单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 97 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
TCF-1-Centered Transcriptional Network Drives an Effector versus Exhausted CD8 T Cell-Fate Decision
2019-11-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.09.013
PMID:31606264
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和谱系追踪研究了TCF-1在慢性感染早期驱动CD8 T细胞命运分岔中的作用 | 首次揭示了TCF-1在早期命运决定和初始生成耗竭CD8 T细胞中的作用，并发现PD-1稳定了TCF-1耗竭前体细胞池 | NA | 探讨TCF-1在CD8 T细胞命运决定中的作用及其机制 | TCF-1在慢性感染早期对CD8 T细胞命运分岔的影响 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | TCF-1Ly108PD-1 CD8 T细胞群体 |
| 62 | 2024-08-09 |
Human Cortical Organoids Expose a Differential Function of GSK3 on Cortical Neurogenesis
2019-11-12, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.09.005
PMID:31607568
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研究论文 | 研究利用人皮质脑类器官探讨GSK3抑制对皮质神经发生的长远影响 | 首次揭示GSK3信号在人皮质发生中的功能相关性，并发现GSK3在调节谷氨酸能谱系和外径向胶质细胞输出中的选择性作用 | NA | 探讨GSK3抑制对人类皮质发生的独特特征的影响 | 人皮质脑类器官 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多个发育阶段的人皮质脑类器官 |
| 63 | 2024-08-09 |
Author Correction: Tubular cell and keratinocyte single-cell transcriptomics applied to lupus nephritis reveal type I IFN and fibrosis relevant pathways
2019-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0529-4
PMID:31605099
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Landscape of Noncoding RNA in Prostate Cancer
2019-11, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2019.08.004
PMID:31623872
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综述 | 本文综述了前列腺癌中非编码RNA的最新发现，特别是长非编码RNA（lncRNAs）和环状RNA（circRNAs）的生物学特性及其临床应用 | 介绍了非编码RNA在前列腺癌中的新研究方向，如RNA-蛋白质相互作用、RNA二级结构和空间转录组学 | NA | 总结前列腺癌中lncRNAs和circRNAs的最新发现，并讨论其临床应用 | 前列腺癌中的非编码RNA，特别是lncRNAs和circRNAs | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-蛋白质相互作用、RNA二级结构、空间转录组学 | NA | RNA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
PhISCS: a combinatorial approach for subperfect tumor phylogeny reconstruction via integrative use of single-cell and bulk sequencing data
2019-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.234435.118
PMID:31628256
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PhISCS的方法，通过整合单细胞和批量测序数据，用于亚完美肿瘤系统发育重建 | PhISCS是首个整合单细胞和批量测序数据并考虑违反ISA突变的方法，提供了解决方案的最优性保证 | 单细胞测序技术的局限性，如频繁的等位基因丢失和可变的序列覆盖，可能导致无法构建完美的系统发育树 | 解决单细胞测序数据在肿瘤系统发育重建中的局限性，并提出一种新的组合方法 | 肿瘤系统发育树的重建 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 批量测序 | 整数线性规划(ILP), 布尔约束满足问题(CSP) | 单细胞测序数据, 批量测序数据 | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
Using single-cell transcriptomics to understand functional states and interactions in microbial eukaryotes
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0098
PMID:31587645
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研究论文 | 本文讨论了如何通过单细胞转录组学分析来揭示原生生物的生物学特性 | 利用单细胞转录组学技术深入研究微生物真核生物的功能状态和相互作用 | NA | 探讨单细胞转录组学在理解微生物真核生物生物学特性中的应用 | 微生物真核生物的功能状态、生理状态及与其他生物的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
Uncovering microbial inter-domain interactions in complex communities
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0087
PMID:31587646
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research paper | 本文讨论了epicPCR技术在揭示复杂微生物群落中真核生物和细菌间相互作用的应用 | epicPCR技术能够以单细胞分辨率恢复给定环境中完整的相互作用网络 | 文章指出epicPCR在操作的微观尺度、高吞吐量和探索性质方面存在挑战和局限 | 揭示微生物群落中的跨域相互作用 | 真核生物和细菌的相互作用 | NA | NA | epicPCR | NA | DNA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
Combined cultivation and single-cell approaches to the phylogenomics of nucleariid amoebae, close relatives of fungi
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0094
PMID:31587649
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研究论文 | 本文通过传统培养和单细胞基因组（SCG）及单细胞转录组扩增方法，研究了核衣壳阿米巴（Opisthokonta）的系统发育基因组学 | 采用SCG扩增技术识别了可能属于Chlamydiales和Rickettsiales的细菌内共生体，并基于264个保守蛋白质和74个单拷贝蛋白质域的数据集进行了系统发育基因组学分析 | 核衣壳阿米巴的多样性和进化历史仍了解不足 | 旨在克服核衣壳阿米巴多样性和进化历史了解不足的限制 | 核衣壳阿米巴的基因组和转录组数据 | 系统发育学 | NA | 单细胞基因组（SCG）和单细胞转录组扩增方法 | NA | 基因组和转录组数据 | 三个物种的基因组和转录组数据 |
| 69 | 2024-08-09 |
Zebrafish MITF-Low Melanoma Subtype Models Reveal Transcriptional Subclusters and MITF-Independent Residual Disease
2019-Nov-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-19-0037
PMID:31582381
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研究论文 | 本研究利用斑马鱼遗传模型研究了低活性Mitfa（MITF-low）状态对黑色素瘤进展的影响，并揭示了MITF-独立残留疾病的转录亚群。 | 首次建立了斑马鱼MITF-低黑色素瘤亚型模型，并发现了MITF-独立残留疾病的异质性及其与人类治疗抵抗性黑色素瘤的相似性。 | NA | 研究MITF-低黑色素瘤的生物学意义及其对患者预后的影响，并探索潜在的治疗策略。 | 斑马鱼遗传模型中的MITF-低黑色素瘤及其残留疾病。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
Absence of HIF1A Leads to Glycogen Accumulation and an Inflammatory Response That Enables Pancreatic Tumor Growth
2019-11-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-18-2994
PMID:31585939
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研究论文 | 研究HIF1A缺失对胰腺肿瘤生长的影响及其机制 | 发现HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞通过积累糖原和分泌炎症细胞因子，启动替代的细胞因子和树突状细胞驱动的血管生成途径 | 研究仅在异种移植小鼠模型中进行，可能需要进一步的人体研究验证 | 探讨HIF1A在胰腺肿瘤血管生成中的作用及其替代途径 | HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞及其在肿瘤生长中的作用 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞和小鼠肿瘤基质细胞 |
| 71 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Uniparental Embryos Reveals Parent-of-Origin Effects on Human Preimplantation Development
2019-Nov-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.09.004
PMID:31588047
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，系统地研究了人类双亲和单亲胚胎从1细胞到桑椹胚阶段的转录组特征，揭示了父母基因组对早期胚胎发育的影响 | 首次系统地分析了单亲胚胎的单细胞转录组，并发现了父母特异性表达基因及其在胚胎发育中的作用 | NA | 探究父母基因组对人类早期胚胎发育的贡献 | 人类双亲和单亲胚胎的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多个双亲和单亲胚胎样本 |
| 72 | 2024-08-09 |
Locally instructed CXCR4hi neutrophils trigger environment-driven allergic asthma through the release of neutrophil extracellular traps
2019-11, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0496-9
PMID:31591573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了低剂量脂多糖（LPS）暴露下肺中性粒细胞在过敏性哮喘中的作用 | 首次揭示了低剂量LPS暴露下，肺中性粒细胞通过上调CXCR4表达并释放中性粒细胞外陷阱（NETs），促进过敏性哮喘的发生 | 研究主要基于小鼠模型，可能与人类情况存在差异 | 探讨环境因素如何通过肺中性粒细胞影响过敏性哮喘的发生 | 肺中性粒细胞及其在过敏性哮喘中的作用 | NA | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 73 | 2024-08-09 |
Centrifugal-Driven Droplet Generation Method with Minimal Waste for Single-Cell Whole Genome Amplification
2019-11-05, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.9b02786
PMID:31571488
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研究论文 | 本文介绍了一种离心驱动的液滴生成方法，用于快速、方便地从较小体积样本中生成均匀液滴，以实现单细胞全基因组扩增。 | 该方法通过减少扩增偏差和增加基因组覆盖率，解决了传统多重置换扩增（MDA）方法的非均匀扩增问题，并实现了超过98%的样本利用率。 | NA | 开发一种新的液滴生成方法，以提高单细胞全基因组扩增的质量和效率。 | 单细胞全基因组扩增技术。 | 生物医学 | NA | 多重置换扩增（MDA） | NA | 基因组数据 | 5 μL样本 |
| 74 | 2024-08-09 |
Early adaptive immune activation detected in monozygotic twins with prodromal multiple sclerosis
2019-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI128475
PMID:31566584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了多发性硬化症（MS）不一致同卵双胞胎脑脊液细胞的基因表达模式，揭示了早期适应性免疫激活的证据 | 首次在MS和亚临床神经炎症（SCNI）受试者的脑脊液细胞中检测到克隆扩增的CD8+ T细胞、浆母细胞和CD4+ T细胞，并发现这些细胞具有组织驻留记忆T（TRM）细胞的特征 | 样本量较小，仅包括六对同卵双胞胎，可能影响结果的普遍性 | 探究多发性硬化症的早期适应性免疫激活机制 | 多发性硬化症不一致同卵双胞胎的脑脊液细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 2752个脑脊液细胞 |
| 75 | 2024-08-09 |
Premature mitotic entry induced by ATR inhibition potentiates olaparib inhibition-mediated genomic instability, inflammatory signaling, and cytotoxicity in BRCA2-deficient cancer cells
2019-11, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12573
PMID:31529615
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研究论文 | 本研究探讨了ATR抑制剂诱导的过早有丝分裂进入如何增强PARP抑制剂奥拉帕尼在BRCA2缺陷癌细胞中的细胞毒性效应 | 发现ATR抑制剂通过加速有丝分裂进入，形成染色质桥和滞后染色体，增强奥拉帕尼处理的BRCA2缺陷细胞的基因组不稳定性 | NA | 揭示PARP抑制剂诱导细胞毒性的机制，并开发增强HR缺陷肿瘤中PARP抑制剂疗效的联合策略 | BRCA2缺陷的癌细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 使用BRCA2缺陷和Brca2敲除的癌细胞系模型进行实验 |
| 76 | 2024-08-09 |
High-Throughput Single-Cell Sequencing with Linear Amplification
2019-11-21, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2019.08.002
PMID:31495564
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研究论文 | 本文介绍了一种名为sci-L3的高通量单细胞测序方法，该方法结合了组合索引和线性扩增技术 | sci-L3方法采用三层索引方案，减少了扩增偏差并实现了指数级的通量增加 | NA | 展示sci-L3方法的通用性，并应用于单细胞全基因组测序、靶向测序以及基因组和转录组的共测定 | sci-L3-WGS方法用于分析超过10,000个F1杂交小鼠的精子和精子前体基因组，映射了86,786个交叉点并描述了罕见的染色体错误分离事件 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 超过10,000个精子和精子前体样本 |
| 77 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Gene Signatures Associated with T-cell Persistence Following Adoptive Cell Therapy
2019-Nov, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-19-0299
PMID:31484655
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了与T细胞持久性相关的基因特征，这些特征在转移性上皮癌患者的过继细胞治疗后被识别 | 首次通过单细胞转录组分析，识别了与T细胞持久性相关的特定基因表达谱，为改进过继细胞治疗提供了新的见解 | 研究仅基于单一患者的数据，结果的普遍性和可重复性有待进一步验证 | 识别与过继细胞治疗后T细胞持久性相关的基因特征，以改进治疗策略 | 转移性结直肠癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）及其在过继细胞治疗后的持久性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 单一患者，涉及472个和528个差异表达基因 |
| 78 | 2024-08-09 |
Tracing the first hematopoietic stem cell generation in human embryo by single-cell RNA sequencing
2019-Nov, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-019-0228-6
PMID:31501518
|
研究论文 | 使用单细胞RNA测序技术，构建了人类胚胎发育过程中内皮细胞向造血干细胞转变的基因表达全景图 | 首次在全基因组尺度上构建了人类胚胎发育过程中内皮细胞向造血干细胞转变的基因表达图谱，并通过亚分类技术显著富集了造血内皮细胞 | NA | 追踪人类胚胎中第一个造血干细胞的产生 | 人类胚胎中的造血干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涵盖Carnegie阶段12-14的多个样本 |
| 79 | 2024-08-09 |
Cardiomyocyte dedifferentiation and remodeling in 3D scaffolds to generate the cellular diversity of engineering cardiac tissues
2019-Nov-01, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/c9bm01003c
PMID:31455969
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研究论文 | 本研究探讨了心肌细胞在三维支架微环境中的细胞命运及其在工程心脏组织细胞多样性生成中的作用 | 首次展示了细胞在三维支架微环境中为生存而进行的适应性去分化，生成异质性组织 | NA | 确定心肌细胞在三维支架微环境中的细胞命运及其在生成工程心脏组织细胞多样性中的作用 | 心肌细胞在三维支架中的去分化和重塑过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 细胞 | 包含与心脏内源性类别相关的多种细胞类型 |
| 80 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomic Map of the Human and Mouse Bladders
2019-11, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019040335
PMID:31462402
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术创建了人类和小鼠膀胱的单细胞转录组图谱 | 发现了两种新型的人类膀胱细胞类型，并验证了这些细胞在小鼠和老鼠膀胱中的存在 | NA | 为了理解良性膀胱疾病和膀胱癌的细胞起源，创建了正常人类膀胱的细胞解剖学综合图谱 | 人类和小鼠的膀胱细胞类型及其功能 | digital pathology | bladder cancer | scRNA-seq | NA | text | 12,423个人类膀胱细胞和12,884个小鼠膀胱细胞 |