单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 58 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-06 |
Decomposing Cell Identity for Transfer Learning across Cellular Measurements, Platforms, Tissues, and Species
2019-05-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.04.004
PMID:31121116
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研究论文 | 开发了scCoGAPS和projectR工具，通过潜在空间表示和迁移学习实现跨细胞测量、平台、组织和物种的细胞身份分析 | 提出基于潜在空间分解的细胞身份分析方法，能够避免批次效应和技术特征干扰，实现跨数据集和物种的生物学特征比较 | 方法依赖于源数据集的质量和代表性，潜在空间的解释仍需进一步验证 | 开发单细胞RNA测序数据的探索性分析工具，实现跨数据集和物种的细胞身份比较 | 小鼠视网膜发育数据、成年小鼠视网膜、人类视网膜发育时间序列、发育中大脑scRNA-seq数据、染色质可及性数据和小鼠细胞类型图谱 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 潜在空间模型, 迁移学习 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 多个单细胞RNA测序数据集，包括小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-10-06 |
Wnt Signaling Separates the Progenitor and Endocrine Compartments during Pancreas Development
2019-05-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.083
PMID:31116975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胰腺发育过程中内分泌细胞与前体细胞通过Wnt信号通路分离的机制 | 发现体外分化过程中内分泌细胞与前体细胞存在于通过不同遗传通路激活的独立区室，并证实WNT通路抑制对胰岛形成的关键作用 | 研究主要基于体外hESCs分化模型，体内验证仍需进一步深入 | 探索胰腺发育过程中细胞自主反应机制，提高体外β细胞分化效率 | 人类胚胎干细胞(hESCs)及其分化过程中的细胞群体 | 发育生物学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 分化球状簇中的hESCs单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
An Atlas of Vagal Sensory Neurons and Their Molecular Specialization
2019-05-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.096
PMID:31116992
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术系统鉴定和分类了迷走神经感觉神经元的分子特化特征 | 首次全面揭示了不同胚胎起源（神经嵴与鳃弓）迷走神经感觉神经元的分子差异，发现了许多先前未知的神经元类型 | NA | 识别、分类和验证迷走神经感觉神经元的类型及其分子特化 | 神经嵴来源（颈静脉神经节）和鳃弓来源（结状神经节）的迷走神经感觉神经元 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Identification of a regeneration-organizing cell in the Xenopus tail
2019-05-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aav9996
PMID:31097661
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在蝌蚪尾部鉴定出一种新型再生组织细胞（ROC），揭示了其在尾部再生过程中的关键作用 | 首次发现并鉴定了一种新型再生组织细胞（ROC），证明其在蝌蚪尾部再生过程中起关键组织作用 | 研究仅限于蝌蚪模型，尚未在哺乳动物中验证ROC的存在和功能 | 探究蝌蚪尾部再生的细胞机制 | 非洲爪蟾蝌蚪尾部组织 | 发育生物学 | 组织再生 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 自然发生再生能力和无再生能力蝌蚪的对比样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
Temporal patterning of apical progenitors and their daughter neurons in the developing neocortex
2019-05-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aav2522
PMID:31073041
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研究论文 | 通过高时间分辨率单细胞RNA测序研究小鼠胚胎新皮质发育过程中顶端祖细胞及其子代神经元的时间分子模式 | 首次在单细胞水平揭示顶端祖细胞随时间变化的分子特征及其向子代神经元的传递机制，发现PRC2表观遗传调控祖细胞时间进程 | 研究仅限于小鼠胚胎模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索新皮质发育过程中神经元亚型顺序产生的分子时序调控机制 | 小鼠胚胎新皮质中的顶端祖细胞及其分化的子代神经元 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎新皮质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2024-08-07 |
How to Find a Resident Kidney Macrophage: the Single-Cell Sequencing Solution
2019-May, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2019030245
PMID:30948628
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Deconstructing Retinal Organoids: Single Cell RNA-Seq Reveals the Cellular Components of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Retina
2019-05, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.2963
PMID:30548510
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术解析人胚胎干细胞来源视网膜类器官的细胞组成 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统分析视网膜类器官在三个分化时间点的细胞组成动态变化 | 仅使用人胚胎干细胞来源的视网膜类器官，未与其他干细胞来源进行比较 | 解析视网膜类器官的细胞组成和发育过程 | 人胚胎干细胞来源的视网膜类器官 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个分化时间点的视网膜类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Cutaneous T-Cell Lymphoma Reveals Underlying Heterogeneity Associated with Disease Progression
2019-05-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-18-3309
PMID:30718356
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研究论文 | 皮肤T细胞淋巴瘤的单细胞分析揭示了与疾病进展相关的潜在异质性 | 首次使用单细胞RNA测序和机器学习方法定义了Sézary综合症中不同的转录组状态，并建立了能够预测早期与晚期CTCL疾病的基因签名 | 对疾病病理机制的理解仍不完整，这可能限制了治疗方案的开发 | 揭示Sézary综合症的异质性，并提供更好的转录组多样性理解 | Sézary综合症中的恶性T细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 增强树分类模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2024-08-05 |
HSV-1 single-cell analysis reveals the activation of anti-viral and developmental programs in distinct sub-populations
2019-05-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.46339
PMID:31090537
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研究论文 | 本文结合活细胞成像和单细胞 RNA 测序，揭示了 HSV-1 感染中不同亚群的抗病毒和发育程序的激活。 | 揭示了在 HSV-1 感染中，感染细胞的转录异质性并识别出转录上独特的亚群体。 | 研究主要集中在初级人类细胞的感染，可能无法完全适用于其他类型细胞或感染方式。 | 研究 HSV-1 感染过程中的单细胞水平的病毒和宿主转录异质性。 | 主要研究初级人类细胞在 HSV-1 感染下的反应。 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序和活细胞成像 | NA | RNA 数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2024-08-05 |
A single-cell transcriptomic atlas of the developing chicken limb
2019-May-22, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-019-5802-2
PMID:31117954
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序构建了小鸡肢体发育的转录组图谱 | 首次在细胞分辨率下 catalog 了小鸡环肢的发育组织类型和转录组动态 | 目前的研究主要集中在小鸡肢体的发育阶段，可能不适用于其他物种 | 揭示转录细胞类型特异性程序与形态形成之间动态相互作用 | 研究小鸡发育过程中不同的组织类型及其转录组动态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞转录组数据 | 共测序了来自小鸡三个人肢发育阶段的17,628个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2024-08-05 |
Multiplexed, Sequential Secretion Analysis of the Same Single Cells Reveals Distinct Effector Response Dynamics Dependent on the Initial Basal State
2019-May-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201801361
PMID:31065513
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研究论文 | 该文章展示了一种基于微芯片的多重、序列化的分泌分析方法，用于研究单个免疫细胞的效应器响应动态. | 文章创新性地提出了一种在同一单细胞上进行10重分泌测定的方法，揭示了基于初始基础状态的不同效应器响应动态 | 样本数量和时间点可能限制了对更广泛免疫反应的全面理解 | 研究不同激活模式下单个人类巨噬细胞对特定刺激物的响应动态 | 单个免疫细胞，尤其是人类巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 微芯片基础的分泌分析 | NA | 蛋白质分泌数据和单细胞RNA测序数据 | 大约5000个单细胞，在4个时间点同时测量 | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2024-08-07 |
HBEGF+ macrophages in rheumatoid arthritis induce fibroblast invasiveness
2019-05-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.aau8587
PMID:31068444
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术，在类风湿性关节炎（RA）患者的关节中定义了不同的巨噬细胞亚群，并探讨了它们在疾病中的作用 | 首次详细描述了HBEGF+巨噬细胞在RA中的特定亚群及其对纤维母细胞侵袭性的影响 | 研究主要集中在体外和组织层面的实验，可能需要进一步的体内研究来验证结果 | 深入理解类风湿性关节炎中巨噬细胞的表型及其在疾病进展中的作用 | 类风湿性关节炎患者的关节巨噬细胞及其与纤维母细胞的相互作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及约1%的人口，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2024-08-07 |
Adaptive Immune Resistance Emerges from Tumor-Initiating Stem Cells
2019-05-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.03.025
PMID:31031009
