单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-09	Single-Cell RNA Sequencing to Understand Host-Pathogen Interactions 2019-03-08, ACS infectious diseases IF:4.0Q1 DOI:10.1021/acsinfecdis.8b00369 PMID:30702856	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术探讨宿主-病原体相互作用，特别是细菌感染中的转录异质性	本文强调了单细胞RNA测序在宿主-病原体相互作用研究中的应用，并提出了该技术在感染研究中的未来前景	当前限制包括在单细胞水平上检测和分析入侵病原体转录组的挑战	旨在通过单细胞水平的整合分析，促进更有效的疫苗和新型治疗药物的开发，以及更准确的诊断标志物	宿主-病原体相互作用，特别是细菌感染中的转录异质性	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
42	2024-08-09	Single-cell sequencing of primate preimplantation embryos reveals chromosome elimination via cellular fragmentation and blastomere exclusion 2019-03, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.239830.118 PMID:30683754	研究论文	本文利用非人类灵长类模型和单细胞DNA测序技术，研究了灵长类胚胎植入前阶段的染色体内容，揭示了染色体异常通过细胞碎片化和卵裂球排除的消除机制。	首次在非人类灵长类模型中使用单细胞DNA测序技术，揭示了人类和猕猴胚胎中染色体异常和微核形成的频率一致性，以及细胞碎片包含来自卵裂球的完整或部分染色体。	研究主要集中在胚胎植入前阶段，未涉及植入后阶段的染色体稳定性。	探究灵长类胚胎植入前阶段染色体异常的消除机制。	254个卵裂球、42个极体和175个细胞碎片，来自50个猕猴分裂阶段的胚胎。	数字病理学	NA	单细胞DNA测序（scDNA-seq）	NA	DNA	471个单细胞样本
43	2024-08-09	Memory CD4+ T cells are generated in the human fetal intestine 2019-03, Nature immunology IF:27.7Q1 DOI:10.1038/s41590-018-0294-9 PMID:30664737	研究论文	本文通过功能性检测、质谱流式细胞术、单细胞RNA测序和高通量T细胞抗原受体（TCR）测序，研究了人类胎儿肠道中的CD4 T细胞群，发现了包括幼稚样、调节样和记忆样亚群在内的22个CD4 T细胞簇。	首次在人类胎儿肠道中发现并详细描述了记忆样CD4 T细胞的存在及其特性。	NA	探究人类胎儿肠道中CD4 T细胞的特性和功能。	人类胎儿肠道中的CD4 T细胞。	免疫学	NA	质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、高通量T细胞抗原受体（TCR）测序	NA	细胞	多个胎儿肠道样本
44	2024-08-09	West Nile Virus-Inclusive Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity in the Type I Interferon Response within Single Cells 2019-03-15, Journal of virology IF:4.0Q2 DOI:10.1128/JVI.01778-18 PMID:30626670	研究论文	本研究使用包含西尼罗河病毒的单细胞RNA测序技术，揭示了单细胞内I型干扰素反应的异质性	首次采用包含西尼罗河病毒的单细胞RNA测序技术，深入研究了单细胞层面的I型干扰素反应异质性	研究主要集中在单细胞层面的转录变化，未涉及细胞间相互作用及更广泛的生理效应	探讨西尼罗河病毒感染后单细胞层面的I型干扰素反应异质性	西尼罗河病毒感染的单细胞	数字病理学	神经疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	具体样本数量未在摘要中提及
45	2024-08-09	Exploiting single-cell RNA sequencing data to link alternative splicing and cancer heterogeneity: A computational approach 2019-03, The international journal of biochemistry & cell biology DOI:10.1016/j.biocel.2018.12.015 PMID:30633986	研究论文	本研究利用公开的单细胞和批量RNA测序数据，探索乳腺癌细胞中的基因、转录本丰度和剪接事件，以揭示剪接机制在定义肿瘤异质性的重要性	本研究通过从基因表达的平均方法到转录本丰度/剪接事件的详细分析，强调了剪接机制在定义肿瘤异质性的重要性，并展示了基因转录本表达研究如何帮助识别合适的体外模型	NA	研究旨在通过分析单细胞RNA测序数据中的替代剪接事件，揭示癌症异质性的分子机制	乳腺癌细胞的单细胞和批量RNA测序数据	数字病理学	乳腺癌	RNA测序	NA	RNA测序数据	乳腺癌原发性肿瘤和永生化细胞系的单细胞和批量RNA测序数据
46	2024-08-09	Single-cell RNA-Seq of follicular lymphoma reveals malignant B-cell types and coexpression of T-cell immune checkpoints 2019-03-07, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood-2018-08-862292 PMID:30591526	研究论文	研究通过单细胞RNA测序分析了来自6个原发性滤泡性淋巴瘤肿瘤的34,188个细胞的转录组，揭示了恶性B细胞类型及其与T细胞免疫检查点的共表达模式	首次通过单细胞RNA测序揭示了滤泡性淋巴瘤中恶性B细胞的亚克隆多样性及其与T细胞免疫检查点的共表达模式	研究仅限于6个原发性滤泡性淋巴瘤肿瘤，样本量较小，可能影响结果的普遍性	解析滤泡性B细胞淋巴瘤的转录网络，并探索肿瘤微环境中免疫调节的基因网络	滤泡性淋巴瘤中的恶性B细胞及其与T细胞免疫检查点的共表达模式	数字病理学	淋巴瘤	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	34,188个细胞来自6个原发性滤泡性淋巴瘤肿瘤
47	2024-08-09	High-throughput single-molecule RNA imaging analysis reveals heterogeneous responses of cardiomyocytes to hemodynamic overload 2019-03, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2 DOI:10.1016/j.yjmcc.2018.12.018 PMID:30611794	研究论文	本文通过高吞吐量的单分子RNA成像分析方法，研究了心肌细胞对血流动力学超负荷的异质性反应	开发了一种新的图像分析流程，实现了单细胞水平基因表达的自动和无偏量化	NA	探究心肌细胞在血流动力学超负荷下的基因表达变化	心肌细胞在血流动力学超负荷下的反应	数字病理学	心血管疾病	单细胞定量PCR (sc-qPCR), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单分子荧光原位杂交 (smFISH)	NA	图像	来自压力超负荷小鼠心脏的心肌细胞和横截面，早期肥大阶段（2周，TAC2W）和晚期心衰阶段（8周，TAC8W）
48	2024-08-09	Single-Cell RNA-Seq of the Pancreatic Islets--a Promise Not yet Fulfilled? 2019-03-05, Cell metabolism IF:27.7Q1 DOI:10.1016/j.cmet.2018.11.016 PMID:30581120	研究论文	本文综述了过去三年中单细胞RNA测序技术在胰腺胰岛细胞研究中的应用及其进展	单细胞RNA测序技术首次实现了对罕见内分泌细胞类型的转录定义，如生长激素释放肽产生的ɛ细胞	关于细胞类型特异性基因表达变化在2型糖尿病中的结论可能需要在大样本量可用时重新审视	探讨单细胞RNA测序技术在胰腺胰岛细胞类型鉴定和疾病状态下的应用	胰腺胰岛细胞，特别是α细胞和β细胞及其在疾病中的变化	数字病理学	代谢性疾病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	涉及小鼠和人的胰腺胰岛细胞
49	2024-08-09	GABA promotes β-cell proliferation, but does not overcome impaired glucose homeostasis associated with diet-induced obesity 2019-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.201801397R PMID:30509117	研究论文	本研究探讨了γ-氨基丁酸（GABA）对健康和糖耐量受损/肥胖小鼠β细胞的影响，发现GABA能增加β细胞数量，但对高脂饮食诱导的胰岛素抵抗和糖耐量受损无改善作用。	本研究首次揭示了GABA在单细胞水平上对β细胞增殖的影响，并发现GABA处理后β细胞中特定基因表达的变化。	研究未探讨GABA对β细胞功能长期影响的机制，且样本量较小。	探讨GABA对β细胞增殖及糖代谢的影响。	健康和糖耐量受损/肥胖小鼠的β细胞。	NA	糖尿病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠样本
50	2024-08-09	Single-cell sequencing defines genetic heterogeneity in pancreatic cancer precursor lesions 2019-03, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.5194 PMID:30430578	研究论文	本研究通过单细胞测序技术，分析了胰腺癌前病变——导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMNs）的遗传异质性	首次在单细胞水平上揭示了IPMNs中同一驱动基因内不同突变的频繁共存现象，并提出了多克隆起源或未知的初始事件的可能性	研究样本量较小，仅涉及十个IPMNs组织	旨在阐明IPMNs在单细胞层面的遗传异质性	导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMNs）	数字病理学	胰腺癌	下一代测序	NA	基因组数据	十个IPMNs组织中的单细胞
51	2024-08-09	New MiniPromoter Ple345 (NEFL) Drives Strong and Specific Expression in Retinal Ganglion Cells of Mouse and Primate Retina 2019-03, Human gene therapy IF:3.9Q2 DOI:10.1089/hum.2018.118 PMID:30062914	研究论文	本文通过计算生物学方法，挖掘人类基因组，开发了一种新的最小启动子元素（MiniPromoter）Ple345（NEFL），旨在提高视网膜神经节细胞基因治疗的安全性和有效性	开发了一种新的基于人类DNA的最小启动子Ple345（NEFL），该启动子在重组腺相关病毒（rAAV）中显示出在非人类灵长类视网膜神经节细胞中的特异性和强表达	NA	改进视网膜神经节细胞基因治疗的安全性和有效性	视网膜神经节细胞	基因治疗	视网膜疾病	单细胞RNA测序（Drop-seq）	NA	基因组数据	在老鼠和非人类灵长类视网膜中测试了七个启动子设计