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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-09 |
Six Immune Associated Genes Construct Prognostic Model Evaluate Low-Grade Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.606164
PMID:33408717
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研究论文 | 本文通过分析NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据，筛选出六个与免疫相关的基因，构建了一个预测低级别胶质瘤预后的风险评分模型 | 首次利用六个特定基因构建风险评分模型，用于评估低级别胶质瘤的预后 | NA | 研究如何通过特定基因评估胶质瘤的预后 | 胶质瘤及其相关的肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 基因表达分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 包括20个胶质瘤样本和15个对照样本，以及669名患者的生存率数据 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-09 |
Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Heterogeneities of Non-cardiomyocytes in Healthy and Ischemic Hearts
2020, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2020.615161
PMID:33365332
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研究论文 | 本研究通过整合三个代表性的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，探讨了在心肌梗死或假手术后3天和7天分离的27,349个非心肌细胞的异质性 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集，揭示了健康和非健康心脏中非心肌细胞的不同动态和功能特性 | NA | 旨在探讨是否可以通过整合多个相似的scRNA-seq数据集，更全面地理解疾病 | 非心肌细胞在健康和心肌缺血心脏中的异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 27,349个非心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling provides insights into retinal endothelial barrier properties
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33380778
|
研究论文 | 通过分析牛视网膜微血管内皮细胞（RMECs）的单细胞转录组，深入了解视网膜内皮屏障特性 | 开发了一种单细胞转录组学工作流程，并揭示了视网膜微血管屏障中先前未报道的连接蛋白 | NA | 更好地表征视网膜内皮屏障特性 | 牛视网膜微血管内皮细胞（RMECs）的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个RMECs | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-09 |
Identification of Pro-Fibrotic Macrophage Populations by Single-Cell Transcriptomic Analysis in West Highland White Terriers Affected With Canine Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.611749
PMID:33384697
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞群体，以识别与疾病相关的细胞异质性 | 首次在犬类特发性肺纤维化模型中使用单细胞RNA测序技术，识别出具有促纤维化能力的巨噬细胞/单核细胞群体 | 需要进一步研究以理解这些巨噬细胞/单核细胞群体在疾病发病机制中的具体作用 | 识别和分析患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬肺部中的促纤维化巨噬细胞群体 | 患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞 | 数字病理学 | 犬类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5只患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬和3只健康西高地白梗犬 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-09 |
Sc-GPE: A Graph Partitioning-Based Cluster Ensemble Method for Single-Cell
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.604790
PMID:33384718
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研究论文 | 本文介绍了一种基于图划分聚类集成的单细胞RNA测序数据分析方法Sc-GPE | Sc-GPE结合了五种基于图划分的单细胞聚类方法，并通过构建加权共识矩阵来区分各方法的重要性 | NA | 开发一种有效的聚类集成策略，用于解决不同单细胞聚类方法结果不一致的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图划分聚类方法 | 数据矩阵 | 12个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-09 |
Redox Regulator GLRX Is Associated With Tumor Immunity in Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.580934
PMID:33329553
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研究论文 | 本研究旨在探讨谷氧还蛋白在胶质瘤中的转录组水平作用及其临床预后价值 | 发现谷氧还蛋白在恶性胶质瘤中高度富集，并与肿瘤免疫微环境密切相关，可能增强胶质瘤免疫治疗的疗效 | NA | 阐明谷氧还蛋白在胶质瘤中的生物学功能及其临床预后价值 | 谷氧还蛋白在胶质瘤中的作用及其临床预后价值 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析，单细胞测序 | NA | 转录组数据，单细胞测序数据 | 1717个胶质瘤样本，6个胶质瘤患者的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-09 |
Integrative Analysis Extracts a Core ceRNA Network of the Fetal Hippocampus With Down Syndrome
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.565955
PMID:33329702
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研究论文 | 本研究通过综合分析提取了与唐氏综合症胎儿海马体相关的核心ceRNA网络 | 首次描绘了唐氏综合症中circRNAs的图谱，并有效整合了ceRNA调控与单细胞RNA测序数据 | NA | 探究唐氏综合症神经病理学的分子机制或治疗靶点 | 唐氏综合症胎儿海马体中的circRNAs、miRNAs和mRNAs | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 唐氏综合症患者8例，对照组6例 | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-09 |
EC-PGMGR: Ensemble Clustering Based on Probability Graphical Model With Graph Regularization for Single-Cell RNA-seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.572242
PMID:33329710
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研究论文 | 本文提出了一种基于概率图模型和图正则化的集成聚类算法EC-PGMGR，用于单细胞RNA测序数据 | EC-PGMGR算法通过概率图模型自动确定聚类数目，并通过添加正则化项减少弱基础聚类结果的影响，实现了自调节权重组合的预学习过程 | 集成聚类方法的结果依赖于基础聚类结果，且集成系统通常不具有自调节能力 | 设计一种鲁棒的无监督聚类方法，以提高聚类准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率图模型 | RNA-seq数据 | 涉及7个数据集，单细胞数量从822到5,132 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-09 |
Single-cell rna seq analysis identifies the biomarkers and differentiation of chondrocyte in human osteoarthritis
2020, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:33312370
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术识别骨关节炎中软骨细胞的生物标志物及其分化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨关节炎中不同类型软骨细胞的表达谱，并预测了与软骨细胞增殖和分化紧密相关的关键基因 | NA | 识别骨关节炎中软骨细胞的潜在标志物并探索不同类型软骨细胞在骨关节炎中的功能 | 骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 480个软骨细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Glioblastoma Reveals Central Nervous System Susceptibility to SARS-CoV-2
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.566599
PMID:33312949
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了胶质母细胞瘤对SARS-CoV-2感染的敏感性 | 揭示了SARS-CoV-2神经侵袭的机制，并指出了神经系统细胞对SARS-CoV-2的易感性 | NA | 探讨中枢神经系统对SARS-CoV-2感染的敏感性 | 胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 涉及胶质母细胞瘤和正常脑组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-09 |
Female reproductive tract has low concentration of SARS-CoV2 receptors
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243959
PMID:33315943
|
研究论文 | 研究调查了女性生殖器官中SARS-CoV2受体的表达情况 | 首次通过单细胞测序数据分析了女性生殖组织中SARS-CoV2受体的表达，发现这些组织中受体表达较低 | 研究仅限于分析已有的单细胞测序数据，未进行新的实验验证 | 探讨SARS-CoV2在女性生殖系统中的感染风险 | 女性生殖器官如子宫、子宫肌层、卵巢、输卵管和乳腺 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 涉及多个女性生殖器官的单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-09 |
DSAVE: Detection of misclassified cells in single-cell RNA-Seq data
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243360
PMID:33270740
|
研究论文 | 本文开发了一种名为DSAVE的方法，用于评估单细胞转录组聚类的纯度并识别错误分类的细胞 | DSAVE方法利用下采样消除采样噪声差异，并使用基于对数似然度的度量来帮助识别错误分类的细胞 | NA | 评估单细胞转录组聚类的纯度并识别错误分类的细胞 | 单细胞RNA测序数据中的错误分类细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-09 |
Microglia Diversity in Health and Multiple Sclerosis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.588021
PMID:33240276
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在健康和多发性硬化症中的多样性及其对病理和修复的贡献 | 利用单细胞RNA测序和免疫细胞的质谱流式细胞术等技术，深入理解了微胶质细胞和巨噬细胞的表型变化 | NA | 探讨微胶质细胞在正常衰老和多发性硬化症中的异质性及其对免疫机制的影响 | 微胶质细胞和巨噬细胞在多发性硬化症中的功能多样性 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-09 |
The Expression Pattern and Clinical Significance of the Immune Checkpoint Regulator VISTA in Human Breast Cancer
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.563044
PMID:33250890
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研究论文 | 研究分析了免疫检查点调节因子VISTA在人乳腺癌中的表达模式及其临床意义 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了乳腺癌组织中VISTA的表达水平，并验证了其在乳腺癌免疫治疗中的潜在价值 | NA | 探讨VISTA在乳腺癌中的免疫调节作用及其对乳腺癌免疫治疗的潜在影响 | 人乳腺癌组织及其配对的正常细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14897个乳腺癌细胞和7320个正常细胞，以及324个人乳腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-09 |
Vascular Heterogeneity With a Special Focus on the Hepatic Microenvironment
2020, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2020.591901
PMID:33262705
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术对血管异质性及其在不同组织中的复杂组成的深入分析，特别关注了肝脏微环境中的血管结构和功能 | NA | NA | 旨在总结不同血管床的变异性、内皮细胞的多样性以及支持细胞如何使血管实现其多种功能 | 血管组织的异质性，特别是内皮细胞和基质微环境的多样性及其在生理和病理条件下的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-09 |
In silico immune infiltration profiling combined with functional enrichment analysis reveals a potential role for naïve B cells as a trigger for severe immune responses in the lungs of COVID-19 patients
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0242900
PMID:33264345
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研究论文 | 本研究利用CIBERSORT-X方法评估COVID-19患者肺组织中的转录估计免疫浸润景观，并发现幼稚B细胞高度浸润，可能是导致过度活跃的体液免疫反应的主要原因。 | 首次揭示了幼稚B细胞在COVID-19患者肺组织中的高度浸润，并提出抑制幼稚B细胞可能是一种缓解COVID-19严重症状的新策略。 | 研究主要基于转录组数据和单细胞RNA测序数据，需要进一步的实验验证。 | 探讨SARS-CoV-2感染引起的免疫反应机制，特别是免疫细胞浸润在肺组织中的变化。 | COVID-19患者的肺组织和免疫细胞亚群。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | CIBERSORT-X | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 涉及COVID-19患者和特发性肺纤维化（IPF）患者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-09 |
Autophagy Regulatory Genes MET and RIPK2 Play a Prognostic Role in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: A Bioinformatic Analysis Based on GEO and TCGA
2020, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2020/8537381
PMID:33204717
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研究论文 | 本研究通过分析GEO和TCGA数据库中的基因表达数据，探讨了自噬调控基因MET和RIPK2在胰腺导管腺癌中的预后作用 | 本研究首次构建了基于MET和RIPK2的预后风险特征，并通过基因集富集分析预测了这两个基因在胰腺导管腺癌中促进自噬的作用 | 研究主要基于公共数据库数据，未进行体内外实验验证 | 预测胰腺导管腺癌中的预后自噬调控基因及其在自噬调控中的作用 | 胰腺导管腺癌中的自噬调控基因MET和RIPK2 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自不同平台的多个数据集，包括GSE62165、GSE85916、TCGA和GSE111672 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-09 |
Benchmarking algorithms for pathway activity transformation of single-cell RNA-seq data
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.10.007
PMID:33209207
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研究论文 | 本文收集了七种广泛使用的通路活性转换算法和32个基于16种scRNA-seq技术的数据集，提出一个综合框架评估这些算法的准确性、稳定性和可扩展性 | 提出了一个综合框架来评估通路活性转换算法的性能，并发现Pagoda2在准确性、可扩展性和稳定性方面表现最佳 | NA | 评估不同通路活性转换算法在单细胞RNA测序数据分析中的性能 | 七种通路活性转换算法和32个scRNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 32个数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Microenvironmental Infiltration of Plasma Cells and Hepatocytic Prognostic Markers in HCC With Cirrhosis
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.596318
PMID:33224891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肝硬化相关肝细胞癌（HCC）中浆细胞的微环境浸润及肝细胞的预后标志物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了肝硬化相关HCC中体液免疫浸润的关键作用及肝细胞自身的关键肿瘤预后基因 | NA | 揭示肝硬化相关肝细胞癌中的免疫细胞浸润情况及肝细胞的预后标志物 | 健康供体、肝硬化患者及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 健康供体、肝硬化患者及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-09 |
Multiple Expression Assessments of ACE2 and TMPRSS2 SARS-CoV-2 Entry Molecules in the Urinary Tract and Their Associations with Clinical Manifestations of COVID-19
2020, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S270543
PMID:33177848
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研究论文 | 本研究探讨了ACE2和TMPRSS2在人体主要器官中的表达模式，特别是在特定疾病条件下，并评估了它们与COVID-19临床表现的关系 | 首次详细研究了ACE2和TMPRSS2在泌尿系统中的表达及其与COVID-19临床表现的关系 | NA | 揭示SARS-CoV-2的致病机制及其在人体睾丸和肾脏中的临床表现 | ACE2和TMPRSS2在人体器官中的表达及其与COVID-19的关系 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及慢性肾脏疾病或糖尿病肾病的个体 | NA | NA | NA | NA |