单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-09 |
Analysis of Transcriptional Profiling of Immune Cells at the Single-Cell Level
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0266-9_4
PMID:31933197
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研究论文 | 本文介绍了如何将10× genomics 5'V(D)J免疫细胞分析流程生成的单细胞RNA测序数据整合到R分析管道中 | 单细胞测序技术揭示了免疫细胞先前未知的多样性和特异性 | NA | 研究如何将单细胞RNA测序数据整合到R分析管道中 | 免疫细胞的转录组 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 242 | 2024-08-09 |
Decoding the development of the human hippocampus
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1917-5
PMID:31942070
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和ATAC-seq分析技术，揭示了人类海马体发育过程中的细胞类型、细胞谱系、分子特征和转录调控 | 首次通过多组学数据揭示了人类海马体发育的转录调控网络，并比较了人类和鼠类海马体的基因表达差异 | NA | 理解人类海马体的发育过程及其相关疾病 | 人类海马体在妊娠16-27周的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，ATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 30,416个细胞 |
| 243 | 2024-08-09 |
B cells and tertiary lymphoid structures promote immunotherapy response
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1922-8
PMID:31942075
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研究论文 | 本文通过RNA测序和计算方法研究了B细胞和三级淋巴结构在免疫检查点阻断（ICB）治疗反应中的作用 | 首次详细探讨了B细胞在ICB治疗反应中的作用，并发现B细胞标志物在响应者肿瘤中差异表达 | 研究主要基于RNA测序和计算方法，可能需要进一步的实验验证 | 探讨B细胞和三级淋巴结构在免疫检查点阻断治疗反应中的作用 | B细胞和三级淋巴结构在ICB治疗中的功能和潜在作用 | 肿瘤学 | 黑色素瘤，肾细胞癌 | RNA测序，MCP-counter计算方法，质谱流式细胞术 | NA | RNA | 多个ICB治疗的患者群体，包括黑色素瘤和肾细胞癌患者 |
| 244 | 2024-08-09 |
Critical Role of Cytosolic DNA and Its Sensing Adaptor STING in Aortic Degeneration, Dissection, and Rupture
2020-01-07, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文研究了细胞质DNA及其感应适配器STING在主动脉退化、撕裂和破裂中的关键作用 | 首次揭示了细胞质DNA和STING信号通路在主动脉退化和散发型主动脉夹层形成中的关键机制 | NA | 识别驱动主动脉退化的机制，以开发有效的药物治疗预防疾病进展 | 主动脉平滑肌细胞和巨噬细胞中的细胞质DNA及STING通路的激活 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 组织样本 | 来自散发型升主动脉夹层患者的主动脉组织样本及Stinggt/gt小鼠模型 |
| 245 | 2024-08-09 |
Arterial Sca1+ Vascular Stem Cells Generate De Novo Smooth Muscle for Artery Repair and Regeneration
2020-01-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.11.010
PMID:31883835
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研究论文 | 本文通过细胞命运图谱和单细胞RNA测序技术，识别了动脉壁外膜层的Sca1血管干细胞（VSCs），并研究了其在严重损伤后迁移至中膜层并生成新的平滑肌细胞（SMCs）的过程。 | 首次提供了遗传学证据，证明Sca1 VSCs能够生成SMCs，并在血管修复中发挥关键作用。 | NA | 研究血管干细胞在动脉修复和再生中的作用。 | 动脉壁中的Sca1血管干细胞及其在损伤后的行为。 | NA | NA | 细胞命运图谱，单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 246 | 2024-08-09 |
Outer Radial Glia-like Cancer Stem Cells Contribute to Heterogeneity of Glioblastoma
2020-01-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.11.015
PMID:31901251
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学创建了胶质母细胞瘤肿瘤细胞图谱，并发现肿瘤内存在多种癌症干细胞（GSC）亚型，其中包括类似外侧放射状胶质细胞（oRG）的侵袭性细胞群。 | 首次发现胶质母细胞瘤中的oRG样细胞表现出特征性的有丝分裂体细胞转移行为，并揭示了PTPRZ1在有丝分裂体细胞转移和胶质母细胞瘤侵袭中的作用。 | NA | 旨在揭示胶质母细胞瘤异质性的驱动因素及其与肿瘤侵袭的关系。 | 胶质母细胞瘤及其癌症干细胞亚型。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 247 | 2024-08-09 |
Single-cell Digital Twins for Cancer Preclinical Investigation
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0159-4_15
PMID:31893381
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研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞通量平衡分析（scFBA）的新计算框架，旨在建立数字代谢双胞胎，以更好地利用实验室患者细胞模型 | 提出了scFBA框架，能够量化单细胞水平的通量，并结合单细胞RNA-seq数据，描绘单细胞代谢表型，并识别代谢亚群 | 目前仅限于描述细胞样本中的总体通量分布，忽略了可能的异质性行为 | 旨在通过量化单细胞水平的通量来分层癌症异质性亚群 | 癌症异质性亚群的代谢表型 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq | scFBA | 单细胞数据 | 未具体说明 |
