单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-09 |
The SARS-CoV-2 receptor ACE2 expression of maternal-fetal interface and fetal organs by single-cell transcriptome study
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0230295
PMID:32298273
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析了SARS-CoV-2受体ACE2在母胎界面及胎儿器官中的表达情况 | 首次揭示了ACE2在母胎界面和胎儿心脏、肝脏、肺等特定细胞类型中的广泛表达 | 研究主要基于现有单细胞RNA测序数据，未涉及直接的临床样本分析 | 探讨SARS-CoV-2在母胎界面及胎儿器官中的垂直传播潜力 | SARS-CoV-2受体ACE2在母胎界面及胎儿器官中的细胞特异性表达 | 数字病理学 | 新冠肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含多个胎儿和新生小鼠肺的系列样本 | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-08-09 |
Deciphering the transcriptomic landscape of tumor-infiltrating CD8 lymphocytes in B16 melanoma tumors with single-cell RNA-Seq
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1737369
PMID:32313720
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了B16黑色素瘤肿瘤中浸润的CD8 T细胞的转录组图谱 | 揭示了四种不同的CD8 TIL状态（耗竭、记忆样、幼稚和效应记忆样），并预测了新的标记物，如Ly6C用于效应记忆样细胞 | NA | 研究肿瘤浸润CD8 T细胞的异质性，并建立其转录组图谱 | B16黑色素瘤肿瘤中浸润的CD8 T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括已知肿瘤特异性的细胞在内的多个CD8 T细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-08-09 |
Cellular, transcriptomic and isoform heterogeneity of breast cancer cell line revealed by full-length single-cell RNA sequencing
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.03.005
PMID:32257051
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研究论文 | 本研究采用全长的单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌细胞系SUM149的细胞、转录组和异构体异质性 | 本研究首次使用深度的全长单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌细胞系中癌症干细胞的细胞、转录组和异构体异质性 | 现有的单细胞转录组技术存在数据丢失和不均匀覆盖的限制，这挑战了肿瘤异质性的进一步划分 | 研究肿瘤异质性的生成机制，特别是通过遗传和表观遗传机制，以及这些机制在肿瘤形成和转移中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系SUM149及其癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及三阴性乳腺癌细胞系SUM149和红白血病K562细胞系作为对照 | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2024-08-09 |
Single-Cell Approaches to Profile the Response to Immune Checkpoint Inhibitors
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00490
PMID:32265933
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综述 | 本文综述了单细胞技术在免疫检查点抑制剂治疗反应分析中的应用 | 整合传统方法与新型单细胞技术，如高参数流式细胞术、单细胞测序和高分辨率成像，以深入研究肿瘤微环境中的分子和细胞相互作用 | NA | 探讨单细胞技术如何帮助揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性 | 免疫检查点抑制剂治疗反应的分子和细胞机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-09 |
Non-coding RNAs in Cardiac Regeneration
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-1671-9_9
PMID:32285411
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研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在心脏再生中的作用 | 文章提出通过重新激活现有心肌细胞的增殖能力来促进心脏再生的新研究方向 | 尽管干细胞疗法对功能参数有积极影响，但c-kit阳性心脏前体细胞对功能性心肌细胞生成的贡献有限 | 研究如何通过重新激活心肌细胞的增殖来促进心脏再生 | 非编码RNA在心脏再生中的作用及心肌细胞的增殖机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序和遗传谱系追踪 | NA | 细胞 | 涉及小鼠心脏在稳态和再生条件下的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing analysis identifies host long noncoding RNA MAMDC2-AS1 as a co-factor for HSV-1 nuclear transport
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.42556
PMID:32226304
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，揭示了宿主长非编码RNA MAMDC2-AS1在HSV-1感染中的作用及其机制 | 首次阐明了MAMDC2-AS1作为HSV-1核运输的共因子，及其通过与Hsp90α相互作用促进病毒蛋白VP16的核运输 | NA | 探究宿主长非编码RNA在HSV-1感染中的作用及其机制 | HSV-1感染的异质性及宿主长非编码RNA MAMDC2-AS1的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2024-08-09 |
Myeloid Cells Enriched for a Dendritic Cell Population From People Living With HIV Have Altered Gene Expression Not Restored by Antiretroviral Therapy
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00261
PMID:32194550
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研究论文 | 研究了HIV感染者中富集的髓系树突状细胞（mDC）的基因表达变化，并探讨了抗逆转录病毒治疗（ART）对这些变化的影响 | 发现HIV感染者中的mDC存在转录变化，部分变化无法通过ART完全恢复 | ART未能完全恢复HIV感染者中mDC的功能 | 探讨ART对HIV感染者中mDC基因表达变化的影响 | HIV感染者中的髓系树突状细胞（mDC） | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HIV感染者和未感染个体的mDC | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2024-08-09 |
Alginate oligosaccharides improve germ cell development and testicular microenvironment to rescue busulfan disrupted spermatogenesis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.43189
PMID:32194870
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研究论文 | 本文研究了海藻酸寡糖（AOS）对布苏法因破坏的精子发生过程的缓解作用，并通过单细胞RNA测序等技术分析了其对小鼠睾丸细胞的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了AOS对布苏法因引起的精子发生障碍的缓解作用及其分子机制 | NA | 探讨AOS对布苏法因引起的精子发生障碍的缓解作用及其机制 | 小鼠睾丸细胞及精子发生过程 | NA | 男性生殖障碍 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 蛋白质印迹, 液相色谱-质谱联用 | NA | RNA, 代谢物 | 小鼠睾丸样本 | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-09 |
Identification and Analysis of Glioblastoma Biomarkers Based on Single Cell Sequencing
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00167
PMID:32195242
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序结果，利用计算方法筛选出能够区分胶质母细胞瘤肿瘤与其周围环境的标志物，并构建了分类模型。 | 本研究首次应用单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤中筛选出31个重要基因作为潜在的标志物，并构建了支持向量机分类模型。 | 本研究仅分析了2343个肿瘤细胞和1246个周围细胞的基因表达谱，样本量相对较小。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和分析胶质母细胞瘤的生物标志物。 | 胶质母细胞瘤的肿瘤细胞及其周围环境。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达谱 | 2343个肿瘤细胞和1246个周围细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 210 | 2024-08-09 |
Corrigendum: The Tumor Suppressor Role of Zinc Finger Protein 671 (ZNF671) in Multiple Tumors Based on Cancer Single-Cell Sequencing
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.00339
PMID:32211338
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-08-09 |
Alternative splicing signatures in preimplantation embryo development
2020, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-020-00399-y
PMID:32175076
|
研究论文 | 本文研究了早期胚胎发育中的选择性剪接（AS）特征，并探讨了AS与基因转录及染色质结构的关系 | 首次揭示了早期胚胎发育中AS在两细胞阶段的关键作用，并展示了AS基因在拓扑关联结构域（TAD）边界的高度富集 | NA | 深入理解早期胚胎发育中的转录和剪接事件 | 早期胚胎发育中的选择性剪接 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高吞吐量染色体构象捕获（Hi-C） | NA | RNA序列数据，染色体构象数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-08-09 |
High-Throughput Transcriptome Profiling in Drug and Biomarker Discovery
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00019
PMID:32117438
|
综述 | 本文综述了高通量转录组技术在药物和生物标志物发现中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和第三代RNA测序工具的新兴应用 | NA | 探讨高通量转录组技术在药物和生物标志物发现中的应用 | 药物和生物标志物的发现 | 生物医学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-08-09 |
Normalization Methods on Single-Cell RNA-seq Data: An Empirical Survey
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00041
PMID:32117453
|
研究论文 | 本文比较了七种专门为单细胞测序设计的归一化方法的有效性 | 通过使用包含spike-in基因的实际数据集和模拟研究，评估了不同归一化方法的效果 | 未提及具体限制 | 比较不同单细胞RNA测序数据归一化方法的效果 | 单细胞RNA测序数据的归一化方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了两个包含spike-in基因的实际数据集，一个模拟研究数据集，以及一个包含三种不同细胞周期状态的实际数据集和一个10X Genomics GemCode平台的多细胞类型数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-08-09 |
Erratum: Identification of Breast Cancer Stem Cell Related Genes Using Functional Cellular Assays Combined With Single-Cell RNA Sequencing in MDA-MB-231 Cells
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00084
PMID:32117464
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-08-09 |
Metabolism in the tumor microenvironment: insights from single-cell analysis
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1726556
PMID:32117592
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析肿瘤微环境中的代谢特征，探讨其与免疫治疗的相关性 | 首次通过单细胞RNA测序数据揭示肿瘤微环境中单个细胞的代谢特征与整体测量结果的差异 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏差 | 深入理解肿瘤微环境中癌症和免疫细胞的代谢特征及其对免疫治疗的影响 | 肿瘤微环境中的癌症和免疫细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-08-09 |
SCelVis: exploratory single cell data analysis on the desktop and in the cloud
2020, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.8607
PMID:32117635
|
研究论文 | 介绍SCelVis，一个用于预处理单细胞数据网络可视化的灵活、交互式且用户友好的应用程序 | SCelVis支持桌面和云系统运行，接受本地和远程源的标准和开放协议输入，并允许在云和本地托管数据 | NA | 促进无生物信息学专业知识用户的单细胞数据分析和解释 | 单细胞表达数据和细胞注释的交互式可视化 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据可视化 | 使用公开可用的scRNA-seq数据进行测试和验证 | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-08-09 |
Dynamic Alternative Splicing During Mouse Preimplantation Embryo Development
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00035
PMID:32117919
|
研究论文 | 本研究通过基于scRNA-seq数据的生物信息学分析，探讨了小鼠植入前胚胎发育过程中替代性前mRNA剪接（AS）的动态变化 | 发现了许多先前未报道的在特定发育阶段差异表达的基因，并建立了植入前发育过程中的AS和差异AS图谱 | NA | 揭示植入前胚胎发育过程中替代性前mRNA剪接的机制 | 小鼠植入前胚胎发育过程中的替代性前mRNA剪接 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-08-09 |
EPIC: A Tool to Estimate the Proportions of Different Cell Types from Bulk Gene Expression Data
2020, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-0327-7_17
PMID:32124324
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为EPIC的计算工具，用于从批量基因表达数据中估计不同细胞类型的比例 | EPIC工具包括基于RNA-seq的基因表达参考 profiles，能够处理用户定义的基因表达参考 profiles，并引入了重归一化步骤以考虑每种细胞类型中不同的mRNA含量 | NA | 提供使用从批量基因表达数据中估计不同细胞类型比例的工具的指南和示例 | 肿瘤样本中的不同细胞类型比例 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-08-09 |
Very rapid cloning, expression and identifying specificity of T-cell receptors for T-cell engineering
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0228112
PMID:32040512
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研究论文 | 本文介绍了一种快速克隆、表达和鉴定T细胞受体特异性的平台，用于T细胞工程。 | 本文创新地结合了全外显子测序、转录组测序和单细胞RNA测序数据，建立了识别TCRαβs识别抗原的平台。 | NA | 开发一种快速识别肿瘤反应性TCRs的平台，用于T细胞的生物工程。 | T细胞受体（TCRαβ）的克隆、表达和特异性鉴定。 | 生物工程 | NA | 全外显子测序、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 数百个单个T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies CD44 as a marker and regulator of endothelial to haematopoietic transition
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14171-5
PMID:31996681
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析和抗体筛选，识别CD44作为内皮细胞向造血细胞转变（EHT）的标记物和调节因子 | 首次确定CD44作为EHT的标记物，并证明通过抑制CD44与其配体透明质酸的相互作用可以阻断EHT | NA | 阐明内皮细胞向造血细胞转变过程中的中间步骤和相关细胞的身份 | 内皮细胞向造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的转变过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |