单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 88 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
α2-Chimaerin is essential for neural stem cell homeostasis in mouse adult neurogenesis
2019-07-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1903891116
PMID:31209021
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研究论文 | 本文研究了α2-chimaerin在成年小鼠海马神经发生中对神经干细胞（NSC）稳态的必要性 | 首次报道了α2-chimaerin在成年海马神经发生中对NSC稳态的关键作用 | NA | 探讨α2-chimaerin在成年海马神经发生中对NSC稳态的作用 | α2-chimaerin在成年小鼠海马神经发生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序和伪时间分析 | NA | RNA | α2-chimaerin条件性敲除（α2-CKO）小鼠 |
| 62 | 2024-08-09 |
Myc and Dnmt1 impede the pluripotent to totipotent state transition in embryonic stem cells
2019-07, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-019-0343-0
PMID:31209294
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研究论文 | 本研究探讨了胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变的机制 | 首次揭示了Myc和Dnmt1在阻止胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变中的作用 | NA | 理解胚胎干细胞从多能状态向全能状态转变的过程 | 胚胎干细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9 | NA | RNA | 小部分细胞 |
| 63 | 2024-08-09 |
A cellular census of human lungs identifies novel cell states in health and in asthma
2019-07, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-019-0468-5
PMID:31209336
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术，对健康和哮喘患者的人类肺部进行了细胞图谱绘制，识别了新的细胞状态 | 报道了位置依赖性的气道上皮细胞状态和一种新的组织驻留记忆T细胞亚群，以及哮喘患者下呼吸道中的粘液细胞增生和杯状细胞增生 | NA | 通过单细胞转录组学技术，揭示健康和哮喘肺部细胞的差异 | 人类肺部的上、下呼吸道和肺实质细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | 健康肺部和哮喘肺部的多个样本 |
| 64 | 2024-08-09 |
Sensory lesioning induces microglial synapse elimination via ADAM10 and fractalkine signaling
2019-07, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-019-0419-y
PMID:31209379
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研究论文 | 本文研究了胡须损伤通过ADAM10和fractalkine信号通路诱导小胶质细胞介导的突触消除 | 首次揭示了神经元到小胶质细胞的信号传导在皮质突触重塑中的必要性，并展示了上下文依赖的免疫机制在哺乳动物大脑中重塑突触的利用 | NA | 探究小胶质细胞如何响应神经活动和炎症变化来调节突触连接 | 小胶质细胞介导的突触消除及其分子机制 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 65 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals TOX as a key regulator of CD8+ T cell persistence in chronic infection
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0403-4
PMID:31209400
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研究论文 | 本研究通过比较急性与慢性病毒感染下CD8 T细胞的单细胞转录组和表观遗传学特征，揭示了TOX作为关键调节因子在慢性感染中维持CD8+ T细胞持久性的作用 | 发现TOX在祖细胞样CD8 T细胞中表现出更高的转录活性，并与更多的活跃组蛋白标记相关，促进了抗病毒CD8 T细胞的持久性 | NA | 探究TOX在慢性病毒感染中对CD8+ T细胞持久性的调控作用 | CD8 T细胞在急性与慢性病毒感染中的单细胞转录组和表观遗传学特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
The immune cell landscape in kidneys of patients with lupus nephritis
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0398-x
PMID:31209404
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本，揭示了21种在疾病中活跃的白细胞亚群 | 首次详细描述了狼疮性肾炎患者肾脏中多种免疫细胞亚群的活性和反应，包括促炎和抗炎反应 | NA | 开发狼疮性肾炎的疾病机制假设 | 狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个狼疮性肾炎患者和健康对照者的肾脏样本 |
| 67 | 2024-08-09 |
Navigating the Depths and Avoiding the Shallows of Pancreatic Islet Cell Transcriptomes
2019-07, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi18-0019
PMID:31221802
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观点 | 本文评估了单细胞RNA测序（scRNA-Seq）在提高我们对β细胞异质性理解方面的能力，并探讨了单细胞分辨率下基因表达检测的局限性及其对单胰岛细胞转录组数据质量的影响 | 采用单细胞RNA测序技术，揭示了人类和鼠类β细胞的显著异质性 | 单细胞分辨率下基因表达检测的局限性可能影响单胰岛细胞转录组数据的质量 | 评估单细胞RNA测序在理解β细胞异质性方面的应用及其局限性 | 人类β细胞的转录组数据 | 基因组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 多个单人类β细胞转录组数据集 |
| 68 | 2024-08-09 |
Learning common and specific patterns from data of multiple interrelated biological scenarios with matrix factorization
2019-07-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz488
PMID:31175825
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研究论文 | 本文提出了一种名为CSMF的灵活框架，通过矩阵分解从多个相关生物场景的数据中同时揭示共同和特定模式 | CSMF框架将整合和差异分析结合到一个范式中，有效揭示了多模态数据中的组合模式 | NA | 开发一种新的方法来分析和整合来自多个相关生物场景的高通量生物数据 | 来自不同细胞系、癌症类型和人类胚胎干细胞分化时间点的ChIP-seq和RNA-seq数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA-seq | 矩阵分解 | 基因组数据 | 包括K562和Huvec细胞系、两种不同癌症的表达谱、三种乳腺癌亚型以及人类胚胎干细胞分化在六个时间点的单细胞RNA-seq数据 |
| 69 | 2024-08-09 |
Cell-Intrinsic Wnt4 Influences Conventional Dendritic Cell Fate Determination to Suppress Type 2 Immunity
2019-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1900363
PMID:31175162
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研究论文 | 研究探讨了Wnt4在常规树突状细胞（cDC）亚群分化和类型2免疫中的作用 | 首次揭示了Wnt4在cDC亚群分化和类型2免疫中的新作用 | NA | 探究Wnt4在常规树突状细胞亚群分化和类型2免疫中的作用 | Wnt4在常规树突状细胞亚群分化中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序分析，流式细胞术 | NA | RNA | 使用了CD11cWnt4小鼠和CD11c对照小鼠的骨髓样本 |
| 70 | 2024-08-09 |
Thermoregulation via Temperature-Dependent PGD2 Production in Mouse Preoptic Area
2019-07-17, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.04.035
PMID:31151773
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和全细胞膜片钳记录，识别了Ptgds作为温度敏感性前视区（POA）神经元的遗传标记，并探讨了这些神经元在体温调节中的作用 | 首次通过遗传标记Ptgds识别温度敏感性POA神经元，并揭示了这些神经元通过调节前列腺素D2（PGD）的产生参与体温调节的机制 | NA | 探究温度敏感性前视区神经元在体温调节中的作用及其分子机制 | 小鼠前视区温度敏感性神经元及其在体温调节中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序，全细胞膜片钳记录，化学遗传学 | NA | RNA | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of the Normal Mouse Aorta Reveals Functionally Distinct Endothelial Cell Populations
2019-07-09, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了正常小鼠主动脉中的细胞异质性，并识别出具有不同功能的内皮细胞亚群 | 利用单细胞RNA测序技术，首次全面描绘了小鼠主动脉中所有细胞的单细胞图谱，并揭示了内皮细胞的三个不同亚群及其在血管疾病中的相关功能 | NA | 研究主动脉壁细胞的异质性及其在血管疾病中的作用 | 小鼠主动脉中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过10,000个细胞 |
| 72 | 2024-08-09 |
GEPIA2: an enhanced web server for large-scale expression profiling and interactive analysis
2019-07-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz430
PMID:31114875
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research paper | 本文介绍了GEPIA2，一个基于TCGA和GTEx数据库的肿瘤和正常样本基因表达分析的增强型网络服务器 | GEPIA2将基因表达量化从基因水平扩展到转录本水平，支持特定癌症亚型的分析和亚型间的比较，并采用了受单细胞测序研究启发的新的基因签名量化技术 | NA | 提供更高分辨率和更多功能的基因表达分析 | 肿瘤和正常样本的基因表达 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 198,619个转录本和84种癌症亚型 |
| 73 | 2024-08-09 |
cDC1s: New Orchestrators of Tissue Innate Immunity
2019-07, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2019.05.002
PMID:31133464
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了I型常规树突状细胞（cDC1s）在细菌感染皮肤中的作用，发现激活的cDC1s亚群通过产生VEGF-α对中性粒细胞招募至关重要 | 揭示了cDC1s在抗原呈递之外的关键功能 | NA | 探讨cDC1s在组织先天免疫中的新作用 | I型常规树突状细胞（cDC1s）在细菌感染皮肤中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct dynamic behavior of sex chromosomes during early human embryogenesis
2019-07, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.23162
PMID:31094050
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了1607个来自99个人类早期胚胎的单细胞，揭示了性染色体在人类早期胚胎发育中的动态行为 | 首次系统地比较了男性与女性胚胎在胚胎基因组激活后的性染色体表达差异，揭示了性染色体在早期胚胎发育中的动态表达和沉默过程 | 研究样本量有限，且仅使用了现有的单细胞RNA测序数据 | 探讨性染色体在人类早期胚胎发育中的分子机制及其对胚胎发育的影响 | 人类早期胚胎的性染色体表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1607个单细胞来自99个人类早期胚胎 |
| 75 | 2024-08-09 |
Tubular cell and keratinocyte single-cell transcriptomics applied to lupus nephritis reveal type I IFN and fibrosis relevant pathways
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0386-1
PMID:31110316
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本，揭示了I型干扰素和纤维化相关通路 | 首次应用单细胞RNA测序技术于狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本，揭示了I型干扰素反应和纤维化相关通路 | NA | 研究狼疮性肾炎的分子和细胞过程，以及其异质性 | 狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Single-Cell Virus Sequencing of Influenza Infections That Trigger Innate Immunity
2019-07-15, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.00500-19
PMID:31068418
|
研究论文 | 本文开发了一种新方法，通过确定单个感染流感病毒细胞中的转录组和全长病毒基因序列，评估病毒群体中的遗传变异如何影响病毒基因表达和先天免疫激活的异质性 | 首次使用长读长PacBio测序技术来确定感染单个细胞的病毒序列，提供了病毒突变如何影响单个细胞感染过程的完整图景 | 病毒遗传变异只能部分解释细胞间病毒基因表达和先天免疫诱导的变异性 | 研究流感病毒感染细胞中病毒基因表达和先天免疫激活的异质性 | 感染流感病毒的单个细胞 | NA | 流感 | PacBio测序 | NA | 序列数据 | 多个感染流感病毒的单个细胞 |
| 77 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of the Liver Epithelium Reveals Dynamic Heterogeneity and an Essential Role for YAP in Homeostasis and Regeneration
2019-07-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.04.004
PMID:31080134
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肝脏上皮细胞在稳态和损伤后的异质性，并揭示了YAP在肝脏稳态和再生中的关键作用 | 发现了在稳态和损伤后，胆道上皮细胞存在显著的异质性，这种异质性反映了YAP依赖的程序的波动激活 | NA | 探索肝脏上皮细胞在稳态和损伤后的异质性及其分子机制 | 肝脏上皮细胞，特别是肝细胞和胆道上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 78 | 2024-08-09 |
YAP, but Not RSPO-LGR4/5, Signaling in Biliary Epithelial Cells Promotes a Ductular Reaction in Response to Liver Injury
2019-07-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.04.005
PMID:31080135
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研究论文 | 研究探讨了胆道上皮细胞在肝脏损伤后形成管状反应的信号通路 | 发现胆道上皮细胞在管状反应中不需要LGR4/5介导的WNT/β-catenin信号，而YAP和mTORC1信号在此过程中是必需的 | NA | 阐明胆道上皮细胞在肝脏损伤后形成管状反应的信号通路及其作用 | 胆道上皮细胞及其在肝脏损伤后的反应 | NA | NA | CRISPR-based loss-of-function screen, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 胆道上皮细胞样类器官 |
| 79 | 2024-08-09 |
Single-Cell Lymphocyte Heterogeneity in Advanced Cutaneous T-cell Lymphoma Skin Tumors
2019-07-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-0148
PMID:31010835
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析探讨了晚期皮肤T细胞淋巴瘤皮肤肿瘤中淋巴细胞的异质性 | 首次通过液滴法单细胞转录组分析揭示了患者特异性的恶性与反应性淋巴细胞在肿瘤局部微环境中的景观，为识别特定标记物提供了基础 | 仅限于5名晚期CTCL患者和4名健康捐赠者的皮肤活检样本 | 探讨皮肤T细胞淋巴瘤（CTCL）中T淋巴细胞的异质性，为诊断和治疗提供新的标记物 | 晚期皮肤T细胞淋巴瘤患者的皮肤肿瘤样本 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14,056个CD3+淋巴细胞（448个来自正常样本，13,608个来自CTCL皮肤样本） |
| 80 | 2024-08-09 |
Fifty Shades of Microglia
2019-07, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2019.03.010
PMID:31005331
|
研究论文 | Masuda等人使用单细胞RNA测序技术研究了小鼠大脑中不同解剖部位、发育阶段和病理类型的微胶质细胞，并对多发性硬化症患者的微胶质细胞进行了转录组特征分析 | 首次对多发性硬化症患者的微胶质细胞进行了转录组特征分析，并发现了跨物种保守的微胶质细胞亚群 | NA | 研究大脑发育和疾病中微胶质细胞的空间和时间异质性 | 小鼠和多发性硬化症患者的微胶质细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个小鼠和多发性硬化症患者的样本 |