单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-07 |
A cell atlas of the adult Drosophila midgut
2020-01-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1916820117
PMID:31915294
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对成年果蝇中肠上皮细胞的转录组进行了表征，并识别出22个不同的细胞群 | 本研究通过无偏倚的方法恢复了大多数已知的肠道干细胞/成肠细胞和内分泌细胞标记，并揭示了肠道干细胞生物学、细胞类型特异性细胞器特征、新转录因子在祖细胞中的作用以及沿肠道区域的变异 | NA | 旨在提供一个全面的资源，用于解决中肠上皮中基因的功能 | 成年果蝇中肠上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 22个不同的细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-07 |
Therapy-induced mutations drive the genomic landscape of relapsed acute lymphoblastic leukemia
2020-01-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019002220
PMID:31697823
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研究论文 | 研究急性淋巴细胞白血病（ALL）复发机制，通过全基因组测序和超深度测序分析复发特异性体细胞变异 | 发现了两种新的复发特异性突变特征，其中一种与硫嘌呤治疗有关，这些特征在非ALL的复发样本和泛癌诊断样本中未见 | 研究主要集中在特定基因和突变特征上，可能未涵盖所有影响ALL复发的因素 | 探究急性淋巴细胞白血病复发机制及其与治疗诱导突变的关系 | 急性淋巴细胞白血病患者的诊断-复发-胚系三联体和连续样本 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 全基因组测序，超深度测序 | 数学模型 | 基因组数据 | 103个诊断-复发-胚系三联体和16名患者的208个连续样本 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of the Intestinal Epithelium
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0747-3_8
PMID:32705639
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review | 本文综述了单细胞转录组学技术在研究小鼠小肠上皮细胞中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术使得能够在细胞水平上研究异质性生物系统 | NA | 探讨单细胞转录组学在小鼠小肠上皮细胞研究中的基本原理和实验设计 | 小鼠小肠上皮细胞 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of transcriptome and DNA methylome in human oocyte maturation
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0241698
PMID:33152014
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组和DNA甲基组数据分析，研究了人类卵母细胞成熟过程中基因调控的机制 | 首次探讨了非CpG甲基化在卵母细胞成熟中的潜在调控作用，并发现DNMT3B基因在成熟卵母细胞中的上调可能与非CpG甲基化增加有关 | NA | 深入理解人类卵母细胞成熟过程中的基因调控机制，并促进体外成熟技术的发展 | 人类卵母细胞在不同成熟阶段的单细胞转录组和甲基组数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析，单细胞甲基组分析 | NA | 转录组数据，甲基组数据 | 1,077个基因在成熟卵母细胞中上调 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-08 |
Profiling chromatin regulatory landscape: insights into the development of ChIP-seq and ATAC-seq
2020, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-020-00009-w
PMID:34765994
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综述 | 本文综述了染色质调控景观的研究进展，特别是ChIP-seq和ATAC-seq技术的发展及其在科学研究中的应用 | 介绍了从低通量到高通量、从批量样本到单细胞层面的表观基因组测序技术的演变 | NA | 探讨表观基因组测序技术的发展及其在科学研究中的应用 | 染色质调控景观及其在疾病过程和胚胎发育中的作用 | NA | NA | ChIP-seq, ATAC-seq | NA | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-09 |
Harmonic Alignment
2020, Proceedings of the ... SIAM International Conference on Data Mining. SIAM International Conference on Data Mining
DOI:10.1137/1.9781611976236.36
PMID:33723496
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的框架，通过数据内在几何的对齐来合并不同数据集 | 该框架不假设数据集之间的点对点对应关系，而是依赖于数据特征之间（可能是未知的）子集的对应关系，利用这种假设构建数据之间的等距对齐 | NA | 旨在通过数据内在几何的对齐来合并不同数据集，特别是用于生物学应用中，如单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据的融合 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 扩散算子 | NA | 测序数据 | 同一细胞群体的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-09 |
Integrated RNA Sequencing Reveals Epigenetic Impacts of Diesel Particulate Matter Exposure in Human Cerebral Organoids
2020, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000513536
PMID:33657557
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研究论文 | 本研究通过综合RNA测序揭示了柴油颗粒物暴露对人脑类器官的表观遗传影响 | 首次结合单细胞和直接转录组学方法，研究柴油颗粒物暴露对人类诱导多能干细胞衍生的脑类器官的毒基因组效应 | NA | 探讨柴油颗粒物暴露对胎儿大脑发育的影响及其在自闭症谱系障碍中的潜在作用 | 人脑类器官 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Expansion of Cytotoxic CD4+ T Lymphocytes and a Landscape of Immune Cells in Primary Sjögren's Syndrome
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.594658
PMID:33603736
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞，揭示了疾病特异性的免疫细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 首次发现原发性干燥综合征患者中细胞毒性CD4+ T淋巴细胞的显著扩张，并识别了两个新的细胞亚群CD4+ CTLs和CD4+ TRAV13-2+ T细胞 | 研究样本量较小，仅包括五名患者和五名健康对照者 | 探索原发性干燥综合征的细胞和分子发病机制 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 57,288个外周血单个核细胞，来自五名原发性干燥综合征患者和五名健康对照者 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-09 |
Development of a Prognostic Signature Based on Single-Cell RNA Sequencing Data of Immune Cells in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.615680
PMID:33613623
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了肝内胆管癌中的免疫细胞，以识别与肿瘤进展相关的生物标志物，并建立了一个与预后相关的基因签名 | 首次基于单细胞RNA测序数据建立了肝内胆管癌的预后相关基因签名，该签名反映了肿瘤微环境的免疫状态 | NA | 探讨肝内胆管癌中单细胞RNA测序数据中差异表达基因的预后价值 | 肝内胆管癌中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 33,991个细胞样本，包括17,090个肝内胆管癌细胞样本和16,901个肝内胆管癌邻近组织细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-09 |
Progress and Clinical Application of Single-Cell Transcriptional Sequencing Technology in Cancer Research
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.593085
PMID:33614479
|
研究论文 | 本文总结了单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）在癌症研究中的最新进展及其对临床治疗的指导意义 | scRNA-seq在肿瘤异质性、肿瘤进化、转移扩散、化疗耐药性发展以及肿瘤微环境与免疫系统关系方面取得了突破性发现 | NA | 探讨scRNA-seq技术在癌症研究中的应用及其对临床治疗的指导作用 | 癌症细胞及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis Reveals Characterization of Infiltrating T Cells in Moderately Differentiated Colorectal Cancer
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.620196
PMID:33584715
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序数据分析中度分化结直肠癌中的肿瘤浸润T细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了中度分化结直肠癌中肿瘤浸润T细胞的特征及其在结肠癌和直肠癌中的差异 | NA | 研究中度分化结直肠癌中肿瘤浸润T细胞的特征 | 中度分化结直肠癌中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 肿瘤组织中1632个T细胞和外周血中1252个T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Intestinal Stem Cells and Immune Cell Relationships: Potential Therapeutic Targets for Inflammatory Bowel Diseases
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.623691
PMID:33584726
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研究论文 | 本文探讨了肠道干细胞与免疫细胞之间的关系，并提出这些关系可能是治疗炎症性肠病的新疗法 | 提出了将生物制剂与肠道干细胞移植结合的新疗法，以改善炎症性肠病患者的临床症状和疾病复发情况 | NA | 研究肠道干细胞与免疫细胞的相互作用，探索治疗炎症性肠病的新策略 | 肠道干细胞、分化上皮细胞和肠道驻留免疫细胞 | NA | 炎症性肠病 | 肠道类器官培养和单细胞RNA测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-09 |
Construction of Bone Metastasis-Specific Regulation Network Based on Prognostic Stemness-Related Signatures in Breast Invasive Carcinoma
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.613333
PMID:33585235
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研究论文 | 本研究基于预测性干细胞相关特征（PSRSs）构建了乳腺癌骨转移特异性调控网络 | 首次基于PSRSs构建了乳腺癌骨转移特异性调控网络，并发现CD248是关键的PSRS，受MAF正向调控并通过顶端连接途径影响骨转移 | NA | 构建乳腺癌骨转移特异性调控网络，并探索其潜在的治疗策略 | 乳腺癌骨转移的调控网络及其治疗策略 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 1080个原发性乳腺癌样本（1048个无骨转移，32个有骨转移） | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-09 |
Alterations in Chromatin Structure and Function in the Microglia
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.626541
PMID:33553166
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综述 | 本文综述了微胶质细胞在不同发育阶段和疾病条件下表观遗传机制的变化及其对功能多样性的影响 | 总结了当前关于微胶质细胞表观遗传机制的知识，并讨论了这些知识如何促进疾病治疗策略的发展 | NA | 探讨微胶质细胞表观遗传变化对功能多样性的影响及其在疾病治疗中的应用 | 微胶质细胞的表观遗传机制及其在不同发育阶段和疾病条件下的变化 | NA | NA | RNA-seq | NA | 基因表达谱 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-09 |
Susceptibility Factors of Stomach for SARS-CoV-2 and Treatment Implication of Mucosal Protective Agent in COVID-19
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.597967
PMID:33521016
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研究论文 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃对SARS-CoV-2的易感性因素，并探讨黏膜保护剂在COVID-19治疗中的应用 | 首次探讨了胃黏膜对SARS-CoV-2的易感性因素，并评估了黏膜保护剂在阻断SARS-CoV-2从胃到肠道传播中的潜在作用 | 研究样本量相对较小，且未涵盖所有可能的易感性因素 | 研究SARS-CoV-2感染患者的胃肠道症状及胃的易感性因素 | SARS-CoV-2感染患者及胃黏膜样本 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12个胃黏膜样本和420例COVID-19患者 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
Dissecting the Invasion-Associated Long Non-coding RNAs Using Single-Cell RNA-Seq Data of Glioblastoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.633455
PMID:33505440
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研究论文 | 本研究通过分析来自四名胶质母细胞瘤患者的3345个单细胞RNA测序数据，识别了与胶质母细胞瘤发展和进展相关的失调基因，包括长非编码RNAs（lncRNAs），并通过共表达网络分析和整合EMT签名、实验验证的侵袭标记及伪时间轨迹分析，确认了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了与胶质母细胞瘤侵袭相关的lncRNAs，并展示了这些lncRNAs在肿瘤细胞侵袭轨迹中的逐渐增加的表达水平。 | 研究仅基于两个数据集的分析，可能需要更多样本和数据集来进一步验证这些发现。 | 理解胶质母细胞瘤细胞侵袭的分子机制，为治疗提供新的见解和潜在靶点。 | 胶质母细胞瘤的单细胞RNA测序数据和相关的lncRNAs。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 共表达网络分析 | RNA测序数据 | 3345个细胞来自四名患者，以及7930个单细胞来自28名胶质母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-09 |
The Role of Anti-angiogenesis in the Treatment Landscape of Non-small Cell Lung Cancer - New Combinational Approaches and Strategies of Neovessel Inhibition
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.610903
PMID:33469537
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综述 | 本文综述了非小细胞肺癌（NSCLC）治疗中抗血管生成的作用，探讨了新的联合治疗策略和血管新生抑制方法 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-Seq）等先进方法深入表征NSCLC的肿瘤微环境（TME），识别更个性化的抗血管生成抑制新方面 | 抗血管生成疗法在NSCLC患者中仅产生边际临床效益，原因包括高度适应性的肿瘤微环境和对肿瘤血管特征的理解不足 | 总结肿瘤血管生成和相应抗血管生成疗法的当前知识，探讨新的抗血管生成治疗策略和血管抑制方法 | 非小细胞肺癌（NSCLC）及其肿瘤微环境 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals That Metabolites Produced by Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526 Ameliorate Type 2 Diabetes in GK Rats by Downregulating the Inflammatory Response
2020, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2020.568805
PMID:33424779
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序研究了Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526产生的代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，发现这些代谢物通过下调炎症反应改善了GK大鼠的2型糖尿病症状 | 首次使用单细胞RNA测序技术探讨BD3526代谢物对GK大鼠肠道细胞组成的影响，并揭示了代谢物通过调节免疫细胞和DCs中的WNT/β-catenin通路来改善糖尿病的机制 | NA | 研究BD3526代谢物如何通过调节肠道细胞和免疫细胞来改善2型糖尿病 | Paenibacillus bovis sp. nov. BD3526的代谢物对GK大鼠肠道细胞和免疫细胞的影响 | 代谢综合征 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及GK大鼠的肠道细胞和免疫细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Efficiently Predicts Transcription Factor Targets in Plants
2020, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2020.603302
PMID:33424903
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研究论文 | 本研究首次基于10× Genomics的单细胞RNA测序方法，在稻叶细胞中建立了一个简单的系统来预测转录因子（TF）目标 | 首次在植物中利用单细胞RNA测序技术有效预测转录因子目标，并提供了一种新的应用 | NA | 探索转录因子目标，以研究调控途径 | 稻叶细胞中的转录因子OsNAC78及其目标基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 表达谱 | 涉及多个单细胞的转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
The T Cell Receptor Immune Repertoire Protects the Liver From Reconsitution
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.584979
PMID:33391261
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠肝脏内CD45免疫细胞在纤维化发病过程中的转录组，揭示了免疫细胞在肝脏纤维化中的变化及其保护作用 | 发现了与纤维化相关的新的CD8 T和CD4 T细胞亚群，并揭示了T细胞受体（TCR）在纤维化肝脏中的明显下降 | NA | 理解肝脏纤维化发病过程中肝脏内免疫细胞的景观 | 小鼠肝脏内的CD45免疫细胞 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 约10,000个单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |