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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing in ovarian cancer: a new frontier in precision medicine
2019-02, Current opinion in obstetrics & gynecology
IF:2.2Q2
DOI:10.1097/GCO.0000000000000516
PMID:30507625
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序数据在指导卵巢癌治疗决策中的进展、应用和挑战 | 单细胞测序技术提供了表征卵巢癌肿瘤组织异质性的手段,并有机会确定影响临床结果的关键分子特性 | 大多数研究使用的是批量样本,导致数据代表所有细胞的平均值 | 提高对肿瘤细胞异质性的理解,以指导个性化癌症治疗 | 卵巢癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
42 | 2024-08-09 |
Recovery and analysis of transcriptome subsets from pooled single-cell RNA-seq libraries
2019-02-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky1204
PMID:30496484
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研究论文 | 本文开发了一种策略,通过物理方法恢复池化单细胞RNA测序库中的转录组子集,以提取更集中的基因表达信息 | 本文提出的方法通过物理恢复DNA分子,使隔离的分子能够通过另一轮DNA测序进行更深入的分析 | NA | 提高单细胞RNA测序库中基因表达信息的提取效率 | 单细胞RNA测序库中的转录组子集 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | DNA序列 | 从复杂的淋巴细胞混合物中重新采样了罕见的单个巨核细胞转录组,并进行了第二轮DNA测序 |
43 | 2024-08-09 |
Human Wharton's Jelly Mesenchymal Stem Cells Show Unique Gene Expression Compared with Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Using Single-Cell RNA-Sequencing
2019-02-01, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2018.0132
PMID:30484393
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术比较了人脐带华通胶间充质干细胞与骨髓间充质干细胞的基因表达差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了人脐带华通胶间充质干细胞与骨髓间充质干细胞在基因表达上的显著差异 | 研究仅限于基因表达层面的比较,未涉及细胞功能的具体实验验证 | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人脐带华通胶间充质干细胞与骨髓间充质干细胞的基因表达差异,以探索其在临床应用中的优势 | 人脐带华通胶间充质干细胞与骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 436个显著差异表达基因 |
44 | 2024-08-09 |
scFTD-seq: freeze-thaw lysis based, portable approach toward highly distributed single-cell 3' mRNA profiling
2019-02-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky1173
PMID:30462277
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scFTD-seq的微芯片平台,用于直接进行单细胞冷冻-解冻裂解的3' mRNA测序 | scFTD-seq平台简化了工作流程,减少了准备步骤和操作时间,同时保持了与最先进的scRNA-seq平台相匹配的数据质量和成本 | NA | 开发一种新的单细胞3' mRNA测序方法,以简化流程并提高可移植性 | 循环滤泡辅助T细胞,这些细胞与系统性红斑狼疮的发病机制有关 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 3' mRNA测序 | NA | mRNA | NA |
45 | 2024-08-09 |
Evaluation and application of RNA-Seq by MinION
2019-Feb-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsy038
PMID:30462165
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研究论文 | 本文评估并应用了使用MinION纳米孔测序仪进行的全长cDNA测序方法 | 利用MinION的长读取特性,能够识别剪接模式及其组合,并提供融合基因转录本的全长cDNA信息,以及用于SNP分型的全长度cDNA信息 | 测序准确性仍有限,仅为92.3% | 评估并应用MinION RNA-Seq技术在全长cDNA测序中的性能 | 全长cDNA测序技术及其在不同应用中的效果 | 基因组学 | NA | RNA-Seq, MinION | NA | cDNA | 两个特定个体的七个主要器官 |
46 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Mesenchymal Stem Cells Reveal Age-Related Cellular Subpopulation Depletion and Impaired Regenerative Function
2019-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.2934
PMID:30412645
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了人骨髓间充质干细胞在年龄相关性细胞亚群耗竭和再生功能受损中的分子机制 | 发现了年轻供体骨髓间充质干细胞中存在一种独特的静止亚群,该亚群仅在年轻细胞中存在,且与更高的组织再生基因表达相关 | NA | 探究年龄对骨髓间充质干细胞功能的影响及其分子机制 | 人骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
47 | 2024-08-09 |
GPseudoRank: a permutation sampler for single cell orderings
2019-02-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty664
PMID:30052778
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GPseudoRank的排列采样器,用于单细胞排序 | GPseudoRank能够从复杂的多模态后验分布中采样,并识别生物过程中低和高伪时间不确定性的阶段 | NA | 开发一种方法来采样复杂的、多模态的排序分布,并估计生物发育过程中排序不确定性的变化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | Bayesian modelling, MCMC | 单细胞RNA测序数据 | NA |
48 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Oocytes: Environment-Driven Metabolic Competition and Compensatory Mechanisms During Oocyte Maturation
2019-02-01, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2017.7151
PMID:29486586
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序探索了人类卵母细胞成熟过程中环境驱动的代谢转变及其补偿机制 | 首次研究表明体外环境暴露会导致人类卵母细胞成熟期间能量代谢下降,但补偿作用维持其发育能力 | NA | 阐明人类体外成熟卵母细胞发育潜力的关键步骤中,环境驱动代谢转变的协调机制 | 人类卵母细胞的成熟过程及其代谢调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |