单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-09 |
Microglia Diversity in Health and Multiple Sclerosis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.588021
PMID:33240276
|
综述 | 本文综述了微胶质细胞在健康和多发性硬化症中的多样性及其对病理和修复的贡献 | 利用单细胞RNA测序和免疫细胞的质谱流式细胞术等技术，深入理解了微胶质细胞和巨噬细胞的表型变化 | NA | 探讨微胶质细胞在正常衰老和多发性硬化症中的异质性及其对免疫机制的影响 | 微胶质细胞和巨噬细胞在多发性硬化症中的功能多样性 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-09 |
The Expression Pattern and Clinical Significance of the Immune Checkpoint Regulator VISTA in Human Breast Cancer
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.563044
PMID:33250890
|
研究论文 | 研究分析了免疫检查点调节因子VISTA在人乳腺癌中的表达模式及其临床意义 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了乳腺癌组织中VISTA的表达水平，并验证了其在乳腺癌免疫治疗中的潜在价值 | NA | 探讨VISTA在乳腺癌中的免疫调节作用及其对乳腺癌免疫治疗的潜在影响 | 人乳腺癌组织及其配对的正常细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14897个乳腺癌细胞和7320个正常细胞，以及324个人乳腺癌样本 |
| 103 | 2024-08-09 |
Vascular Heterogeneity With a Special Focus on the Hepatic Microenvironment
2020, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2020.591901
PMID:33262705
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术对血管异质性及其在不同组织中的复杂组成的深入分析，特别关注了肝脏微环境中的血管结构和功能 | NA | NA | 旨在总结不同血管床的变异性、内皮细胞的多样性以及支持细胞如何使血管实现其多种功能 | 血管组织的异质性，特别是内皮细胞和基质微环境的多样性及其在生理和病理条件下的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 104 | 2024-08-09 |
In silico immune infiltration profiling combined with functional enrichment analysis reveals a potential role for naïve B cells as a trigger for severe immune responses in the lungs of COVID-19 patients
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0242900
PMID:33264345
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研究论文 | 本研究利用CIBERSORT-X方法评估COVID-19患者肺组织中的转录估计免疫浸润景观，并发现幼稚B细胞高度浸润，可能是导致过度活跃的体液免疫反应的主要原因。 | 首次揭示了幼稚B细胞在COVID-19患者肺组织中的高度浸润，并提出抑制幼稚B细胞可能是一种缓解COVID-19严重症状的新策略。 | 研究主要基于转录组数据和单细胞RNA测序数据，需要进一步的实验验证。 | 探讨SARS-CoV-2感染引起的免疫反应机制，特别是免疫细胞浸润在肺组织中的变化。 | COVID-19患者的肺组织和免疫细胞亚群。 | 数字病理学 | 肺部疾病 | CIBERSORT-X | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 涉及COVID-19患者和特发性肺纤维化（IPF）患者的肺组织样本 |
| 105 | 2024-08-09 |
Autophagy Regulatory Genes MET and RIPK2 Play a Prognostic Role in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: A Bioinformatic Analysis Based on GEO and TCGA
2020, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2020/8537381
PMID:33204717
|
研究论文 | 本研究通过分析GEO和TCGA数据库中的基因表达数据，探讨了自噬调控基因MET和RIPK2在胰腺导管腺癌中的预后作用 | 本研究首次构建了基于MET和RIPK2的预后风险特征，并通过基因集富集分析预测了这两个基因在胰腺导管腺癌中促进自噬的作用 | 研究主要基于公共数据库数据，未进行体内外实验验证 | 预测胰腺导管腺癌中的预后自噬调控基因及其在自噬调控中的作用 | 胰腺导管腺癌中的自噬调控基因MET和RIPK2 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自不同平台的多个数据集，包括GSE62165、GSE85916、TCGA和GSE111672 |
| 106 | 2024-08-09 |
Benchmarking algorithms for pathway activity transformation of single-cell RNA-seq data
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.10.007
PMID:33209207
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研究论文 | 本文收集了七种广泛使用的通路活性转换算法和32个基于16种scRNA-seq技术的数据集，提出一个综合框架评估这些算法的准确性、稳定性和可扩展性 | 提出了一个综合框架来评估通路活性转换算法的性能，并发现Pagoda2在准确性、可扩展性和稳定性方面表现最佳 | NA | 评估不同通路活性转换算法在单细胞RNA测序数据分析中的性能 | 七种通路活性转换算法和32个scRNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 32个数据集 |
| 107 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Reveals Microenvironmental Infiltration of Plasma Cells and Hepatocytic Prognostic Markers in HCC With Cirrhosis
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.596318
PMID:33224891
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肝硬化相关肝细胞癌（HCC）中浆细胞的微环境浸润及肝细胞的预后标志物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了肝硬化相关HCC中体液免疫浸润的关键作用及肝细胞自身的关键肿瘤预后基因 | NA | 揭示肝硬化相关肝细胞癌中的免疫细胞浸润情况及肝细胞的预后标志物 | 健康供体、肝硬化患者及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 健康供体、肝硬化患者及肝细胞癌患者的单细胞RNA测序数据 |
| 108 | 2024-08-09 |
Multiple Expression Assessments of ACE2 and TMPRSS2 SARS-CoV-2 Entry Molecules in the Urinary Tract and Their Associations with Clinical Manifestations of COVID-19
2020, Infection and drug resistance
IF:2.9Q2
DOI:10.2147/IDR.S270543
PMID:33177848
|
研究论文 | 本研究探讨了ACE2和TMPRSS2在人体主要器官中的表达模式，特别是在特定疾病条件下，并评估了它们与COVID-19临床表现的关系 | 首次详细研究了ACE2和TMPRSS2在泌尿系统中的表达及其与COVID-19临床表现的关系 | NA | 揭示SARS-CoV-2的致病机制及其在人体睾丸和肾脏中的临床表现 | ACE2和TMPRSS2在人体器官中的表达及其与COVID-19的关系 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 涉及慢性肾脏疾病或糖尿病肾病的个体 |
| 109 | 2024-08-09 |
Current Status of Stem Cell-Derived Therapies for Parkinson's Disease: From Cell Assessment and Imaging Modalities to Clinical Trials
2020, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2020.558532
PMID:33177975
|
研究论文 | 本文综述了干细胞衍生的多巴胺神经元移植作为帕金森病治疗方案的最新进展，包括细胞来源、评估方法和临床试验结果 | 探讨了干细胞移植在帕金森病治疗中的应用潜力，并总结了临床试验的教训 | 文章指出干细胞移植治疗帕金森病仍需考虑多种因素，如干细胞来源、质量、患者年龄等 | 旨在更新干细胞衍生的多巴胺神经元移植治疗帕金森病的现状和进展 | 主要研究对象为帕金森病患者和干细胞衍生的多巴胺神经元 | NA | 帕金森病 | 单细胞测序、成像技术 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 110 | 2024-08-09 |
Differential Expression of Viral Transcripts From Single-Cell RNA Sequencing of Moderate and Severe COVID-19 Patients and Its Implications for Case Severity
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.603509
PMID:33178176
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析中度和重度COVID-19患者的病毒转录本表达差异及其对病例严重程度的意义 | 首次报道了SARS-CoV-2 ORF10基因在中度和重度病例中的差异表达，并发现了与病毒领导者序列独立融合的转录调控序列（TRS）主要在死亡病例中检测到 | 研究结果需要更多数据验证 | 探索SARS-CoV-2感染细胞中病毒基因表达的特征和进化差异，以预测疾病进展和患者分级 | 中度和重度COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液中的感染细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 中度和重度COVID-19患者的样本 |
| 111 | 2024-08-09 |
Profiling Microglia From Alzheimer's Disease Donors and Non-demented Elderly in Acute Human Postmortem Cortical Tissue
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.00134
PMID:33192286
|
研究论文 | 研究通过批量和单细胞RNA测序技术，分析了阿尔茨海默病（AD）患者和非痴呆老年人死后急性皮质脑组织中的小胶质细胞转录组 | 首次在人类样本中识别出七种具有基因表达异质性的小胶质细胞亚群 | 研究未发现AD患者和非痴呆老年人之间小胶质细胞的基因表达和亚群组成有显著差异 | 探讨小胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其基因表达特征 | 阿尔茨海默病患者和非痴呆老年人的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用急性人类死后皮质脑样本 |
| 112 | 2024-08-09 |
LRR-Containing Oncofetal Trophoblast Glycoprotein 5T4 Shapes Neural Circuits in Olfactory and Visual Systems
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.581018
PMID:33192298
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研究论文 | 本文探讨了含有LRR的癌胚滋养层糖蛋白5T4在嗅觉和视觉系统中神经回路形成中的作用 | 首次揭示了5T4在嗅觉和视觉系统中对神经回路形成的关键作用 | NA | 研究5T4在嗅觉和视觉系统中对神经回路形成的作用 | 嗅觉和视觉系统中的神经回路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 113 | 2024-08-09 |
BrainWiki-A Wiki-Style, User Driven, Comparative Brain Anatomy Tool
2020, Frontiers in neuroanatomy
IF:2.1Q3
DOI:10.3389/fnana.2020.548172
PMID:33192339
|
研究论文 | 介绍了一个名为BrainWiki的用户友好型网络脑图谱平台，该平台将人类和小鼠大脑并列展示，便于直接比较 | BrainWiki是首个将人类和小鼠大脑并列展示的网络平台，支持用户互动和贡献，使其成为一个动态更新的脑科学资源 | NA | 旨在创建一个用户驱动的、比较性的脑解剖学工具，以促进对人类和小鼠大脑的理解 | 人类和小鼠的大脑解剖结构及其相关研究 | 神经科学 | NA | NA | NA | 文本 | NA |
| 114 | 2024-08-09 |
Identification of Immune Cell Infiltration and Immune-Related Genes in the Tumor Microenvironment of Glioblastomas
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.585034
PMID:33193404
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研究论文 | 本研究旨在识别胶质母细胞瘤（GBM）肿瘤微环境中的免疫细胞浸润和免疫相关基因 | 本研究通过RNA测序和临床数据分析，识别了24个与肿瘤微环境浸润相关的免疫相关基因，这些基因可能作为新的生物标志物和免疫治疗靶点 | NA | 识别胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫相关基因 | 胶质母细胞瘤（GBM）的肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫相关基因 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和CGGA的GBM样本数据 |
| 115 | 2024-08-09 |
NeuralEE: A GPU-Accelerated Elastic Embedding Dimensionality Reduction Method for Visualizing Large-Scale scRNA-Seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00786
PMID:33193561
|
研究论文 | 本文设计了一种GPU加速的方法NeuralEE，结合了弹性嵌入和神经网络的优势，用于大规模单细胞RNA测序数据的降维和可视化 | NeuralEE方法具有可扩展性和通用性，能够在有限的计算资源下保持高性能 | NA | 开发一种高效的降维和可视化工具，以应对单细胞RNA测序数据量和规模的急剧增加 | 大规模单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | GPU加速 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 130万个小鼠脑细胞 |
| 116 | 2024-08-09 |
Stemness Related Genes Revealed by Network Analysis Associated With Tumor Immune Microenvironment and the Clinical Outcome in Lung Adenocarcinoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.549213
PMID:33193623
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研究论文 | 本研究利用加权基因共表达网络分析（WGCNA）全面分析了癌症干细胞特性与肿瘤微环境（TME）在肺腺癌（LUAD）中的作用 | 本研究首次揭示了癌症干细胞特性与抗肿瘤免疫之间的关系，并通过多种算法探索了关键基因表达与癌症免疫特性的关系 | 研究结果需要在更大样本中进一步验证，以确认其作为预测标志物和治疗靶点的潜力 | 探讨癌症干细胞特性与肿瘤微环境在肺腺癌中的作用及其对临床结果的影响 | 肺腺癌（LUAD）及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |
| 117 | 2024-08-09 |
Evolution of Advanced Chronic Lymphoid Leukemia Unveiled by Single-Cell Transcriptomics: A Case Report
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.584607
PMID:33194728
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病例报告 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了慢性淋巴细胞白血病（CLL）在诊断和复发阶段的遗传和转录异质性 | 利用单细胞RNA测序技术，首次在CLL患者中发现了在治疗过程中克隆优势的重大转变，并揭示了与疾病进展相关的特定克隆和信号通路的激活 | 本研究仅基于单一病例，可能无法完全代表所有CLL患者的普遍情况 | 通过单细胞转录组学分析，揭示CLL的疾病异质性，以优化治疗方案 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）的遗传和转录异质性 | 数字病理学 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 单一CLL病例，包括诊断和复发阶段的样本 |
| 118 | 2024-08-09 |
Identification of Differential Gene Groups From Single-Cell Transcriptomes Using Network Entropy
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.588041
PMID:33195248
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法DiffGE，利用网络熵来测量不同细胞类型间基因组的表达动态，并识别高度差异的基因组 | 采用网络熵作为测量工具，以识别不同细胞类型间高度差异的基因组 | NA | 揭示特定细胞类型间的转录差异 | 单细胞转录组数据中的差异基因组 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三个独立的单细胞RNA-seq数据集 |
| 119 | 2024-08-09 |
Vertebrate Sensory Ganglia: Common and Divergent Features of the Transcriptional Programs Generating Their Functional Specialization
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.587699
PMID:33195244
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研究论文 | 本文总结了脊椎动物头部感觉神经节的普遍解剖结构、功能和神经多样性，并概述了控制感觉系统发育中神经发生和神经元分化的转录网络的当前知识，特别关注头部感觉神经节，强调其发育的特定方面并与躯干感觉神经节进行比较 | 利用单细胞RNA测序技术，近期研究在大多数感觉神经节的神经元多样性表征方面取得了显著进展 | 目前对不同头部感觉神经节胚胎发育的分子机制的理解仍然有限 | 探讨脊椎动物感觉神经节的转录程序及其功能特化的共同和差异特征 | 脊椎动物的感觉神经节及其相关的神经 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 120 | 2024-08-09 |
The identification and functional analysis of CD8+PD-1+CD161+ T cells in hepatocellular carcinoma
2020, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-020-00133-4
PMID:33145436
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研究论文 | 本研究通过构建单细胞免疫环境，分析了肝细胞癌（HCC）中CD8+PD-1+CD161+ T细胞的分布、功能和进化轨迹 | 首次详细描述了CD8+PD-1+CD161+和CD8+PD-1+CD161- T细胞在肿瘤和非肿瘤组织中的差异分布及其免疫活性，为HCC免疫环境的异质性提供了新的见解 | NA | 探索肝细胞癌中CD8+PD-1+CD161+ T细胞的功能和分布，为免疫治疗提供新的靶点 | 肝细胞癌（HCC）中的CD8+PD-1+CD161+ T细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 约20,000,000个免疫细胞来自15对HCC肿瘤和非肿瘤邻近组织及10份血液样本（包括5份HCC和5份健康对照） |