| 248 | 2024-08-09 |
Neuron-glia interaction through Serotonin-BDNF-NGFR axis enables regenerative neurogenesis in Alzheimer's model of adult zebrafish brain
2020-01, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000585
PMID:31905199
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组学分析，揭示了在阿尔茨海默病模型中，血清素-脑源性神经营养因子-神经生长因子受体轴在成年斑马鱼大脑神经再生中的作用 | 发现了血清素通过下调脑源性神经营养因子的表达抑制神经干细胞增殖，而脑源性神经营养因子通过神经生长因子受体A/核因子κB信号增强神经干细胞可塑性和神经发生 | 研究仅在斑马鱼模型中进行，尚未在哺乳动物模型中验证 | 探讨阿尔茨海默病中神经再生的分子机制 | 成年斑马鱼大脑中的神经干细胞和神经发生 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 成年斑马鱼大脑样本 |
| 249 | 2024-08-09 |
A Single Cell but Many Different Transcripts: A Journey into the World of Long Non-Coding RNAs
2020-Jan-01, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms21010302
PMID:31906285
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综述 | 本文综述了长非编码RNA（lncRNAs）的分类及其在单细胞分析中的新发现 | 介绍了单细胞RNA测序和荧光放大技术在lncRNA功能研究中的应用 | NA | 收集关于lncRNA分类的最新信息及其在单细胞分析中的功能新发现 | 长非编码RNA（lncRNAs）及其在细胞中的表达和亚细胞定位 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 250 | 2024-08-09 |
Highly multiplexed single-cell RNA-seq by DNA oligonucleotide tagging of cellular proteins
2020-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0372-z
PMID:31873215
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研究论文 | 本文描述了一种通用的单细胞RNA测序样本多重化方法，通过将识别DNA寡核苷酸附着到固定细胞的细胞蛋白上来进行化学标记 | 该方法能够揭示从大量实验或临床样本中细胞群体结构和转录状态的变化，这些变化无法通过整体测量来辨别 | NA | 建立一种高效的方法，用于从大型实验或临床样本中以单细胞RNA测序的深度和分辨率调查细胞群体 | 单细胞RNA测序中的细胞群体结构和转录状态 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 96个多重化样本 |
| 251 | 2024-08-09 |
Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial target in glioblastoma
2020-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0694-x
PMID:31873309
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研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析了94名代表五种不同癌症类型的患者，识别出胶质母细胞瘤中独特的CD73巨噬细胞群体，并探讨了CD73作为联合治疗靶点的重要性。 | 本文首次识别出胶质母细胞瘤中持续存在的CD73巨噬细胞群体，并通过反向转化研究证实CD73缺失可提高抗CTLA-4和抗PD-1治疗下的生存率。 | 临床试验中联合免疫检查点策略的机制合理性尚不明确，且研究仅限于特定肿瘤类型。 | 旨在识别肿瘤特异性免疫调节靶点，以改进免疫检查点疗法在胶质母细胞瘤中的应用。 | 94名代表五种不同癌症类型的患者，特别是胶质母细胞瘤、前列腺癌和结直肠癌患者。 | 数字病理学 | 脑癌 | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 94名患者 |
| 252 | 2024-08-09 |
Neurological Disorder Drug Discovery from Gene Expression with Tensor Decomposition
2020, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于张量分解的策略，用于从基因表达数据中发现神经疾病药物候选化合物 | 本文采用了张量分解（TD）进行无监督特征提取，以筛选出在阿尔茨海默病模型动物实验中表达改变的基因，并与人类细胞系中药物处理后的基因表达进行比较 | NA | 旨在通过基因表达数据识别神经疾病患者的有效候选药物化合物，以缩短寻找有效治疗的时间并改善治疗结果 | 神经疾病患者的基因表达数据及药物候选化合物 | 生物信息学 | 神经疾病 | 张量分解（TD） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 401个基因在阿尔茨海默病模型动物实验中被筛选出 |
| 253 | 2024-08-09 |
A developmental landscape of 3D-cultured human pre-gastrulation embryos
2020-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1875-y
PMID:31830756
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研究论文 | 本文报道了一种三维（3D）囊胚培养系统，能够支持人类囊胚发育至原条形成阶段 | 开发了一种新的三维培养系统，模拟了人类胚胎在体内的发育标志和三维结构 | NA | 探究人类胚胎在原肠形成前的发育过程，包括空间自我组织和细胞类型发育 | 人类早期胚胎的发育过程 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 254 | 2024-08-09 |
Loss of ADAMTS19 causes progressive non-syndromic heart valve disease
2020-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-019-0536-2
PMID:31844321
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研究论文 | 本文通过全外显子测序和基因敲除小鼠模型，揭示了ADAMTS19基因突变与渐进性非综合征性心脏瓣膜疾病之间的关系 | 首次发现ADAMTS19基因的截短无义突变是导致渐进性心脏瓣膜疾病的原因，并通过基因敲除小鼠模型验证了其病理机制 | NA | 研究ADAMTS19基因在心脏瓣膜疾病中的作用及其分子机制 | ADAMTS19基因及其在心脏瓣膜疾病中的功能 | NA | 心脏瓣膜疾病 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 两个近亲家族中的四名受影响成员及Adamts19基因敲除小鼠 |
| 255 | 2024-08-09 |
Identification of differentially expressed genes by single-cell transcriptional profiling of umbilical cord and synovial fluid mesenchymal stem cells
2020-01, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.14891
PMID:31845522
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了人脐带源性间充质干细胞（hUC-MSCs）和人滑膜液源性间充质干细胞（hSF-MSCs）的异质性 | 本研究首次通过scRNA-seq技术详细分析了hUC-MSCs和hSF-MSCs的转录组特征，并识别了多个亚群及其差异表达基因 | NA | 测量人脐带源性间充质干细胞和人滑膜液源性间充质干细胞的异质性 | 人脐带源性间充质干细胞（hUC-MSCs）和人滑膜液源性间充质干细胞（hSF-MSCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | hUC-MSCs样本有104,761,163条读取，hSF-MSCs样本有6,577,715条读取 |
| 256 | 2024-08-09 |
Allele-specific single-cell RNA sequencing reveals different architectures of intrinsic and extrinsic gene expression noises
2020-01-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz1134
PMID:31799601
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研究论文 | 本文利用等位特异性单细胞RNA测序技术，在老鼠成纤维细胞中评估了3975个基因的内在和外在表达噪声成分 | 首次揭示了内在和外在基因表达噪声的不同架构，并验证了TATA盒和微小RNA靶向等因素对这些噪声的影响 | NA | 探究内在和外在基因表达噪声的架构及其影响因素 | 老鼠成纤维细胞中的3975个基因 | 基因组学 | NA | 等位特异性单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 3975个基因 |
| 257 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Renal Endothelium Heterogeneity and Metabolic Adaptation to Water Deprivation
2020-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019080832
PMID:31818909
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示肾脏内皮细胞的异质性和对缺水的代谢适应 | 首次揭示了肾脏内皮细胞在缺水和高渗环境下对氧化磷酸化的代谢适应的新角色 | NA | 研究肾脏内皮细胞在不同微环境条件下的异质性和对缺水的代谢适应 | 肾脏内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过40,000个鼠肾脏内皮细胞 |
| 258 | 2024-08-09 |
Tumor mutation burden, immune checkpoint crosstalk and radiosensitivity in single-cell RNA sequencing data of breast cancer
2020-01, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.radonc.2019.11.003
PMID:31767471
|
研究论文 | 本研究分析了乳腺癌和免疫细胞的单细胞RNA测序数据，主要关注肿瘤突变负荷（TMB）、免疫检查点交叉对话和放射敏感性 | 本研究首次在单细胞水平上探讨了乳腺癌中肿瘤突变负荷、免疫检查点交叉对话与放射敏感性的关系 | 研究样本量较小，且仅使用了公开数据库中的数据，可能限制了结果的普遍性 | 探讨乳腺癌中单细胞RNA测序数据中的肿瘤突变负荷、免疫检查点交叉对话和放射敏感性的关系 | 乳腺癌细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 肿瘤细胞和免疫细胞共492个，其中肿瘤细胞来自原发肿瘤和转移淋巴结共317个 |
| 259 | 2024-08-09 |
Single-Cell Capture, RNA-seq, and Transcriptome Analysis from the Neural Retina
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0175-4_12
PMID:31786788
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研究论文 | 本文描述了从成年视网膜组织中进行单细胞RNA测序（scRNA-seq）的当前技术，包括视网膜解剖、视网膜分离、细胞群体评估、cDNA合成、文库构建和下一代测序，并介绍了使用开源工具的scRNA-seq数据分析流程 | 介绍了从成年视网膜组织中进行scRNA-seq的技术流程，并引入了使用开源工具的数据分析方法 | NA | 解决细胞异质性挑战 | 成年视网膜组织中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 超过100种神经细胞亚型 |
| 260 | 2024-08-09 |
Guiding T lymphopoiesis from pluripotent stem cells by defined transcription factors
2020-01, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-019-0251-7
PMID:31729468
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研究论文 | 本文研究了通过特定转录因子在体外诱导多能干细胞向T淋巴细胞分化的方法 | 首次证明Runx1和Hoxa9的协同短暂表达可以在体外PSC分化方案中优先产生可移植的造血祖细胞，这些祖细胞能够归巢到胸腺并发育成成熟的T细胞 | NA | 实现从多能干细胞中获得免疫活性及治疗性T淋巴细胞 | 多能干细胞向T淋巴细胞的分化 | 干细胞生物学 | 免疫缺陷疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |