单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 881 - 900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 881 | 2024-08-09 |
Advantages of Single-Nucleus over Single-Cell RNA Sequencing of Adult Kidney: Rare Cell Types and Novel Cell States Revealed in Fibrosis
2019-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.2018090912
PMID:30510133
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研究论文 | 本文比较了单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）在成年小鼠肾脏中的应用，特别是在纤维化肾脏中的表现 | snRNA-seq在成年肾脏中实现了与scRNA-seq相当的基因检测，同时具有减少分离偏差、兼容冷冻样本、消除分离诱导的转录应激反应等优势 | NA | 探讨单核RNA测序在成年肾脏研究中的优势，特别是在纤维化肾脏中的应用 | 成年小鼠肾脏，特别是纤维化肾脏 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA序列 | 总共生成了11,391个转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 882 | 2024-08-09 |
Myelodysplastic syndrome progression to acute myeloid leukemia at the stem cell level
2019-01, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-018-0267-4
PMID:30510255
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研究论文 | 研究探讨了骨髓增生异常综合征（MDS）向急性髓系白血病（AML）进展过程中干细胞水平的变化 | 通过靶向深度测序结合单细胞测序，揭示了MDS阶段干细胞具有更高的亚克隆复杂性，并含有大量与衰老相关的变异 | NA | 确定MDS向AML进展的细胞起源和机制 | MDS进展至AML患者的纵向样本中的高度分馏干细胞群体 | 数字病理学 | 骨髓增生异常综合征 | 靶向深度测序，单细胞测序 | NA | 细胞 | MDS进展至AML患者的纵向样本 | NA | NA | NA | NA |
| 883 | 2024-08-09 |
Hypothalamic cell diversity: non-neuronal codes for long-distance volume transmission by neuropeptides
2019-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2018.10.012
PMID:30471413
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研究论文 | 本文探讨了下丘脑神经肽通过非神经细胞进行长距离体积传输的机制 | 利用单细胞RNA测序数据发现tanycytes和室管膜作为神经活性物质的替代来源，以及通过神经元-室管膜耦合介导的相位体积传输 | NA | 研究下丘脑神经肽的长距离体积传输及其在神经精神疾病中的作用 | 下丘脑细胞多样性及神经肽的体积传输机制 | 神经科学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 884 | 2024-08-09 |
Recovery and analysis of transcriptome subsets from pooled single-cell RNA-seq libraries
2019-02-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky1204
PMID:30496484
|
研究论文 | 本文开发了一种策略，通过物理方法恢复池化单细胞RNA测序库中的转录组子集，以提取更集中的基因表达信息 | 本文提出的方法通过物理恢复DNA分子，使隔离的分子能够通过另一轮DNA测序进行更深入的分析 | NA | 提高单细胞RNA测序库中基因表达信息的提取效率 | 单细胞RNA测序库中的转录组子集 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | DNA序列 | 从复杂的淋巴细胞混合物中重新采样了罕见的单个巨核细胞转录组，并进行了第二轮DNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 885 | 2024-08-09 |
Human Wharton's Jelly Mesenchymal Stem Cells Show Unique Gene Expression Compared with Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Using Single-Cell RNA-Sequencing
2019-02-01, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2018.0132
PMID:30484393
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术比较了人脐带华通胶间充质干细胞与骨髓间充质干细胞的基因表达差异 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了人脐带华通胶间充质干细胞与骨髓间充质干细胞在基因表达上的显著差异 | 研究仅限于基因表达层面的比较，未涉及细胞功能的具体实验验证 | 旨在通过单细胞RNA测序技术揭示人脐带华通胶间充质干细胞与骨髓间充质干细胞的基因表达差异，以探索其在临床应用中的优势 | 人脐带华通胶间充质干细胞与骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 436个显著差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 886 | 2024-08-09 |
Comparative Analysis of Droplet-Based Ultra-High-Throughput Single-Cell RNA-Seq Systems
2019-01-03, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2018.10.020
PMID:30472192
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研究论文 | 本文对三种广泛使用的基于液滴的超高通量单细胞RNA测序系统（inDrop、Drop-seq和10X Genomics Chromium）进行了系统比较分析 | 首次对这些系统进行了直接比较，揭示了各自的特征和适用场景 | NA | 比较不同超高通量单细胞RNA测序系统的性能和应用 | 基于液滴的超高通量单细胞RNA测序系统 | 生物医学研究 | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 同一细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 887 | 2024-08-09 |
A complex auxiliary: IL-17/Th17 signaling during type 1 diabetes progression
2019-01, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2018.11.007
PMID:30472513
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综述 | 本文综述了IL-17/Th17信号在1型糖尿病进展中的辅助作用 | 通过重新分析最近发表的单细胞测序和排序细胞批量测序数据集中的关键因子，提供了IL-17信号装置在胰岛内分泌细胞中普遍存在的证据 | 需要解决多个问题以评估抗IL-17疗法在治疗1型糖尿病中的潜在适用性 | 探讨IL-17在1型糖尿病进展中的作用及其在糖尿病并发症中的影响 | IL-17/Th17信号在1型糖尿病中的作用及其在远端组织并发症中的影响 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 888 | 2024-08-09 |
A Deep Dive into Immunotherapy Resistance
2019-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-ND2018-010
PMID:30487234
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序，两组研究人员揭示了CD8+ T细胞和肿瘤细胞在驱动免疫疗法抗性中的不同作用 | 研究确定了两种不同的T细胞状态以及肿瘤细胞促进的T细胞排除程序，这些可能影响患者对免疫检查点阻断的反应 | NA | 探讨免疫疗法抗性的机制 | CD8+ T细胞和肿瘤细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 889 | 2024-08-09 |
pyNVR: investigating factors affecting feature selection from scRNA-seq data for lineage reconstruction
2019-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty950
PMID:30445607
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研究论文 | 本文介绍了pyNVR工具，用于从scRNA-seq数据中选择特征以进行谱系重建，并比较了其与多种无监督算法的性能差异 | 开发了基于邻域方差比（NVR）的特征选择方法，并将其作为Python包实现，显著提高了性能 | NA | 研究影响scRNA-seq数据特征选择的因素，并评估不同算法在特征选择上的表现 | scRNA-seq数据中的特征选择算法及其性能 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 890 | 2024-08-09 |
GRNBoost2 and Arboreto: efficient and scalable inference of gene regulatory networks
2019-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty916
PMID:30445495
|
research paper | 本文介绍了GRNBoost2和Arboreto框架，用于从大规模基因表达数据中高效推断基因调控网络 | 提出了GRNBoost2算法和Arboreto框架，能够高效处理因高通量基因分析技术（如单细胞RNA-seq）产生的日益增长的数据量 | NA | 开发工具集以从大型表达数据集中推断基因调控网络 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 梯度提升 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 891 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing in facioscapulohumeral muscular dystrophy disease etiology and development
2019-04-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddy400
PMID:30445587
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序结合伪时间轨迹建模，研究了面肩肱型肌营养不良症（FSHD）的病因和细胞进展 | 本文首次在单细胞水平上揭示了FSHD特异性细胞群，并发现了与DUX4去抑制相关的新基因，同时构建了FSHD细胞进展模型 | 本文主要集中在单细胞RNA测序数据的分析，未涉及临床治疗效果的验证 | 旨在揭示FSHD疾病的病因和细胞进展，为治疗提供新的生物标志物和靶点 | 面肩肱型肌营养不良症（FSHD）的病因和细胞进展 | 数字病理学 | 面肩肱型肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹建模 | RNA | 所有测试的患者来源的培养物中均鉴定出少量FSHD特异性细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 892 | 2024-08-09 |
scFTD-seq: freeze-thaw lysis based, portable approach toward highly distributed single-cell 3' mRNA profiling
2019-02-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky1173
PMID:30462277
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scFTD-seq的微芯片平台，用于直接进行单细胞冷冻-解冻裂解的3' mRNA测序 | scFTD-seq平台简化了工作流程，减少了准备步骤和操作时间，同时保持了与最先进的scRNA-seq平台相匹配的数据质量和成本 | NA | 开发一种新的单细胞3' mRNA测序方法，以简化流程并提高可移植性 | 循环滤泡辅助T细胞，这些细胞与系统性红斑狼疮的发病机制有关 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 3' mRNA测序 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 893 | 2024-08-09 |
Evaluation and application of RNA-Seq by MinION
2019-Feb-01, DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/dnares/dsy038
PMID:30462165
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研究论文 | 本文评估并应用了使用MinION纳米孔测序仪进行的全长cDNA测序方法 | 利用MinION的长读取特性，能够识别剪接模式及其组合，并提供融合基因转录本的全长cDNA信息，以及用于SNP分型的全长度cDNA信息 | 测序准确性仍有限，仅为92.3% | 评估并应用MinION RNA-Seq技术在全长cDNA测序中的性能 | 全长cDNA测序技术及其在不同应用中的效果 | 基因组学 | NA | RNA-Seq, MinION | NA | cDNA | 两个特定个体的七个主要器官 | NA | NA | NA | NA |
| 894 | 2024-08-09 |
Usage of Single-Cell RNA Sequencing to Unveil Immune Lymphoid Cell Precursors
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-8885-3_5
PMID:30465196
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研究论文 | 本文描述了一种基于板式的协议，用于制备骨髓先天淋巴细胞前体的单细胞cDNA文库，以便进行下一代测序基础的转录组分析 | 利用单细胞RNA测序技术，揭示免疫淋巴细胞前体的新细胞群和细胞异质性 | NA | 研究免疫细胞的发现和细胞发育轨迹 | 骨髓先天淋巴细胞前体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 895 | 2024-08-09 |
Single-cell analyses identify distinct and intermediate states of zebrafish pancreatic islet development
2019-06-01, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjy064
PMID:30407522
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了转基因斑马鱼胰腺胰岛在四个胚胎发育阶段的动态变化 | 本文首次详细描述了胰腺胰岛发育过程中的不同状态和分子特征，并识别了具有不同细胞周期阶段的增殖性内分泌前体细胞 | NA | 定义胰腺胰岛发育过程中的特征和分化过程 | 胰腺胰岛细胞的发育轨迹及其调控网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从TgBAC(neurod1:EGFP)转基因斑马鱼中分离的单个胰岛细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 896 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing defines genetic heterogeneity in pancreatic cancer precursor lesions
2019-03, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.5194
PMID:30430578
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，分析了胰腺癌前病变——导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMNs）的遗传异质性 | 首次在单细胞水平上揭示了IPMNs中同一驱动基因内不同突变的频繁共存现象，并提出了多克隆起源或未知的初始事件的可能性 | 研究样本量较小，仅涉及十个IPMNs组织 | 旨在阐明IPMNs在单细胞层面的遗传异质性 | 导管内乳头状粘液性肿瘤（IPMNs） | 数字病理学 | 胰腺癌 | 下一代测序 | NA | 基因组数据 | 十个IPMNs组织中的单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 897 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Human Mesenchymal Stem Cells Reveal Age-Related Cellular Subpopulation Depletion and Impaired Regenerative Function
2019-02, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.2934
PMID:30412645
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了人骨髓间充质干细胞在年龄相关性细胞亚群耗竭和再生功能受损中的分子机制 | 发现了年轻供体骨髓间充质干细胞中存在一种独特的静止亚群，该亚群仅在年轻细胞中存在，且与更高的组织再生基因表达相关 | NA | 探究年龄对骨髓间充质干细胞功能的影响及其分子机制 | 人骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 898 | 2024-08-09 |
Building and Regenerating the Lung Cell by Cell
2019-01-01, Physiological reviews
IF:29.9Q1
DOI:10.1152/physrev.00001.2018
PMID:30427276
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研究论文 | 本文探讨了哺乳动物肺部细胞和分子机制在肺形态发生中的作用 | 利用单细胞RNA测序数据和高分辨率成像技术，揭示了肺部细胞类型的显著异质性及其在肺发育中的基因表达 | NA | 研究肺部细胞多样性、肺形成和功能以及肺器官发生中的细胞和分子途径 | 肺部细胞的多样性、肺形成和功能以及肺器官发生中的细胞和分子途径 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 899 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq analysis identifies a noncoding interleukin 4 (IL-4) RNA that post-transcriptionally up-regulates IL-4 production in T helper cells
2019-01-04, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA118.004111
PMID:30404921
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠2型辅助T细胞的转录组复杂性，发现了一种非编码的IL-4 RNA，该RNA通过后转录机制上调IL-4的产生 | 首次在单细胞水平上发现了一种非编码的IL-4 RNA，该RNA通过后转录机制调控IL-4蛋白的产生 | NA | 揭示非典型转录本如何通过后转录机制调控其对应典型基因的表达 | 小鼠2型辅助T细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 900 | 2024-08-09 |
ArrayExpress update - from bulk to single-cell expression data
2019-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky964
PMID:30357387
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研究论文 | 本文更新了ArrayExpress数据库，从批量表达数据扩展到单细胞表达数据 | 引入了新的提交工具Annotare，收集必要的元数据以解释实验，并开发了BioStudies数据库以整合不同检测模式的多组学实验数据 | NA | 更新和扩展ArrayExpress数据库，以适应基于测序技术特别是RNA-seq实验的增加以及单细胞研究的显著增长 | 功能基因组学数据，特别是基于RNA-seq的单细胞表达数据 | 功能基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |