单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 281 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-09 |
Identification and Analysis of Glioblastoma Biomarkers Based on Single Cell Sequencing
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00167
PMID:32195242
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序结果，利用计算方法筛选出能够区分胶质母细胞瘤肿瘤与其周围环境的标志物，并构建了分类模型。 | 本研究首次应用单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤中筛选出31个重要基因作为潜在的标志物，并构建了支持向量机分类模型。 | 本研究仅分析了2343个肿瘤细胞和1246个周围细胞的基因表达谱，样本量相对较小。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和分析胶质母细胞瘤的生物标志物。 | 胶质母细胞瘤的肿瘤细胞及其周围环境。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达谱 | 2343个肿瘤细胞和1246个周围细胞 |
| 202 | 2024-08-09 |
Corrigendum: The Tumor Suppressor Role of Zinc Finger Protein 671 (ZNF671) in Multiple Tumors Based on Cancer Single-Cell Sequencing
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.00339
PMID:32211338
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-08-09 |
Alternative splicing signatures in preimplantation embryo development
2020, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-020-00399-y
PMID:32175076
|
研究论文 | 本文研究了早期胚胎发育中的选择性剪接（AS）特征，并探讨了AS与基因转录及染色质结构的关系 | 首次揭示了早期胚胎发育中AS在两细胞阶段的关键作用，并展示了AS基因在拓扑关联结构域（TAD）边界的高度富集 | NA | 深入理解早期胚胎发育中的转录和剪接事件 | 早期胚胎发育中的选择性剪接 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高吞吐量染色体构象捕获（Hi-C） | NA | RNA序列数据，染色体构象数据 | NA |
| 204 | 2024-08-09 |
Single-cell sperm transcriptomes and variants from fathers of children with and without autism spectrum disorder
2020, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-020-0117-4
PMID:32133155
|
研究论文 | 本研究使用10× Chromium单细胞测序技术，分析了来自六名精子捐赠者的超过65,000个单个精子的转录组，其中包括两名患有自闭症谱系障碍（ASD）儿童的父亲和四名神经正常的儿童的父亲，以探索精子中的RNA和突变与ASD的关系。 | 本研究首次使用单细胞测序技术分析精子转录组，能够检测到低频变异，从而更深入地了解精子中的遗传变异与ASD的关联。 | 研究样本量较小，仅包括六名精子捐赠者，可能影响结果的普遍性。 | 探索精子中的RNA和突变与自闭症谱系障碍（ASD）的关系。 | 精子转录组和突变。 | 基因组学 | 自闭症谱系障碍 | 10× Chromium单细胞测序技术 | NA | 转录组数据 | 超过65,000个单个精子，来自六名精子捐赠者 |
| 205 | 2024-08-09 |
Characterizing Adult Cochlear Supporting Cell Transcriptional Diversity Using Single-Cell RNA-Seq: Validation in the Adult Mouse and Translational Implications for the Adult Human Cochlea
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.00013
PMID:32116546
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术对成年小鼠耳蜗支持细胞的转录多样性进行了首次单细胞水平的表征，并验证了其在成年人类耳蜗中的相关性 | 首次对成年耳蜗支持细胞的转录组进行了单细胞水平的表征，并展示了这些细胞在成年人类耳蜗中的相关性 | NA | 探索耳蜗支持细胞的转录组特征，为耳蜗细胞再生治疗提供基础 | 成年小鼠和人类的耳蜗支持细胞 | 数字病理学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年小鼠耳蜗支持细胞 |
| 206 | 2024-08-09 |
High-Throughput Transcriptome Profiling in Drug and Biomarker Discovery
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00019
PMID:32117438
|
综述 | 本文综述了高通量转录组技术在药物和生物标志物发现中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和第三代RNA测序工具的新兴应用 | NA | 探讨高通量转录组技术在药物和生物标志物发现中的应用 | 药物和生物标志物的发现 | 生物医学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 207 | 2024-08-09 |
Normalization Methods on Single-Cell RNA-seq Data: An Empirical Survey
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00041
PMID:32117453
|
研究论文 | 本文比较了七种专门为单细胞测序设计的归一化方法的有效性 | 通过使用包含spike-in基因的实际数据集和模拟研究，评估了不同归一化方法的效果 | 未提及具体限制 | 比较不同单细胞RNA测序数据归一化方法的效果 | 单细胞RNA测序数据的归一化方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两个包含spike-in基因的实际数据集，一个模拟研究数据集，以及一个包含三种不同细胞周期状态的实际数据集和一个10X Genomics GemCode平台的多细胞类型数据集 |
| 208 | 2024-08-09 |
Erratum: Identification of Breast Cancer Stem Cell Related Genes Using Functional Cellular Assays Combined With Single-Cell RNA Sequencing in MDA-MB-231 Cells
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00084
PMID:32117464
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-09 |
Metabolism in the tumor microenvironment: insights from single-cell analysis
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1726556
PMID:32117592
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析肿瘤微环境中的代谢特征，探讨其与免疫治疗的相关性 | 首次通过单细胞RNA测序数据揭示肿瘤微环境中单个细胞的代谢特征与整体测量结果的差异 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏差 | 深入理解肿瘤微环境中癌症和免疫细胞的代谢特征及其对免疫治疗的影响 | 肿瘤微环境中的癌症和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 210 | 2024-08-09 |
SCelVis: exploratory single cell data analysis on the desktop and in the cloud
2020, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.8607
PMID:32117635
|
研究论文 | 介绍SCelVis，一个用于预处理单细胞数据网络可视化的灵活、交互式且用户友好的应用程序 | SCelVis支持桌面和云系统运行，接受本地和远程源的标准和开放协议输入，并允许在云和本地托管数据 | NA | 促进无生物信息学专业知识用户的单细胞数据分析和解释 | 单细胞表达数据和细胞注释的交互式可视化 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据可视化 | 使用公开可用的scRNA-seq数据进行测试和验证 |
| 211 | 2024-08-09 |
Dynamic Alternative Splicing During Mouse Preimplantation Embryo Development
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00035
PMID:32117919
|
研究论文 | 本研究通过基于scRNA-seq数据的生物信息学分析，探讨了小鼠植入前胚胎发育过程中替代性前mRNA剪接（AS）的动态变化 | 发现了许多先前未报道的在特定发育阶段差异表达的基因，并建立了植入前发育过程中的AS和差异AS图谱 | NA | 揭示植入前胚胎发育过程中替代性前mRNA剪接的机制 | 小鼠植入前胚胎发育过程中的替代性前mRNA剪接 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列 | NA |
| 212 | 2024-08-09 |
EPIC: A Tool to Estimate the Proportions of Different Cell Types from Bulk Gene Expression Data
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0327-7_17
PMID:32124324
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为EPIC的计算工具，用于从批量基因表达数据中估计不同细胞类型的比例 | EPIC工具包括基于RNA-seq的基因表达参考 profiles，能够处理用户定义的基因表达参考 profiles，并引入了重归一化步骤以考虑每种细胞类型中不同的mRNA含量 | NA | 提供使用从批量基因表达数据中估计不同细胞类型比例的工具的指南和示例 | 肿瘤样本中的不同细胞类型比例 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 213 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis of human adipose tissue identifies depot and disease specific cell types
2020-01, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-019-0152-6
PMID:32066997
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了肥胖个体的内脏和皮下脂肪组织，揭示了脂肪库特异性细胞类型的差异 | 首次展示了人体脂肪组织中脂肪库特异性细胞类型的差异，并识别了与代谢疾病状态相关的代谢活跃的脂肪驻留免疫细胞亚群 | NA | 研究人体脂肪组织中脂肪库特异性细胞类型与代谢疾病风险之间的关系 | 肥胖个体的内脏和皮下脂肪组织 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自肥胖个体的脂肪组织样本 |
| 214 | 2024-08-09 |
New Developments in Transcriptomic Analysis of Synovial Tissue
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.00021
PMID:32083090
|
研究论文 | 本文探讨了转录组技术在类风湿性关节炎患者关节组织病理变化研究中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在理解细胞亚群多样性和功能方面的新进展，以及未来高分辨率空间转录组技术的发展前景 | NA | 研究转录组技术在类风湿性关节炎病理机制和潜在治疗靶点发现中的应用 | 类风湿性关节炎患者的关节组织 | 数字病理学 | 类风湿性关节炎 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 215 | 2024-08-09 |
Very rapid cloning, expression and identifying specificity of T-cell receptors for T-cell engineering
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0228112
PMID:32040512
|
研究论文 | 本文介绍了一种快速克隆、表达和鉴定T细胞受体特异性的平台，用于T细胞工程。 | 本文创新地结合了全外显子测序、转录组测序和单细胞RNA测序数据，建立了识别TCRαβs识别抗原的平台。 | NA | 开发一种快速识别肿瘤反应性TCRs的平台，用于T细胞的生物工程。 | T细胞受体（TCRαβ）的克隆、表达和特异性鉴定。 | 生物工程 | NA | 全外显子测序、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 数百个单个T细胞 |
| 216 | 2024-08-09 |
Chromatin mapping and single-cell immune profiling define the temporal dynamics of ibrutinib response in CLL
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14081-6
PMID:31996669
|
研究论文 | 本研究通过结合免疫表型分析、单细胞转录组测序和染色质图谱，分析了慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者在接受伊布替尼治疗期间的时间动态变化 | 研究揭示了伊布替尼治疗CLL的细胞和分子层面的时间依赖性效应，并建立了一种基于表观基因组/转录组的治疗监测方法 | NA | 定义伊布替尼治疗CLL的潜在调控动态 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者 | NA | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序，染色质图谱 | NA | 基因表达数据，染色质数据 | 多个CLL患者样本 |
| 217 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies CD44 as a marker and regulator of endothelial to haematopoietic transition
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14171-5
PMID:31996681
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析和抗体筛选，识别CD44作为内皮细胞向造血细胞转变（EHT）的标记物和调节因子 | 首次确定CD44作为EHT的标记物，并证明通过抑制CD44与其配体透明质酸的相互作用可以阻断EHT | NA | 阐明内皮细胞向造血细胞转变过程中的中间步骤和相关细胞的身份 | 内皮细胞向造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的转变过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 218 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional diversity is a hallmark of developmental potential
2020-01-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aax0249
PMID:31974247
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据，开发了一种计算框架CytoTRACE，用于预测细胞分化状态 | 提出了一种新的计算框架CytoTRACE，用于从单细胞RNA测序数据中预测分化状态，并在多种组织类型和生物体中表现优于先前方法 | NA | 研究细胞分化潜力及其在不同组织和生物体中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | RNA测序数据 | 近19,000个注释基因集和52个实验确定的发育轨迹 |
| 219 | 2024-08-09 |
scMAGeCK links genotypes with multiple phenotypes in single-cell CRISPR screens
2020-01-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-1928-4
PMID:31980032
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scMAGeCK的计算框架，用于在单细胞CRISPR筛选中识别与多种表达型表型相关的基因组元件 | scMAGeCK超越现有方法，能够识别与细胞增殖相关的已知和新功能基因及增强子，并实现基因型-表型网络的无偏构建 | NA | 研究基因型与表型之间的关系 | 单细胞CRISPR筛选中的基因组元件 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因组数据, 表达数据 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 220 | 2024-08-09 |
Cellular diversity and lineage trajectory: insights from mouse single cell transcriptomes
2020-01-24, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.179788
PMID:31980483
|
研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析小鼠胚胎发育中的细胞多样性和谱系轨迹方面的应用 | 文章介绍了单细胞技术与计算方法的最新进展，这些方法能够在没有明确引入遗传标记的情况下推断细胞的分化谱系 | 分析和解释这些多组学数据仍面临挑战，需要进一步的方法学发展 | 探讨单细胞实验和计算方法在小鼠胚胎发育研究中的应用，并强调其在细胞身份、多样性和谱系分化方面的关键见解 | 小鼠胚胎发育中的细胞多样性和谱系轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 大量单细胞样本 |