单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-09 |
Analysis of Gene Signatures of Tumor Microenvironment Yields Insight Into Mechanisms of Resistance to Immunotherapy
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00348
PMID:32528935
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术，对肿瘤微环境进行分类，并识别出特定表型的基因，以揭示免疫治疗抵抗的潜在机制 | 通过单细胞RNA测序技术，首次将肿瘤微环境分为免疫治疗响应和非响应的炎症型，并识别出特定表型的基因，为理解免疫治疗抵抗机制提供了新视角 | 研究主要集中在肿瘤微环境的基因表达分析，未涉及临床试验验证潜在药物的效果 | 旨在揭示肿瘤微环境中免疫治疗抵抗的机制，并探索提高免疫治疗效果的潜在药物 | 肿瘤微环境中的基因表达模式及其与免疫治疗响应的关系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 182 | 2024-08-09 |
MFCNV: A New Method to Detect Copy Number Variations From Next-Generation Sequencing Data
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00434
PMID:32499814
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法MFCNV，用于从下一代测序数据中准确检测拷贝数变异 | MFCNV方法全面考虑了基因组中相邻位置间的内在相关性，计算每个基因组bin的读取深度、GC含量偏差、碱基质量和相关性值，并通过训练神经网络算法来预测拷贝数变异 | NA | 开发一种新的方法来提高从下一代测序数据中检测拷贝数变异的准确性 | 拷贝数变异在肿瘤基因组中的检测 | 数字病理学 | 肿瘤 | NGS | 神经网络 | 测序数据 | 使用模拟和真实测序数据进行测试 |
| 183 | 2024-08-09 |
Gene regulatory networks during the development of the Drosophila visual system
2020, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2020.02.010
PMID:32450970
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研究论文 | 本文描述了果蝇视觉系统发育过程中涉及的已知基因调控网络，并探讨了这些基因网络中的通用组件 | 讨论了果蝇视觉系统作为单细胞转录组学时代基因调控网络发现模型的优势 | NA | 研究果蝇视觉系统发育过程中的基因调控网络 | 果蝇视觉系统的发育及其基因调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-09 |
Hybrid Stem Cell States: Insights Into the Relationship Between Mammary Development and Breast Cancer Using Single-Cell Transcriptomics
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00288
PMID:32457901
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了正常乳腺发育与乳腺癌之间的关系，特别是混合型干细胞状态在其中的作用 | 本研究首次整合了人类和小鼠的乳腺单细胞RNA测序数据，以及TCGA中的乳腺癌bulk RNA测序数据，以探究正常乳腺和癌症中的混合型干细胞状态 | NA | 利用单细胞RNA测序技术量化正常乳腺在不同发育阶段和条件重编程下的细胞状态分布 | 正常乳腺干细胞和乳腺癌细胞的混合型状态 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | RNA-seq数据 | 包括人类和小鼠的多个乳腺单细胞RNA测序数据集，以及TCGA中的乳腺癌bulk RNA测序数据 |
| 185 | 2024-08-09 |
Identifying Cell-Type Specific Genes and Expression Rules Based on Single-Cell Transcriptomic Atlas Data
2020, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2020.00350
PMID:32411685
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研究论文 | 本研究通过分析小鼠的单细胞转录组图谱数据，旨在识别在组织发育和器官发生中起功能作用的特定细胞类型关键基因和表达规则 | 本研究利用单细胞测序技术，针对以往研究中未深入探讨的个体多细胞生物细胞间基因组差异，识别特定细胞类型的关键基因和表达规则 | NA | 识别在组织发育和器官发生中起功能作用的特定细胞类型关键基因和表达规则 | 小鼠的单细胞转录组图谱数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 转录组数据 | 18种细胞类别 |
| 186 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Mitochondrial Dynamics in Oocytes of Patients With Polycystic Ovary Syndrome
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00396
PMID:32425983
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了多囊卵巢综合征（PCOS）患者卵母细胞中线粒体动力学的变化 | 首次揭示了PCOS患者卵母细胞发育失败与线粒体功能异常之间的关系 | 研究样本量较小，需要进一步扩大样本以验证结果的普遍性 | 探究PCOS患者卵母细胞中线粒体功能与卵母细胞质量下降的关系 | PCOS患者的卵母细胞 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序 | WGCNA（加权基因共表达网络分析） | 转录组数据 | 14个健康女性和20个PCOS患者的卵母细胞 |
| 187 | 2024-08-09 |
An Adaptive Sparse Subspace Clustering for Cell Type Identification
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.00407
PMID:32425984
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研究论文 | 本文设计了一种自适应稀疏子空间聚类方法（AdaptiveSSC）用于细胞类型识别 | AdaptiveSSC方法基于同一类型细胞表达在同一子空间的假设，并使用数据驱动的自适应稀疏约束构建相似矩阵 | NA | 解决单细胞数据计算分析中细胞类型识别的问题 | 单细胞转录组测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 稀疏子空间聚类 | 表达谱 | 10个scRNA-seq数据集 |
| 188 | 2024-08-09 |
Heterogeneity of exhausted T cells in the tumor microenvironment is linked to patient survival following resection in hepatocellular carcinoma
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1746573
PMID:32426177
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研究论文 | 研究分析了肝细胞癌患者手术样本中耗竭T细胞（Tex）的浸润情况及其对患者预后的影响 | 通过单细胞RNA测序揭示了CD4-Tex、CD8-Tex和FOXP3-Treg在肿瘤及邻近组织中的组成变化及其分子特征 | NA | 评估肿瘤邻近区域T细胞状态及其对肝细胞癌预后的影响 | 肝细胞癌患者的手术样本中的耗竭T细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 117个肝细胞癌患者的手术样本 |
| 189 | 2024-08-09 |
Association of Urine sCD163 With Proliferative Lupus Nephritis, Fibrinoid Necrosis, Cellular Crescents and Intrarenal M2 Macrophages
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00671
PMID:32351512
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研究论文 | 研究评估尿液可溶性CD163（sCD163）作为狼疮性肾炎（LN）生物标志物的潜力 | 发现尿液sCD163在活动性LN患者中显著升高，并与多种肾脏病理特征相关，表明其作为预测肾脏病理的潜在标志物 | 研究主要集中在活动性LN患者，未涵盖所有LN患者群体 | 评估尿液sCD163作为狼疮性肾炎生物标志物的潜力 | 活动性狼疮性肾炎患者、活动性非肾脏狼疮患者、非活动性系统性红斑狼疮患者及健康对照 | NA | 狼疮性肾炎 | ELISA | NA | 尿液蛋白质 | 228名系统性红斑狼疮患者和56名健康对照 |
| 190 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity of liver-resident immune cells in human
2020, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-020-0157-z
PMID:32351704
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了人肝脏驻留免疫细胞的异质性 | 首次详细描述了人肝脏中超过30种不同免疫细胞亚群的组成、基因表达和功能模块，并提出了基于趋化因子受体的T和NK细胞分类系统 | NA | 揭示人肝脏驻留免疫细胞的异质性和功能多样性 | 人肝脏驻留免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共70,706个CD45免疫细胞样本，包括肝脏、脾脏和外周血 |
| 191 | 2024-08-09 |
Improved Prognostic Prediction of Glioblastoma using a PAS Detected from Single-cell RNA-seq
2020, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.44034
PMID:32328180
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据筛选出与胶质母细胞瘤预后相关的差异表达基因，并构建了一个预测模型来提高患者的生存概率预测 | 利用单细胞RNA测序数据筛选出与胶质母细胞瘤预后相关的基因集，并构建了一个新的预测模型 | NA | 提高胶质母细胞瘤患者的生存概率预测 | 胶质母细胞瘤患者的预后预测 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 192 | 2024-08-09 |
Changing Technologies of RNA Sequencing and Their Applications in Clinical Oncology
2020, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2020.00447
PMID:32328458
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研究论文 | 本文讨论了RNA测序技术的发展及其在临床肿瘤学中的应用 | 介绍了从批量RNA测序到数字空间RNA分析等多种RNA测序技术的进步 | 未明确提及 | 指导癌症研究人员选择最适合其生物学问题的RNA测序技术 | RNA测序技术的不同类型及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 193 | 2024-08-09 |
The SARS-CoV-2 receptor ACE2 expression of maternal-fetal interface and fetal organs by single-cell transcriptome study
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0230295
PMID:32298273
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析了SARS-CoV-2受体ACE2在母胎界面及胎儿器官中的表达情况 | 首次揭示了ACE2在母胎界面和胎儿心脏、肝脏、肺等特定细胞类型中的广泛表达 | 研究主要基于现有单细胞RNA测序数据，未涉及直接的临床样本分析 | 探讨SARS-CoV-2在母胎界面及胎儿器官中的垂直传播潜力 | SARS-CoV-2受体ACE2在母胎界面及胎儿器官中的细胞特异性表达 | 数字病理学 | 新冠肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包含多个胎儿和新生小鼠肺的系列样本 |
| 194 | 2024-08-09 |
Deciphering the transcriptomic landscape of tumor-infiltrating CD8 lymphocytes in B16 melanoma tumors with single-cell RNA-Seq
2020, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2020.1737369
PMID:32313720
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了B16黑色素瘤肿瘤中浸润的CD8 T细胞的转录组图谱 | 揭示了四种不同的CD8 TIL状态（耗竭、记忆样、幼稚和效应记忆样），并预测了新的标记物，如Ly6C用于效应记忆样细胞 | NA | 研究肿瘤浸润CD8 T细胞的异质性，并建立其转录组图谱 | B16黑色素瘤肿瘤中浸润的CD8 T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括已知肿瘤特异性的细胞在内的多个CD8 T细胞样本 |
| 195 | 2024-08-09 |
Cellular, transcriptomic and isoform heterogeneity of breast cancer cell line revealed by full-length single-cell RNA sequencing
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.03.005
PMID:32257051
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研究论文 | 本研究采用全长的单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌细胞系SUM149的细胞、转录组和异构体异质性 | 本研究首次使用深度的全长单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌细胞系中癌症干细胞的细胞、转录组和异构体异质性 | 现有的单细胞转录组技术存在数据丢失和不均匀覆盖的限制，这挑战了肿瘤异质性的进一步划分 | 研究肿瘤异质性的生成机制，特别是通过遗传和表观遗传机制，以及这些机制在肿瘤形成和转移中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系SUM149及其癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及三阴性乳腺癌细胞系SUM149和红白血病K562细胞系作为对照 |
| 196 | 2024-08-09 |
Single-Cell Approaches to Profile the Response to Immune Checkpoint Inhibitors
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00490
PMID:32265933
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综述 | 本文综述了单细胞技术在免疫检查点抑制剂治疗反应分析中的应用 | 整合传统方法与新型单细胞技术，如高参数流式细胞术、单细胞测序和高分辨率成像，以深入研究肿瘤微环境中的分子和细胞相互作用 | NA | 探讨单细胞技术如何帮助揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性 | 免疫检查点抑制剂治疗反应的分子和细胞机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 197 | 2024-08-09 |
Non-coding RNAs in Cardiac Regeneration
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-1671-9_9
PMID:32285411
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研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在心脏再生中的作用 | 文章提出通过重新激活现有心肌细胞的增殖能力来促进心脏再生的新研究方向 | 尽管干细胞疗法对功能参数有积极影响，但c-kit阳性心脏前体细胞对功能性心肌细胞生成的贡献有限 | 研究如何通过重新激活心肌细胞的增殖来促进心脏再生 | 非编码RNA在心脏再生中的作用及心肌细胞的增殖机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序和遗传谱系追踪 | NA | 细胞 | 涉及小鼠心脏在稳态和再生条件下的细胞 |
| 198 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-sequencing analysis identifies host long noncoding RNA MAMDC2-AS1 as a co-factor for HSV-1 nuclear transport
2020, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.42556
PMID:32226304
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，揭示了宿主长非编码RNA MAMDC2-AS1在HSV-1感染中的作用及其机制 | 首次阐明了MAMDC2-AS1作为HSV-1核运输的共因子，及其通过与Hsp90α相互作用促进病毒蛋白VP16的核运输 | NA | 探究宿主长非编码RNA在HSV-1感染中的作用及其机制 | HSV-1感染的异质性及宿主长非编码RNA MAMDC2-AS1的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 199 | 2024-08-09 |
Myeloid Cells Enriched for a Dendritic Cell Population From People Living With HIV Have Altered Gene Expression Not Restored by Antiretroviral Therapy
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00261
PMID:32194550
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研究论文 | 研究了HIV感染者中富集的髓系树突状细胞（mDC）的基因表达变化，并探讨了抗逆转录病毒治疗（ART）对这些变化的影响 | 发现HIV感染者中的mDC存在转录变化，部分变化无法通过ART完全恢复 | ART未能完全恢复HIV感染者中mDC的功能 | 探讨ART对HIV感染者中mDC基因表达变化的影响 | HIV感染者中的髓系树突状细胞（mDC） | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | HIV感染者和未感染个体的mDC |
| 200 | 2024-08-09 |
Alginate oligosaccharides improve germ cell development and testicular microenvironment to rescue busulfan disrupted spermatogenesis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.43189
PMID:32194870
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研究论文 | 本文研究了海藻酸寡糖（AOS）对布苏法因破坏的精子发生过程的缓解作用，并通过单细胞RNA测序等技术分析了其对小鼠睾丸细胞的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了AOS对布苏法因引起的精子发生障碍的缓解作用及其分子机制 | NA | 探讨AOS对布苏法因引起的精子发生障碍的缓解作用及其机制 | 小鼠睾丸细胞及精子发生过程 | NA | 男性生殖障碍 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 蛋白质印迹, 液相色谱-质谱联用 | NA | RNA, 代谢物 | 小鼠睾丸样本 |