单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-09 |
Probabilistic cell typing enables fine mapping of closely related cell types in situ
2020-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0631-4
PMID:31740815
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研究论文 | 本文介绍了一种名为pciSeq的方法，通过结合单细胞RNA测序和原位测序技术，实现了对紧密相关细胞类型的精细空间映射。 | pciSeq方法利用先前的scRNA-seq分类结果，通过多重原位RNA检测技术来识别细胞类型，为理解组织中细胞类型的空间组织提供了一种新方法。 | NA | 开发一种新的方法来识别和映射紧密相关细胞类型的空间组织。 | 小鼠海马区CA1的抑制性神经元及其层状组织。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 原位测序 | NA | RNA | 小鼠海马区CA1的抑制性神经元 |
| 262 | 2024-08-09 |
Enteroendocrine Progenitor Cell-Enriched miR-7 Regulates Intestinal Epithelial Proliferation in an Xiap-Dependent Manner
2020, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2019.11.001
PMID:31756561
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研究论文 | 研究探讨了肠内分泌细胞（EEC）前体细胞中富集的miR-7如何通过Xiap依赖的方式调节肠道上皮细胞增殖 | 首次证明EEC前体细胞中富集的miR-7受饮食扰动的影响，并通过完整的Xiap和Egfr信号通路调节肠道类器官的生长 | NA | 探究肠内分泌细胞前体细胞在肠道上皮生长和更新中的作用机制 | 肠内分泌细胞（EEC）前体细胞及其miR-7的调控作用 | NA | NA | 无偏序列分析、单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 使用了八种不同的老鼠模型和分类方法 |
| 263 | 2024-08-09 |
CancerTracer: a curated database for intrapatient tumor heterogeneity
2020-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz1061
PMID:31701131
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研究论文 | 介绍了一个名为CancerTracer的手动整理数据库，用于追踪和描述个体患者肿瘤生长的进化轨迹 | CancerTracer数据库提供了多区域和单细胞测序数据，帮助研究者识别肿瘤内的共同驱动事件和异质性体细胞事件 | NA | 旨在通过分析肿瘤的克隆组成及其在疾病进展和治疗中的演变，为药物设计确定精确的治疗靶点 | 肿瘤样本及其在个体患者中的进化轨迹 | 数字病理学 | NA | 多区域和单细胞测序 | NA | 数据 | 收集了来自1548名患者的6000多个肿瘤样本，涵盖45种不同类型的癌症 |
| 264 | 2024-08-09 |
GP130 signaling and the control of naïve pluripotency in humans, monkeys, and pigs
2020-01-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2019.111712
PMID:31697928
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综述 | 本文综述了LIF/GP130/JAK/STAT3信号通路在支持人类、猴子和猪的多能干细胞（PSCs）的原始状态多能性中的作用 | 强调了LIF/GP130/JAK/STAT3信号在将传统的人类和猴子PSCs重编程为类似原始多能性中的作用 | NA | 探讨LIF/GP130/JAK/STAT3通路在非啮齿类物种中调控原始多能性的作用 | 人类、猴子和猪的多能干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 人类和猴子胚胎中的多能细胞 |
| 265 | 2024-08-09 |
Melatonin promotes the development of immature oocytes from the COH cycle into healthy offspring by protecting mitochondrial function
2020-Jan, Journal of pineal research
IF:8.3Q1
DOI:10.1111/jpi.12621
PMID:31714635
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研究论文 | 研究探讨了褪黑素（MT）通过保护线粒体功能促进从控制性卵巢过度刺激（COH）周期中获取的不成熟卵母细胞发育为健康后代的效果 | 首次详细探讨了褪黑素在人类卵母细胞发育中的有益效果，特别是在提高优质囊胚形成率和降低非整倍体率方面 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定的实验条件和临床试验 | 研究褪黑素在人类卵母细胞发育中的作用及其对线粒体功能的保护效果 | 从COH周期中获取的不成熟卵母细胞及其发育为健康后代的过程 | 生殖医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 193个不成熟卵母细胞，分为两组：MT组（105个）和非MT组（88个） |
| 266 | 2024-08-09 |
TM3'seq: A Tagmentation-Mediated 3' Sequencing Approach for Improving Scalability of RNAseq Experiments
2020-01-07, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1534/g3.119.400821
PMID:31676507
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TM3'seq的新型3'富集文库制备协议，该协议使用Tn5转座酶并保留每个步骤中的样本身份，旨在提高RNA-seq实验的可扩展性 | TM3'seq协议能够在6小时内处理96个样本，且只需3小时的直接操作时间，成本仅为每样本1.5美元，显著降低了RNA-seq实验的成本和时间 | NA | 开发一种成本和时间效率高的RNA-seq文库制备方法，以促进大规模RNA-seq实验的普及 | 人类和其他RNA样本的转录组 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | 多种人类和其他RNA样本 |
| 267 | 2024-08-09 |
Developmental and cellular age direct conversion of CD4+ T cells into RORγ+ or Helios+ colon Treg cells
2020-01-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20190428
PMID:31685531
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研究论文 | 研究探讨了CD4+ T细胞向RORγ+或Helios+结肠Treg细胞的定向分化 | 首次揭示了CD4+ Tconv细胞能够根据细胞或个体的年龄差异分化为RORγ+和Helios+ pTreg细胞，为结肠Treg细胞的生理适应性提供了新见解 | NA | 阐明结肠中RORγ+和Helios+ Treg细胞的起源和关系 | CD4+ T细胞、RORγ+和Helios+ Treg细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用单个结肠化和小鼠模型进行研究 |
| 268 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Yes-Associated Protein 1-Dependent Hepatic Mesothelial Progenitors in Fibrolamellar Carcinoma
2020-01, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2019.09.018
PMID:31669305
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了来源于患者的纤维板层癌异种移植模型，并识别了治疗靶点 | 首次发现Yes相关蛋白1依赖的肝间皮祖细胞在纤维板层癌中的作用，并证实抑制YAP1可显著减少细胞生长和迁移 | NA | 探索纤维板层癌的治疗靶点 | 纤维板层癌细胞及其治疗靶点 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来源于患者的纤维板层癌异种移植模型 |
| 269 | 2024-08-09 |
Conversion of human cardiac progenitor cells into cardiac pacemaker-like cells
2020-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2019.09.015
PMID:31678351
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研究论文 | 本研究通过筛选策略测试了将人类心脏前体细胞（CPCs）转化为类似起搏器细胞的再编程因子 | 发现SHOX2、HCN2和TBX5（SHT5）组合的转录因子在驱动CPCs转化为类似起搏器细胞方面比其他组合和单一转录因子更有效 | NA | 探索将人类心脏前体细胞转化为类似起搏器细胞的方法，以促进心脏衰竭患者起搏器样细胞疗法的发展 | 人类心脏前体细胞（CPCs）和类似起搏器细胞 | NA | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 270 | 2024-08-09 |
Macrophage-Derived CXCL9 and CXCL10 Are Required for Antitumor Immune Responses Following Immune Checkpoint Blockade
2020-01-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1868
PMID:31636098
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研究论文 | 研究免疫检查点阻断治疗后，巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在抗肿瘤免疫反应中的作用 | 首次揭示了巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在免疫检查点阻断治疗中对T细胞招募和治疗效果的关键作用 | NA | 探讨免疫检查点阻断治疗中，巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10对T细胞招募和治疗效果的影响 | 巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在免疫检查点阻断治疗中的作用 | 免疫学 | NA | NanoString-based分析、流式细胞术、细胞珠阵列、单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 包括小鼠模型和接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 |
| 271 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Identifies Cell Diversity in Embryonic Salivary Glands
2020-01, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/0022034519883888
PMID:31644367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎期12天的下颌下腺和腮腺中的14,441个细胞的转录组，以揭示这些腺体在芽形成初期的分子特征 | 首次全面描述了芽形成阶段特定的细胞分子标志，并提供了胚胎期腮腺的转录组数据，尤其是对未充分研究的间充质细胞群体 | NA | 探索胚胎期唾液腺中细胞多样性的分子基础 | 胚胎期12天的下颌下腺和腮腺中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14,441个细胞 |
| 272 | 2024-08-09 |
Quantitative Analysis of Circulating Tumor Cells Using RNA-Based Digital Scoring
2020, Recent results in cancer research. Fortschritte der Krebsforschung. Progres dans les recherches sur le cancer
DOI:10.1007/978-3-030-26439-0_4
PMID:31605224
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研究论文 | 本文探讨了基于RNA的数字评分方法在循环肿瘤细胞（CTCs）定量分析中的应用 | 引入新的基于RNA的分析平台，为CTCs的身份识别和临床应用提供新工具 | NA | 研究CTCs的转录组分析及其在理解转移性癌症进展和开发诊断试剂中的相关性 | 循环肿瘤细胞（CTCs） | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 273 | 2024-08-09 |
Low- and high-thermogenic brown adipocyte subpopulations coexist in murine adipose tissue
2020-01-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI129167
PMID:31573981
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研究论文 | 本研究利用多种遗传标记的小鼠模型、单细胞RNA测序和3D组织成像技术，发现棕色脂肪组织中存在低和高产热活性的棕色脂肪细胞亚群共存的现象 | 首次揭示了棕色脂肪组织中棕色脂肪细胞的功能异质性，发现低和高产热活性的棕色脂肪细胞亚群 | 研究主要基于小鼠模型，未来需在人类中验证这些发现 | 探究棕色脂肪组织中棕色脂肪细胞的亚群及其功能特性 | 棕色脂肪组织中的棕色脂肪细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序，3D组织成像 | NA | 细胞 | 多种遗传标记的小鼠模型 |
| 274 | 2024-08-09 |
Increased expression of anion transporter SLC26A9 delays diabetes onset in cystic fibrosis
2020-01-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI129833
PMID:31581148
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研究论文 | 本文研究了阴离子转运蛋白SLC26A9在囊性纤维化相关糖尿病（CFRD）发病年龄中的作用 | 发现SLC26A9的高表达可以延迟囊性纤维化相关糖尿病的发病年龄，为治疗囊性纤维化的主要并发症提供了新的思路 | NA | 探讨SLC26A9表达与囊性纤维化相关糖尿病发病年龄的关系 | 囊性纤维化患者的SLC26A9基因及其表达 | NA | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | DNA序列数据 | 762名囊性纤维化患者 |
| 275 | 2024-08-09 |
The blood-brain barrier and blood-tumour barrier in brain tumours and metastases
2020-01, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-019-0205-x
PMID:31601988
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综述 | 本文综述了血脑屏障（BBB）和血瘤屏障（BTB）在脑肿瘤和转移中的细胞和分子成分，以及它们对药物递送的挑战和影响 | 探讨了新兴的分子、细胞和物理策略以改善药物通过BBB和BTB的递送，并讨论了这些策略对传统及新兴治疗方法的影响 | NA | 深入理解BBB和BTB，并通过单细胞测序和成像技术以及系统生物学方法开发新的个性化治疗策略 | 血脑屏障（BBB）和血瘤屏障（BTB）在脑肿瘤和转移中的作用 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-08-09 |
DNA Methylation in Epidermal Differentiation, Aging, and Cancer
2020-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2019.05.011
PMID:31427190
|
综述 | 本文综述了DNA甲基化在表皮分化、衰老和癌症中的作用 | 讨论了DNA甲基转移酶的功能角色、甲基化时钟以及肿瘤起源细胞的确定等最新发现 | NA | 探讨表皮稳态、衰老和癌症中与DNA甲基化相关的最新进展 | 表皮分化、衰老和癌症中的DNA甲基化机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomics: putting genome-wide expression on the map
2020-01, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-019-0484-7
PMID:31444395
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-08-09 |
ACTINN: automated identification of cell types in single cell RNA sequencing
2020-01-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz592
PMID:31359028
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ACTINN的自动化细胞类型识别方法，该方法使用具有三个隐藏层的神经网络，通过预定义细胞类型的数据集进行训练，并基于训练参数预测其他数据集的细胞类型 | ACTINN采用神经网络自动识别细胞类型，避免了传统方法中的人工查找和标记物不足的问题 | NA | 开发一种自动化的细胞类型识别方法，以改进单细胞RNA测序中的细胞类型分配 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | 文本 | 包括小鼠细胞类型图谱（Tabula Muris Atlas）和人类免疫细胞数据集 |
| 279 | 2024-08-09 |
VirtualCytometry: a webserver for evaluating immune cell differentiation using single-cell RNA sequencing data
2020-01-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz610
PMID:31373613
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研究论文 | 介绍了一个名为VirtualCytometry的网络计算平台，用于利用单细胞RNA测序数据评估免疫细胞分化 | 利用单细胞RNA测序数据，通过细胞间基因表达的变异来识别不同功能状态的细胞亚群，从而更全面地理解免疫细胞分化 | NA | 开发一种新的分析方法，用于研究免疫细胞分化 | 免疫细胞分化过程中的细胞亚群和关键信号分子及转录因子 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过226个单细胞RNA测序数据集，涵盖正常和疾病组织中的多种人和小鼠免疫细胞类型 |
| 280 | 2024-08-09 |
State of the Future: Translational Approaches in Renal Cell Carcinoma in the Immunotherapy Era
2020-01-15, European urology focus
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.euf.2019.02.014
PMID:30827939
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review | 本文综述了在免疫治疗时代，肾细胞癌（RCC）中转化研究的新技术进展，特别是单细胞测序和基于PD-L1示踪剂的成像技术在生物标志物发现中的应用，以及体外肿瘤球体在创建肿瘤“免疫图谱”中的作用。 | 本文强调了单细胞测序和新型PD-L1示踪剂成像技术在RCC免疫治疗转化研究中的潜在价值，以及体外肿瘤球体在克服治疗抵抗中的应用。 | NA | 旨在通过新技术理解为何部分患者对免疫治疗无反应，并开发策略克服治疗抵抗，以识别哪些患者会对治疗有反应。 | 肾细胞癌（RCC）患者及其对免疫治疗的反应和抵抗机制。 | digital pathology | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | image | NA |