单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Revealed That Vitrification of Somatic Cloned Porcine Blastocysts Causes Substantial Perturbations in Gene Expression
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00640
PMID:32793277
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2024-08-09 |
Integrating single-cell RNA-sequencing and functional assays to decipher mammary cell states and lineage hierarchies
2020, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-020-00175-8
PMID:32793804
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和功能实验，解析了乳腺细胞状态和谱系层次结构 | 利用单细胞RNA测序技术，识别并分子表征了复杂组织中的细胞层次结构，发现了新的细胞类型和状态 | NA | 理解正常细胞稳态和肿瘤发生的关键 | 乳腺上皮细胞的异质性和细胞层次结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及人和小鼠的乳腺组织 |
| 163 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals immune landscape in kidneys of patients with chronic transplant rejection
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.48201
PMID:32754283
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了慢性移植肾排斥反应患者的肾脏免疫景观 | 首次在单细胞水平上揭示了慢性移植肾排斥反应中肾脏细胞的多样性和功能差异 | 研究样本量较小，仅包括三个健康肾脏和两个慢性移植肾排斥反应样本 | 探索慢性移植肾排斥反应的细胞和分子机制 | 慢性移植肾排斥反应患者的肾脏细胞 | 数字病理学 | 移植排斥反应 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三个健康人肾脏和两个慢性移植肾排斥反应活检样本 |
| 164 | 2024-08-09 |
Stem cell programs in cancer initiation, progression, and therapy resistance
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.41648
PMID:32754274
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综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）在癌症起始、进展和治疗抵抗中的关键特征和机制 | 讨论了CSC治疗抵抗的因素，如静止状态、上皮间质转化（EMT）和DNA损伤诱导的细胞死亡抵抗，并评估了消除治疗抵抗CSC亚群的治疗方法 | 仍需解决的挑战包括研究CSCs的实验方法和治疗靶向CSCs的障碍 | 阐明驱动癌症干细胞维持、可塑性和治疗抵抗的分子机制，以提高针对CSCs的靶向治疗效果 | 癌症干细胞（CSCs）及其在肿瘤进展、治疗抵抗和疾病复发中的作用 | NA | NA | 单细胞测序、CRISPR-Cas9筛选 | NA | NA | NA |
| 165 | 2024-08-09 |
Corrigendum: FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.01521
PMID:32765526
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-09 |
Gaps and Doubts in Search to Recognize Glioblastoma Cellular Origin and Tumor Initiating Cells
2020, Journal of oncology
DOI:10.1155/2020/6783627
PMID:32774372
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研究论文 | 本文讨论了胶质母细胞瘤（GB）的细胞起源及其肿瘤起始细胞的问题，并提出了基于与中枢神经系统（CNS）细胞比较的GB起源的可能建议 | 提出了GFAP阳性细胞（星形胶质细胞、放射状胶质细胞或GFAP阳性神经前体细胞）作为GB起源的可能性，并建议进一步研究应聚焦于这些细胞 | 神经生物学家在定义神经干细胞（NSC）方面的不一致性使问题复杂化 | 探讨胶质母细胞瘤的细胞起源和肿瘤起始细胞 | 胶质母细胞瘤的细胞起源和肿瘤起始细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞NGS和单细胞转录组学 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 167 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Profile of Meniscal Tissue Macrophages in Human Osteoarthritis
2020, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2020/8127281
PMID:32775469
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，探讨了人膝关节软骨组织中巨噬细胞在骨关节炎中的异质性和功能特化 | 首次系统地研究了骨关节炎中低丰度的巨噬细胞，并通过单细胞RNA测序揭示了其在健康人群和骨关节炎患者中的基因表达特征变化 | NA | 深入理解骨关节炎炎症的基础，为开发新疗法提供希望 | 人膝关节软骨组织中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 168 | 2024-08-09 |
Midbrain Dopaminergic Neuron Development at the Single Cell Level: In vivo and in Stem Cells
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00463
PMID:32733875
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研究论文 | 本文探讨了中脑多巴胺能神经元在单细胞水平上的发育，特别是在体内和干细胞中的发育 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和生物信息学技术，详细分析了人类发育中脑中的细胞类型及其基因表达模式 | 目前对人类多巴胺能神经元发育的程序了解较少 | 阐明人类多巴胺能神经元的发育过程，并探讨其在帕金森病细胞替代治疗和疾病模型中的应用 | 中脑多巴胺能神经元在单细胞水平上的发育 | NA | 帕金森病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 169 | 2024-08-09 |
Single-cell Transcriptome Profiling reveals Dermal and Epithelial cell fate decisions during Embryonic Hair Follicle Development
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.44306
PMID:32685006
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了胚胎期毛囊发育过程中真皮和表皮细胞命运决定的分子途径 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了毛囊发育过程中不同细胞群的动态基因表达模式和细胞间通信，为理解毛囊从头形态发生的分子途径提供了宝贵的资源 | 由于毛囊细胞的高度异质性和不同步发育，目前对毛囊发育的分子机制理解仍然有限 | 研究毛囊从头形态发生的分子途径，为未来的脱发治疗提供理论基础 | 胚胎期和新生小鼠的背侧皮肤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入（tSNE） | 转录组 | E13.5（诱导阶段）、E16.5（器官发生）和新生小鼠（出生后第0天，P0）的背侧皮肤细胞 |
| 170 | 2024-08-09 |
Ketogenesis activates metabolically protective γδ T cells in visceral adipose tissue
2020-01, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-019-0160-6
PMID:32694683
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了生酮饮食对脂肪组织中免疫细胞的影响，特别是γδ T细胞的作用。 | 首次揭示了生酮饮食通过扩张代谢保护性的γδ T细胞来抑制炎症，并探讨了长期生酮饮食对代谢健康的影响。 | 研究主要在老鼠模型上进行，需要进一步在人类中验证生酮饮食对γδ T细胞的影响及其对代谢健康的长期效应。 | 探讨生酮饮食如何影响脂肪组织中的炎症和能量平衡，特别是γδ T细胞的作用。 | 脂肪组织中的免疫细胞，特别是γδ T细胞。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老鼠模型 |
| 171 | 2024-08-09 |
Single-Cell Studies of Intestinal Stem Cell Heterogeneity During Homeostasis and Regeneration
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0747-3_9
PMID:32705640
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究肠道干细胞在稳态和再生过程中的异质性 | 描述了许多新的肠道干细胞及其后代的潜在标记物，并识别出成熟细胞类型的新亚群及其发育轨迹 | NA | 探讨这些亚群在组织稳态中的功能，以及在组织损伤后具有诱导再生潜力的潜在亚群 | 肠道干细胞及其在稳态和再生过程中的异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 172 | 2024-08-09 |
Click chemistry-based amplification and detection of endogenous RNA and DNA molecules in situ using clampFISH probes
2020, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2020.04.049
PMID:32713535
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于点击化学的放大和检测内源性RNA和DNA分子的方法——clampFISH探针，该方法能够在固定细胞中可视化基因组位点和单个RNA转录本 | clampFISH方法通过使用C形寡核苷酸探针和点击化学反应，实现了荧光信号的放大，同时保持了特异性，适用于高通量技术 | 传统的单分子RNA荧光原位杂交（FISH）方法由于荧光信号较弱，需要长时间曝光和高倍显微镜，导致样本量有限 | 开发一种能够放大荧光信号并保持特异性的新技术，以提高FISH方法的通量和适用性 | 内源性RNA和DNA分子 | 分子生物学 | NA | 荧光原位杂交（FISH） | NA | 图像 | 单个细胞 |
| 173 | 2024-08-09 |
Novel Approaches to Profile Functional Long Noncoding RNAs Associated with Stem Cell Pluripotency
2020-Jan, Current genomics
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了功能性长非编码RNA（lncRNA）在体细胞重编程和细胞分化中的最新研究进展 | 探讨了lncRNA通过顺式或反式机制参与重编程启动、多能性维持和发育过程的新方法 | NA | 关注于体细胞重编程和细胞分化中功能性lncRNA的分析方法 | 长非编码RNA（lncRNA）及其在干细胞多能性中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | RNA | 数百种lncRNA |
| 174 | 2024-08-09 |
Brainstem Organoids From Human Pluripotent Stem Cells
2020, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2020.00538
PMID:32670003
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研究论文 | 本文开发了一种从人类多能干细胞生成人类脑干类器官（hBSOs）的方法 | 首次成功生成包含多种神经细胞类型的人类脑干类器官，这些类器官的细胞组成与人类脑干相似 | 现有的类器官模型在重现人类大脑发育方面存在局限，无法完全阐明影响大脑各部分的疾病 | 探索和研究影响脑干的中枢神经系统疾病，并进行有效的药物筛选 | 人类脑干类器官（hBSOs）及其细胞组成 | 数字病理学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 包含多种神经细胞类型的人类脑干类器官 |
| 175 | 2024-08-09 |
Erratum: Author Correction: Immune cell profiling of COVID-19 patients in the recovery stage by single-cell sequencing
2020, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-00187-5
PMID:32595980
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2024-08-09 |
Cathepsin S and Protease-Activated Receptor-2 Drive Alloimmunity and Immune Regulation in Kidney Allograft Rejection
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00398
PMID:32582696
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研究论文 | 本文探讨了组织蛋白酶S（Cat-S）和蛋白酶激活受体-2（PAR-2）在肾脏同种异体移植排斥中的作用 | 通过单细胞RNA测序和免疫染色证实了Cat-S在肾脏同种异体移植中的表达，并发现Cat-S抑制可以显著保护同种异体移植免受炎症和血管炎的影响 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 研究Cat-S和PAR-2在肾脏同种异体移植排斥中的作用及其机制 | 组织蛋白酶S、蛋白酶激活受体-2、肾脏同种异体移植 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | RNA | 涉及小鼠和人类肾脏同种异体移植样本 |
| 177 | 2024-08-09 |
Single-cell genomic analysis of human cerebral organoids
2020, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2020.03.013
PMID:32586444
|
研究论文 | 本文描述了如何从人类脑类器官的同一悬浮细胞群中生成单细胞RNA测序和ATAC测序数据，并重点介绍了通过在一个实验中多重化多个个体来减少批次效应的方法。 | 利用干细胞衍生的三维细胞培养系统（脑类器官）来模拟早期大脑发育，并结合单细胞转录组和调控景观分析，以高分辨率理解细胞类型特异性特征和发育中的瞬态状态。 | NA | 研究患者特异性大脑发育，并理解细胞类型特异性特征和发育中的瞬态状态及其调控逻辑。 | 人类脑类器官中的单细胞转录组和调控景观。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，ATAC测序 | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 多个个体 |
| 178 | 2024-08-09 |
Increased Connexin36 Phosphorylation in AII Amacrine Cell Coupling of the Mouse Myopic Retina
2020, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2020.00124
PMID:32547367
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研究论文 | 本研究使用形態剝奪性近視小鼠模型，評估了連接蛋白36在AII無長突細胞中的表達模式和磷酸化狀態，以探討近視視網膜中信號傳輸的調節機制。 | 本研究首次發現近視視網膜中AII無長突細胞的連接蛋白36磷酸化水平增加，可能是對信號狀態改變的一種適應性調整。 | 本研究僅使用了形態剝奪性近視小鼠模型，未涵蓋其他類型的近視模型，可能影響結果的普遍性。 | 探討近視視網膜中信號傳輸的細胞和機制，以及連接蛋白36在其中的作用。 | AII無長突細胞中的連接蛋白36及其磷酸化狀態。 | NA | 近視 | 單細胞RNA測序 | NA | RNA | 形態剝奪性近視小鼠模型 |
| 179 | 2024-08-09 |
Ligand-receptor interaction atlas within and between tumor cells and T cells in lung adenocarcinoma
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.42080
PMID:32549766
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和基因表达数据，分析了肺腺癌中肿瘤细胞与T细胞之间的配体-受体相互作用，并构建了一个基于这些相互作用的机器学习模型来预测肺腺癌患者的预后。 | 首次系统地分析了肺腺癌中肿瘤细胞与T细胞之间的配体-受体相互作用，并构建了一个有效的机器学习模型来预测患者的预后。 | NA | 揭示肺腺癌中肿瘤细胞与T细胞之间的功能性相互作用，并探索这些相互作用对肿瘤微环境及癌症进展的潜在机制。 | 肺腺癌患者的肿瘤细胞、上皮细胞和T细胞。 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 39,692个细胞 |
| 180 | 2024-08-09 |
POFUT1 is dispensable for structure, function and survival of mouse podocytes
2020, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:32509213
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研究论文 | 研究探讨了POFUT1基因在鼠足细胞结构、功能和存活中的必要性 | 通过单细胞RNA测序确定了POFUT1在鼠足细胞中的非必要性，并提出了预测POFUT1在其他细胞类型中必要性的可行性 | NA | 研究POFUT1基因在鼠足细胞中的作用及其非必要性的原因 | 鼠足细胞 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 条件性敲除小鼠与野生型对照 |