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当前共找到 60 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-09 |
Novel insights into cell cycle regulation of cell fate determination
2019-Jun, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B1900197
PMID:31090272
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综述 | 本文综述了细胞周期调控在细胞命运决定中的最新进展 | 利用高分辨率表观基因组分析、单细胞转录组学和细胞周期报告系统提供了新的见解 | NA | 探讨细胞周期调控在细胞命运决定中的作用及其在转化医学中的潜在应用 | 干细胞/祖细胞的自我更新和多谱系分化能力 | NA | NA | 高分辨率表观基因组分析、单细胞转录组学 | NA | 表观基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2024-08-09 |
Oncogenes and Clotting Factors: The Emerging Role of Tumor Cell Genome and Epigenome in Cancer-Associated Thrombosis
2019-Jun, Seminars in thrombosis and hemostasis
IF:3.6Q1
DOI:10.1055/s-0039-1687891
PMID:31096313
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研究论文 | 探讨肿瘤细胞基因组和表观基因组在癌症相关血栓形成中的新兴作用 | 提出癌症可能作为促凝复合体运作，其中单个细胞及其主导群体表达不同的促凝表型，对止血系统产生净影响 | NA | 研究癌症进展的生物学和遗传学方面与癌症相关血栓形成机制之间的联系 | 胶质母细胞瘤的多形性，以及肿瘤细胞基因组和表观基因组在癌症相关血栓形成中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 胶质母细胞瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 43 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiles and Clinically Useful Properties of Human Mesenchymal Stem Cells of Adipose and Bone Marrow Origin
2019-06, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/0363546519848678
PMID:31100005
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研究论文 | 本文探讨了脂肪和骨髓来源的人间充质干细胞在单细胞和批量细胞水平上的特征和差异，并研究了这两种细胞在治疗骨关节炎中的临床结果，为更精确的临床应用提供指导。 | 本文通过单细胞RNA测序分析和临床试验的元分析，揭示了脂肪来源干细胞在转录组异质性、能量产生依赖性和免疫抑制能力方面的优势。 | NA | 探索脂肪和骨髓来源的人间充质干细胞的特征和差异，并研究其在治疗骨关节炎中的临床效果。 | 脂肪来源干细胞（ADSCs）和骨髓间充质干细胞（BMSCs）。 | 细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自同一供体的ADSCs和BMSCs | NA | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-09 |
MARS-seq2.0: an experimental and analytical pipeline for indexed sorting combined with single-cell RNA sequencing
2019-06, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0164-4
PMID:31101904
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研究论文 | 本文介绍了MARS-seq2.0，一种结合索引排序和单细胞RNA测序的实验和分析流程 | MARS-seq2.0在成本、重复性和减少污染方面进行了改进，结合了亚微升反应体积、酶混合物的优化和增强的分析流程 | NA | 开发一种高效的集成流程，用于索引排序和大规模并行单细胞RNA测序，以识别不同组织和疾病中的独特细胞类型 | 人类组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过100万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2024-08-09 |
Efficient integration of heterogeneous single-cell transcriptomes using Scanorama
2019-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0113-3
PMID:31061482
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Scanorama的算法，用于有效整合来自多个实验、实验室和技术的异质性单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | Scanorama算法能够识别并合并所有数据集中共享的细胞类型，准确整合异质性scRNA-seq数据集 | NA | 开发一种新的算法以克服现有scRNA-seq数据整合方法的限制，实现跨多个实验和技术的数据整合 | scRNA-seq数据集，特别是来自不同实验、实验室和技术的数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Scanorama算法 | 转录组数据 | 105,476个细胞来自26个不同的scRNA-seq实验，代表9种不同技术 | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2024-08-09 |
Genetic Insights Into Smooth Muscle Cell Contributions to Coronary Artery Disease
2019-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.119.312141
PMID:31043074
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研究论文 | 本文总结了支持平滑肌细胞在冠状动脉疾病中作用的几个全基因组显著位点的实验证据，并讨论了分子定量性状位点映射在平滑肌细胞和冠状动脉疾病相关组织中的应用 | 强调了需要替代的遗传策略，如cis/trans-调控网络分析、基因组编辑和扰动，以及在正常和疾病状态下对平滑肌细胞组织和模型生物进行单细胞测序 | NA | 通过整合多种实验和分析模式，提高对冠状动脉疾病全基因组关联研究和分子定量性状位点信号的解释，并为治疗干预或风险预测提供候选目标 | 平滑肌细胞在冠状动脉疾病中的作用及其相关基因和途径 | 遗传学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究、分子定量性状位点映射、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 47 | 2024-08-09 |
Spatial transcriptomics coming of age
2019-06, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-019-0129-z
PMID:30980030
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2024-08-09 |
Cell lineage and communication network inference via optimization for single-cell transcriptomics
2019-06-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz204
PMID:30923815
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研究论文 | 本文介绍了基于相似矩阵优化的单细胞数据分析方法SoptSC，用于推断细胞亚群、伪时间排序、细胞谱系及标记基因，并预测细胞间通信网络 | SoptSC方法整合了无监督聚类、伪时间排序、细胞谱系推断和标记基因识别，通过结构化的细胞间相似矩阵实现多任务一致性处理 | NA | 旨在解决细胞间通信推断的挑战，通过一致性的数学框架实现多任务处理 | 单细胞转录组数据中的细胞亚群、细胞谱系及细胞间通信网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学 | 相似矩阵优化 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-08-09 |
Cell-specific network constructed by single-cell RNA sequencing data
2019-06-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz172
PMID:30864667
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研究论文 | 本文提出了一种新的方法，利用单细胞RNA测序数据为每个单细胞构建细胞特异性网络（CSN） | 首次能够在单细胞分辨率水平上识别基因关联/网络，并将数据从‘不稳定’的基因表达形式转换为‘稳定’的基因关联形式 | 传统的网络方法局限于分组细胞，而不是每个单细胞，因此会消除单细胞的异质性 | 开发一种新的方法来分析单细胞RNA测序数据，以揭示单细胞水平的基因关联 | 单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 细胞特异性网络（CSN） | 基因表达数据 | 大量单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-08-09 |
Cell lineage inference from SNP and scRNA-Seq data
2019-06-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz146
PMID:30820578
|
研究论文 | 本文开发了一种方法，从scRNA-Seq数据中检测显著的、细胞类型特异性的序列突变，并展示了这些突变与表达数据结合可以提高重建模型的准确性 | 本文提出了一种新的方法，通过检测scRNA-Seq数据中的序列突变来重建细胞谱系，这种方法结合了表达数据，提高了模型的准确性 | 目前的方法存在局限性，如伪时间排序方法和使用CRISPR插入随机突变的方法都有其不足之处 | 开发一种新的方法来从scRNA-Seq数据中推断细胞谱系 | 研究对象包括scRNA-Seq数据和序列突变 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-08-09 |
Conserved pathway activation following xenogeneic, heterotypic fusion
2019-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201801700R
PMID:30807240
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研究论文 | 本文研究了人类间充质干细胞与小鼠心肌细胞异种融合后的转录组变化，探讨了融合过程中是否涉及保守通路的激活 | 首次记录了在融合伙伴中潜伏的少数基因在杂交种中的表达，如人类生长激素1、小鼠核糖体蛋白S27和小鼠ATP合酶H转运线粒体Fo复合体亚基C2 | NA | 探索异种融合后细胞转录组的保守通路激活 | 人类间充质干细胞与小鼠心肌细胞的异种融合细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类和小鼠的多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-08-09 |
Role of alternative polyadenylation dynamics in acute myeloid leukaemia at single-cell resolution
2019-06, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2019.1586139
PMID:30810468
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序数据分析了急性髓系白血病（AML）中不同细胞类型的选择性多聚腺苷酸化（APA）动态变化 | 首次在单细胞分辨率下探讨了AML中不同细胞类型的APA动态变化，揭示了APA在白血病发展和红细胞生成中的广泛调控作用 | NA | 探讨急性髓系白血病中不同细胞类型的选择性多聚腺苷酸化动态变化 | 急性髓系白血病患者和健康个体的骨髓单个核细胞（BMMCs） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 16,843个骨髓单个核细胞（BMMCs） | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-08-09 |
Evolution of neuronal types and families
2019-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2019.01.022
PMID:30826503
|
综述 | 本文综述了近年来在神经元和神经系统进化方面的概念进展，特别是通过比较单细胞转录组学来定义细胞类型，并探讨了如何利用单细胞数据识别和大规模比较神经元类型及其家族 | 利用比较单细胞转录组学方法，为解决神经元进化的关键问题提供了新的研究途径 | NA | 探讨神经元和神经系统的进化问题，包括神经元起源、神经元表型的趋同进化以及从简单神经网到复杂中央神经系统的转变 | 神经元类型及其家族，特别是脊椎动物前脑不同部位的GABA能神经元家族 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-08-09 |
Tissue Repair in the Mouse Liver Following Acute Carbon Tetrachloride Depends on Injury-Induced Wnt/β-Catenin Signaling
2019-06, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.30563
PMID:30762896
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研究论文 | 研究了在小鼠肝脏中，急性四氯化碳损伤后组织修复依赖于损伤诱导的Wnt/β-Catenin信号通路 | 发现内皮细胞是急性四氯化碳毒性后Wnt的主要来源，并且Wnt/β-Catenin信号通路在恢复组织完整性中起重要作用 | NA | 探讨Wnt/β-Catenin信号通路在急性肝脏毒性后组织修复中的作用 | 小鼠肝脏在急性四氯化碳损伤后的Wnt基因表达和信号传导 | NA | NA | 原位杂交、单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-08-09 |
Defining the Cell Types That Drive Idiopathic Pulmonary Fibrosis Using Single-Cell RNA Sequencing
2019-Jun-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201901-0197ED
PMID:30715901
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-08-09 |
Neuronal cell types in the annelid Platynereis dumerilii
2019-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2018.12.008
PMID:30685735
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综述 | 本文综述了海洋环节动物Platynereis dumerilii中神经细胞类型的多样性 | Platynereis dumerilii具有一些在主要无脊椎模型生物（如C. elegans和Drosophila）中缺失的生物学特征和细胞类型，如纤毛运动、去甲肾上腺素能神经元和纤毛光感受器细胞 | NA | 探讨Platynereis dumerilii中神经细胞类型的多样性及其功能 | Platynereis dumerilii的神经细胞类型及其功能 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序、全基因表达图谱、连续电子显微镜重建 | NA | 细胞类型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-08-09 |
Hypermutagenesis in untreated adult gliomas due to inherited mismatch mutations
2019-06-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.32054
PMID:30536544
|
研究论文 | 研究未治疗的成人胶质瘤中由于遗传性错配修复突变导致的超突变现象 | 首次识别出未经治疗成人胶质瘤中存在的新生超突变表型，并探讨了自发和治疗诱导的超突变进化 | NA | 揭示未治疗成人胶质瘤中超突变过程的新理解，并为胶质瘤治疗的免疫疗法提供临床意义 | 未经治疗和治疗后的超突变胶质瘤 | 数字病理学 | 脑瘤 | 全外显子测序（WES），全转录组测序（WTS），单细胞测序（SCS） | NA | 基因组数据 | 涉及未经治疗和治疗后的超突变胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-08-09 |
Hypothalamic cell diversity: non-neuronal codes for long-distance volume transmission by neuropeptides
2019-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2018.10.012
PMID:30471413
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研究论文 | 本文探讨了下丘脑神经肽通过非神经细胞进行长距离体积传输的机制 | 利用单细胞RNA测序数据发现tanycytes和室管膜作为神经活性物质的替代来源，以及通过神经元-室管膜耦合介导的相位体积传输 | NA | 研究下丘脑神经肽的长距离体积传输及其在神经精神疾病中的作用 | 下丘脑细胞多样性及神经肽的体积传输机制 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-08-09 |
GRNBoost2 and Arboreto: efficient and scalable inference of gene regulatory networks
2019-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty916
PMID:30445495
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research paper | 本文介绍了GRNBoost2和Arboreto框架，用于从大规模基因表达数据中高效推断基因调控网络 | 提出了GRNBoost2算法和Arboreto框架，能够高效处理因高通量基因分析技术（如单细胞RNA-seq）产生的日益增长的数据量 | NA | 开发工具集以从大型表达数据集中推断基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 梯度提升 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-08-09 |
Single-cell analyses identify distinct and intermediate states of zebrafish pancreatic islet development
2019-06-01, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjy064
PMID:30407522
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了转基因斑马鱼胰腺胰岛在四个胚胎发育阶段的动态变化 | 本文首次详细描述了胰腺胰岛发育过程中的不同状态和分子特征，并识别了具有不同细胞周期阶段的增殖性内分泌前体细胞 | NA | 定义胰腺胰岛发育过程中的特征和分化过程 | 胰腺胰岛细胞的发育轨迹及其调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从TgBAC(neurod1:EGFP)转基因斑马鱼中分离的单个胰岛细胞 | NA | NA | NA | NA |