单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-07 |
Discovery of a CD10-negative B-progenitor in human fetal life identifies unique ontogeny-related developmental programs
2019-09-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2019001289
PMID:31383639
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研究论文 | 本文提供了人类胎儿B细胞发育层次的综合分析，报道了胎儿组织中两种不同的CD19 B祖细胞，即成人型CD10+ ProB祖细胞和新的CD10- PreProB祖细胞，并描述了它们的分子和功能特征。 | 发现了人类胎儿生命中CD10阴性的B祖细胞，并描述了其独特的发育程序，这些程序与成人的PreProB祖细胞不同。 | NA | 理解胎儿B淋巴细胞生成及其在早期生命中白血病启动的关键作用。 | 人类胎儿B细胞发育层次及其分子和功能特征。 | NA | NA | 单细胞转录组学和功能分析 | NA | 转录组数据 | 胎儿骨髓中的B祖细胞 |
| 162 | 2024-08-07 |
Defining the Identity and Dynamics of Adult Gastric Isthmus Stem Cells
2019-09-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.07.008
PMID:31422913
|
研究论文 | 本研究通过无偏倚的遗传标记和生物物理建模，揭示了胃体腺被分为两个独立区域，慢周期干细胞维持基部，而快速周期干细胞通过“点状”中性漂移动态维持坑-峡-颈部区域。 | 首次通过单细胞RNA测序分析定义了单个周期性峡部干细胞的分子身份和谱系关系。 | NA | 确定成年胃峡部干细胞的身份和动态。 | 胃体峡部干细胞及其与其他干细胞群体的相互作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | 单个周期性峡部干细胞 |
| 163 | 2024-08-07 |
The Eleventh ENBDC Workshop: Advances in Technology Help to Unveil Mechanisms of Mammary Gland Development and Cancerogenesis
2019-09, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-019-09436-0
PMID:31494779
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研讨会报告 | 第十一届欧洲乳腺发育与癌症网络研讨会，主题为乳腺生物学和乳腺癌研究中的高分辨率基因组学和蛋白质组学方法 | 介绍了单细胞RNA测序、遗传条形码、谱系追踪、空间转录组学、光遗传学、遗传小鼠模型和类器官等创新方法 | NA | 探讨乳腺发育和癌症发生机制 | 乳腺发育和乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、遗传条形码、空间转录组学、光遗传学 | 遗传小鼠模型、类器官 | 基因组学、蛋白质组学 | NA |
| 164 | 2024-08-07 |
Intrinsic Resistance to Immune Checkpoint Blockade in a Mismatch Repair-Deficient Colorectal Cancer
2019-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-18-0683
PMID:31217164
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研究论文 | 本文描述了一例MSI-H结直肠癌患者在接受免疫检查点抑制剂治疗后出现疾病进展的情况，并通过基因组、转录组和病理学特征分析了其内在抗药性 | 研究揭示了MSI-H肿瘤对免疫检查点抑制剂的抗药性机制，并提出了针对结直肠癌的免疫治疗策略 | 研究仅基于单一病例，可能需要更多样本验证结果 | 探讨MSI-H结直肠癌对免疫检查点抑制剂的内在抗药性 | MSI-H结直肠癌患者的肿瘤及其免疫微环境 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析，多重免疫荧光 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 数百个结直肠癌样本 |
| 165 | 2024-08-07 |
In silico error correction improves cfDNA mutation calling
2019-07-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty1004
PMID:30520956
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PCR错误校正（PEC）的算法，用于识别和校正短读序数据中的错误，利用PCR扩增过程中的冗余来提高循环肿瘤DNA（ctDNA）分析的突变检测准确性 | PEC算法通过利用PCR扩增过程中的冗余，显著提高了突变检测的准确性，且性能与需要额外步骤和校准DNA数据集的更复杂策略相当 | NA | 提高循环肿瘤DNA分析中的突变检测准确性 | 循环肿瘤DNA（ctDNA） | 生物信息学 | 癌症 | PCR | 算法 | 短读序数据 | NA |
| 166 | 2024-08-07 |
Spatially constrained tumour growth affects the patterns of clonal selection and neutral drift in cancer genomic data
2019-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1007243
PMID:31356595
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研究论文 | 本文通过空间随机细胞自动机模型模拟肿瘤生长，研究空间约束对肿瘤基因组数据中克隆选择和遗传漂变模式的影响 | 提出了一个统计推断框架，该框架考虑了肿瘤生长中的空间效应，有助于从基因组数据中推断进化动力学 | 测量癌症进化使用下一代测序技术时，考虑到众多混杂因素仍然具有挑战性 | 量化空间肿瘤采样对下一代测序数据中检测到的突变模式的影响 | 研究空间结构对固体癌症中克隆选择和遗传漂变的检测影响 | 数字病理学 | NA | 下一代测序 | 细胞自动机模型 | 基因组数据 | 多区域采样数据 |
