单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Method for RNA extraction and transcriptomic analysis of single fungal spores
2020, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2019.12.002
PMID:31908984
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研究论文 | 本文描述了一种从单个真菌孢子中提取和扩增转录本的方法，并应用于单细胞转录组学研究 | 该方法首次实现了对微生物孢子的单细胞转录组分析，填补了该领域的空白 | 该方法目前仅适用于真菌孢子，尚未在其他微生物细胞中进行测试 | 开发一种适用于单个真菌孢子转录组分析的新方法 | 真菌孢子 | NA | NA | 转录组分析 | NA | 转录本 | 单个真菌孢子 |
| 62 | 2024-08-07 |
Chemical Cocktail Induces Hematopoietic Reprogramming and Expands Hematopoietic Stem/Progenitor Cells
2020-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201901785
PMID:31921559
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研究论文 | 本文报道了通过化学混合物处理，无需引入外源基因即可将小鼠成纤维细胞重编程为造血细胞，并增强造血干细胞/祖细胞（HSPCs）的体外增殖能力 | 首次展示了通过化学混合物实现造血重编程，并促进HSPCs的体外增殖，为获取HSPCs提供了一种新策略 | NA | 探索通过化学混合物实现细胞重编程和HSPCs扩增的方法 | 小鼠成纤维细胞和造血干细胞/祖细胞 | NA | NA | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Clonally expanded CD8 T cells patrol the cerebrospinal fluid in Alzheimer's disease
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1895-7
PMID:31915375
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研究论文 | 本研究通过综合分析多个队列，揭示了阿尔茨海默病中血液和脑脊液的适应性免疫变化，并发现了克隆扩增的CD8 T细胞在脑脊液中的存在 | 首次发现阿尔茨海默病患者脑脊液中存在克隆扩增的CD8 T细胞，并证实这些细胞对Epstein-Barr病毒抗原具有特异性 | NA | 探究阿尔茨海默病中适应性免疫反应的贡献 | 阿尔茨海默病患者的外周血单个核细胞和脑脊液中的CD8 T细胞 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | 机器学习 | 细胞 | 多个队列的患者样本 |
| 64 | 2024-08-07 |
Interleukin 27 Protects From Gastric Atrophy and Metaplasia During Chronic Autoimmune Gastritis
2020, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2020.04.014
PMID:32376420
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研究论文 | 研究白细胞介素27（IL27）在自身免疫性胃炎小鼠模型中对胃萎缩、增生和化生的作用 | 发现IL27通过抑制CD4+ T细胞介导的炎症来抑制胃炎和化生 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步在人类中验证 | 探讨免疫细胞和细胞因子如何调节慢性炎症与胃癌发生之间的关系 | 自身免疫性胃炎小鼠模型中的胃萎缩、增生和化生 | NA | 胃炎 | 免疫荧光、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | TxA23小鼠（对照组）和TxA23xEbi3-/-小鼠 |
| 65 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis Uncovers Distinct Functional Human NKT Cell Sub-Populations in Peripheral Blood
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00384
PMID:32528956
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人外周血中的NKT细胞，揭示了不同的功能性NKT细胞亚群 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了多个先前未被识别的NKT细胞亚群及其潜在的功能特异性 | 研究中使用的样本数量有限，可能影响对NKT细胞亚群的全面理解 | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人NKT细胞的功能性亚群，以推动针对特定NKT亚群的个性化治疗 | 人外周血中的NKT细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 超过4000个未刺激和7000个刺激的人外周血NKT细胞 |
| 66 | 2024-08-07 |
A cell atlas of the adult Drosophila midgut
2020-01-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1916820117
PMID:31915294
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术对成年果蝇中肠上皮细胞的转录组进行了表征，并识别出22个不同的细胞群 | 本研究通过无偏倚的方法恢复了大多数已知的肠道干细胞/成肠细胞和内分泌细胞标记，并揭示了肠道干细胞生物学、细胞类型特异性细胞器特征、新转录因子在祖细胞中的作用以及沿肠道区域的变异 | NA | 旨在提供一个全面的资源，用于解决中肠上皮中基因的功能 | 成年果蝇中肠上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 22个不同的细胞群 |
| 67 | 2024-08-07 |
Loss of Kat2a enhances transcriptional noise and depletes acute myeloid leukemia stem-like cells
2020-01-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.51754
PMID:31985402
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研究论文 | 研究探讨了Kat2a基因在急性髓系白血病（AML）中的作用，发现Kat2a的缺失增强了转录噪音并耗尽了AML干细胞样细胞 | 首次证明了Kat2a在AML中的遗传脆弱性，并通过染色质分析和单细胞转录组学揭示了Kat2a对AML干细胞样细胞的维持作用 | 研究基于条件性敲除小鼠模型，可能需要进一步的人体细胞实验验证 | 探讨Kat2a在AML中的作用及其对AML干细胞样细胞的影响 | 急性髓系白血病及其干细胞样细胞 | NA | 急性髓系白血病 | 染色质分析，单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 条件性敲除小鼠 |
| 68 | 2024-08-07 |
Therapy-induced mutations drive the genomic landscape of relapsed acute lymphoblastic leukemia
2020-01-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019002220
PMID:31697823
|
研究论文 | 研究急性淋巴细胞白血病（ALL）复发机制，通过全基因组测序和超深度测序分析复发特异性体细胞变异 | 发现了两种新的复发特异性突变特征，其中一种与硫嘌呤治疗有关，这些特征在非ALL的复发样本和泛癌诊断样本中未见 | 研究主要集中在特定基因和突变特征上，可能未涵盖所有影响ALL复发的因素 | 探究急性淋巴细胞白血病复发机制及其与治疗诱导突变的关系 | 急性淋巴细胞白血病患者的诊断-复发-胚系三联体和连续样本 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 全基因组测序，超深度测序 | 数学模型 | 基因组数据 | 103个诊断-复发-胚系三联体和16名患者的208个连续样本 |
| 69 | 2024-08-07 |
Nuclear MYH9-induced CTNNB1 transcription, targeted by staurosporin, promotes gastric cancer cell anoikis resistance and metastasis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.46001
PMID:32685004
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研究论文 | 本文通过多种技术手段研究了MYH9在胃癌细胞中的表达及其对细胞凋亡抵抗和转移的影响，并探讨了staurosporin对其的抑制作用。 | 首次揭示了核定位的MYH9通过促进CTNNB1转录来增强胃癌细胞的凋亡抵抗和转移能力，并发现staurosporin可以作为潜在的治疗药物。 | NA | 探讨MYH9在胃癌转移中的作用及其潜在的治疗策略。 | 胃癌细胞及胃癌患者的转移组织。 | 数字病理学 | 胃癌 | 2-DIGE, MALDI-TOF/TOF MS, 单细胞转录组, 免疫荧光, 免疫透射电子显微镜, 染色质分离, 共免疫沉淀, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告, 琼脂糖-寡核苷酸拉下, 流式细胞术, 细胞凋亡检测 | NA | 蛋白质, 转录组 | 包括正常胃黏膜、原发性胃癌及腹膜转移组织，以及胃癌细胞系和裸鼠模型。 |
| 70 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of the Intestinal Epithelium
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0747-3_8
PMID:32705639
|
review | 本文综述了单细胞转录组学技术在研究小鼠小肠上皮细胞中的应用 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术使得能够在细胞水平上研究异质性生物系统 | NA | 探讨单细胞转录组学在小鼠小肠上皮细胞研究中的基本原理和实验设计 | 小鼠小肠上皮细胞 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | text | NA |
| 71 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of transcriptome and DNA methylome in human oocyte maturation
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0241698
PMID:33152014
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组和DNA甲基组数据分析，研究了人类卵母细胞成熟过程中基因调控的机制 | 首次探讨了非CpG甲基化在卵母细胞成熟中的潜在调控作用，并发现DNMT3B基因在成熟卵母细胞中的上调可能与非CpG甲基化增加有关 | NA | 深入理解人类卵母细胞成熟过程中的基因调控机制，并促进体外成熟技术的发展 | 人类卵母细胞在不同成熟阶段的单细胞转录组和甲基组数据 | NA | NA | 单细胞转录组分析，单细胞甲基组分析 | NA | 转录组数据，甲基组数据 | 1,077个基因在成熟卵母细胞中上调 |
| 72 | 2024-08-08 |
Profiling chromatin regulatory landscape: insights into the development of ChIP-seq and ATAC-seq
2020, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-020-00009-w
PMID:34765994
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综述 | 本文综述了染色质调控景观的研究进展，特别是ChIP-seq和ATAC-seq技术的发展及其在科学研究中的应用 | 介绍了从低通量到高通量、从批量样本到单细胞层面的表观基因组测序技术的演变 | NA | 探讨表观基因组测序技术的发展及其在科学研究中的应用 | 染色质调控景观及其在疾病过程和胚胎发育中的作用 | NA | NA | ChIP-seq, ATAC-seq | NA | 序列数据 | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
Harmonic Alignment
2020, Proceedings of the ... SIAM International Conference on Data Mining. SIAM International Conference on Data Mining
DOI:10.1137/1.9781611976236.36
PMID:33723496
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研究论文 | 本文提出了一种新颖的框架，通过数据内在几何的对齐来合并不同数据集 | 该框架不假设数据集之间的点对点对应关系，而是依赖于数据特征之间（可能是未知的）子集的对应关系，利用这种假设构建数据之间的等距对齐 | NA | 旨在通过数据内在几何的对齐来合并不同数据集，特别是用于生物学应用中，如单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据的融合 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 扩散算子 | NA | 测序数据 | 同一细胞群体的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 |
| 74 | 2024-08-09 |
Integrated RNA Sequencing Reveals Epigenetic Impacts of Diesel Particulate Matter Exposure in Human Cerebral Organoids
2020, Developmental neuroscience
IF:2.3Q3
DOI:10.1159/000513536
PMID:33657557
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研究论文 | 本研究通过综合RNA测序揭示了柴油颗粒物暴露对人脑类器官的表观遗传影响 | 首次结合单细胞和直接转录组学方法，研究柴油颗粒物暴露对人类诱导多能干细胞衍生的脑类器官的毒基因组效应 | NA | 探讨柴油颗粒物暴露对胎儿大脑发育的影响及其在自闭症谱系障碍中的潜在作用 | 人脑类器官 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Expansion of Cytotoxic CD4+ T Lymphocytes and a Landscape of Immune Cells in Primary Sjögren's Syndrome
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.594658
PMID:33603736
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞，揭示了疾病特异性的免疫细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 首次发现原发性干燥综合征患者中细胞毒性CD4+ T淋巴细胞的显著扩张，并识别了两个新的细胞亚群CD4+ CTLs和CD4+ TRAV13-2+ T细胞 | 研究样本量较小，仅包括五名患者和五名健康对照者 | 探索原发性干燥综合征的细胞和分子发病机制 | 原发性干燥综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 57,288个外周血单个核细胞，来自五名原发性干燥综合征患者和五名健康对照者 |
| 76 | 2024-08-09 |
Development of a Prognostic Signature Based on Single-Cell RNA Sequencing Data of Immune Cells in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.615680
PMID:33613623
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了肝内胆管癌中的免疫细胞，以识别与肿瘤进展相关的生物标志物，并建立了一个与预后相关的基因签名 | 首次基于单细胞RNA测序数据建立了肝内胆管癌的预后相关基因签名，该签名反映了肿瘤微环境的免疫状态 | NA | 探讨肝内胆管癌中单细胞RNA测序数据中差异表达基因的预后价值 | 肝内胆管癌中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 33,991个细胞样本，包括17,090个肝内胆管癌细胞样本和16,901个肝内胆管癌邻近组织细胞样本 |
| 77 | 2024-08-09 |
Progress and Clinical Application of Single-Cell Transcriptional Sequencing Technology in Cancer Research
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.593085
PMID:33614479
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研究论文 | 本文总结了单细胞转录组测序技术（scRNA-seq）在癌症研究中的最新进展及其对临床治疗的指导意义 | scRNA-seq在肿瘤异质性、肿瘤进化、转移扩散、化疗耐药性发展以及肿瘤微环境与免疫系统关系方面取得了突破性发现 | NA | 探讨scRNA-seq技术在癌症研究中的应用及其对临床治疗的指导作用 | 癌症细胞及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis Reveals Characterization of Infiltrating T Cells in Moderately Differentiated Colorectal Cancer
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.620196
PMID:33584715
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研究论文 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序数据分析中度分化结直肠癌中的肿瘤浸润T细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了中度分化结直肠癌中肿瘤浸润T细胞的特征及其在结肠癌和直肠癌中的差异 | NA | 研究中度分化结直肠癌中肿瘤浸润T细胞的特征 | 中度分化结直肠癌中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 肿瘤组织中1632个T细胞和外周血中1252个T细胞 |
| 79 | 2024-08-09 |
Intestinal Stem Cells and Immune Cell Relationships: Potential Therapeutic Targets for Inflammatory Bowel Diseases
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.623691
PMID:33584726
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研究论文 | 本文探讨了肠道干细胞与免疫细胞之间的关系，并提出这些关系可能是治疗炎症性肠病的新疗法 | 提出了将生物制剂与肠道干细胞移植结合的新疗法，以改善炎症性肠病患者的临床症状和疾病复发情况 | NA | 研究肠道干细胞与免疫细胞的相互作用，探索治疗炎症性肠病的新策略 | 肠道干细胞、分化上皮细胞和肠道驻留免疫细胞 | NA | 炎症性肠病 | 肠道类器官培养和单细胞RNA测序技术 | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Construction of Bone Metastasis-Specific Regulation Network Based on Prognostic Stemness-Related Signatures in Breast Invasive Carcinoma
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.613333
PMID:33585235
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研究论文 | 本研究基于预测性干细胞相关特征（PSRSs）构建了乳腺癌骨转移特异性调控网络 | 首次基于PSRSs构建了乳腺癌骨转移特异性调控网络，并发现CD248是关键的PSRS，受MAF正向调控并通过顶端连接途径影响骨转移 | NA | 构建乳腺癌骨转移特异性调控网络，并探索其潜在的治疗策略 | 乳腺癌骨转移的调控网络及其治疗策略 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 1080个原发性乳腺癌样本（1048个无骨转移，32个有骨转移） |