单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 66 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of human T cells reveals tissue and activation signatures in health and disease
2019-10-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12464-3
PMID:31624246
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示人类T细胞在健康和疾病状态下的组织特异性特征和活化特征 | 首次建立人类T细胞在多个组织部位的高维参考图谱，揭示组织特异性T细胞特征和谱系特异性活化状态 | 样本来源仅限于肺部、淋巴结、骨髓和血液组织，未涵盖所有人体组织 | 研究组织部位对人类T细胞持久性和功能的影响 | 人类T细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过50,000个静息和活化T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Interleukin-36γ-producing macrophages drive IL-17-mediated fibrosis
2019-10-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aax4783
PMID:31604843
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析鉴定生物材料诱导的功能性巨噬细胞亚群及其在组织修复和纤维化中的作用 | 首次发现CD9IL-36γ巨噬细胞亚群驱动IL-17介导的纤维化过程 | 体内功能性巨噬细胞亚群的鉴定和表型特征描述仍有限 | 研究生物材料诱导的巨噬细胞亚群在免疫反应和组织修复中的功能 | 小鼠和人类组织样本中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | 无偏聚类和伪时间分析 | 单细胞RNA测序数据 | 从小鼠生物基质和合成生物材料中分选的巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
Lifting the veil on macrophage diversity in tissue regeneration and fibrosis
2019-10-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aaz0749
PMID:31604845
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示巨噬细胞在组织修复和纤维化过程中的多样性作用 | 首次通过单细胞RNA测序系统解析巨噬细胞在组织修复与纤维化中的异质性功能 | NA | 阐明巨噬细胞在组织再生和纤维化过程中的作用机制 | 巨噬细胞 | 单细胞组学 | 纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Dissociation of solid tumor tissues with cold active protease for single-cell RNA-seq minimizes conserved collagenase-associated stress responses
2019-10-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1830-0
PMID:31623682
|
研究论文 | 本研究比较了低温蛋白酶和胶原酶在实体瘤组织解离中对单细胞RNA测序的影响 | 发现胶原酶消化会诱导应激反应基因表达，而低温活性蛋白酶能最小化这种应激反应 | 应激反应具有组织和细胞类型依赖性，可能影响癌症单细胞研究中应激通路表达的解读 | 研究不同组织解离方法对单细胞RNA测序技术变异和生物学变异的影响 | 患者癌组织、患者来源的乳腺癌异种移植模型和癌细胞系 | 单细胞测序 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 155,165个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Integrative Transcriptomics Reveals Sexually Dimorphic Control of the Cholinergic/Neurokine Interface in Schizophrenia and Bipolar Disorder
2019-10-15, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.017
PMID:31618642
|
研究论文 | 开发整合转录组学方法揭示精神分裂症和双相情感障碍中胆碱能/神经因子界面的性别二态性调控机制 | 建立整合大规模转录组元分析、单细胞测序和连接组学的多维度分析方法，突破传统仅关注最低p值转录本的局限 | 方法尚未应用于其他神经递质系统和疾病的研究 | 解析精神分裂症和双相情感障碍的性别二态性分子机制 | 患者脑组织、CNS神经元、人源性别特异性细胞系 | 生物信息学 | 精神分裂症, 双相情感障碍 | RNA测序, 单细胞测序, 短RNA测序, 转录组元分析 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 连接组数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Tissue stiffness at the human maternal-fetal interface
2019-10-02, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/dez139
PMID:31579915
|
研究论文 | 本研究测量了人类母胎界面不同组织的硬度，发现胎盘侵入部位的底蜕膜硬度显著高于其他组织 | 首次对人类母胎界面不同组织进行直接硬度测量，揭示了底蜕膜硬度的特异性增加 | 采用离体组织测量，缺乏血流影响；不孕症患者的子宫内膜样本可能无法代表正常生育女性 | 探究人类母胎界面组织的机械特性及其对胚胎植入和胎盘发育的影响 | 人类非妊娠期分泌期子宫内膜、早期妊娠底蜕膜、壁蜕膜和胎盘组织 | 生物力学 | 生殖医学 | 原子力显微镜、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 非妊娠子宫内膜(N=5)、底蜕膜(N=6)、壁蜕膜(N=5)、胎盘(N=5)、Matrigel(N=5) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue profiling
2019-10, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-019-0548-y
PMID:31501547
|
研究论文 | 开发了一种高分辨率空间转录组学方法，用于原位组织分析 | 创建了密集空间条形码珠阵列，能在2微米分辨率下同时捕获RNA和空间信息 | NA | 开发高分辨率空间转录组学技术用于组织分析 | 小鼠脑组织和原发性乳腺癌组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间RNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 密集空间条形码珠阵列 |
| 8 | 2025-10-06 |
Single-Cell Applications of Next-Generation Sequencing
2019-10-01, Cold Spring Harbor perspectives in medicine
IF:7.8Q1
DOI:10.1101/cshperspect.a026898
PMID:30617056
|
综述 | 本文为非专业人士提供单细胞测序技术的高层次概述，并展示其在胚胎学、发育遗传学和癌症研究中的基础与临床应用 | 系统阐述下一代测序技术在单细胞生物学中开启的新前沿，实现数百至数百万细胞的并行分析 | NA | 概述单细胞测序技术及其在基础研究和临床应用中的影响 | 异质性细胞群体（包括组织、生物体、微生物生态系统和癌细胞） | 基因组学 | 癌症 | 下一代测序（NGS） | NA | RNA和DNA序列数据 | 数百至数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Machine learning predicts putative hematopoietic stem cells within large single-cell transcriptomics data sets
2019-10, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2019.08.009
PMID:31513832
|
研究论文 | 开发了一种名为hscScore的机器学习工具，用于从单细胞转录组数据中识别小鼠骨髓造血干细胞 | 首次开发了基于机器学习的方法来替代传统流式细胞术鉴定造血干细胞，能够在缺乏表面标志物信息的情况下从大规模单细胞转录组数据中识别HSCs | 目前仅在小鼠骨髓数据上验证，尚未在人类样本或其他组织中测试 | 建立从单细胞转录组数据中识别造血干细胞的替代方法 | 小鼠骨髓造血干细胞 | 机器学习 | 血液疾病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | 多个实验室的小鼠骨髓单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Proliferation-competent Tcf1+ CD8 T cells in dysfunctional populations are CD4 T cell help independent
2019-10-01, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1902701116
PMID:31530725
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了CD4 T细胞帮助对慢性感染和癌症中CD8 T细胞前体群体功能的影响 | 发现功能失调群体中具有增殖能力的Tcf1+ CD8 T细胞前体不依赖CD4 T细胞帮助，这与传统记忆T细胞形成鲜明对比 | 研究主要关注慢性感染和癌症模型中的T细胞反应，可能不适用于其他免疫环境 | 探究CD4 T细胞帮助对CD8 T细胞前体群体维持和分化的调控机制 | 慢性感染和癌症模型中的CD8 T细胞群体 | 免疫学 | 慢性感染和癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Epigenomics and Single-Cell Sequencing Define a Developmental Hierarchy in Langerhans Cell Histiocytosis
2019-10, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-19-0138
PMID:31345789
|
研究论文 | 通过单细胞测序和表观基因组分析揭示朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的发育层次结构 | 首次在LCH病变中识别出多种复发性LCH细胞类型，包括推定的LCH祖细胞和分化LCH细胞亚群，并定义了不同LCH细胞亚群的表观基因组和基因调控基础 | NA | 探索LCH病理生理学的分子机制及其临床异质性特征 | 原发性LCH病变 | 单细胞组学 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序,染色质可及性分析,免疫组织化学 | NA | 转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
Correcting the Mean-Variance Dependency for Differential Variability Testing Using Single-Cell RNA Sequencing Data
2019-Oct-23, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.08.003
PMID:31647917
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-11 |
Nonparametric expression analysis using inferential replicate counts
2019-10-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz622
PMID:31372651
|
研究论文 | 本文提出了一种使用推断复制计数的非参数模型Swish，用于RNA-seq数据中的差异表达分析，并考虑了推断不确定性 | Swish方法在控制假发现率方面表现更好，特别是在具有高推断不确定性的转录本上 | NA | 旨在改进RNA-seq数据中差异表达基因或转录本的识别，同时控制技术偏差 | RNA-seq数据中的差异表达基因或转录本 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 非参数模型 | RNA-seq数据 | 涉及单细胞RNA-seq数据集中的亚群细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-05 |
Heterogeneity and plasticity in healthy and atherosclerotic vasculature explored by single-cell sequencing
2019-Oct-01, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvz185
PMID:31350876
|
综述 | 文章探讨了通过单细胞测序研究健康和动脉粥样硬化血管中的异质性和可塑性。 | 提出了异质性和可塑性的定义，并通过单细胞测序探讨了血管中的新知识。 | 当前单细胞测序研究在重复次数、细胞数量和空间信息的丧失方面存在一些局限性。 | 研究单细胞测序在揭示血管异质性中的应用及其局限性。 | 研究了健康和动脉粥样硬化血管中的细胞异质性和可塑性。 | 数字病理学 | 动脉粥样硬化 | 单细胞测序（SCS） | NA | RNA序列数据 | 使用了不同数量的细胞，具体数量不详 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-05 |
Decoding human fetal liver haematopoiesis
2019-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1652-y
PMID:31597962
|
research paper | 本文研究了人类胎儿肝脏中的确定性造血过程 | 通过单细胞转录组分析，揭示了人类发育过程中血液和免疫细胞的谱系 | 在对人类的理解方面仍然有限，特别是在特定的微环境影响下 | 探讨胎儿肝脏中的造血干细胞和多能前体的自我更新及分化机制 | 大约140,000个肝脏细胞和74,000个皮肤、肾脏和卵黄囊细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 约140,000个肝脏细胞和74,000个皮肤、肾脏和卵黄囊细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-05 |
Applications of single cell RNA sequencing to research of stem cells
2019-Oct-26, World journal of stem cells
IF:3.6Q3
DOI:10.4252/wjsc.v11.i10.722
PMID:31692946
|
综述 | 该文章探讨了单细胞RNA测序技术在干细胞研究中的应用 | 强调了单细胞RNA测序在揭示干细胞异质性及其子群体方面的重要性 | 未提及具体的实验数据或研究局限性 | 旨在深入理解干细胞的异质性及其潜在的治疗应用 | 主要研究干细胞的不同亚群体及其基因表达特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-05 |
Lgr5 and Col22a1 Mark Progenitor Cells in the Lineage toward Juvenile Articular Chondrocytes
2019-10-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.08.006
PMID:31522976
|
研究论文 | 本文通过谱系追踪研究识别了Lgr5标记的细胞群体在关节组织形成中的贡献 | 揭示了Lgr5细胞在关节前体的谱系分化及其向关节软骨细胞的进展中的重要性 | 对谱系标记的细胞在整个关节组织形成过程中的具体作用尚不完全了解 | 探索关节形成过程中前体细胞的谱系规格化 | Lgr5和Col22a1标记的前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-05 |
The CRISPR-Cas13a Gene-Editing System Induces Collateral Cleavage of RNA in Glioma Cells
2019-Oct-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201901299
PMID:31637166
|
研究论文 | 这篇文章探讨了CRISPR-Cas13a基因编辑系统在胶质瘤细胞中对RNA的附带切割效应。 | 文章的创新点在于证明了CRISPR-Cas13a系统在EGFRvIII过表达的胶质瘤细胞中诱导了细胞死亡及其附带效应。 | 文章未提及具体的局限性。 | 研究CRISPR-Cas13a系统在癌细胞上的潜在应用和机制。 | 研究对象为EGFRvIII过表达的胶质瘤细胞。 | 数字病理学 | 胶质瘤 | CRISPR-Cas13a | NA | RNA测序 | U87-Cas13a-EGFRvIII细胞，具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-05 |
LTMG: a novel statistical modeling of transcriptional expression states in single-cell RNA-Seq data
2019-10-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz655
PMID:31372654
|
研究论文 | 该文章开发了LTMG模型以捕捉单细胞RNA-seq数据中的基因表达状态的多样性 | LTMG模型通过处理低表达和零表达的数据，提供了对单细胞基因表达状态的多重模式的推断 | NA | 研究单细胞RNA-seq数据中基因表达状态的建模 | 单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 混合高斯模型 | 基因表达数据 | 大量scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepatocellular Carcinoma
2019-Oct-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.003
PMID:31675496
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研究论文 | 本研究结合两种单细胞RNA测序技术，分析了肝细胞癌患者五个免疫相关部位的CD45免疫细胞转录组 | 首次揭示了LAMP3树突状细胞在肿瘤与淋巴结间的迁移潜力及其对多种淋巴细胞亚型的调控作用 | NA | 深入了解肝细胞癌的免疫微环境 | 肝细胞癌患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自五个不同部位的肝细胞癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |