单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 97 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics reveals changes in expression during hair-cell development
2019-11-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50777
PMID:31682227
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研究论文 | 本文利用单细胞纳米级 shotgun 质谱技术研究了鸡胚胎第15天椭圆囊中分化中的毛细胞的蛋白质表达动态变化 | 首次使用单细胞质谱技术揭示了毛细胞分化过程中蛋白质表达的变化，并与单细胞转录组数据相结合，提供了细胞发育特征的新见解 | NA | 探索内耳中感觉毛细胞分化过程中的蛋白质表达动态变化 | 鸡胚胎第15天椭圆囊中的毛细胞及其前体细胞 | 蛋白质组学 | NA | 单细胞 shotgun 质谱技术 | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling Reveals Sex, Lineage, and Regional Diversity in the Mouse Kidney
2019-11-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.10.005
PMID:31689386
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研究论文 | 本研究通过解剖引导的单细胞RNA测序结合原位表达研究和细胞系追踪，揭示了成年雄性和雌性小鼠肾脏的细胞多样性、显著的性别差异以及肾单位的组织和细胞组成 | 研究首次综合了单细胞RNA测序、原位表达研究和细胞系追踪，揭示了小鼠肾脏中的细胞多样性和性别差异，并创建了一个可搜索的数据库Kidney Cell Explorer | NA | 增强对哺乳动物肾脏的理解，特别是在细胞多样性和性别差异方面 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏 | 数字病理学 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-09 |
Non-templated addition and template switching by Moloney murine leukemia virus (MMLV)-based reverse transcriptases co-occur and compete with each other
2019-11-29, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.010676
PMID:31640989
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研究论文 | 本研究详细分析了基于Moloney鼠白血病病毒（MMLV）的逆转录酶在模板切换过程中的偏倚，特别是RNA模板5'端序列和性质（加帽与非加帽）对这些偏倚的影响 | 研究发现非模板添加和模板切换是同时且相互竞争的过程，这与当前对模板切换过程的理解相反 | NA | 探讨单细胞RNA测序中模板切换机制的细节及其影响因素 | Moloney鼠白血病病毒（MMLV）型逆转录酶的模板切换特性和非模板添加的组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Dynamics of trophoblast differentiation in peri-implantation-stage human embryos
2019-11-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1911362116
PMID:31636193
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析培养的人类囊胚细胞，定义了在绒毛膜形成前的第8天至第12天植入期周围胎盘滋养层细胞的转录组图谱 | 首次详细描述了人类胚胎植入期间滋养层细胞的动态分化过程，并揭示了不同类型滋养层细胞的转录组特征 | NA | 研究人类胚胎植入期间滋养层细胞的分化动态及其转录组特征 | 人类胚胎植入期间的滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从培养的胚胎中手动挑选的3种早期胎盘细胞类型（细胞滋养层细胞、合体滋养层细胞和迁移性滋养层细胞） | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
Immunology Driven by Large-Scale Single-Cell Sequencing
2019-11, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2019.09.004
PMID:31645299
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研究论文 | 本文讨论了利用大规模单细胞多组学数据和改进的计算方法来解析免疫细胞身份的必要性 | 提出了结合大规模单细胞多组学数据和先进计算方法来深入研究免疫细胞的多样性和可塑性 | NA | 探讨如何利用大规模单细胞多组学数据和计算方法来解析免疫细胞身份 | 免疫细胞的多样性和可塑性 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 大规模 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
Single-pollen-cell sequencing for gamete-based phased diploid genome assembly in plants
2019-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.251033.119
PMID:31649061
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研究论文 | 本文介绍了一种结合花粉原生质体分离和单细胞DNA扩增技术的新方法，用于植物配子阶段的双倍体基因组组装 | 本文首次成功利用单花粉细胞测序技术，实现了梨基因组的高效准确分相，揭示了梨参考基因组中8.12%的基因存在镶嵌式组装 | 该方法目前仅在梨这一特定植物物种中得到验证，其普遍适用性有待进一步研究 | 开发一种新的方法，用于植物配子阶段的双倍体基因组组装，并分析基因表达的等位效应 | 梨基因组及其在花粉中减数分裂期间的重组信息 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 12个花粉细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thymic Lymphoid Progenitors and Thymus Organogenesis in Human Embryos
2019-11-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.09.008
PMID:31604687
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，解析了人类胚胎中前胸腺淋巴祖细胞和胸腺器官发生的空间时间发育过程 | 首次揭示了人类胚胎中前胸腺淋巴祖细胞的类型和特征，并探讨了胸腺上皮细胞发育及细胞间相互作用在胸腺器官发生中的作用 | NA | 阐明调控人类胚胎中T淋巴细胞生成的细胞和分子机制 | 人类胚胎中的淋巴祖细胞和胸腺器官发生 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个胚胎和胎儿阶段的造血和造血干细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
TCF-1-Centered Transcriptional Network Drives an Effector versus Exhausted CD8 T Cell-Fate Decision
2019-11-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.09.013
PMID:31606264
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和谱系追踪研究了TCF-1在慢性感染早期驱动CD8 T细胞命运分岔中的作用 | 首次揭示了TCF-1在早期命运决定和初始生成耗竭CD8 T细胞中的作用，并发现PD-1稳定了TCF-1耗竭前体细胞池 | NA | 探讨TCF-1在CD8 T细胞命运决定中的作用及其机制 | TCF-1在慢性感染早期对CD8 T细胞命运分岔的影响 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | TCF-1Ly108PD-1 CD8 T细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-08-09 |
Author Correction: Tubular cell and keratinocyte single-cell transcriptomics applied to lupus nephritis reveal type I IFN and fibrosis relevant pathways
2019-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0529-4
PMID:31605099
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-08-09 |
Landscape of Noncoding RNA in Prostate Cancer
2019-11, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2019.08.004
PMID:31623872
|
综述 | 本文综述了前列腺癌中非编码RNA的最新发现，特别是长非编码RNA（lncRNAs）和环状RNA（circRNAs）的生物学特性及其临床应用 | 介绍了非编码RNA在前列腺癌中的新研究方向，如RNA-蛋白质相互作用、RNA二级结构和空间转录组学 | NA | 总结前列腺癌中lncRNAs和circRNAs的最新发现，并讨论其临床应用 | 前列腺癌中的非编码RNA，特别是lncRNAs和circRNAs | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-蛋白质相互作用、RNA二级结构、空间转录组学 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
PhISCS: a combinatorial approach for subperfect tumor phylogeny reconstruction via integrative use of single-cell and bulk sequencing data
2019-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.234435.118
PMID:31628256
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PhISCS的方法，通过整合单细胞和批量测序数据，用于亚完美肿瘤系统发育重建 | PhISCS是首个整合单细胞和批量测序数据并考虑违反ISA突变的方法，提供了解决方案的最优性保证 | 单细胞测序技术的局限性，如频繁的等位基因丢失和可变的序列覆盖，可能导致无法构建完美的系统发育树 | 解决单细胞测序数据在肿瘤系统发育重建中的局限性，并提出一种新的组合方法 | 肿瘤系统发育树的重建 | 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞测序, 批量测序 | 整数线性规划(ILP), 布尔约束满足问题(CSP) | 单细胞测序数据, 批量测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
Using single-cell transcriptomics to understand functional states and interactions in microbial eukaryotes
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0098
PMID:31587645
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研究论文 | 本文讨论了如何通过单细胞转录组学分析来揭示原生生物的生物学特性 | 利用单细胞转录组学技术深入研究微生物真核生物的功能状态和相互作用 | NA | 探讨单细胞转录组学在理解微生物真核生物生物学特性中的应用 | 微生物真核生物的功能状态、生理状态及与其他生物的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-08-09 |
Uncovering microbial inter-domain interactions in complex communities
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0087
PMID:31587646
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research paper | 本文讨论了epicPCR技术在揭示复杂微生物群落中真核生物和细菌间相互作用的应用 | epicPCR技术能够以单细胞分辨率恢复给定环境中完整的相互作用网络 | 文章指出epicPCR在操作的微观尺度、高吞吐量和探索性质方面存在挑战和局限 | 揭示微生物群落中的跨域相互作用 | 真核生物和细菌的相互作用 | NA | NA | epicPCR | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Combined cultivation and single-cell approaches to the phylogenomics of nucleariid amoebae, close relatives of fungi
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0094
PMID:31587649
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研究论文 | 本文通过传统培养和单细胞基因组（SCG）及单细胞转录组扩增方法，研究了核衣壳阿米巴（Opisthokonta）的系统发育基因组学 | 采用SCG扩增技术识别了可能属于Chlamydiales和Rickettsiales的细菌内共生体，并基于264个保守蛋白质和74个单拷贝蛋白质域的数据集进行了系统发育基因组学分析 | 核衣壳阿米巴的多样性和进化历史仍了解不足 | 旨在克服核衣壳阿米巴多样性和进化历史了解不足的限制 | 核衣壳阿米巴的基因组和转录组数据 | 系统发育学 | NA | 单细胞基因组（SCG）和单细胞转录组扩增方法 | NA | 基因组和转录组数据 | 三个物种的基因组和转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-09 |
Absence of HIF1A Leads to Glycogen Accumulation and an Inflammatory Response That Enables Pancreatic Tumor Growth
2019-11-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-18-2994
PMID:31585939
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研究论文 | 研究HIF1A缺失对胰腺肿瘤生长的影响及其机制 | 发现HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞通过积累糖原和分泌炎症细胞因子，启动替代的细胞因子和树突状细胞驱动的血管生成途径 | 研究仅在异种移植小鼠模型中进行，可能需要进一步的人体研究验证 | 探讨HIF1A在胰腺肿瘤血管生成中的作用及其替代途径 | HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞及其在肿瘤生长中的作用 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞和小鼠肿瘤基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Uniparental Embryos Reveals Parent-of-Origin Effects on Human Preimplantation Development
2019-Nov-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.09.004
PMID:31588047
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，系统地研究了人类双亲和单亲胚胎从1细胞到桑椹胚阶段的转录组特征，揭示了父母基因组对早期胚胎发育的影响 | 首次系统地分析了单亲胚胎的单细胞转录组，并发现了父母特异性表达基因及其在胚胎发育中的作用 | NA | 探究父母基因组对人类早期胚胎发育的贡献 | 人类双亲和单亲胚胎的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多个双亲和单亲胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-08-09 |
Centrifugal-Driven Droplet Generation Method with Minimal Waste for Single-Cell Whole Genome Amplification
2019-11-05, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.9b02786
PMID:31571488
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研究论文 | 本文介绍了一种离心驱动的液滴生成方法，用于快速、方便地从较小体积样本中生成均匀液滴，以实现单细胞全基因组扩增。 | 该方法通过减少扩增偏差和增加基因组覆盖率，解决了传统多重置换扩增（MDA）方法的非均匀扩增问题，并实现了超过98%的样本利用率。 | NA | 开发一种新的液滴生成方法，以提高单细胞全基因组扩增的质量和效率。 | 单细胞全基因组扩增技术。 | 生物医学 | NA | 多重置换扩增（MDA） | NA | 基因组数据 | 5 μL样本 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
Early adaptive immune activation detected in monozygotic twins with prodromal multiple sclerosis
2019-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI128475
PMID:31566584
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了多发性硬化症（MS）不一致同卵双胞胎脑脊液细胞的基因表达模式，揭示了早期适应性免疫激活的证据 | 首次在MS和亚临床神经炎症（SCNI）受试者的脑脊液细胞中检测到克隆扩增的CD8+ T细胞、浆母细胞和CD4+ T细胞，并发现这些细胞具有组织驻留记忆T（TRM）细胞的特征 | 样本量较小，仅包括六对同卵双胞胎，可能影响结果的普遍性 | 探究多发性硬化症的早期适应性免疫激活机制 | 多发性硬化症不一致同卵双胞胎的脑脊液细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 2752个脑脊液细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
Premature mitotic entry induced by ATR inhibition potentiates olaparib inhibition-mediated genomic instability, inflammatory signaling, and cytotoxicity in BRCA2-deficient cancer cells
2019-11, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12573
PMID:31529615
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研究论文 | 本研究探讨了ATR抑制剂诱导的过早有丝分裂进入如何增强PARP抑制剂奥拉帕尼在BRCA2缺陷癌细胞中的细胞毒性效应 | 发现ATR抑制剂通过加速有丝分裂进入，形成染色质桥和滞后染色体，增强奥拉帕尼处理的BRCA2缺陷细胞的基因组不稳定性 | NA | 揭示PARP抑制剂诱导细胞毒性的机制，并开发增强HR缺陷肿瘤中PARP抑制剂疗效的联合策略 | BRCA2缺陷的癌细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 使用BRCA2缺陷和Brca2敲除的癌细胞系模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-08-09 |
Tracing the first hematopoietic stem cell generation in human embryo by single-cell RNA sequencing
2019-Nov, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-019-0228-6
PMID:31501518
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序技术，构建了人类胚胎发育过程中内皮细胞向造血干细胞转变的基因表达全景图 | 首次在全基因组尺度上构建了人类胚胎发育过程中内皮细胞向造血干细胞转变的基因表达图谱，并通过亚分类技术显著富集了造血内皮细胞 | NA | 追踪人类胚胎中第一个造血干细胞的产生 | 人类胚胎中的造血干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涵盖Carnegie阶段12-14的多个样本 | NA | NA | NA | NA |