单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Alterations in Chromatin Structure and Function in the Microglia
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.626541
PMID:33553166
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在不同发育阶段和疾病条件下表观遗传机制的变化及其对功能多样性的影响 | 总结了当前关于微胶质细胞表观遗传机制的知识，并讨论了这些知识如何促进疾病治疗策略的发展 | NA | 探讨微胶质细胞表观遗传变化对功能多样性的影响及其在疾病治疗中的应用 | 微胶质细胞的表观遗传机制及其在不同发育阶段和疾病条件下的变化 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因表达谱 | NA |
| 82 | 2024-08-09 |
Susceptibility Factors of Stomach for SARS-CoV-2 and Treatment Implication of Mucosal Protective Agent in COVID-19
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.597967
PMID:33521016
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研究论文 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃对SARS-CoV-2的易感性因素，并探讨黏膜保护剂在COVID-19治疗中的应用 | 首次探讨了胃黏膜对SARS-CoV-2的易感性因素，并评估了黏膜保护剂在阻断SARS-CoV-2从胃到肠道传播中的潜在作用 | 研究样本量相对较小，且未涵盖所有可能的易感性因素 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃的易感性因素 | SARS-CoV-2感染患者及胃黏膜样本 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胃黏膜样本和420例COVID-19患者 |
| 83 | 2024-08-09 |
Dissecting the Invasion-Associated Long Non-coding RNAs Using Single-Cell RNA-Seq Data of Glioblastoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.633455
PMID:33505440
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研究论文 | 本研究通过分析来自四名胶质母细胞瘤患者的3345个单细胞RNA测序数据，识别了与胶质母细胞瘤发展和进展相关的失调基因，包括长非编码RNAs（lncRNAs），并通过共表达网络分析和整合EMT签名、实验验证的侵袭标记及伪时间轨迹分析，确认了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs，并展示了这些lncRNAs在肿瘤细胞侵袭轨迹中的逐渐增加的表达水平。 | 研究仅基于两个数据集的分析，可能需要更多样本和数据集来进一步验证这些发现。 | 理解胶质母细胞瘤细胞侵袭的分子机制，为治疗提供新的见解和潜在靶点。 | 胶质母细胞瘤的单细胞RNA测序数据和相关的lncRNAs。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 共表达网络分析 | RNA测序数据 | 3345个细胞来自四名患者，以及7930个单细胞来自28名胶质母细胞瘤患者 |
| 84 | 2024-08-09 |
The Role of Anti-angiogenesis in the Treatment Landscape of Non-small Cell Lung Cancer - New Combinational Approaches and Strategies of Neovessel Inhibition
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.610903
PMID:33469537
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌（NSCLC）治疗中抗血管生成的作用，探讨了新的联合治疗策略和血管新生抑制方法 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）等先进方法深入表征NSCLC的肿瘤微环境（TME），识别更个性化的抗血管生成抑制新方面 | 抗血管生成疗法在NSCLC患者中仅产生边际临床效益，原因包括高度适应性的肿瘤微环境和对肿瘤血管特征的理解不足 | 总结肿瘤血管生成和相应抗血管生成疗法的当前知识，探讨新的抗血管生成治疗策略和血管抑制方法 | 非小细胞肺癌（NSCLC）及其肿瘤微环境 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 85 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals That Metabolites Produced by Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526 Ameliorate Type 2 Diabetes in GK Rats by Downregulating the Inflammatory Response
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.568805
PMID:33424779
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526产生的代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，发现这些代谢物通过下调炎症反应改善了GK大鼠的2型糖尿病症状 | 首次使用单细胞RNA测序技术探讨BD3526代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，并揭示了代谢物通过调节免疫细胞和DCs中的WNT/β-catenin通路来改善糖尿病的机制 | NA | 研究BD3526代谢物如何通过调节肠道细胞和免疫细胞来改善2型糖尿病 | Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526的代谢物对GK大鼠肠道细胞和免疫细胞的影响 | 代谢综合征 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及GK大鼠的肠道细胞和免疫细胞样本 |
| 86 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Efficiently Predicts Transcription Factor Targets in Plants
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.603302
PMID:33424903
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研究论文 | 本研究首次基于10× Genomics的单细胞RNA测序方法，在稻叶细胞中建立了一个简单的系统来预测转录因子（TF）目标 | 首次在植物中利用单细胞RNA测序技术有效预测转录因子目标，并提供了一种新的应用 | NA | 探索转录因子目标，以研究调控途径 | 稻叶细胞中的转录因子OsNAC78及其目标基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 涉及多个单细胞的转录组 |
| 87 | 2024-08-09 |
The T Cell Receptor Immune Repertoire Protects the Liver From Reconsitution
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.584979
PMID:33391261
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠肝脏内CD45免疫细胞在纤维化发病过程中的转录组，揭示了免疫细胞在肝脏纤维化中的变化及其保护作用 | 发现了与纤维化相关的新的CD8 T和CD4 T细胞亚群，并揭示了T细胞受体（TCR）在纤维化肝脏中的明显下降 | NA | 理解肝脏纤维化发病过程中肝脏内免疫细胞的景观 | 小鼠肝脏内的CD45免疫细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 约10,000个单细胞转录组 |
| 88 | 2024-08-09 |
Six Immune Associated Genes Construct Prognostic Model Evaluate Low-Grade Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.606164
PMID:33408717
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研究论文 | 本文通过分析NCBI Gene Expression Omnibus (GEO)数据库中的数据，筛选出六个与免疫相关的基因，构建了一个预测低级别胶质瘤预后的风险评分模型 | 首次利用六个特定基因构建风险评分模型，用于评估低级别胶质瘤的预后 | NA | 研究如何通过特定基因评估胶质瘤的预后 | 胶质瘤及其相关的肿瘤相关小胶质细胞/巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 脑瘤 | 基因表达分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 包括20个胶质瘤样本和15个对照样本，以及669名患者的生存率数据 |
| 89 | 2024-08-09 |
Comprehensive Integration of Single-Cell Transcriptional Profiling Reveals the Heterogeneities of Non-cardiomyocytes in Healthy and Ischemic Hearts
2020, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2020.615161
PMID:33365332
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研究论文 | 本研究通过整合三个代表性的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集，探讨了在心肌梗死或假手术后3天和7天分离的27,349个非心肌细胞的异质性 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集，揭示了健康和非健康心脏中非心肌细胞的不同动态和功能特性 | NA | 旨在探讨是否可以通过整合多个相似的scRNA-seq数据集，更全面地理解疾病 | 非心肌细胞在健康和心肌缺血心脏中的异质性 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 27,349个非心肌细胞 |
| 90 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomic profiling provides insights into retinal endothelial barrier properties
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33380778
|
研究论文 | 通过分析牛视网膜微血管内皮细胞（RMECs）的单细胞转录组，深入了解视网膜内皮屏障特性 | 开发了一种单细胞转录组学工作流程，并揭示了视网膜微血管屏障中先前未报道的连接蛋白 | NA | 更好地表征视网膜内皮屏障特性 | 牛视网膜微血管内皮细胞（RMECs）的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 单个RMECs |
| 91 | 2024-08-09 |
Identification of Pro-Fibrotic Macrophage Populations by Single-Cell Transcriptomic Analysis in West Highland White Terriers Affected With Canine Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.611749
PMID:33384697
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞群体，以识别与疾病相关的细胞异质性 | 首次在犬类特发性肺纤维化模型中使用单细胞RNA测序技术，识别出具有促纤维化能力的巨噬细胞/单核细胞群体 | 需要进一步研究以理解这些巨噬细胞/单核细胞群体在疾病发病机制中的具体作用 | 识别和分析患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬肺部中的促纤维化巨噬细胞群体 | 患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬的支气管肺泡灌洗液中的巨噬细胞/单核细胞 | 数字病理学 | 犬类疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5只患有特发性肺纤维化的西高地白梗犬和3只健康西高地白梗犬 |
| 92 | 2024-08-09 |
Sc-GPE: A Graph Partitioning-Based Cluster Ensemble Method for Single-Cell
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.604790
PMID:33384718
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于图划分聚类集成的单细胞RNA测序数据分析方法Sc-GPE | Sc-GPE结合了五种基于图划分的单细胞聚类方法，并通过构建加权共识矩阵来区分各方法的重要性 | NA | 开发一种有效的聚类集成策略，用于解决不同单细胞聚类方法结果不一致的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图划分聚类方法 | 数据矩阵 | 12个单细胞RNA测序数据集 |
| 93 | 2024-08-09 |
Redox Regulator GLRX Is Associated With Tumor Immunity in Glioma
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.580934
PMID:33329553
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研究论文 | 本研究旨在探讨谷氧还蛋白在胶质瘤中的转录组水平作用及其临床预后价值 | 发现谷氧还蛋白在恶性胶质瘤中高度富集，并与肿瘤免疫微环境密切相关，可能增强胶质瘤免疫治疗的疗效 | NA | 阐明谷氧还蛋白在胶质瘤中的生物学功能及其临床预后价值 | 谷氧还蛋白在胶质瘤中的作用及其临床预后价值 | 数字病理学 | 脑瘤 | 转录组数据分析，单细胞测序 | NA | 转录组数据，单细胞测序数据 | 1717个胶质瘤样本，6个胶质瘤患者的单细胞测序数据 |
| 94 | 2024-08-09 |
Integrative Analysis Extracts a Core ceRNA Network of the Fetal Hippocampus With Down Syndrome
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.565955
PMID:33329702
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研究论文 | 本研究通过综合分析提取了与唐氏综合症胎儿海马体相关的核心ceRNA网络 | 首次描绘了唐氏综合症中circRNAs的图谱，并有效整合了ceRNA调控与单细胞RNA测序数据 | NA | 探究唐氏综合症神经病理学的分子机制或治疗靶点 | 唐氏综合症胎儿海马体中的circRNAs、miRNAs和mRNAs | 数字病理学 | 唐氏综合症 | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 唐氏综合症患者8例，对照组6例 |
| 95 | 2024-08-09 |
EC-PGMGR: Ensemble Clustering Based on Probability Graphical Model With Graph Regularization for Single-Cell RNA-seq Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.572242
PMID:33329710
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研究论文 | 本文提出了一种基于概率图模型和图正则化的集成聚类算法EC-PGMGR，用于单细胞RNA测序数据 | EC-PGMGR算法通过概率图模型自动确定聚类数目，并通过添加正则化项减少弱基础聚类结果的影响，实现了自调节权重组合的预学习过程 | 集成聚类方法的结果依赖于基础聚类结果，且集成系统通常不具有自调节能力 | 设计一种鲁棒的无监督聚类方法，以提高聚类准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率图模型 | RNA-seq数据 | 涉及7个数据集，单细胞数量从822到5,132 |
| 96 | 2024-08-09 |
Single-cell rna seq analysis identifies the biomarkers and differentiation of chondrocyte in human osteoarthritis
2020, American journal of translational research
IF:1.7Q4
PMID:33312370
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术识别骨关节炎中软骨细胞的生物标志物及其分化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了骨关节炎中不同类型软骨细胞的表达谱，并预测了与软骨细胞增殖和分化紧密相关的关键基因 | NA | 识别骨关节炎中软骨细胞的潜在标志物并探索不同类型软骨细胞在骨关节炎中的功能 | 骨关节炎中的软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 480个软骨细胞样本 |
| 97 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Glioblastoma Reveals Central Nervous System Susceptibility to SARS-CoV-2
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.566599
PMID:33312949
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析探讨了胶质母细胞瘤对SARS-CoV-2感染的敏感性 | 揭示了SARS-CoV-2神经侵袭的机制，并指出了神经系统细胞对SARS-CoV-2的易感性 | NA | 探讨中枢神经系统对SARS-CoV-2感染的敏感性 | 胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 涉及胶质母细胞瘤和正常脑组织样本 |
| 98 | 2024-08-09 |
Female reproductive tract has low concentration of SARS-CoV2 receptors
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243959
PMID:33315943
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研究论文 | 研究调查了女性生殖器官中SARS-CoV2受体的表达情况 | 首次通过单细胞测序数据分析了女性生殖组织中SARS-CoV2受体的表达，发现这些组织中受体表达较低 | 研究仅限于分析已有的单细胞测序数据，未进行新的实验验证 | 探讨SARS-CoV2在女性生殖系统中的感染风险 | 女性生殖器官如子宫、子宫肌层、卵巢、输卵管和乳腺 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 涉及多个女性生殖器官的单细胞测序数据 |
| 99 | 2024-08-09 |
Role of Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity and Interactions in Vessel Wall Inflammation
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.599415
PMID:33324416
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研究论文 | 本文探讨了血管平滑肌细胞的可塑性及其在血管壁炎症中的相互作用 | 引入了新技术如杂交接近连接分析、CreER-loxP系统的细胞命运追踪以及具有空间分辨率的单细胞测序技术，以深化对这些细胞复杂生物学的理解 | NA | 旨在进一步阐明动脉粥样硬化疾病的发病机制，以发现新的治疗方法 | 血管平滑肌细胞及其在血管壁炎症中的作用 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | 杂交接近连接分析、CreER-loxP系统的细胞命运追踪、单细胞测序技术 | NA | 细胞 | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
DSAVE: Detection of misclassified cells in single-cell RNA-Seq data
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243360
PMID:33270740
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研究论文 | 本文开发了一种名为DSAVE的方法，用于评估单细胞转录组聚类的纯度并识别错误分类的细胞 | DSAVE方法利用下采样消除采样噪声差异，并使用基于对数似然度的度量来帮助识别错误分类的细胞 | NA | 评估单细胞转录组聚类的纯度并识别错误分类的细胞 | 单细胞RNA测序数据中的错误分类细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |