单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-09	Diverse repertoire of human adipocyte subtypes develops from transcriptionally distinct mesenchymal progenitor cells 2019-09-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.1906512116 PMID:31420514	研究论文	本文报道了4种不同的人类脂肪细胞亚型及其各自的间充质前体细胞的存在和特征	发现了多种新型的人类脂肪细胞亚型，这些亚型在表型和功能上具有差异性，并且与特定的间充质前体细胞相关	NA	揭示人类脂肪组织功能及其在代谢疾病中的作用	人类脂肪细胞亚型及其间充质前体细胞	NA	代谢疾病	单细胞测序技术	NA	转录组数据	NA
42	2024-08-09	Single-Cell Survey of Human Lymphatics Unveils Marked Endothelial Cell Heterogeneity and Mechanisms of Homing for Neutrophils 2019-09-17, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2019.06.027 PMID:31402260	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术对33,000个人类淋巴结中的淋巴管内皮细胞（LECs）进行了全面分析	揭示了六种主要类型的人类LECs，并发现了髓质淋巴管内皮细胞在人类免疫中的新作用	NA	全面表征淋巴管内皮细胞的异质性，并揭示其在人类免疫中的新角色	人类淋巴结中的淋巴管内皮细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	33,000个淋巴管内皮细胞
43	2024-08-09	Author Correction: Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma 2019-Sep, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-019-0212-1 PMID:31409908	correction	对一篇关于单细胞RNA测序揭示胰腺导管腺癌内肿瘤异质性和恶性进展的论文进行修正	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
44	2024-08-09	Targeted sequencing aids in identifying clonality in chronic myelomonocytic leukemia 2019-09, Leukemia research IF:2.1Q3 DOI:10.1016/j.leukres.2019.106190 PMID:31377458	研究论文	本研究通过分子和细胞遗传学分析以及单细胞测序技术，探讨了慢性粒单核细胞白血病（CMML）中克隆性的鉴定	首次在韩国CMML患者中使用单细胞测序技术，发现与先前在白种人研究中不同的突变频率和类型	研究样本仅限于韩国患者，可能限制了结果的普遍性	确定CMML的克隆性，并探讨其分子和细胞遗传学特征	慢性粒单核细胞白血病患者	数字病理学	血液疾病	靶向测序	NA	基因数据	35名CMML患者，41份骨髓样本，2例单细胞分析
45	2024-08-09	Smooth Muscle Cell Phenotypic Diversity 2019-09, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.119.312131 PMID:31340668	综述	本文综述了血管平滑肌细胞（SMC）的表型多样性及其在健康和疾病血管组织中的作用	利用体内命运图谱系统和单细胞RNA测序技术，深入探讨了SMC的表型特征及其在血管疾病中的作用	尚未完全揭示SMC表型转换的机制及其功能相关性	探讨SMC表型多样性及其在血管疾病中的作用，并讨论结合命运图谱和单细胞转录组学技术的机遇与挑战	血管平滑肌细胞及其在血管疾病中的作用	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	转录组	NA
46	2024-08-09	Generation of Human PSC-Derived Kidney Organoids with Patterned Nephron Segments and a De Novo Vascular Network 2019-09-05, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2019.06.009 PMID:31303547	研究论文	本文介绍了一种生成具有血管化三维（3D）肾脏类器官的多功能协议，并展示了其在疾病建模和药物验证中的应用	通过动态调节WNT信号通路，控制近端与远端肾单位的相对比例，并生成相关的血管内皮生长因子A（VEGFA）水平，定义了驻留的血管网络	NA	研究人类肾脏发育、疾病发病机制建模及患者特异性药物验证	人类多能干细胞衍生的肾脏类器官	NA	遗传性多囊肾病	单细胞RNA测序	NA	类器官	NA
47	2024-08-09	Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity and malignant progression in pancreatic ductal adenocarcinoma 2019-Sep, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-019-0195-y PMID:31273297	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤内异质性和恶性进展	发现了PDAC中具有异常和恶性基因表达谱的两种导管亚型，并揭示了肿瘤内在转录状态与T细胞激活之间的联系	NA	全面描绘PDAC的肿瘤内异质性及其恶性进展的潜在机制	胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和恶性进展	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组	57,530个胰腺细胞
48	2024-08-09	CHETAH: a selective, hierarchical cell type identification method for single-cell RNA sequencing 2019-09-19, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkz543 PMID:31226206	研究论文	本文介绍了一种名为CHETAH的单细胞RNA测序细胞类型识别方法，该方法通过层次分类技术，能够快速且准确地识别细胞类型，并提供中间或未分类的选项	CHETAH算法在处理未知类型的细胞时具有更高的特异性，如在肿瘤样本中能够准确识别出恶性细胞，并将其标记为中间或未分类	NA	开发一种新的单细胞RNA测序细胞类型识别方法，以提高细胞类型识别的准确性和特异性	单细胞RNA测序数据中的细胞类型	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	层次分类	基因表达数据	NA
49	2024-08-09	Cellular crosstalk in the development and regeneration of the respiratory system 2019-09, Nature reviews. Molecular cell biology DOI:10.1038/s41580-019-0141-3 PMID:31217577	综述	本文综述了呼吸系统在发育和再生过程中细胞间相互作用的研究进展	利用单细胞测序技术、细胞和组织成像以及细胞谱系追踪等新技术的进展，揭示了呼吸系统细胞和功能异质性比预期更高且高度适应	NA	探讨协调呼吸系统发育和再生的细胞间相互作用	呼吸系统的细胞相互作用及其在发育、环境交互和损伤响应中的作用	NA	NA	单细胞测序	NA	细胞数据	NA
50	2024-08-09	Single-cell transcriptomics reveals the landscape of intra-tumoral heterogeneity and stemness-related subpopulations in liver cancer 2019-09-10, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2019.06.002 PMID:31195060	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了肝癌内部异质性和与干细胞特性相关的亚群	首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了肝癌内部的异质性，并识别出可能与干细胞特性相关的新亚克隆	研究主要集中在体外和裸鼠模型中，需要进一步的临床验证	探索肝癌内部的异质性及其与干细胞特性相关亚群的关系	肝癌细胞及其亚群	数字病理学	肝癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中明确
51	2024-08-09	What has single-cell RNA-seq taught us about mammalian spermatogenesis? 2019-09-01, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioz088 PMID:31077285	综述	本文综述了单细胞RNA测序技术在哺乳动物精子发生研究中的应用及其揭示的分子机制	单细胞RNA测序技术揭示了精子发生过程中先前未被发现的细胞类型间的分子异质性	NA	探讨单细胞RNA测序数据在精子发生研究中的当前价值和未来应用潜力	哺乳动物的精子发生过程及其相关细胞类型	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
52	2024-08-09	Single-cell Transcriptomics and Solid Organ Transplantation 2019-09, Transplantation IF:5.3Q1 DOI:10.1097/TP.0000000000002725 PMID:30946217	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在实体器官移植中的应用，探讨了其在移植病理学中的潜力及未来发展方向	scRNA-seq能够识别稀有细胞类型、新的细胞状态和细胞间通信网络，这些在传统的整体转录组分析中可能被掩盖	NA	探讨单细胞测序技术在移植领域的应用及其未来发展	单细胞RNA测序技术及其在实体器官移植中的应用	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组	NA
53	2024-08-09	PROSSTT: probabilistic simulation of single-cell RNA-seq data for complex differentiation processes 2019-09-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btz078 PMID:30715210	研究论文	本文介绍了一种名为PROSSTT的概率模拟方法，用于生成具有复杂拓扑结构的单细胞RNA测序数据集，以支持细胞谱系树重建工具的测试和开发	PROSSTT能够模拟具有任意复杂度、噪声水平、噪声模型和大小的单细胞RNA测序数据集，并提供脚本量化预测谱系树的质量	NA	开发和测试用于细胞谱系树重建的工具	单细胞RNA测序数据集及其谱系树	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	概率模拟	RNA测序数据	任意大小
54	2024-08-09	ClusterMap: compare multiple single cell RNA-Seq datasets across different experimental conditions 2019-09-01, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btz024 PMID:30649203	研究论文	本文介绍了一种名为ClusterMap的方法和流程，用于比较不同生物条件下多个单细胞RNA测序数据集	ClusterMap通过层次聚类标记基因的方法匹配不同样本中的细胞亚型，并引入纯度树切割方法和可分离性度量来量化匹配质量和总结亚群变化	NA	开发一种有效的方法来比较不同条件下多个单细胞RNA测序数据集，以理解生物过程和亚群水平的潜在机制	单细胞RNA测序数据集在不同生物条件下的比较	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	层次聚类	RNA测序数据	多个单细胞RNA测序数据集