidney Transplantation
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01204
PMID:32849490
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研究论文 | 本研究探讨了缺血再灌注损伤（IRI）在同种异体肾移植后是否会导致CXCL13水平上调及其对B细胞招募的影响 | 首次证明了IRI在肾移植中与CXCL13水平升高相关，并揭示了B细胞的招募与CXCL13表达的关系 | 研究仅在鼠模型中进行，结果的临床相关性需要进一步验证 | 探索IRI在肾移植中对CXCL13水平的影响及其机制 | CXCL13在肾移植中的表达及其对B细胞招募的作用 | NA | 肾移植 | 免疫组织化学研究，单细胞RNA测序分析 | NA | 细胞 | 研究使用了单侧和双侧肾IRI的鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-09 |
Conventional and Computational Flow Cytometry Analyses Reveal Sustained Human Intrathymic T Cell Development From Birth Until Puberty
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01659
PMID:32849574
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研究论文 | 本文通过常规和计算流式细胞术分析，研究了从出生到青春期人类胸腺内T细胞发育的持续性 | 建立了新的计算分析流程，该流程从单细胞转录组测序数据分析中改编而来，能够克服批次效应，同时分析多个样本，并通过子采样限制计算成本，依赖KNN图进行基于图的聚类 | 尽管使用了新的计算分析方法，但胸腺早期退化对T细胞发育的影响仍需进一步研究 | 研究胸腺退化对胸腺内免疫亚群频率的影响 | 从出生到14岁的人类胸腺样本 | NA | NA | 流式细胞术 | KNN图 | 细胞 | 从出生到14岁的多个胸腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-09 |
Characterization of the Bronchoalveolar Lavage Fluid by Single Cell Gene Expression Analysis in Healthy Dogs: A Promising Technique
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01707
PMID:32849601
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研究论文 | 本研究利用单细胞mRNA测序技术（scRNA-seq）分析健康犬的支气管肺泡灌洗液（BALF）中的细胞异质性 | 首次在犬类中使用scRNA-seq技术研究BALF中的细胞亚群，并识别出14种不同的细胞集群 | NA | 验证scRNA-seq技术在犬类组织成分研究中的潜力 | 健康犬的支气管肺泡灌洗液中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 4只健康犬，共分析了5,710个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 167 | 2024-08-09 |
Neural Regulation of Feeding Behavior
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-7086-5_3
PMID:32852737
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研究论文 | 本文探讨了神经调节摄食行为的电路和细胞机制 | 采用了基因操作、光遗传学、病毒示踪和单细胞测序等先进技术，提供了关于中枢神经系统如何调节食物摄入的新见解 | NA | 研究能量平衡和摄食行为的协调机制 | 神经调节摄食行为的电路和细胞机制 | 神经科学 | 肥胖症，厌食症 | 基因操作，光遗传学，病毒示踪，单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-09 |
Reciprocal change in Glucose metabolism of Cancer and Immune Cells mediated by different Glucose Transporters predicts Immunotherapy response
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.48954
PMID:32863946
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研究论文 | 研究通过分析RNA-seq和FDG正电子发射断层扫描（PET）数据，探讨了肺癌鳞状细胞癌（LUSC）中葡萄糖转运蛋白（GLUT）表达与免疫细胞富集分数（ImmuneScore）及免疫治疗反应之间的关系 | 首次探讨了GLUT3/GLUT1比率作为免疫代谢功能的代表，并研究了其与免疫治疗反应的关联 | 研究样本量有限，且仅限于肺癌鳞状细胞癌和黑色素瘤患者 | 探索肿瘤微环境中的葡萄糖代谢特性及其在免疫治疗反应中的潜在应用 | 肺癌鳞状细胞癌（LUSC）和黑色素瘤患者的肿瘤和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, FDG正电子发射断层扫描 | NA | RNA-seq数据, 图像 | 63例肺癌鳞状细胞癌样本, 5例肺癌样本, 两个黑色素瘤队列 | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Immune Cells: Cell Isolation and cDNA Library Generation for scRNA-Seq
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0802-9_1
PMID:32808214
|
研究论文 | 本文描述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）前三个主要实验步骤的优化 | 提供了针对免疫CD8a T细胞的单细胞cDNA文库生成方法 | NA | 优化scRNA-seq实验技术步骤 | 免疫CD8a T细胞 | 单细胞测序 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组 | 从鼠脾组织中分离的CD8a T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-09 |
The Conjugation of Antibodies for the Simultaneous Detection of Surface Proteins and Transcriptome Analysis at a Single-Cell Level
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0802-9_3
PMID:32808216
|
研究论文 | 本文介绍了一种简单可靠的方法，用于将寡核苷酸与抗体结合，并用于单细胞转录组测序 | 本文开发了一种新方法，通过将抗体与条形码寡核苷酸结合，实现了在单细胞水平上同时检测表面蛋白和转录组分析 | NA | 开发一种能够在单细胞水平上同时进行转录组和蛋白质水平分析的方法 | 单细胞转录组和蛋白质水平 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 171 | 2024-08-09 |
Digestive symptoms of COVID-19 and expression of ACE2 in digestive tract organs
2020, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-020-00307-w
PMID:32818075
|
研究论文 | 本研究旨在全面调查COVID-19患者的消化道症状及其在消化道器官中的潜在致病途径，并探讨ACE2在这些器官中的表达情况 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序数据，首次揭示了消化道器官中ACE2表达水平高于肺部，并且在肿瘤细胞中的表达高于正常组织 | 研究样本量较小，仅包括48名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨COVID-19患者的消化道症状及SARS-CoV-2在消化道器官中的感染途径 | COVID-19患者的消化道症状及消化道器官中ACE2的表达 | NA | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA | 48名COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 172 | 2024-08-09 |
clustifyr: an R package for automated single-cell RNA sequencing cluster classification
2020, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.22969.2
PMID:32765839
|
研究论文 | clustifyr是一个R包，用于自动分类单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | clustifyr利用多种外部数据类型，包括基因表达谱，使用来自单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列表达数据或签名基因列表的数据来分配可能的细胞类型 | NA | 开发一个轻量级且有效的细胞类型分配工具，适用于各种单细胞RNA测序分析流程 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分配 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 173 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Revealed That Vitrification of Somatic Cloned Porcine Blastocysts Causes Substantial Perturbations in Gene Expression
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00640
PMID:32793277
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 174 | 2024-08-09 |
Integrating single-cell RNA-sequencing and functional assays to decipher mammary cell states and lineage hierarchies
2020, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-020-00175-8
PMID:32793804
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和功能实验，解析了乳腺细胞状态和谱系层次结构 | 利用单细胞RNA测序技术，识别并分子表征了复杂组织中的细胞层次结构，发现了新的细胞类型和状态 | NA | 理解正常细胞稳态和肿瘤发生的关键 | 乳腺上皮细胞的异质性和细胞层次结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人和小鼠的乳腺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 175 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals immune landscape in kidneys of patients with chronic transplant rejection
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.48201
PMID:32754283
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性移植肾排斥反应患者的肾脏免疫景观 | 首次在单细胞水平上揭示了慢性移植肾排斥反应中肾脏细胞的多样性和功能差异 | 研究样本量较小，仅包括三个健康肾脏和两个慢性移植肾排斥反应样本 | 探索慢性移植肾排斥反应的细胞和分子机制 | 慢性移植肾排斥反应患者的肾脏细胞 | 数字病理学 | 移植排斥反应 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个健康人肾脏和两个慢性移植肾排斥反应活检样本 | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-09 |
Stem cell programs in cancer initiation, progression, and therapy resistance
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.41648
PMID:32754274
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综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）在癌症起始、进展和治疗抵抗中的关键特征和机制 | 讨论了CSC治疗抵抗的因素，如静止状态、上皮间质转化（EMT）和DNA损伤诱导的细胞死亡抵抗，并评估了消除治疗抵抗CSC亚群的治疗方法 | 仍需解决的挑战包括研究CSCs的实验方法和治疗靶向CSCs的障碍 | 阐明驱动癌症干细胞维持、可塑性和治疗抵抗的分子机制，以提高针对CSCs的靶向治疗效果 | 癌症干细胞（CSCs）及其在肿瘤进展、治疗抵抗和疾病复发中的作用 | NA | NA | 单细胞测序、CRISPR-Cas9筛选 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2024-08-09 |
Corrigendum: FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01521
PMID:32765526
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2024-08-09 |
Gaps and Doubts in Search to Recognize Glioblastoma Cellular Origin and Tumor Initiating Cells
2020, Journal of oncology
DOI:10.1155/2020/6783627
PMID:32774372
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研究论文 | 本文讨论了胶质母细胞瘤（GB）的细胞起源及其肿瘤起始细胞的问题，并提出了基于与中枢神经系统（CNS）细胞比较的GB起源的可能建议 | 提出了GFAP阳性细胞（星形胶质细胞、放射状胶质细胞或GFAP阳性神经前体细胞）作为GB起源的可能性，并建议进一步研究应聚焦于这些细胞 | 神经生物学家在定义神经干细胞（NSC）方面的不一致性使问题复杂化 | 探讨胶质母细胞瘤的细胞起源和肿瘤起始细胞 | 胶质母细胞瘤的细胞起源和肿瘤起始细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞NGS和单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Profile of Meniscal Tissue Macrophages in Human Osteoarthritis
2020, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2020/8127281
PMID:32775469
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，探讨了人膝关节软骨组织中巨噬细胞在骨关节炎中的异质性和功能特化 | 首次系统地研究了骨关节炎中低丰度的巨噬细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了其在健康人群和骨关节炎患者中的基因表达特征变化 | NA | 深入理解骨关节炎炎症的基础，为开发新疗法提供希望 | 人膝关节软骨组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2024-08-09 |
Midbrain Dopaminergic Neuron Development at the Single Cell Level: In vivo and in Stem Cells
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00463
PMID:32733875
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研究论文 | 本文探讨了中脑多巴胺能神经元在单细胞水平上的发育，特别是在体内和干细胞中的发育 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和生物信息学技术，详细分析了人类发育中脑中的细胞类型及其基因表达模式 | 目前对人类多巴胺能神经元发育的程序了解较少 | 阐明人类多巴胺能神经元的发育过程，并探讨其在帕金森病细胞替代治疗和疾病模型中的应用 | 中脑多巴胺能神经元在单细胞水平上的发育 | NA | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |