单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 901 - 913 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 901 | 2024-08-09 |
CancerSEA: a cancer single-cell state atlas
2019-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky939
PMID:30329142
|
研究论文 | 开发了CancerSEA数据库，这是一个专注于探索癌症单细胞水平上不同功能状态的首个专用数据库 | CancerSEA是首个专注于癌症单细胞功能状态的数据库，提供了14种功能状态的详细信息，并允许用户查询特定基因或基因列表在不同癌症中的功能状态关联 | NA | 构建一个专用资源以解码癌症单细胞的功能状态 | 41,900个来自25种癌症类型的单细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 41,900个癌症单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 902 | 2024-08-09 |
CellMarker: a manually curated resource of cell markers in human and mouse
2019-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky900
PMID:30289549
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research paper | 本文开发了CellMarker数据库，旨在为人类和小鼠组织中各种细胞类型提供全面准确的细胞标记资源 | 通过手动整理超过10万篇已发表的论文，收集并记录了4124条包含细胞标记信息、组织类型、细胞类型、癌症信息和来源的条目 | NA | 提供一个全面且准确的细胞标记资源，以帮助精确识别和表征细胞，特别是在单细胞水平 | 人类和小鼠组织中的各种细胞类型 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 文本 | 收集了13605个细胞标记，涵盖467种细胞类型在158个人类组织/亚组织中；以及9148个细胞标记，涵盖389种细胞类型在81个小鼠组织/亚组织中 | NA | NA | NA | NA |
| 903 | 2024-08-09 |
Targeting individual cells by barcode in pooled sequence libraries
2019-01-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky856
PMID:30256981
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研究论文 | 本文介绍了一种多重PCR方法，用于从混合单细胞序列库中选择性测序特定细胞 | 提出了一种分子富集方法，结合FACS技术，有效针对超稀有细胞类型，如AXL+SIGLEC6+树突状细胞子集，减少了单细胞测序所需的努力 | NA | 开发一种方法，从混合单细胞序列库中选择性测序特定细胞 | 人类血液细胞中的多种细胞类型 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 序列数据 | 数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 904 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Adult Mouse Kidney: From Molecular Cataloging of Cell Types to Disease-Associated Predictions
2019-01, American journal of kidney diseases : the official journal of the National Kidney Foundation
IF:9.4Q1
DOI:10.1053/j.ajkd.2018.07.002
PMID:30241960
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 905 | 2024-08-09 |
Phylogeny and physiology of candidate phylum BRC1 inferred from the first complete metagenome-assembled genome obtained from deep subsurface aquifer
2019-Jan, Systematic and applied microbiology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.syapm.2018.08.013
PMID:30201528
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研究论文 | 本文通过从深层地下热含水层微生物群落的宏基因组中重建BRC1细菌BY40的完整基因组，进行了代谢重建和与现有基因组数据的比较分析 | 首次从深层地下含水层获得了候选门BRC1的完整宏基因组组装基因组，并提出了新的分类建议 | NA | 研究候选细菌门BRC1的系统发育和生理特性 | 候选细菌门BRC1及其成员BY40的基因组和代谢途径 | 微生物学 | NA | 宏基因组学 | NA | 基因组数据 | 单个细菌BY40的3.3Mb基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 906 | 2024-08-09 |
Impact of similarity metrics on single-cell RNA-seq data clustering
2019-11-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bby076
PMID:30137247
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研究论文 | 本文比较了多种相似性度量在单细胞RNA测序数据聚类中的影响 | 首次对不同相似性度量在单细胞RNA测序数据聚类中的影响进行了基准测试，并发现基于相关性的度量（如皮尔逊相关）优于基于距离的度量（如欧几里得距离） | 文章未提及具体的局限性 | 研究不同相似性度量对单细胞RNA测序数据聚类质量的影响 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 基于核的聚类算法 (SIMLR) | 基因表达数据 | 多个注释的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 907 | 2024-08-09 |
New MiniPromoter Ple345 (NEFL) Drives Strong and Specific Expression in Retinal Ganglion Cells of Mouse and Primate Retina
2019-03, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2018.118
PMID:30062914
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研究论文 | 本文通过计算生物学方法，挖掘人类基因组，开发了一种新的最小启动子元素（MiniPromoter）Ple345（NEFL），旨在提高视网膜神经节细胞基因治疗的安全性和有效性 | 开发了一种新的基于人类DNA的最小启动子Ple345（NEFL），该启动子在重组腺相关病毒（rAAV）中显示出在非人类灵长类视网膜神经节细胞中的特异性和强表达 | NA | 改进视网膜神经节细胞基因治疗的安全性和有效性 | 视网膜神经节细胞 | 基因治疗 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（Drop-seq） | NA | 基因组数据 | 在老鼠和非人类灵长类视网膜中测试了七个启动子设计 | NA | NA | NA | NA |
| 908 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct gene expression patterns in glucose metabolism of human preimplantation embryos
2019-Jan, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD18178
PMID:30017025
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类胚胎植入前阶段葡萄糖代谢相关基因的表达模式 | 首次在单细胞分辨率下研究了胚胎植入前阶段葡萄糖代谢的动态基因表达谱 | NA | 探究人类胚胎植入前阶段葡萄糖代谢相关基因的表达调控机制 | 人类胚胎植入前阶段的葡萄糖代谢相关基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 人类胚胎植入前阶段的多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 909 | 2024-08-09 |
Genetic and phenotypic difference in CD8+ T cell exhaustion between chronic hepatitis B infection and hepatocellular carcinoma
2019-01, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2018-105267
PMID:29666149
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研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎（CHB）和肝细胞癌（HCC）中CD8+ T细胞耗竭的遗传和表型差异 | 首次详细比较了CHB和HCC中CD8+ T细胞耗竭的表型、功能状态和分子机制的差异 | 研究仅基于已发表的单细胞测序数据和有限的样本，可能无法全面反映所有CHB和HCC患者的CD8+ T细胞耗竭情况 | 探索CHB和HCC中CD8+ T细胞耗竭的遗传和表型差异 | CHB和HCC患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于已发表的数据集GSE98638 | NA | NA | NA | NA |
| 910 | 2024-08-09 |
Placing RNA in context and space - methods for spatially resolved transcriptomics
2019-04, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.14435
PMID:29542254
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综述 | 本文综述了空间分辨转录组学的方法，特别是原位RNA分析技术及其最新进展 | 介绍了更全面和高度多重化的空间分辨转录组学方法的最新发展 | 讨论了这些方法的局限性和挑战 | 旨在更好地理解多细胞生物的细胞和组织功能，需要在其生理、形态和解剖背景和空间中绘制细胞图谱 | 多细胞生物的细胞和组织功能 | NA | NA | 原位RNA分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 911 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Oocytes: Environment-Driven Metabolic Competition and Compensatory Mechanisms During Oocyte Maturation
2019-02-01, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2017.7151
PMID:29486586
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序探索了人类卵母细胞成熟过程中环境驱动的代谢转变及其补偿机制 | 首次研究表明体外环境暴露会导致人类卵母细胞成熟期间能量代谢下降，但补偿作用维持其发育能力 | NA | 阐明人类体外成熟卵母细胞发育潜力的关键步骤中，环境驱动代谢转变的协调机制 | 人类卵母细胞的成熟过程及其代谢调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 912 | 2024-08-09 |
How to design a single-cell RNA-sequencing experiment: pitfalls, challenges and perspectives
2019-07-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bby007
PMID:29394315
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序实验的设计方法、计算工具及其在不同实验设计和生物问题中的应用 | 提供了针对特定实验设计的分析框架建议，并评估了该领域的挑战和未来展望 | 大多数方法尚未进行性能基准测试，增加了选择最优实验和分析流程的难度 | 旨在概述当前可用于处理单细胞RNA测序数据的实验和计算方法 | 单细胞RNA测序实验的设计和数据分析方法 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 913 | 2024-08-09 |
Clustering single cells: a review of approaches on high-and low-depth single-cell RNA-seq data
2019-11-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/ely001
PMID:29346505
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |