单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-09 |
A robust semi-supervised NMF model for single cell RNA-seq data
2020, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.10091
PMID:33088619
|
研究论文 | 本文提出了一种鲁棒的半监督非负矩阵分解（rssNMF）模型，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 首次将先验知识（如细胞标记基因）引入到单细胞RNA测序数据的聚类分析中 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的聚类分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解（NMF） | 基因表达数据 | 十二个带有真实标签的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-09 |
Cell Development Deficiency and Gene Expression Dysregulation of Trisomy 21 Retina Revealed by Single-Nucleus RNA Sequencing
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.564057
PMID:33072724
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序技术揭示了唐氏综合症（T21）视网膜的细胞发育缺陷和基因表达失调 | 首次提供了人类T21视网膜的单细胞转录组图谱，揭示了细胞组成的多样性和异质性以及异常的细胞构成 | NA | 评估染色体非整倍性对视网膜发育的影响 | 唐氏综合症（T21）视网膜的单细胞转录组特征 | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个T21胎儿的视网膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-09 |
Benchmarking evolutionary tinkering underlying human-viral molecular mimicry shows multiple host pulmonary-arterial peptides mimicked by SARS-CoV-2
2020, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-020-00321-y
PMID:33024578
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研究论文 | 本研究报告了33个与SARS-CoV-2和人类参考蛋白质组相同的8-mer/9-mer肽段，并通过与其他病毒-人类肽段同一性的比较，揭示了SARS-CoV-2在分子模拟方面的普遍相似性 | 发现了20个由SARS-CoV-2模拟的新型人类肽段，这些肽段在之前的冠状病毒株中未被观察到，并且通过单细胞RNA测序分析，显示这些目标基因在人类肺部和动脉中显著表达 | NA | 揭示分子模拟在SARS-CoV-2进化和免疫逃避中的作用 | SARS-CoV-2与人类蛋白质组的8-mer/9-mer肽段 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 肽段序列 | 33个8-mer/9-mer肽段 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-09 |
Joint learning of multiple gene networks from single-cell gene expression data
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.09.004
PMID:33033579
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research paper | 本文介绍了一种新的联合高斯Copula图模型（JGCGM），用于从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中联合估计多个细胞亚群的多基因网络 | 提出了联合高斯Copula图模型（JGCGM），能够处理非高斯数据和缺失值，并识别多个细胞亚群的共同和独特网络结构 | NA | 从单细胞RNA测序数据中推断基因网络，以理解细胞内的功能组织 | 单细胞RNA测序数据中的多个细胞亚群的基因网络 | digital pathology | NA | scRNA-seq | Gaussian copula graphical model | gene expression data | 多个细胞亚群的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-09 |
Evaluating Distribution and Prognostic Value of New Tumor-Infiltrating Lymphocytes in HCC Based on a scRNA-Seq Study With CIBERSORTx
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.00451
PMID:33043022
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研究论文 | 本研究通过CIBERSORTx方法，基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，评估了肝细胞癌（HCC）中新肿瘤浸润淋巴细胞的分布及其预后价值 | 首次在TCGA HCC队列中研究了通过scRNA-seq鉴定的新细胞亚群的肿瘤浸润和预后价值 | 研究仅限于TCGA和ICGC队列，未来研究需要扩大样本量和多样性 | 探讨HCC中新的肿瘤浸润淋巴细胞亚群的分布及其预后价值 | 肝细胞癌（HCC）中的肿瘤浸润淋巴细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CIBERSORTx | 基因表达数据 | TCGA和ICGC队列中的大量样本 | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-09 |
Corrigendum: FB5P-seq: FACS-Based 5-Prime End Single-Cell RNA-seq for Integrative Analysis of Transcriptome and Antigen Receptor Repertoire in B and T Cells
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.02047
PMID:33013865
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-09 |
Novel Glial Cell Functions: Extensive Potency, Stem Cell-Like Properties, and Participation in Regeneration and Transdifferentiation
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00809
PMID:33015034
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综述 | 本文综述了胚胎期和成年期施万细胞的多潜能特性及其在再生和转分化中的作用 | 探讨了施万细胞在神经和非神经组织损伤修复中的潜在应用，以及在肿瘤发展调控中的可能作用 | NA | 深入了解施万细胞的生物学特性，以开发有效的治疗策略 | 施万细胞的多潜能特性和其在再生及转分化中的作用 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Identifies Cell Subsets in Human Placenta That Highly Expresses Factors Driving Pathogenesis of SARS-CoV-2
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00783
PMID:32974340
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，识别了人类胎盘中表达SARS-CoV-2感染所需因子的细胞亚群，并探讨了这些细胞在病毒感染中的作用 | 本文首次揭示了胎盘中特定细胞亚群表达SARS-CoV-2感染所需因子，并展示了这些细胞可能驱动病毒在发育中的人类胎盘中的传播 | NA | 旨在预测胎盘是否易受SARS-CoV-2感染，并揭示其在妊娠期病毒感染中的作用 | 人类胎盘中的细胞亚群及其在SARS-CoV-2感染中的作用 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多个物种的胎盘样本，包括人类 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-09 |
HSPA12B Secreted by Tumor-Associated Endothelial Cells Might Induce M2 Polarization of Macrophages via Activating PI3K/Akt/mTOR Signaling
2020, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S254985
PMID:32982299
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤相关内皮细胞分泌的HSPA12B在头颈部鳞状细胞癌中诱导巨噬细胞M2极化的潜在功能角色 | 发现肿瘤相关内皮细胞通过分泌HSPA12B，激活PI3K/Akt/mTOR信号通路，诱导巨噬细胞M2极化，这是一种新的肿瘤相关内皮细胞与肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用 | NA | 探索肿瘤相关内皮细胞分泌的HSPA12B在头颈部鳞状细胞癌中诱导巨噬细胞M2极化的功能角色 | 头颈部鳞状细胞癌中的肿瘤相关内皮细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | Bulk-seq, 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过5000个细胞来自18个原发性头颈部鳞状细胞癌病例 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-09 |
Re-analysis of Single Cell Transcriptome Reveals That the NR3C1-CXCL8-Neutrophil Axis Determines the Severity of COVID-19
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.02145
PMID:32983174
|
研究论文 | 本研究通过重新分析COVID-19患者的单细胞转录组数据，探讨了NR3C1-CXCL8-中性粒细胞轴与疾病严重程度的关系 | 首次揭示了NR3C1-CXCL8-中性粒细胞轴在决定COVID-19严重程度中的作用 | NA | 探讨COVID-19患者疾病严重程度与免疫特征的关系 | COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-09 |
Reproducibility across single-cell RNA-seq protocols for spatial ordering analysis
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0239711
PMID:32986734
|
研究论文 | 本文评估了三种不同单细胞RNA测序协议（Smart-seq、MARS-seq和10X）在空间重构分析中的可重复性 | 发现不同协议和计算算法生成的数据在空间重构分析后基因表达谱高度一致 | 需要优化协议中测序深度和细胞数量的平衡，以有效利用资源 | 评估不同单细胞RNA测序协议在空间重构分析中的表现 | 三种单细胞RNA测序协议在空间重构分析中的可重复性和生物信号再现能力 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了三种不同协议的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-09 |
Understanding Diseases from Single-Cell Sequencing and Methylation
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_1
PMID:32949386
|
review | 本书综述了单细胞测序和甲基化在疾病中的作用，并探讨了单细胞测序和甲基化的疾病特异性改变 | 本书强调了单细胞测序和甲基化方法在临床实践和应用中的重要性，以及其在非癌疾病中的潜在价值 | NA | 旨在应用单细胞测序和甲基化测量进行临床诊断和治疗，并理解这些参数的临床价值 | 单细胞测序和甲基化在疾病中的应用 | digital pathology | pulmonary disease | single-cell sequencing, methylation sequencing | NA | DNA, RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-09 |
Methods for Single-Cell Isolation and Preparation
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_2
PMID:32949387
|
研究论文 | 本文综述了当前用于基于测序的下游分析的单细胞分离方法的最新技术，并讨论了它们的优缺点 | 介绍了多种单细胞分离方法，并允许转录组学与细胞电生理或形态学参数的相关性分析 | 需要仔细选择合适的方法以避免数据错误或偏差，可能导致误解 | 提供单细胞分离方法的广泛概述，并详细讨论关键参数 | 单细胞分离技术及其在测序基础下游分析中的应用 | 生命科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of T cell Receptors: A Perspective on the Technological Development and Translational Application
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_3
PMID:32949388
|
综述 | 本文综述了T细胞受体（TCR）的单细胞测序技术发展及其在自身免疫性疾病中的转化应用 | 介绍了单细胞测序技术在研究TCR库中的应用，改变了TCR库的调查和分析方式 | 在技术上仍存在挑战，如如何序列化TCR并提供与免疫系统中大量TCR库相关的概念性背景 | 探讨TCR的生物学特性、信号传导及其在自身免疫中的意义，并讨论单细胞测序平台在自身免疫性疾病中的应用 | T细胞受体（TCR）及其在免疫反应中的作用 | 生物技术 | 自身免疫性疾病 | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-09 |
Application of Single-Cell RNA Sequencing in Pancreatic Cancer and the Endocrine Pancreas
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_12
PMID:32949397
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在胰腺癌和内分泌胰腺研究中的应用 | scRNA-seq技术能深入分析胰腺和胰腺癌中的细胞异质性，特别是在细胞类型特异性分子识别和癌细胞与间质微环境相互作用的检测方面 | NA | 综述scRNA-seq策略在胰腺转录组学和胰腺癌研究中的最新进展 | 胰腺癌和内分泌胰腺 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing in Genitourinary Malignancies
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_13
PMID:32949398
|
研究论文 | 本文综述了单细胞测序（SCS）在泌尿生殖系统恶性肿瘤中的应用，包括其在肾细胞癌、膀胱癌和前列腺癌中的研究进展 | SCS技术革新了对肿瘤异质性、肿瘤微环境、免疫浸润、癌症干细胞（CSCs）、循环肿瘤细胞（CTCs）和克隆进化的理解 | NA | 探讨SCS技术在泌尿生殖系统恶性肿瘤中的应用及其未来发展 | 肾细胞癌、膀胱癌和前列腺癌 | 数字病理学 | 泌尿生殖系统恶性肿瘤 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-09 |
Single Cell RNA Sequencing in Human Disease: Renal, Pancreatic, and Viral Diseases
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_16
PMID:32949401
|
综述 | 本章讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在探索病毒感染以及肾脏和胰腺疾病中的具体应用 | scRNA-seq技术已推进对肺部和心脏疾病、移植免疫学、癌症等多种疾病的研究 | 本综述并非详尽无遗 | 探讨scRNA-seq在人类疾病中的应用，特别是肾脏、胰腺和病毒性疾病 | 病毒感染、肾脏和胰腺疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病、胰腺疾病、病毒性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞表达模式 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing in Human Genital Infections
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_17
PMID:32949402
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的应用 | 单细胞测序技术为研究药物抗性克隆、细胞间变异、获得性药物抗性突变、病原体在不同感染阶段的转录多样性、识别稀有细胞类型以及研究生殖器感染病原体的不同细胞状态提供了新的可能性 | 本文讨论了单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的局限性和挑战 | 探讨单细胞测序技术在人类生殖器感染研究中的应用及其局限性 | 人类生殖器感染及其相关病原体 | NA | 生殖器感染 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-09 |
Values of Single-Cell RNA Sequencing in Development of Cerebral Cortex
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-4494-1_19
PMID:32949404
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在研究大脑皮层细胞复杂性、集群和特定功能中的应用 | 本文提出了将scRNA-seq扩展到单个神经元细胞的代谢谱，并整合转录组与分子和功能表型，以深入理解大脑发育和疾病发生的分子机制 | 大脑样本易受干扰和混杂因素影响，需要开发更先进的计算系统生物学方法来克服单细胞信号检测中的固有干扰和技术差异 | 研究单细胞RNA测序在理解大脑皮层发育和神经疾病发病机制中的应用 | 大脑皮层细胞的异质性和转录组变化 | 数字病理学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-09 |
scTree: An R package to generate antibody-compatible classifiers from single-cell sequencing data
2020, Journal of open source software
DOI:10.21105/joss.02061
PMID:32954206
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研究论文 | 介绍了一个名为scTree的R包，用于从单细胞测序数据中生成抗体兼容的分类器 | scTree工具旨在为使用R编程语言和scRNA-seq分析程序的生物学家提供一组最小的基因，以便用于下游实验 | NA | 开发一个工具，帮助生物学家从单细胞测序数据中选择用于下游实验的最小基因集 | 单细胞RNA测序数据中的基因选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |