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当前共找到 91 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
scRNA-seq assessment of the human lung, spleen, and esophagus tissue stability after cold preservation
2019-12-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1906-x
PMID:31892341
|
研究论文 | 评估冷保存对人体肺、脾和食管组织稳定性的单细胞RNA测序研究 | 首次系统评估多种人体器官在冷保存条件下单细胞RNA测序数据的稳定性，为样本收集提供时间窗口指导 | 仅评估了三种器官组织，样本量相对有限（≥5名供体），未涵盖所有人体组织类型 | 研究冷保存时间对单细胞RNA测序数据质量的影响，优化样本处理流程 | 健康人体肺组织、脾组织和食管组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | 单细胞转录组数据,基因组序列数据 | ≥5名供体的肺、脾和食管组织，共240,000个高质量单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Discrimination of Dormant and Active Hematopoietic Stem Cells by G0 Marker Reveals Dormancy Regulation by Cytoplasmic Calcium
2019-12-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.11.061
PMID:31851939
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研究论文 | 本研究通过建立G0标记小鼠系区分休眠和活跃的造血干细胞，并揭示细胞质钙浓度对干细胞休眠的调控机制 | 开发了能够可视化静息细胞的G0标记小鼠系，首次在传统静息造血干细胞群中识别出活跃与休眠亚群，发现细胞质钙浓度调控干细胞休眠的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，在人类造血干细胞中的适用性需要进一步验证 | 探究休眠与活跃造血干细胞的区分标志及其调控机制 | 小鼠造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序，高通量小分子筛选 | NA | 基因表达数据，细胞成像数据 | 小鼠造血干细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
IL-33 Signaling Alters Regulatory T Cell Diversity in Support of Tumor Development
2019-12-03, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.10.120
PMID:31801068
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示IL-33信号通过调控调节性T细胞多样性促进肿瘤发展的机制 | 首次纵向追踪肺腺癌模型中调节性T细胞的动态变化，发现ST2受体在晚期疾病中主导效应表型形成 | 研究基于基因工程小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究调节性T细胞在肿瘤发展过程中的动态变化及其免疫抑制机制 | 肺腺癌基因工程小鼠模型中的调节性T细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Characterizing smoking-induced transcriptional heterogeneity in the human bronchial epithelium at single-cell resolution
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw3413
PMID:31844660
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析吸烟对人类支气管上皮细胞转录异质性的影响 | 首次在单细胞分辨率下识别出吸烟者支气管上皮中表达支气管癌前病变标志物的新型杯状细胞周围亚群 | 样本量较小（仅12名参与者），未包含戒烟者群体 | 表征吸烟诱导的人类支气管上皮转录异质性 | 人类支气管上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 无监督分析 | 单细胞转录组数据 | 12名参与者（6名从不吸烟者，6名当前吸烟者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Transcriptomic, epigenetic, and functional analyses implicate neutrophil diversity in the pathogenesis of systemic lupus erythematosus
2019-12-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1908576116
PMID:31754025
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研究论文 | 本研究通过转录组学、表观遗传学和功能分析揭示了系统性红斑狼疮中中性粒细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | 首次系统性地识别了狼疮低密度粒细胞的两个亚群（中间成熟和未成熟中性粒细胞），并揭示了它们在染色质可及性、转录因子基序和功能特征上的差异 | 研究样本量未明确说明，且主要关注中性粒细胞亚群，可能未完全涵盖其他免疫细胞在疾病中的作用 | 阐明系统性红斑狼疮中中性粒细胞异质性及其在疾病发病机制中的具体作用 | 系统性红斑狼疮患者的低密度粒细胞、自体正常密度中性粒细胞和健康对照中性粒细胞 | 生物医学研究 | 系统性红斑狼疮 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC-seq | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Ontogenic Changes in Hematopoietic Hierarchy Determine Pediatric Specificity and Disease Phenotype in Fusion Oncogene-Driven Myeloid Leukemia
2019-12, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1463
PMID:31662298
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研究论文 | 本研究揭示了融合癌基因驱动的儿童急性髓系白血病中造血层次结构的个体发育变化决定了疾病表型和儿科特异性 | 首次证明融合癌基因在不同发育阶段的造血干细胞中具有不同的致白血病潜能，并发现表型由关键转录因子活性的可逆改变维持 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究融合癌基因驱动髓系白血病中年龄与表型特异性的关联机制 | 胎儿和成年小鼠造血干细胞、白血病细胞 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组分析、染色质可及性分析、可诱导转基因小鼠模型 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Next-generation computational tools for interrogating cancer immunity
2019-12, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-019-0166-7
PMID:31515541
|
综述 | 本文综述了用于解析癌症免疫机制的计算工具，讨论了各种方法的优缺点并提供了方法选择指南 | 系统梳理了新兴计算工具在癌症免疫研究中的应用，为多维数据分析提供方法选择指导 | 作为综述文章，未提出新的计算方法，主要基于现有工具进行评述 | 评述用于解析癌症免疫机制的计算工具和方法选择 | 癌症免疫研究中的计算分析工具 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序,质谱流式细胞术,多重空间细胞表型分析 | NA | 多维分子和细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2025-10-07 |
Elite control of HIV is associated with distinct functional and transcriptional signatures in lymphoid tissue CD8+ T cells
2019-12-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aax4077
PMID:31852798
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞方法揭示了HIV精英控制者淋巴组织中CD8+ T细胞的功能和转录特征 | 首次在淋巴组织中系统比较精英控制者与慢性进展者的HIV特异性CD8+ T细胞特征，发现非细胞毒性抑制病毒复制的新机制 | 样本量有限，研究仅针对淋巴组织，未涉及其他潜在影响因素 | 探究HIV精英控制者淋巴组织中CD8+ T细胞的功能和分子特征 | HIV精英控制者和慢性进展者的淋巴组织CD8+ T细胞 | 免疫学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | HIV精英控制者和慢性进展者淋巴组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2024-10-10 |
Co-culture of functionally enriched cancer stem-like cells and cancer-associated fibroblasts for single-cell whole transcriptome analysis
2019-12-31, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyz029
PMID:31820801
|
研究论文 | 开发了一种平台，用于分离单细胞并培养单细胞衍生的球体，以功能性富集癌症干细胞样细胞（CSCs），并研究CSCs与癌症相关成纤维细胞（CAFs）的相互作用 | 首次通过单细胞转录组测序分析了CSCs与CAFs共培养对癌症干细胞特性和上皮/间充质状态的影响，并发现了与患者生存相关的关键基因 | 研究仅限于SUM149乳腺癌细胞系，需要进一步验证在其他癌症类型中的适用性 | 研究CSCs与CAFs的相互作用及其对乳腺癌发展和转移的影响 | 乳腺癌干细胞样细胞（CSCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | SUM149乳腺癌细胞和CAFs共培养的单细胞衍生的球体 | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-09-07 |
Fast, sensitive and accurate integration of single-cell data with Harmony
2019-12, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0619-0
PMID:31740819
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Harmony的算法，用于快速、灵敏且准确地整合单细胞RNA测序数据 | Harmony算法能够将细胞投影到一个共享嵌入空间中，使得细胞按细胞类型分组而非数据集特定的条件，同时考虑了多个实验和生物因素 | NA | 开发一种高效的方法来整合不同技术测量的单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据，包括外周血单核细胞、胰腺胰岛细胞、小鼠胚胎发育数据以及空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Harmony算法 | RNA测序数据 | 约10个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-21 |
Transcriptomic and Single-Cell Analysis of the Murine Parotid Gland
2019-12, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/0022034519882355
PMID:31623513
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析了小鼠腮腺在不同成熟阶段的转录组特征 | 首次全面揭示了腮腺在不同成熟阶段的全球基因表达谱，并发现了腮腺特异性的基因特征和细胞异质性 | NA | 阐明腮腺的分子特性 | 小鼠腮腺的转录组和单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同成熟阶段的小鼠腮腺样本 | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiles of Retinal Ganglion Cells Differing in Resilience to Injury Reveal Neuroprotective Genes
2019-12-18, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.11.006
PMID:31784286
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序对小鼠视网膜神经节细胞的选择性抗损伤能力进行了分析 | 该研究首次建立了一套系统框架，以解析不同类型的细胞对损伤的反应，并揭示了用于干预的分子靶标 | 研究主要聚焦于小鼠模型，可能无法完全代表其他物种的情况 | 探讨视网膜神经节细胞对损伤的抗性及相关基因 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 46种视网膜神经节细胞类型的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-05 |
scPred: accurate supervised method for cell-type classification from single-cell RNA-seq data
2019-12-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1862-5
PMID:31829268
|
研究论文 | 本文介绍了scPred，一种从单细胞RNA测序数据中进行细胞类型分类的准确监督方法 | scPred通过无偏特征选择与机器学习概率预测方法的结合，提供了高度准确的单细胞分类 | NA | 研究单细胞的转录特征，以便进行细胞类型分类 | 单细胞RNA测序数据，涉及胰腺组织、单核细胞、结肠肿瘤活检和循环树突状细胞 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-05 |
High-throughput dense reconstruction of cell lineages
2019-12, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.190229
PMID:31822210
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评论 | 本文汇编了关于高通量细胞谱系重建会议的共识，讨论了新技术的挑战及解决方案 | 探讨了结合单细胞RNA测序的新工具，允许在单细胞分辨率下重建复杂模型生物的谱系 | 会议内容仅为共识，并未提供具体实验数据和结果 | 研究新工具在重建细胞谱系中的应用及其技术挑战 | 高通量细胞谱系重建的新工具和策略 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-05 |
Single-cell connectomic analysis of adult mammalian lungs
2019-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aaw3851
PMID:31840053
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了成年哺乳动物肺部细胞间相互作用 | 揭示了肺泡细胞群体之间的信号传递系统，并确定了各细胞类型在远端肺部的功能角色 | 研究主要集中于成年哺乳动物，未涉及其他发展阶段或物种的肺部细胞交互 | 阐明影响组织稳态的细胞间相互作用机制 | 成年小鼠、大鼠、猪和人类的肺组织 | 数字病理学 | 慢性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 未明确说明具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-05 |
Establishment of a high-resolution 3D modeling system for studying pancreatic epithelial cell biology in vitro
2019-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2019.09.005
PMID:31767167
|
研究论文 | 本文建立了一种高分辨率的三维培养系统，用于研究胰腺上皮细胞生物学 | 本文首次建立了一种简单可重复的基于Matrigel的三维囊泡培养模型，可用于小鼠和人类胰腺前体的研究 | 尚未提及实验证明该系统在体内应用的有效性 | 研究胰腺上皮化和内分泌发育的机制 | 小鼠和人类的胰腺前体细胞 | 数字病理学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 三维囊泡培养模型 | 细胞文化数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-05 |
cellHarmony: cell-level matching and holistic comparison of single-cell transcriptomes
2019-12-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz789
PMID:31529053
|
研究论文 | 本文介绍了cellHarmony，一个用于单细胞转录组分析和比较的新工具 | cellHarmony采用社区聚类和对齐策略有效匹配单细胞转录组，能够揭示细胞特异的基因表达差异 | NA | 研究目的在于定义疾病相关细胞群体内外的变化，理解人类疾病的分子发病机制 | 研究对象为正常和疾病状态下的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 潜在涉及数十个细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-07 |
High-throughput sequencing of the transcriptome and chromatin accessibility in the same cell
2019-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0290-0
PMID:31611697
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SNARE-seq的方法，能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性 | SNARE-seq方法能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性，实现了转录调控与其输出结果的直接匹配 | NA | 开发一种能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性的方法 | 新生和成年小鼠大脑皮层的细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠大脑皮层5,081个细胞，成年小鼠大脑皮层10,309个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-07 |
Visualizing structure and transitions in high-dimensional biological data
2019-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0336-3
PMID:31796933
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PHATE的视觉化方法，用于揭示高维生物数据中的结构和模式 | PHATE方法能够捕捉数据点之间的信息几何距离，更好地保留数据的局部和全局非线性结构 | NA | 开发一种新的视觉化工具，以直观地展示高维生物数据中的结构和模式 | 高维生物数据，包括人工和生物数据集 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高维数据 | 包括新产生的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Single-nuclei RNA-seq on human retinal tissue provides improved transcriptome profiling
2019-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12917-9
PMID:31848347
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序（snRNA-seq）技术对人类视网膜组织进行了转录组分析 | 本研究展示了单核RNA测序在人类冷冻组织中获取单细胞转录组的能力，相较于人类批量RNA测序或动物模型，提供了更深入的见解 | NA | 通过单核RNA测序技术解析复杂组织中的异质性 | 人类视网膜组织及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本，来自3名健康捐赠者，共5873个单核 | NA | NA | NA | NA |