| 167 | 2024-08-07 |
New insights into hematopoietic differentiation landscapes from single-cell RNA sequencing
2019-03-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2018-08-835355
PMID:30728144
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在解析造血分化景观中的应用 | 探讨了单细胞分子 profiling 如何在高分辨率下绘制时间解析的分化轨迹，并挑战了我们对干细胞和祖细胞类型及其组织的先前认知 | 依赖于对转录组景观的推断，并基于某些假设 | 深入理解造血层次结构 | 造血分化过程及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 168 | 2024-08-07 |
Beyond Fibroblast Heterogeneity: What Single-Cell RNA Sequencing Tells Us
2019-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2019-0120ED
PMID:30978296
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-07 |
Single-nuclei RNA-seq on human retinal tissue provides improved transcriptome profiling
2019-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12917-9
PMID:31848347
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序（snRNA-seq）技术对人类视网膜组织进行了转录组分析 | 本研究展示了单核RNA测序在人类冷冻组织中获取单细胞转录组的能力，相较于人类批量RNA测序或动物模型，提供了更深入的见解 | NA | 通过单核RNA测序技术解析复杂组织中的异质性 | 人类视网膜组织及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本，来自3名健康捐赠者，共5873个单核 |
| 170 | 2024-08-07 |
Single-cell technologies in reproductive immunology
2019-09, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13157
PMID:31206899
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综述 | 本文综述了单细胞技术在生殖免疫学中的应用，特别是如何通过这些技术来理解母胎界面的复杂免疫环境 | 介绍了单细胞RNA测序与微流控技术结合，以及多色流式细胞术在识别新型细胞类型中的应用 | 生成的数据集具有极高的维度和大小，需要应用新的计算方法进行无偏分析 | 为生殖免疫学界提供关于复杂流式细胞术和RNA测序数据获取及分析的计算工具的概述和简要入门 | 母胎界面的免疫环境及其中的细胞类型 | 生殖免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，多色流式细胞术 | tSNE，SPADE，SPICE | 细胞分辨率的数据 | NA |
| 171 | 2024-08-07 |
Dissecting Cellular Heterogeneity Using Single-Cell RNA Sequencing
2019-Mar-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2019.2446
PMID:30764602
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析细胞异质性中的应用 | 介绍了scRNA-seq技术如何通过提供来自数万个单个细胞的全基因组分子轮廓来定量和无偏地表征细胞异质性 | NA | 探讨如何利用scRNA-seq数据解释观察到的细胞间变异性 | 细胞异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数万个单个细胞 |
| 172 | 2024-08-07 |
Comparative analysis of sequencing technologies for single-cell transcriptomics
2019-04-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1676-5
PMID:30961669
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研究论文 | 本文首次比较了BGISEQ-500平台与Illumina HiSeq平台在单细胞RNA测序技术中的应用 | 提供了468个单细胞和1297个匹配的单cDNA样本的资源，用于基准测试新的单细胞RNA测序库准备协议和测序平台 | NA | 比较不同测序技术在单细胞转录组学中的性能 | 单细胞RNA测序技术 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 468个单细胞和1297个匹配的单cDNA样本 |
| 173 | 2024-08-07 |
In situ 10-cell RNA sequencing in tissue and tumor biopsy samples
2019-03-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-41235-9
PMID:30894605
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研究论文 | 本文介绍了一种在组织和肿瘤活检样本中进行原位10细胞RNA测序的方法 | 结合激光捕获技术和改进的预放大程序，实现了对10个微切割细胞的RNA测序，提高了单细胞RNA测序的技术可靠性和灵敏度 | NA | 开发一种新的方法来量化细胞在其原始组织环境中的个体调控状态 | 组织和肿瘤活检样本中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 10个微切割细胞 |
| 174 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Lymphoma Clearance Induced by High-Dose Alkylating Agents
2019-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1393
