单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 74 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2024-11-23 |
RNase H-dependent PCR-enabled T-cell receptor sequencing for highly specific and efficient targeted sequencing of T-cell receptor mRNA for single-cell and repertoire analysis
2019-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0195-x
PMID:31341290
|
研究论文 | 介绍了一种基于RNase H依赖的PCR技术进行T细胞受体测序的方法，用于单细胞和T细胞受体库分析 | 该方法通过RNase H依赖的PCR技术实现了T细胞受体的特异性扩增和双索引条码的添加，简化了工作流程，并提高了单细胞T细胞受体配对信息的成功率 | 与基于液滴的方法相比，该方法的通量较低，适用于分析小规模的排序细胞群体 | 开发一种高效且特异性的T细胞受体测序方法，用于单细胞和T细胞受体库分析 | T细胞受体（TCR）的α/β克隆型和T细胞受体库 | 基因测序 | NA | RNase H依赖的PCR（rhPCR） | NA | RNA | 单细胞或批量RNA样本，单细胞分析可处理384孔板中的细胞 |
| 2 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analyses reveal novel targets modulating cardiac neovascularization by resident endothelial cells following myocardial infarction
2019-08-07, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehz305
PMID:31162546
|
研究论文 | 该文章探讨了心肌梗死后，成体小鼠心脏中内皮细胞在新血管生成中的起源和克隆动态 | 首次提供了心脏特异性内皮细胞的单细胞基因表达图谱，揭示了内源性血管修复的转录层级 | 主要基于鼠模型，可能在转化到人类的生物学和临床应用上存在局限性 | 旨在更好地理解冠状血管再生的调控通路，以支持心脏疾病的治疗策略 | 成体小鼠心脏中的内皮细胞及其在心肌梗死后的新血管生成 | 数字病理学 | 心脏疾病 | 单细胞转录组分析 | 多谱系谱系追踪小鼠模型 | 基因表达数据 | 包括小鼠和人类心脏样本 |
| 3 | 2024-08-05 |
Embracing Systems Toxicology at Single-Cell Resolution
2019-Aug, Current opinion in toxicology
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.cotox.2019.04.003
PMID:31768481
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞分辨率下的系统毒理学。 | 介绍了单细胞RNA测序如何改变系统毒理学研究，能够敏感地检测细胞变化并精确识别受毒物影响的细胞 | NA | 研究系统毒理学在单细胞解析中的应用 | 主要集中在通过单细胞技术研究细胞特定的变化和响应轨迹 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 4 | 2024-08-05 |
Testis single-cell RNA-seq reveals the dynamics of de novo gene transcription and germline mutational bias in Drosophila
2019-08-16, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.47138
PMID:31418408
|
研究论文 | 该研究探讨了果蝇睾丸中遗传新奇性表达模式及其细胞类型的动态变化 | 研究首次揭示了特定细胞类型中de novo基因的表达模式及其与生殖细胞替代的关系 | 研究主要集中在果蝇的睾丸，可能无法直接推广至其他物种 | 研究睾丸中的遗传新奇性如何影响生殖功能和进化创新 | 成年果蝇的睾丸细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 成年果蝇睾丸细胞的单细胞样本 |
| 5 | 2024-08-07 |
Large Particle Fluorescence-Activated Cell Sorting Enables High-Quality Single-Cell RNA Sequencing and Functional Analysis of Adult Cardiomyocytes
2019-08-16, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.315493
PMID:31415233
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6 | 2024-08-05 |
scAlign: a tool for alignment, integration, and rare cell identification from scRNA-seq data
2019-08-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1766-4
PMID:31412909
|
研究论文 | scAlign是一种用于对scRNA-seq数据进行对齐、集成和稀有细胞识别的工具 | 提出了一种无监督深度学习方法scAlign，可处理部分、重叠或完整的细胞标签集，具备出色的数据集集成性能 | NA | 解决单细胞RNA测序数据的集成及稀有细胞的识别问题 | 单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 深度学习 | 基因表达数据 | NA |
| 7 | 2024-08-05 |
Multi-Objective Optimized Fuzzy Clustering for Detecting Cell Clusters from Single-Cell Expression Profiles
2019-08-13, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes10080611
PMID:31412637
|
研究论文 | 本文提出了一种多目标优化的模糊聚类方法，用于从单细胞RNA测序数据中检测细胞簇 | 创新点在于结合多目标优化和模糊聚类算法进行细胞簇的识别 | 未提及具体的计算效率和方法的适用范围 | 目标是提高从单细胞RNA测序数据中检测细胞簇的准确性 | 研究对象为小鼠稀有肠道细胞类型的单细胞表达谱 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 模糊c均值聚类 | 表达数据 | 288个细胞，来自23,630个基因特征 |
| 8 | 2024-08-07 |
Molecular and anatomical organization of the dorsal raphe nucleus
2019-08-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.46464
PMID:31411560
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、原位杂交、解剖追踪和空间相关性分析，研究了小鼠背侧缝核的转录和空间细胞特征 | 揭示了至少18种不同的神经元亚型和5种血清素能神经元亚型，其中包括一种优先支配基底神经节的血清素能神经元亚型 | NA | 阐明背侧缝核的分子组织结构 | 小鼠背侧缝核的细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 39,411个单细胞 |
| 9 | 2024-08-07 |
Deciphering Brain Complexity Using Single-cell Sequencing
2019-08, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2018.07.007
PMID:31586689
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解析大脑复杂性方面的进展和应用 | 介绍了单细胞测序技术在脑研究中的新应用，如细胞类型分类、脑发育和脑疾病机制 | 讨论了单细胞测序领域面临的挑战和未来发展 | 旨在概述单细胞测序产生的大数据如何推动神经科学进步，并揭示理解脑功能和疾病的复杂问题 | 人类大脑中的细胞类型、连接性和功能 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组、基因组和/或表观基因组数据 | NA |
| 10 | 2024-08-07 |
Intrinsic Resistance to Immune Checkpoint Blockade in a Mismatch Repair-Deficient Colorectal Cancer
2019-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-18-0683
PMID:31217164
|
研究论文 | 本文描述了一例MSI-H结直肠癌患者在接受免疫检查点抑制剂治疗后出现疾病进展的情况，并通过基因组、转录组和病理学特征分析了其内在抗药性 | 研究揭示了MSI-H肿瘤对免疫检查点抑制剂的抗药性机制，并提出了针对结直肠癌的免疫治疗策略 | 研究仅基于单一病例，可能需要更多样本验证结果 | 探讨MSI-H结直肠癌对免疫检查点抑制剂的内在抗药性 | MSI-H结直肠癌患者的肿瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析，多重免疫荧光 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 数百个结直肠癌样本 |
| 11 | 2024-08-08 |
When blood development meets single-cell transcriptomics
2019-Aug, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000007
PMID:35402794
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在血液细胞发育中的应用，特别是造血干细胞（HSCs）的生成过程。 | 结合单细胞转录组学技术，提供了关于血液细胞生成过程中分子演变及其机制的新见解。 | NA | 探讨单细胞转录组学技术在血液细胞发育研究中的应用及未来展望。 | 血液细胞的生成过程，特别是造血干细胞（HSCs）。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 12 | 2024-08-08 |
Tumor heterogeneity of acute myeloid leukemia: insights from single-cell sequencing
2019-Aug, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000015
PMID:35402804
|
综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术研究急性髓系白血病异质性的进展 | 单细胞测序技术为分析个体细胞层面的基因组、转录组、蛋白质组和表观基因组提供了强大工具 | 讨论了单细胞测序技术在急性髓系白血病预后和治疗中的局限性和未来方向 | 理解肿瘤在疾病进展和治疗干预选择下的演化 | 急性髓系白血病的肿瘤异质性 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组和表观基因组数据 | NA |
| 13 | 2024-08-09 |
Clustering methods for single-cell RNA-sequencing expression data: performance evaluation with varying sample sizes and cell compositions
2019-08-14, Statistical applications in genetics and molecular biology
IF:0.8Q3
DOI:10.1515/sagmb-2019-0004
PMID:31646845
|
研究论文 | 本文评估了11种单细胞RNA测序（scRNA-seq）聚类方法在不同样本大小和细胞组成条件下的性能 | 首次系统评估了样本大小和细胞组成对scRNA-seq数据聚类方法性能的影响 | 研究仅使用了合成数据集，可能与真实数据存在差异 | 评估不同样本大小和细胞组成对scRNA-seq数据聚类方法性能的影响 | 11种scRNA-seq聚类方法的性能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 聚类方法 | 表达数据 | 合成数据集，具有不同的样本大小和子群数量 |
| 14 | 2024-08-09 |
Endothelial Cell Development and Its Application to Regenerative Medicine
2019-08-02, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.311405
PMID:31518171
|
综述 | 本文综述了内皮细胞的分化和特化过程及其在干细胞生物学和再生医学中的应用 | 介绍了信号通路和转录调控因子在内皮细胞分化和特化中的作用，以及单细胞测序技术在研究血管异质性和发育中的应用 | NA | 探讨内皮细胞发育及其在再生医学中的应用 | 内皮细胞的分化和特化过程，以及其在干细胞生物学和再生医学中的应用 | 再生医学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-09 |
ascend: R package for analysis of single-cell RNA-seq data
2019-08-01, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giz087
PMID:31505654
|
研究论文 | ascend是一个R包，旨在简化并加速单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的初步分析 | ascend包整合了多种分析方法，提供了灵活的生物信息学工具和R函数集成，同时支持快速并行计算和高效内存管理 | NA | 开发一个强大、快速且灵活的工具包，用于单细胞RNA测序数据的分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | 大量单细胞样本 |
| 16 | 2024-08-09 |
A hotspot for new genes
2019-08-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50136
PMID:31464682
|
研究论文 | 本文通过果蝇的单细胞RNA测序，揭示了新基因在精子形成过程中的表达情况 | 提供了关于新基因在精子形成过程中表达的详细和前所未有的图像 | NA | 探索新基因在果蝇精子形成过程中的表达 | 果蝇的单细胞RNA | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 17 | 2024-08-09 |
Light-induced injury in mouse embryos revealed by single-cell RNA sequencing
2019-Aug-29, Biological research
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40659-019-0256-1
PMID:31466525
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了高强度光照对小鼠胚胎的影响 | 首次通过转录组学研究探索了光照诱导的损伤及其在着床前胚胎中的响应 | NA | 研究高强度光照对小鼠胚胎的影响及其潜在的修复响应 | 小鼠胚胎从2细胞阶段到囊胚阶段的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 不同光照条件下的多个小鼠胚胎样本 |
| 18 | 2024-08-09 |
High-resolution analysis of germ cells from men with sex chromosomal aneuploidies reveals normal transcriptome but impaired imprinting
2019-08-28, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-019-0720-3
PMID:31462300
|
研究论文 | 本研究通过深度亚硫酸氢盐测序和单细胞RNA测序技术，分析了Klinefelter综合征患者生殖细胞的表观遗传和转录组特征 | 首次揭示了Klinefelter综合征患者生殖细胞具有正常的转录组，但在印记区域存在DNA甲基化异常 | 研究受限于Klinefelter综合征患者睾丸中生殖细胞数量较少 | 探究Klinefelter综合征患者生殖细胞的分子生物学特性，特别是其DNA甲基化模式和转录组 | Klinefelter综合征患者的生殖细胞 | NA | 性染色体非整倍体 | 深度亚硫酸氢盐测序，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 19 | 2024-08-09 |
Temporal and partial inhibition of GLI1 in neural stem cells (NSCs) results in the early maturation of NSC derived oligodendrocytes in vitro
2019-08-27, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-019-1374-y
PMID:31455382
|
研究论文 | 本研究通过在神经干细胞（NSCs）中短暂和部分抑制GLI1，促进了NSC来源的少突胶质细胞在体外早期成熟 | 使用小分子GANT61短暂和部分抑制GLI1，促进了少突胶质细胞前体细胞（OPCs）的迁移能力和早期分化为产生髓鞘的少突胶质细胞 | NA | 开发一种基于小分子的体外方案，以更快地生成功能性少突胶质细胞 | 人诱导多能干细胞（iPSC）和人胚胎干细胞（hESCs）来源的神经干细胞（NSCs）及其衍生的少突胶质细胞 | 干细胞研究 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（RNA-Seq） | NA | RNA | 192个少突胶质细胞前体细胞（OPCs） |
| 20 | 2024-08-09 |
ALK mutation dynamics and clonal evolution in a neuroblastoma model exhibiting two ALK mutations
2019-Aug-13, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.27119
PMID:31452835
|
研究论文 | 本研究分析了神经母细胞瘤模型中ALK基因突变动力学和克隆进化 | 首次揭示了神经母细胞瘤模型中ALK基因双突变（F1174L和L1196M）的动态变化及其对药物反应的影响 | NA | 探索神经母细胞瘤中ALK基因突变动力学及克隆进化 | 神经母细胞瘤细胞系及其ALK基因突变 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 全外显子测序, 数字滴液PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 两个神经母细胞瘤细胞系，分别来自原发肿瘤和骨髓 |