单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals new evolutionary complexity in uveal melanoma
2020-01-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14256-1
PMID:31980621
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了8个原发性和3个转移性葡萄膜黑色素瘤样本中的59,915个肿瘤和非瘤细胞，揭示了肿瘤细胞的新亚克隆基因组复杂性和转录状态，以及肿瘤浸润免疫细胞的先前未被识别的多样性。 | 发现了葡萄膜黑色素瘤中肿瘤细胞的新亚克隆基因组复杂性和转录状态，以及肿瘤浸润免疫细胞的多样性，特别是CD8 T细胞主要表达LAG3而不是PD1或CTLA4。 | NA | 探究葡萄膜黑色素瘤的肿瘤微环境，并寻找潜在的免疫治疗靶点。 | 葡萄膜黑色素瘤的原发性和转移性样本中的肿瘤和非瘤细胞。 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 59,915个肿瘤和非瘤细胞，来自8个原发性和3个转移性样本 |
| 222 | 2024-08-09 |
Snake Venom Gland Organoids
2020-01-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.11.038
PMID:31978343
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研究论文 | 本研究建立了来自多种蛇类的长期扩展的毒腺类器官，并利用单细胞RNA测序分析了这些类器官和原始组织的细胞类型。 | 首次将类器官技术扩展到爬行动物的组织，并描述了一个实验上可操作的蛇毒腺模型系统。 | NA | 扩展类器官技术至爬行动物组织，并建立蛇毒腺的实验模型。 | 蛇毒腺类器官及其细胞类型。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种蛇类的毒腺组织 |
| 223 | 2024-08-09 |
Multiplexed Single Cell mRNA Sequencing Analysis of Mouse Embryonic Cells
2020-01-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/60647
PMID:31984954
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研究论文 | 本文使用基于液滴的scRNA-Seq方法，以心脏为例，展示了如何对小鼠胚胎组织细胞进行单细胞mRNA测序分析 | 本文将两种策略整合到工作流程中，以在单次实验中同时分析多个样本，并成功同时分析了来自八个心脏样本的9,000多个细胞 | NA | 展示如何使用基于液滴的scRNA-Seq方法对小鼠胚胎组织细胞进行单细胞mRNA测序分析 | 小鼠胚胎组织细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-Seq | NA | mRNA | 9,000多个细胞，来自八个心脏样本 |
| 224 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics from human pancreatic islets: sample preparation matters
2020, Biology methods & protocols
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/biomethods/bpz019
PMID:31984226
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研究论文 | 本文通过比较四种不同的样本处理策略对新鲜胰岛样本的单细胞RNA测序数据的影响，探讨了样本准备对研究结果的重要性。 | 首次详细比较了不同样本处理方法对人类胰岛单细胞RNA测序数据的影响，强调了样本处理方法在单细胞研究中的重要性。 | 研究仅限于胰岛组织，可能需要进一步研究其他类型组织以验证结论的普遍性。 | 评估不同样本准备协议对新鲜胰岛样本单细胞RNA测序数据的可能影响。 | 人类胰岛组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两个捐赠者的新鲜胰岛样本 |
| 225 | 2024-08-09 |
Microglia response following acute demyelination is heterogeneous and limits infiltrating macrophage dispersion
2020-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aay6324
PMID:31998844
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研究论文 | 本研究通过基因标记和单细胞RNA测序技术，探讨了急性脱髓鞘后小胶质细胞和浸润巨噬细胞的反应及其相互作用 | 揭示了小胶质细胞在限制浸润巨噬细胞扩散中的新作用，并提出这可能是中枢神经系统维持其“免疫特权”状态的一种先前未被识别的机制 | NA | 研究中枢神经系统损伤后小胶质细胞和浸润巨噬细胞的反应及其相对贡献 | 小胶质细胞和浸润巨噬细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 226 | 2024-08-09 |
Preparation of single cells from tumors for single-cell RNA sequencing
2020, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2019.05.057
PMID:32000902
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研究论文 | 本文描述了一种从人类肿瘤样本中生成单细胞悬浮液的协议，该协议已针对单细胞RNA测序进行了优化 | 提出了一个优化的单细胞RNA测序样本准备协议，旨在最大化细胞活力并最小化可能影响下游分析的细胞应激因素 | 样本准备过程如果执行不当，可能会产生误导性结果 | 优化单细胞RNA测序的样本准备过程 | 人类肿瘤样本中的单细胞悬浮液 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 227 | 2024-08-09 |
Chromosome segregation error during early cleavage in mouse pre-implantation embryo does not necessarily cause developmental failure after blastocyst stage
2020-01-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-020-57817-x
PMID:31965014
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研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单个囊胚移植评估了早期卵裂阶段染色体分离错误与发育之间的关系 | 首次展示了早期染色体分离错误导致的微核形成并不一定会导致囊胚阶段后的发育失败 | 研究仅限于体外受精获得的鼠胚胎，可能限制了结果的普遍性 | 探讨早期卵裂阶段染色体分离错误对胚胎发育的影响 | 鼠的早期植入前胚胎 | NA | NA | 活细胞成像，单细胞测序 | NA | 图像，序列数据 | 使用了通过体外受精获得的鼠胚胎进行实验 |
| 228 | 2024-08-09 |
Memory B Cell Activation, Broad Anti-influenza Antibodies, and Bystander Activation Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2020-01-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.12.063
PMID:31968262
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组学、纵向抗体谱系测序和抗体结合测量，研究了流感疫苗接种后的抗体反应的分子和细胞特征 | 揭示了记忆B细胞激活的程序，包括CD11c和T-bet表达，与克隆扩增和分化为效应功能相关，并发现了流感疫苗接种引发的非特异性旁观者抗体激活 | NA | 探讨抗体记忆反应中转录程序、细胞增殖和抗原特异性抗体产生的协调机制 | 记忆B细胞的激活、抗体克隆的广谱性和旁观者激活 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 229 | 2024-08-09 |
Tumor Functional Heterogeneity Unraveled by scRNA-seq Technologies
2020-01, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2019.11.010
PMID:31952776
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示肿瘤功能异质性 | 利用单细胞测序技术深入分析肿瘤内部结构，预测该技术将在多个研究领域广泛应用 | NA | 探讨单细胞测序技术在癌症治疗中的应用 | 肿瘤内部复杂性和功能异质性 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 230 | 2024-08-09 |
Visualization of Single Cell RNA-Seq Data Using t-SNE in R
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0301-7_8
PMID:31960377
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研究论文 | 本文详细介绍了使用t-SNE和Seurat工具在R环境中对单细胞RNA测序数据进行可视化的过程 | 采用t-SNE这一非线性降维技术，相较于早期的PCA方法，在单细胞RNA测序数据可视化方面具有优势 | NA | 探讨单细胞RNA测序数据的可视化方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | t-SNE | 基因表达数据 | NA |
| 231 | 2024-08-09 |
Use of SuperCT for Enhanced Characterization of Single-Cell Transcriptomic Profiles
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0301-7_9
PMID:31960378
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于监督学习的新方法，用于增强单细胞转录组特征的表征 | 提出了一种基于监督学习的新方法，用于解决单细胞转录组技术中细胞身份识别的问题 | NA | 深入理解异质性组织中的细胞身份 | 单细胞转录组特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习 | 转录组数据 | 多种已知细胞类型的单细胞转录组数据 |
| 232 | 2024-08-09 |
Photoactivated Selective Release of Droplets from Microwell Arrays
2020-Jan-22, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.9b17575
PMID:31912738
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研究论文 | 本文介绍了一种通过光响应聚合物层实现微孔阵列中液滴选择性释放的技术 | 利用光响应聚合物层实现液滴的选择性释放，无需复杂的物理阀门网络和外部控制单元 | NA | 开发一种新的技术，用于从微孔阵列中选择性释放液滴，以便进一步分析 | 微孔阵列中的液滴 | 微流控技术 | NA | 光响应聚合物层 | NA | 液滴 | 大量液滴 |
| 233 | 2024-08-09 |
Cell-to-Cell Variation in Defective Virus Expression and Effects on Host Responses during Influenza Virus Infection
2020-01-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02880-19
PMID:31937643
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了流感病毒感染下人A549细胞和原代支气管上皮细胞的病毒转录和宿主反应的动态变化 | 本研究首次详细描述了单细胞水平上缺陷型病毒基因组（DVGs）与宿主转录程序变异的相关性，并验证了缺陷型病毒基因组的干扰和免疫刺激功能 | 本研究主要集中在单细胞水平上的转录组分析，未涉及更广泛的细胞和组织层面的影响 | 旨在阐明流感病毒感染中单细胞水平上的病毒转录变异及其对宿主反应的影响 | 人A549细胞和原代支气管上皮细胞在流感病毒A感染下的病毒转录和宿主反应 | 数字病理学 | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个时间点的单个细胞样本 |
| 234 | 2024-08-09 |
Identification and transfer of spatial transcriptomics signatures for cancer diagnosis
2020-01-13, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-019-1242-9
PMID:31931856
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，通过支持向量机机器学习方法，识别并转移乳腺癌组织切片中的空间转录组学特征，以区分非恶性、原位导管癌（DCIS）和浸润性导管癌（IDC）区域 | 首次展示了从专家选择的乳腺癌组织切片中学习到的空间转录组学特征可以用于识别整个组织切片中的乳腺癌区域，包括未训练的区域，并且这些特征可以在未用于训练的组织切片中以高精度分类癌症区域 | NA | 研究空间转录组学特征在乳腺癌诊断中的应用 | 乳腺癌组织切片中的非恶性、DCIS和IDC区域 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学（ST） | 支持向量机（SVM） | 转录组数据 | 使用了四个公开的ST乳腺癌数据集，共25,179个表达转录本，798个表达特征转录本 |
| 235 | 2024-08-09 |
The Renin-Angiotensin System in the Central Nervous System and Its Role in Blood Pressure Regulation
2020-01-10, Current hypertension reports
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s11906-019-1011-2
PMID:31925571
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综述 | 本文主要讨论了先进技术如何帮助我们理解脑内肾素-血管紧张素系统（RAS）的神经生理和分子机制 | 使用了新的原位杂交技术和转基因动物模型，以及基因工程动物结合靶向病毒微注射技术 | 脑内RAS的存在仍然存在争议 | 探讨脑内RAS的运作机制及其在血压调节中的作用 | 脑内肾素-血管紧张素系统及其分子和神经生理机制 | NA | NA | 原位杂交技术，转基因动物模型，基因工程技术，靶向病毒微注射 | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-09 |
Recovery of viable endocrine-specific cells and transcriptomes from human pancreatic islet-engrafted mice
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901022RR
PMID:31914605
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研究论文 | 本文开发了一种从人胰腺胰岛移植到免疫缺陷小鼠中恢复活细胞的方法，并进行了功能和激素特异性转录组分析 | 首次实现了从移植后的小鼠中恢复活细胞，并进行了单细胞RNA测序和体外葡萄糖刺激胰岛素分泌实验 | 恢复的胰岛细胞产量相对较低 | 研究人胰腺胰岛移植后的细胞特性和功能 | 人胰腺胰岛移植到免疫缺陷小鼠后的活细胞和转录组 | NA | 糖尿病 | RNA测序 | 单细胞RNA测序 | 细胞 | NA |
| 237 | 2024-08-09 |
Lineage specification and pluripotency revealed by transcriptome analysis from oocyte to blastocyst in pig
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901818RR
PMID:31914626
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了从卵母细胞到猪早期囊胚的转录组，揭示了细胞谱系特化和多能性的分子特征 | 首次展示了猪早期胚胎中原始多能性特征的存在，并描述了X染色体剂量补偿的动态变化 | NA | 探讨猪早期胚胎发育中的细胞谱系特化和多能性 | 猪从卵母细胞到早期囊胚的早期胚胎 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从卵母细胞到早期囊胚的多个猪早期胚胎样本 |
| 238 | 2024-08-09 |
Tracheal brush cells release acetylcholine in response to bitter tastants for paracrine and autocrine signaling
2020-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901314RR
PMID:31914675
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研究论文 | 本文研究了气管刷状细胞在响应苦味物质时释放乙酰胆碱的机制，及其在旁分泌和自分泌信号传导中的作用 | 首次直接证明了气管刷状细胞在苦味物质刺激下释放乙酰胆碱，并揭示了这一过程在自分泌和旁分泌信号传导中的调节机制 | NA | 探讨气管刷状细胞在响应苦味物质时释放乙酰胆碱的机制及其在免疫反应中的作用 | 气管刷状细胞、苦味受体激动剂、乙酰胆碱释放 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠气管刷状细胞 |
| 239 | 2024-08-09 |
Differential excitatory vs inhibitory SCN expression at single cell level regulates brain sodium channel function in neurodevelopmental disorders
2020-Jan, European journal of paediatric neurology : EJPN : official journal of the European Paediatric Neurology Society
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.ejpn.2019.12.019
PMID:31928904
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类和小鼠中电压门控钠通道SCN1/2/3/8A在不同神经元类型中的表达模式，揭示了这些通道在兴奋性和抑制性神经元中的差异表达，及其在神经发育障碍中的潜在作用 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了SCN1/2/3/8A在兴奋性和抑制性神经元中的差异表达，与之前的低分辨率RNA筛选结果形成对比 | NA | 探讨电压门控钠通道在神经发育障碍中的作用机制 | 电压门控钠通道SCN1/2/3/8A在不同神经元类型中的表达模式 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的样本 |
| 240 | 2024-08-09 |
Simultaneous Measurement of Surface Proteins and Gene Expression from Single Cells
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0266-9_3
PMID:31933196
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CITE-seq的新方法，该方法能够同时从单个细胞中测量表面蛋白和基因表达 | CITE-seq方法结合了单细胞测序技术和寡核苷酸标记的抗体，实现了对细胞表面蛋白和基因表达的同步测量 | NA | 开发一种能够同时测量单细胞表面蛋白和基因表达的新技术 | 单细胞的表面蛋白和基因表达 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 单个细胞 |