PMID:31040105
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研究论文 | 本文探讨了高剂量烷化剂在人类双打击淋巴瘤中清除淋巴瘤的机制 | 发现高剂量烷化剂通过诱导内质网应激，促进巨噬细胞依赖的淋巴瘤清除，这是一种新的机制 | NA | 研究高剂量环磷酰胺在人类双打击淋巴瘤中的作用机制 | 人类双打击淋巴瘤 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 175 | 2024-08-07 |
Model-based understanding of single-cell CRISPR screening
2019-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10216-x
PMID:31110232
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研究论文 | 本文介绍了MUSIC，一个集成管道，用于基于模型的单细胞CRISPR筛选数据理解 | MUSIC能够准确量化和优先处理单细胞CRISPR筛选数据中的个体基因扰动效应，并能容忍数据分析中存在的显著噪声 | NA | 开发一个集成管道，以基于模型的方法分析单细胞CRISPR筛选数据，从而阐明扰动功能和生物电路 | 单细胞CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | CRISPR筛选, 单细胞RNA测序 | 集成管道 | 单细胞数据 | 使用所有公开可用的数据进行综合测试 |
| 176 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing-Based CRISPRi Screening Resolves Molecular Drivers of Early Human Endoderm Development
2019-Apr-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.03.076
PMID:30995470
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和CRISPRi筛选技术，解析了人类内胚层早期发育的分子驱动因素 | 首次将单细胞RNA测序与CRISPRi筛选相结合，全面定义了内胚层发育中基因功能丧失的表型 | NA | 研究人类内胚层发育的分子基础 | 人类胚胎干细胞向内胚层的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPRi | NA | RNA | NA |
| 177 | 2024-08-07 |
CRISPR Screening in Single Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_23
PMID:31028650
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研究论文 | 本文描述了在单细胞水平上使用CRISPR筛选技术的当前协议 | 结合单细胞RNA测序和CRISPR技术，可以高效地研究任意数量的基因 | 研究受限于测序能力 | 探索在单细胞水平上使用CRISPR筛选技术的方法 | 单细胞中的基因 | 基因编辑 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 任意数量的基因，受限于测序能力 |
| 178 | 2024-08-07 |
Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepatocellular Carcinoma
2019-Oct-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.003
PMID:31675496
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研究论文 | 本研究结合两种单细胞RNA测序技术，分析了肝细胞癌患者五个免疫相关部位的CD45免疫细胞转录组 | 首次揭示了LAMP3树突状细胞在肿瘤与淋巴结间的迁移潜力及其对多种淋巴细胞亚型的调控作用 | NA | 深入了解肝细胞癌的免疫微环境 | 肝细胞癌患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自五个不同部位的肝细胞癌患者样本 |
| 179 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals novel gene expression signatures of trastuzumab treatment in HER2+ breast cancer: A pilot study
2019-Jun, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000015872
PMID:31261495
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了HER2阳性乳腺癌患者在接受曲妥珠单抗治疗前后的基因表达谱变化 | 首次在单细胞水平上研究了曲妥珠单抗治疗患者的转录组特征，揭示了新的基因表达特征及其在乳腺癌和心脏毒性中的作用 | 作为一项试点研究，样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探索曲妥珠单抗治疗HER2阳性乳腺癌的分子机制及其引起的心脏毒性 | HER2阳性乳腺癌患者在接受曲妥珠单抗治疗前后的单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 461个差异表达基因 |
| 180 | 2024-08-07 |
Evaluation of Weng et al.: Leveraging Cell Type Correlations and Single-Cell Bioinformatics to Identify Progenitor Diversity and Lineage
2019-05-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.04.011
PMID:31051125
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评论 | 本文是对Weng等人2019年发表的关于单细胞转录组学研究中间胶质前体细胞及细胞命运和胶质瘤发生的关键决定因素的同行评审过程的展示 | NA | NA | 展示对Weng等人研究的同行评审过程 | 单细胞转录组学研究的中间胶质前体细胞及细胞命运和胶质瘤发生的关键决定因素 | 单细胞生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |