单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 91 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Chronic Stress Induces Activity, Synaptic, and Transcriptional Remodeling of the Lateral Habenula Associated with Deficits in Motivated Behaviors
2019-12-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.09.005
PMID:31672263
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研究论文 | 本文研究了慢性压力（CS）对侧缰核（LHb）神经元的活动、突触和转录重塑，以及这些变化与动机行为缺陷的关联 | 首次揭示了CS诱导的LHb神经元超活动与被动应对（PC）增加的关联，并利用单细胞转录组学识别了一组可作为PC增加小鼠生物标志物的基因 | NA | 探讨慢性压力对侧缰核神经元的活动、突触和转录重塑及其与动机行为缺陷的关系 | 侧缰核（LHb）神经元及其与腹侧被盖区（VTA）和背缝核（DR）的神经连接 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠 |
| 62 | 2024-08-09 |
Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a microfluidic phase-switch device
2019-Dec-02, The Analyst
DOI:10.1039/c9an00823c
PMID:31688860
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research paper | 本文介绍了一种新型微流控相变装置，用于提高单细胞转录组测序的效率，特别适用于细胞数量有限的珍贵样本。 | 设计了一种集成多个单细胞隔离室的微流控装置，实现了近100%的单细胞捕获率和极低的细胞损失，并采用了一种新的相变方法将单细胞封装到皮升大小的水凝胶液滴中。 | NA | 提高单细胞转录组测序的效率和可及性。 | 单细胞转录组测序，特别是细胞数量有限的珍贵样本。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 数十个hESCs（H9） |
| 63 | 2024-08-09 |
Unravelling fibrosis using single-cell transcriptomics
2019-12, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2019.09.004
PMID:31670054
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示纤维化疾病发病机制中的应用 | 单细胞转录组学技术使得在纤维化背景下对个体致病细胞群体的研究达到了前所未有的分辨率 | NA | 探讨单细胞转录组学如何推动对纤维化疾病发病机制的理解 | 纤维化疾病及其治疗靶点的精确识别 | 单细胞转录组学 | 纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Preclinical development of T-cell receptor-engineered T-cell therapy targeting the 5T4 tumor antigen on renal cell carcinoma
2019-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-019-02419-4
PMID:31686124
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研究论文 | 本研究开发了一种针对肾细胞癌中5T4肿瘤抗原的T细胞受体工程化T细胞疗法，并通过单细胞RNA测序和功能测试验证了其有效性 | 首次探索了5T4作为T细胞受体工程化T细胞疗法的目标，并成功开发了针对该抗原的T细胞疗法 | NA | 开发和验证针对5T4肿瘤抗原的T细胞受体工程化T细胞疗法 | 5T4肿瘤抗原特异性的T细胞克隆及其功能 | 免疫疗法 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | T细胞受体工程化T细胞 | RNA | 七对独特的TRA-TRB配对 |
| 65 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing and its applications in head and neck cancer
2019-12, Oral oncology
IF:4.0Q2
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在头颈癌研究中的应用及其在基因组、转录组和表观基因组层面的技术和计算进展 | 单细胞测序技术为理解肿瘤生物学中的细微差异提供了新途径，通过识别不同的细胞亚群、解析肿瘤微环境中的信号传导以及描述细胞基因组突变和拷贝数异常 | NA | 探讨单细胞测序技术在头颈癌研究和临床实践中的应用 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞亚群及其基因组、转录组和表观基因组特征 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组数据 | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Mouse Heart Immune Infiltrate in Pressure Overload-Driven Heart Failure Reveals Extent of Immune Activation
2019-12-17, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠压力超负荷诱导的心力衰竭模型中心脏免疫浸润的组成和免疫激活情况 | 揭示了在心力衰竭中，除了已知的巨噬细胞和T淋巴细胞外，中性粒细胞、B细胞、自然杀伤细胞和肥大细胞等多种免疫细胞类型也参与了免疫激活 | NA | 探究压力超负荷诱导的心力衰竭中的心脏免疫反应 | 小鼠心脏中的免疫细胞亚群及其在心力衰竭中的变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 67 | 2024-08-09 |
Isolation of Cardiomyocytes Undergoing Mitosis With Complete Cytokinesis
2019-12-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.314908
PMID:31648614
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研究论文 | 本研究开发了一种新技术，通过使用分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞 | 本研究提出了一种新的方法，通过分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离具有真正有丝分裂潜力的心肌细胞，这是对基于DNA含量的现有方法的替代 | NA | 深入理解心肌细胞分裂的机制，特别是那些完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞 | 从人诱导多能干细胞衍生的真正增殖的心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 荧光激活细胞分选（FACS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