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研究论文 | 本文通过设计一种皮肤癌模型，研究了肿瘤起始干细胞（tSCs）如何通过适应性免疫抵抗机制克服免疫监视 | 发现tSCs通过表达CD80并结合CTLA4直接抑制细胞毒性T细胞活性，从而抵抗免疫疗法 | NA | 探讨肿瘤起始干细胞如何克服免疫监视并形成肿瘤复发的机制 | 肿瘤起始干细胞（tSCs）及其在皮肤鳞状细胞癌（SCC）中的免疫抵抗机制 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2024-08-07 |
Model-based understanding of single-cell CRISPR screening
2019-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10216-x
PMID:31110232
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研究论文 | 本文介绍了MUSIC，一个集成管道，用于基于模型的单细胞CRISPR筛选数据理解 | MUSIC能够准确量化和优先处理单细胞CRISPR筛选数据中的个体基因扰动效应，并能容忍数据分析中存在的显著噪声 | NA | 开发一个集成管道，以基于模型的方法分析单细胞CRISPR筛选数据，从而阐明扰动功能和生物电路 | 单细胞CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | CRISPR筛选, 单细胞RNA测序 | 集成管道 | 单细胞数据 | 使用所有公开可用的数据进行综合测试 | NA | NA | NA | NA |
| 15 | 2024-08-07 |
Evaluation of Weng et al.: Leveraging Cell Type Correlations and Single-Cell Bioinformatics to Identify Progenitor Diversity and Lineage
2019-05-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.04.011
PMID:31051125
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评论 | 本文是对Weng等人2019年发表的关于单细胞转录组学研究中间胶质前体细胞及细胞命运和胶质瘤发生的关键决定因素的同行评审过程的展示 | NA | NA | 展示对Weng等人研究的同行评审过程 | 单细胞转录组学研究的中间胶质前体细胞及细胞命运和胶质瘤发生的关键决定因素 | 单细胞生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals the impact of chromosomal instability on glioblastoma cancer stem cells
2019-05-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-019-0532-5
PMID:31151460
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了染色体不稳定（CIN）对胶质母细胞瘤癌症干细胞（CSC）基因表达的影响 | 首次揭示了CIN直接导致基因表达变化，并增加了胶质母细胞瘤CSC的遗传和转录异质性 | NA | 研究CIN如何影响个体细胞中的基因表达 | 染色体不稳定的胶质母细胞瘤癌症干细胞和正常二倍体神经干细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个染色体不稳定的胶质母细胞瘤癌症干细胞系和一个正常二倍体神经干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2024-08-09 |
Molecular Logic of Spinocerebellar Tract Neuron Diversity and Connectivity
2019-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.113
PMID:31141687
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和遗传操作技术，探讨了脊髓小脑束神经元（SCTNs）多样性和连接性的分子逻辑。 | 首次揭示了Hox基因在SCTN亚型特异性转录程序中的作用，以及这些基因在神经回路组装中的关键角色。 | NA | 阐明脊髓小脑束神经元多样性和连接性的分子机制。 | 脊髓小脑束神经元（SCTNs）及其在感觉信息传递中的作用。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 18 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptional Profiling of Aortic Endothelium Identifies a Hierarchy from Endovascular Progenitors to Differentiated Cells
2019-05-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.102
PMID:31141696
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了主动脉内皮细胞的异质性及其从内皮祖细胞到分化细胞的层次结构 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了主动脉内皮细胞的亚群及其层次结构，并验证了这些细胞群的异质性 | NA | 阐明循环系统内皮细胞的细胞和分子特征 | 主动脉内皮细胞的异质性及其层次结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Estrogen Signaling Coordinately Augments One-Carbon, Polyamine, and Purine Synthesis in Breast Cancer
2019-May-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.05.047
PMID:31141700
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2024-08-09 |
Dissecting lung development and fibrosis at single-cell resolution
2019-05-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-019-0645-7
PMID:31126351
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组测序技术，对肺部发育和纤维化过程中的细胞群体进行了高分辨率分析 | 本文创新性地使用单细胞RNA测序技术，研究了肺部发育和纤维化疾病中免疫细胞与组织成分的相互作用机制 | NA | 研究肺部发育和纤维化过程中的细胞机制 | 肺部发育和纤维化过程中的细胞群体 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |