单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 66 篇文献，本页显示第 61 - 66 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Matrix-metalloproteinase expression and gelatinase activity in the avian retina and their influence on Müller glia proliferation
2019-10, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2019.112984
PMID:31251936
|
研究论文 | 本研究探讨了兴奋性毒性损伤后鸟类视网膜中明胶酶活性的动态变化及其对Müller胶质细胞前体细胞形成的影响 | 首次揭示了MMP2在Müller胶质细胞向Müller胶质细胞前体细胞重编程中的作用 | NA | 研究明胶酶在视网膜再生中的作用 | 鸟类视网膜中的明胶酶活性和Müller胶质细胞前体细胞的形成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及鸟类视网膜中的多种细胞类型，包括少突胶质细胞、非星形内视网膜胶质细胞（NIRG）、小胶质细胞、Müller胶质细胞（MG）等 |
| 62 | 2024-08-09 |
CD166 Engagement Augments Mouse and Human Hematopoietic Progenitor Function via Activation of Stemness and Cell Cycle Pathways
2019-10, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.3053
PMID:31260147
|
研究论文 | 本文研究了CD166在鼠和人类造血祖细胞功能中的增强作用，通过激活干细胞和细胞周期通路 | 首次展示了CD166同型相互作用在体外增强鼠和人类造血祖细胞生成的能力，并通过单细胞RNA测序分析揭示了CD166参与激活多种信号通路 | NA | 探讨CD166在维持干细胞/祖细胞功能中的作用 | 鼠和人类的造血干细胞和祖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了来自野生型和CD166敲除小鼠的LSK细胞以及人脐带血CD34细胞 |
| 63 | 2024-08-09 |
Functional genomics of CDHR3 confirms its role in HRV-C infection and childhood asthma exacerbations
2019-10, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2019.01.052
PMID:30930175
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研究论文 | 本研究通过功能基因组学方法，证实了CDHR3蛋白在HRV-C感染和儿童哮喘加重中的作用 | 使用单细胞转录组学、CRISPR-Cas9基因敲除和基因型特异性供体实验，首次在原代气道上皮细胞中研究CDHR3的功能及其对HRV-C感染的影响 | NA | 确定CDHR3是否是HRV-C感染原代气道上皮细胞所必需的，并识别CDHR3变异体增加哮喘加重风险的分子机制 | CDHR3蛋白及其编码变异体rs6967330在HRV-C感染和儿童哮喘加重中的作用 | 遗传学 | 哮喘 | 单细胞转录组学、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据 | 原代气道上皮细胞 |
| 64 | 2024-08-09 |
Probabilistic count matrix factorization for single cell expression data analysis
2019-10-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz177
PMID:30865271
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研究论文 | 本文提出了一种概率计数矩阵分解（pCMF）方法，用于单细胞表达数据分析，该方法基于稀疏Gamma-Poisson因子模型，并使用变分EM算法进行推断 | pCMF方法能够同时构建细胞和基因的低维表示，适用于单细胞数据的可视化和聚类 | NA | 探索高吞吐量单细胞测序技术在细胞转录组群体多样性研究中的应用 | 单细胞表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | Gamma-Poisson因子模型 | 表达数据 | NA |
| 65 | 2024-08-09 |
SinNLRR: a robust subspace clustering method for cell type detection by non-negative and low-rank representation
2019-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz139
PMID:30821315
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研究论文 | 本文提出了一种名为SinNLRR的新型单细胞RNA测序（scRNA-seq）细胞类型检测方法，基于相似性学习的非负和低秩表示的鲁棒子空间聚类方法 | 该方法通过在相似矩阵上施加非负和低秩结构，并采用交替方向乘子法解决优化问题，提出了一种自适应惩罚选择方法以避免对参数的敏感性 | NA | 开发新的scRNA-seq聚类方法以解决细胞异质性和多样性的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 不同数据集 |
| 66 | 2024-08-09 |
Destin: toolkit for single-cell analysis of chromatin accessibility
2019-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz141
PMID:30821321
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研究论文 | 本文介绍了Destin工具包，用于单细胞染色质可及性数据的生物信息学和统计分析 | Destin通过加权主成分分析进行细胞类型聚类，并利用现有基因组注释和公开的调控组数据进行加权，优于现有方法 | NA | 开发和评估一种新的生物信息学和统计框架，用于单细胞染色质可及性数据的全面分析 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | 加权主成分分析 | 单细胞数据 | 2088个成年小鼠前脑细胞 |