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当前共找到 281 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Realistic in silico generation and augmentation of single-cell RNA-seq data using generative adversarial networks
2020-01-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14018-z
PMID:31919373
|
研究论文 | 提出使用条件单细胞生成对抗网络(cscGAN)来真实生成单细胞RNA-seq数据 | 首次将条件生成对抗网络应用于单细胞RNA-seq数据的生成和增强，能够学习复杂的基因间非线性依赖关系 | 未提及具体的数据集规模和验证方法的局限性 | 解决生物医学研究中样本数量不足的问题，提高分析结果的稳健性和可重复性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | GAN, cscGAN | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Sources of variation in cell-type RNA-Seq profiles
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0239495
PMID:32956417
|
研究论文 | 研究细胞类型RNA测序谱变异来源及其对细胞比例反卷积方法的影响 | 系统评估了实验室间技术变异、组织来源和测序方法对细胞类型基因表达谱的影响，首次量化了这些因素对细胞比例反卷积的混淆效应 | 仅分析了公开可用的B细胞和T细胞数据集，未涵盖其他细胞类型 | 识别影响细胞类型特异性基因表达谱变异的主要因素 | B细胞和T细胞 | 生物信息学 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开可用的bulk和单细胞RNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | UMI-based单细胞RNA测序 |
| 3 | 2025-10-06 |
Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial target in glioblastoma
2020-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0694-x
PMID:31873309
|
研究论文 | 通过免疫分析识别CD73作为胶质母细胞瘤的联合治疗靶点 | 发现胶质母细胞瘤中存在独特的CD73巨噬细胞群体，并证明靶向CD73可增强免疫检查点疗法的抗肿瘤免疫反应 | 研究样本量相对有限（94例患者），且动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证 | 探索肿瘤特异性免疫调节靶点以改善免疫检查点治疗效果 | 94例代表五种不同癌症类型的患者，包括胶质母细胞瘤、前列腺癌和结直肠癌 | 免疫肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,质谱流式细胞数据 | 94例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
A Conserved TCRβ Signature Dominates a Highly Polyclonal T-Cell Expansion During the Acute Phase of a Murine Malaria Infection
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.587756
PMID:33329568
|
研究论文 | 本研究通过分析小鼠疟疾感染急性期脾脏CD4 T细胞受体库，揭示了在高度多克隆扩增中存在保守的TCRβ特征 | 首次描述了疟疾感染急性期T细胞扩增的克隆性和克隆组成，发现TRBV3基因使用在效应T细胞库中持续占主导地位 | 研究仅限于小鼠模型，尚未确定驱动这种保守反应的宿主或寄生虫因素 | 阐明疟疾感染急性期T细胞受体库的克隆组成和特征 | 小鼠脾脏CD4 αβ T细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, RNA-seq分析 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | 多个重复实验的小鼠脾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Tocilizumab-Treated Peripheral Blood Mononuclear Cells as an in vitro Model of Inflammation
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.610682
PMID:33469465
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析托珠单抗处理的外周血单个核细胞，建立体外炎症模型 | 首次在单细胞水平展示托珠单抗对炎症相关基因和生物学通路的抑制作用 | 样本来源于肾移植受者，可能限制结果在COVID-19中的直接适用性 | 研究托珠单抗在炎症条件下的生物学效应 | 托珠单抗处理前后的刺激外周血单个核细胞 | 单细胞测序 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 体外炎症模型 | 单细胞基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
BingleSeq: a user-friendly R package for bulk and single-cell RNA-Seq data analysis
2020, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.10469
PMID:33391870
|
研究论文 | 开发了一个用户友好的R软件包BingleSeq，用于批量RNA测序和单细胞RNA测序数据分析 | 提供了同时支持批量RNA测序和单细胞RNA测序分析的灵活工具，集成了三种先进软件包并采用交互式仪表板界面 | 未在摘要中明确说明 | 开发无需编程经验的RNA测序数据分析工具 | RNA测序产生的计数矩阵数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达计数矩阵 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Role of Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity and Interactions in Vessel Wall Inflammation
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.599415
PMID:33324416
|
综述 | 本文探讨血管平滑肌细胞可塑性及其在血管壁炎症中的相互作用机制 | 整合新型技术方法揭示VSMC表现型转化的多样性及其在炎症过程中的非专业吞噬功能 | NA | 阐明动脉粥样硬化疾病中血管平滑肌细胞的生物学作用 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | NA | 心血管疾病 | 杂交邻近连接分析, CreER-loxP系统细胞命运追踪, 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Chromatin mapping and single-cell immune profiling define the temporal dynamics of ibrutinib response in CLL
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14081-6
PMID:31996669
|
研究论文 | 通过染色质图谱和单细胞免疫分析定义伊布替尼在慢性淋巴细胞白血病中应答的时间动态 | 结合免疫表型分析、单细胞转录组分析和染色质图谱，首次系统描绘了伊布替尼治疗过程中CLL细胞的调控动态程序 | 研究样本量有限，患者间存在异质性 | 阐明伊布替尼治疗慢性淋巴细胞白血病的分子调控机制 | 慢性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞分析 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组分析,染色质图谱,免疫表型分析 | NA | 单细胞转录组数据,染色质数据,免疫表型数据 | 接受伊布替尼治疗的CLL患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq,染色质图谱 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Loss of Kat2a enhances transcriptional noise and depletes acute myeloid leukemia stem-like cells
2020-01-27, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.51754
PMID:31985402
|
研究论文 | 本研究通过染色质分析和单细胞转录组学揭示Kat2a缺失通过增强转录噪音消耗急性髓系白血病干细胞样细胞 | 首次发现Kat2a通过调控转录爆发频率控制转录变异性，从而维持白血病干细胞样细胞的自我更新能力 | 研究基于条件性基因敲除小鼠模型，人类AML中的直接适用性需进一步验证 | 探究Kat2a在急性髓系白血病干细胞维持中的作用机制 | 条件性Kat2a敲除小鼠模型中的白血病干细胞样细胞 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 染色质分析, 单细胞转录组学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据, 染色质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
An optimized protocol for retina single-cell RNA sequencing
2020, Molecular vision
IF:1.8Q3
PMID:33088174
|
研究论文 | 开发了一种优化的视网膜单细胞RNA测序方案，改进了样本制备和数据分析流程 | 改良了视网膜样本的温和解离方法，减少了细胞死亡并保持细胞形态，同时改进了计算分析流程 | 比较了新鲜与冷冻视网膜样本的优缺点，但未明确说明具体适用范围 | 优化视网膜单细胞RNA测序的样本制备和数据分析方法 | 小鼠视网膜组织 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal the molecular, cellular and spatial bone marrow niche organization
2020-01, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-019-0439-6
PMID:31871321
|
研究论文 | 结合单细胞和空间转录组学系统绘制骨髓微环境的分子、细胞和空间组成图谱 | 首次结合单细胞和空间转录组技术揭示骨髓微环境的三维空间组织，开发了可从单细胞转录组数据推断空间定位的RNA-Magnet算法 | NA | 解析骨髓微环境的细胞和空间组织结构 | 骨髓驻留细胞类型，特别是Cxcl12富集网状细胞亚群 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | RNA-Magnet算法 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Vaccinology
2020, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2020/8624963
PMID:32802896
|
综述 | 本文探讨单细胞RNA测序技术在疫苗学中的应用潜力 | 系统阐述单细胞RNA测序在传染病疫苗开发中的创新应用价值 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述 | 探索单细胞RNA测序技术在疫苗研发领域的应用前景 | 疫苗免疫反应和传染病（包括COVID-19） | 系统免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-06 |
Patterns, Profiles, and Parsimony: Dissecting Transcriptional Signatures From Minimal Single-Cell RNA-Seq Output With SALSA
2020, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2020.511286
PMID:33193599
|
研究论文 | 介绍SALSA工作流程，可从超稀疏单细胞RNA测序数据中推断稳健表达谱 | 结合测量可靠性指标与潜在变量提取，使用矩阵聚焦方法识别必需基因，基于最小特征基因集进行细胞聚类 | 未明确说明算法在更复杂组织或疾病模型中的适用性 | 开发能够从稀疏单细胞RNA测序数据中提取稳健转录特征的计算方法 | 人类外周血单核细胞和小鼠视网膜细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 潜在语义分析 | 单细胞基因表达数据 | 2,700个人类外周血单细胞和64,000个小鼠视网膜细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Genomics PBMC 3K, DropSeq | 10X Genomics PBMC 3K数据集和DropSeq平台 |
| 14 | 2025-10-06 |
Nuclear MYH9-induced CTNNB1 transcription, targeted by staurosporin, promotes gastric cancer cell anoikis resistance and metastasis
2020, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.46001
PMID:32685004
|
研究论文 | 本研究揭示核MYH9通过促进CTNNB1转录增强胃癌细胞失巢凋亡抵抗和转移能力 | 首次发现MYH9在胃癌细胞核内定位并通过四个核定位信号调控CTNNB1转录的机制 | 动物模型主要使用裸鼠和转基因小鼠，临床转化需进一步验证 | 探究胃癌腹膜转移的分子机制及潜在治疗策略 | 胃癌细胞系、裸鼠模型、转基因小鼠模型、人类胃癌组织样本 | 癌症生物学 | 胃癌 | 2-DIGE, MALDI-TOF/TOF MS, 单细胞转录组测序, 免疫荧光, 免疫透射电镜, 染色质免疫沉淀, 双荧光素酶报告基因检测 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 影像数据 | 未明确样本数量，包含正常胃黏膜、原发胃癌和腹膜转移组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Sequencing From Mouse Incisor Reveals Dental Epithelial Cell-Type Specific Genes
2020, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2020.00841
PMID:32984333
|
研究论文 | 通过小鼠切牙单细胞RNA测序揭示牙釉质上皮细胞类型特异性基因 | 首次通过单细胞RNA测鉴定了牙釉质上皮细胞的新型标记基因，揭示了分泌期成釉细胞亚型分化轨迹 | 仅使用出生后7天小鼠切牙样本，未验证其他发育阶段或牙齿类型 | 阐明牙釉质上皮细胞类型的异质性 | 小鼠切牙牙釉质上皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类，伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 6,260个单细胞（出生后7天小鼠切牙） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Characterizing Adult Cochlear Supporting Cell Transcriptional Diversity Using Single-Cell RNA-Seq: Validation in the Adult Mouse and Translational Implications for the Adult Human Cochlea
2020, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2020.00013
PMID:32116546
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序首次表征了成年小鼠耳蜗支持细胞的转录组多样性，并验证其在成年人类耳蜗中的相关性 | 首次对成年耳蜗支持细胞进行单细胞转录组表征，揭示了其与围产期支持细胞的转录差异 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 为听力恢复治疗提供成年耳蜗支持细胞的转录组基准 | 成年小鼠耳蜗支持细胞和成年人类耳蜗组织 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序，荧光免疫组化，原位杂交，qPCR | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | FACS纯化的成年小鼠耳蜗支持细胞（GFP表达） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of human adipose tissue identifies depot and disease specific cell types
2020-01, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-019-0152-6
PMID:32066997
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类不同脂肪库的基质血管组分，识别与代谢疾病相关的特异性细胞类型 | 首次在人类肥胖个体中系统比较内脏和皮下脂肪组织的单细胞转录组差异，发现与2型糖尿病相关的脂肪祖细胞亚型和表达金属硫蛋白的功能失调CD8+ T细胞 | 研究样本仅来自肥胖个体，未包含正常体重对照群体 | 解析人类脂肪组织分布与代谢疾病风险的细胞学基础 | 肥胖个体的内脏和皮下脂肪组织样本 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖个体的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2025-10-06 |
New Developments in Transcriptomic Analysis of Synovial Tissue
2020, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2020.00021
PMID:32083090
|
综述 | 本文综述了滑膜组织转录组学分析技术的最新进展及其在类风湿关节炎研究中的应用 | 系统总结了从微阵列到单细胞测序再到空间转录组学的技术演进，特别强调了单细胞测序在揭示滑膜成纤维细胞亚群多样性方面的突破性贡献 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于文献综述和技术展望 | 探讨转录组学技术在滑膜组织研究中的发展历程和应用前景 | 滑膜组织，特别是类风湿关节炎患者的关节组织 | 转录组学 | 类风湿关节炎 | 微阵列，bulk RNA测序，单细胞测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics from human pancreatic islets: sample preparation matters
2020, Biology methods & protocols
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/biomethods/bpz019
PMID:31984226
|
研究论文 | 比较不同样本制备方案对人类胰岛单细胞转录组测序结果的影响 | 首次系统评估不同样本处理策略（包括固定和冷冻保存）对新鲜人类胰岛单细胞RNA测序数据的影响 | 研究仅基于两名供体的胰岛样本，样本量较小 | 评估样本制备方案对单细胞转录组测序结果的影响 | 人类胰岛组织 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2名人类供体的胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
Probabilistic cell typing enables fine mapping of closely related cell types in situ
2020-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0631-4
PMID:31740815
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研究论文 | 提出一种名为pciSeq的概率细胞分型方法，通过原位测序技术实现紧密相关细胞类型的精细空间定位 | 结合单细胞RNA测序分类结果，利用多重原位RNA检测技术实现细胞类型的概率识别和空间定位 | 方法依赖于先前的scRNA-seq分类结果，需要已有充分的基础研究数据支持 | 开发能够精确定位紧密相关细胞类型空间组织的新方法 | 小鼠海马CA1区抑制性神经元和等皮质锥体细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位测序 | 概率模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | pciSeq（概率细胞分型原位测序） |