Inhibiting repressive epigenetic modification promotes telomere rejuvenation in somatic cell reprogramming
2019-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901486RR
PMID:31645134
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研究论文 | 研究通过小分子筛选和实验验证，发现褪黑素能促进体细胞核转移（SCNT）重编程过程中的端粒恢复，提高克隆动物的生产效率 | 首次研究了褪黑素处理与SCNT介导重编程中端粒恢复的关系，并发现褪黑素能抑制与基因沉默相关的异染色质表观遗传修饰 | NA | 提高体细胞核转移重编程的效率，促进克隆动物的生产 | 体细胞核转移重编程过程中的端粒恢复和表观遗传修饰 | NA | NA | 单细胞RNA测序，定量FISH实验 | NA | RNA | SCNT衍生胚胎 |
| 69 | 2024-08-09 |
Single-cell study of neural stem cells derived from human iPSCs reveals distinct progenitor populations with neurogenic and gliogenic potential
2019-Dec, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.12731
PMID:31651061
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来源于人诱导多能干细胞（iPSCs）和胎脑的神经干细胞（NSCs），揭示了神经发生和胶质发生前体细胞的异质性 | 发现了来源于iPS细胞的NSC与胎脑来源的NSC在神经发生前体细胞的异质性及自发分化潜能上的差异 | NA | 研究神经干细胞阶段细胞类型的内在异质性 | 来源于人诱导多能干细胞和胎脑的神经干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个来源于人诱导多能干细胞的神经干细胞系和一个来源于胎脑的神经干细胞系 |
| 70 | 2024-08-09 |
A single-cell view of tissue regeneration in plants
2019-12, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2019.09.003
PMID:31655397
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综述 | 本文综述了利用先进的分子遗传学和计算技术在植物组织再生中对单个细胞的研究进展 | 通过单细胞RNA测序（ScRNA-seq）和实时成像技术，定义了再生组织中的形态发生和细胞变化，并利用迭代计算和实验方法阐明了候选机制 | NA | 探讨植物组织再生的细胞机制 | 植物组织再生中的细胞死亡、分裂、去分化和转分化过程 | 分子遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Ontogenic Changes in Hematopoietic Hierarchy Determine Pediatric Specificity and Disease Phenotype in Fusion Oncogene-Driven Myeloid Leukemia
2019-12, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1463
PMID:31662298
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研究论文 | 本研究探讨了融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的年龄特异性及其对疾病表型的影响 | 首次揭示了融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的年龄依赖性作用，并发现关键转录因子的活性差异 | NA | 研究融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的作用及其与年龄的关系 | 融合致癌基因、儿童急性髓系白血病、关键转录因子 | 数字病理学 | 白血病 | 染色质可及性分析、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用诱导性转基因小鼠模型进行分析 |
| 72 | 2024-08-09 |
Tumour-associated macrophage-derived interleukin-1 mediates glioblastoma-associated cerebral oedema
2019-12-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awz331
PMID:31665239
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞衍生的白细胞介素-1在胶质母细胞瘤相关脑水肿中的作用，并探讨了地塞米松对此过程的影响。 | 首次证明了地塞米松能阻断骨髓来源和脑内巨噬细胞中的白细胞介素-1产生，并抑制其下游效应，同时揭示了白细胞介素-1信号通路在胶质母细胞瘤相关脑水肿治疗中的潜在价值。 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床应用的实际效果和副作用需要进一步验证。 | 探讨胶质母细胞瘤相关脑水肿的机制及潜在治疗策略。 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关巨噬细胞、脑水肿、地塞米松治疗效果。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | 涉及骨髓来源和脑内巨噬细胞的细胞培养及小鼠模型实验。 |
| 73 | 2024-08-09 |
Many Ways to Build a Polyp
2019-12, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2019.09.003
PMID:31629552
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究淡水刺胞动物Hydra的再生能力，揭示了构建Hydra水螅体的细胞谱系和基因调控网络 | 首次通过转录因子特征直接比较Hydra和水螅体在身体结构上的差异 | NA | 研究Hydra水螅体的构建机制 | Hydra水螅体的细胞谱系和基因调控网络 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of Mesp1-induced skeletal myogenic development
2019-12-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2019.09.140
PMID:31590918
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和其他策略分析了Mesp1诱导的骨骼肌发育过程 | 揭示了Mesp1+衍生物在多能性和中胚层到间充质和骨骼肌发育过程中的异质性 | NA | 探究头和躯干/四肢肌肉发育过程的差异 | Mesp1+骨骼肌衍生物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了多西环素诱导的Mesp1表达的胚胎干细胞系 |
| 75 | 2024-08-09 |
Latent cellular analysis robustly reveals subtle diversity in large-scale single-cell RNA-seq data
2019-12-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz826
PMID:31566233
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研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的分析流程——潜在细胞分析（LCA），用于处理大规模单细胞RNA测序数据 | LCA结合了余弦相似度测量和基于图的聚类算法，能够在不进行显性基因过滤的情况下，提供对群体数量推断、降维、特征选择和技术变异控制的启发式解决方案 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的挑战，如低信噪比、数据稀疏性、批次效应和可扩展性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 数十万细胞 |
| 76 | 2024-08-09 |
Diesel exhaust particles dysregulate multiple immunological pathways in murine macrophages: Lessons from microarray and scRNA-seq technologies
2019-12-15, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2019.108116
PMID:31568751
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研究论文 | 研究柴油废气颗粒（DEP）对小鼠巨噬细胞免疫途径的失调作用，使用微阵列和单细胞RNA测序技术进行分析 | 首次综合使用微阵列和单细胞RNA测序技术，分别在体外和体内研究DEP对巨噬细胞基因表达的影响 | 研究主要集中在巨噬细胞上，未涉及其他细胞类型对DEP的反应 | 探讨柴油废气颗粒如何通过影响巨噬细胞的基因表达，进而影响心血管疾病的发展 | 小鼠的腹膜和肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 体外实验使用C57BL/6J小鼠的腹膜巨噬细胞，体内实验使用C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 |
| 77 | 2024-08-09 |
Mass cytometry-based single-cell analysis of human stem cell reprogramming uncovers differential regulation of specific pluripotency markers
2019-12-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.009061
PMID:31570522
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研究论文 | 本文利用质谱流式细胞术分析了人类干细胞重编程过程中多能性标志物和细胞周期标志物的表达 | 首次使用质谱流式细胞术研究人类重编程和多能性，揭示了hiPSC重编程过程中的几个中间细胞簇和标志物表达模式 | NA | 研究人类诱导多能干细胞(hiPSCs)的重编程过程 | 人类干细胞重编程过程中的多能性标志物和细胞周期标志物 | 数字病理学 | NA | 质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 未具体说明样本数量 |
| 78 | 2024-08-09 |
Expansion of Hydra actinoporin-like toxin (HALT) gene family: Expression divergence and functional convergence evolved through gene duplication
2019-Dec, Toxicon : official journal of the International Society on Toxinology
IF:2.6Q3
DOI:10.1016/j.toxicon.2019.09.007
PMID:31513812
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研究论文 | 研究探讨了Hydra actinoporin-like toxin (HALT)基因家族的扩展，以及通过基因重复导致的表达分歧和功能趋同 | 发现HALT基因家族通过基因重复后表达的亚功能化，使其在不同细胞类型中具有特异性 | HALT-3和HALT-5在单细胞数据集中的信息缺失 | 研究HALT基因家族的功能和表达特异性 | Hydra magnipapillata中的HALT基因及其编码的蛋白质 | NA | NA | ELISA, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质, RNA | 涉及六种重组HALT蛋白和单细胞RNA测序数据集 |
| 79 | 2024-08-09 |
Next-generation computational tools for interrogating cancer immunity
2019-12, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-019-0166-7
PMID:31515541
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综述 | 本文综述了用于探究癌症免疫的下一代计算工具，讨论了各种方法的优势和局限性，并提供了方法选择的指导 | 介绍了包括单细胞测序、质谱流式细胞术和多重空间细胞表型分析在内的新兴技术，并探讨了相应的计算方法和软件工具 | 文章主要讨论了现有计算工具的优势和局限性，未深入探讨具体技术的实施细节 | 旨在综述和评估用于处理、分析和可视化癌症免疫多维数据集的计算工具 | 癌症免疫的分子和细胞特征 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序, 质谱流式细胞术, 多重空间细胞表型分析 | NA | 多维数据集 | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Dermal adipose tissue has high plasticity and undergoes reversible dedifferentiation in mice
2019-12-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI130239
PMID:31503545
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研究论文 | 本文研究了皮肤脂肪组织（dWAT）的特性及其在不同生理和病理生理条件下的可逆去分化过程 | 首次详细描述了皮肤脂肪细胞的高可塑性及其在生理和病理生理条件下的去分化和再分化过程 | NA | 探究皮肤脂肪细胞的特性和其在不同条件下的动态变化 | 皮肤脂肪细胞及其在生理和病理生理条件下的行为 | NA | NA | 脉冲追踪谱系示踪和单细胞RNA测序 | NA | 细胞和分子水平的数据 | NA |