单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 861 - 880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 861 | 2024-08-09 |
A Genome-wide Framework for Mapping Gene Regulation via Cellular Genetic Screens
2019-01-10, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2018.11.029
PMID:30612741
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研究论文 | 本文提出了一种基于表达数量性状位点（eQTL）的框架，通过CRISPR/Cas9介导的扰动和单细胞RNA测序，大规模映射增强子-基因对 | 该研究通过引入随机组合的CRISPR/Cas9扰动，结合单细胞RNA测序技术，成功映射了大量增强子-基因对，为解析人类基因组中的顺式调控景观提供了新方法 | 研究主要集中在常见变异和连锁不平衡的范围内，可能无法涵盖所有类型的基因调控元素 | 旨在开发一种新的方法来大规模映射增强子-基因调控相互作用 | 研究对象包括5,920个候选增强子和254,974个单细胞转录组 | 基因组学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 5,920个候选增强子, 254,974个单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 862 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq of the Pancreatic Islets--a Promise Not yet Fulfilled?
2019-03-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2018.11.016
PMID:30581120
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研究论文 | 本文综述了过去三年中单细胞RNA测序技术在胰腺胰岛细胞研究中的应用及其进展 | 单细胞RNA测序技术首次实现了对罕见内分泌细胞类型的转录定义，如生长激素释放肽产生的ɛ细胞 | 关于细胞类型特异性基因表达变化在2型糖尿病中的结论可能需要在大样本量可用时重新审视 | 探讨单细胞RNA测序技术在胰腺胰岛细胞类型鉴定和疾病状态下的应用 | 胰腺胰岛细胞，特别是α细胞和β细胞及其在疾病中的变化 | 数字病理学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及小鼠和人的胰腺胰岛细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 863 | 2024-08-09 |
The genomic organization and expression pattern of the low-affinity Fc gamma receptors (FcγR) in the Göttingen minipig
2019-02, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-018-01099-1
PMID:30564855
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研究论文 | 本文研究了Göttingen小型猪中低亲和力Fcγ受体（FcγR）的基因组结构和表达模式 | 首次在Göttingen小型猪中鉴定出新的FcγRIIa基因，并分析了其在血小板上的表达 | 文章未提及具体的局限性 | 探讨Göttingen小型猪中Fcγ受体的基因组结构和表达模式，以促进其在治疗性抗体预临床研究中的应用 | Göttingen小型猪的Fcγ受体基因及其表达模式 | 生物医学研究 | NA | 基因组分析、测序、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA序列数据 | 涉及Göttingen小型猪的外周血单核细胞（PBMCs）和全血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 864 | 2024-08-09 |
Tumor Suppressor PTEN Regulates Negatively Sertoli Cell Proliferation, Testis Size, and Sperm Production In Vivo
2019-02-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/en.2018-00892
PMID:30576429
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型，探讨了IGFs在睾丸中的来源及其通过IGF/PTEN/PI3K途径促进未成熟Sertoli细胞增殖的机制 | 首次揭示了IGFs在睾丸间质类固醇生成前体细胞中的表达，并通过PTEN基因敲除小鼠模型验证了IGF/PTEN/PI3K途径在未成熟Sertoli细胞增殖中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明IGFs在睾丸中的来源及其通过IGF/PTEN/PI3K途径促进未成熟Sertoli细胞增殖的机制 | 未成熟Sertoli细胞的增殖、睾丸大小和精子产量 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | RNA | 小鼠胚胎睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 865 | 2024-08-09 |
Tissue Resident CCR2- and CCR2+ Cardiac Macrophages Differentially Orchestrate Monocyte Recruitment and Fate Specification Following Myocardial Injury
2019-01-18, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.118.314028
PMID:30582448
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研究论文 | 本文研究了心肌损伤后组织驻留的CCR2-和CCR2+心脏巨噬细胞如何不同地调控单核细胞的招募和命运指定 | 首次揭示了组织驻留的CCR2+和CCR2-巨噬细胞在心肌损伤后对单核细胞招募和命运指定的不同调控机制 | NA | 测试组织驻留的CCR2-和CCR2+巨噬细胞在心肌损伤后对单核细胞招募和命运指定的不同调控作用的假设 | 组织驻留的CCR2-和CCR2+心脏巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用多种小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 866 | 2024-08-09 |
Metabolic heterogeneity underlies reciprocal fates of TH17 cell stemness and plasticity
2019-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0806-7
PMID:30568299
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研究论文 | 本文研究了T17细胞在自身免疫性疾病模型中的代谢异质性及其对细胞命运的影响 | 首次揭示了T17细胞中存在具有干细胞样特征的亚群和具有高代谢活性的亚群，并阐明了mTORC1信号通路在调控T17细胞命运决策中的关键作用 | NA | 探讨T17细胞在慢性炎症条件下的异质性及其对自身免疫性疾病的贡献 | T17细胞的代谢异质性和细胞命运 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 867 | 2024-08-09 |
A test metric for assessing single-cell RNA-seq batch correction
2019-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0254-1
PMID:30573817
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研究论文 | 本文介绍了一种用于评估单细胞RNA测序批次效应校正的用户友好、稳健且敏感的k近邻批次效应测试（kBET） | 提出了一个量化批次效应的kBET方法，用于评估批次回归和归一化方法的效果，并区分细胞类型特异性个体间变异与细胞群体相对比例的变化 | NA | 评估单细胞RNA测序中的批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | k近邻批次效应测试（kBET） | 单细胞转录组数据 | 外周血单个核细胞（PBMCs）来自健康捐赠者 | NA | NA | NA | NA |
| 868 | 2024-08-09 |
Optimal Gene Filtering for Single-Cell data (OGFSC)-a gene filtering algorithm for single-cell RNA-seq data
2019-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty1016
PMID:30535000
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研究论文 | 本文提出了一种名为Optimal Gene Filtering for Single-Cell data (OGFSC)的新算法，用于构建基于基因表达水平和相应方差的阈值曲线，以有效减少单细胞RNA-seq数据中的技术噪声 | OGFSC算法通过构建基于基因表达水平和方差的阈值曲线，避免了传统固定阈值方法导致的过度严格或不足严格错误 | NA | 旨在提高单细胞RNA-seq数据中差异表达基因和细胞群的精确识别 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个模拟和已发表的实验数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 869 | 2024-08-09 |
DensityPath: an algorithm to visualize and reconstruct cell state-transition path on density landscape for single-cell RNA sequencing data
2019-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty1009
PMID:30535348
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研究论文 | 提出了一种名为DensityPath的算法，用于在单细胞RNA测序数据的密度景观上可视化和重建细胞状态转换路径 | DensityPath算法通过采用弹性嵌入的非线性降维方法，揭示数据内在结构，并从单细胞多模态密度景观中提取高密度水平集簇的拓扑特征，重建细胞状态转换的最优路径 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中细胞发育轨迹的可视化和重建问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 弹性嵌入 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 870 | 2024-08-09 |
Hypermutagenesis in untreated adult gliomas due to inherited mismatch mutations
2019-06-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.32054
PMID:30536544
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研究论文 | 研究未治疗的成人胶质瘤中由于遗传性错配修复突变导致的超突变现象 | 首次识别出未经治疗成人胶质瘤中存在的新生超突变表型，并探讨了自发和治疗诱导的超突变进化 | NA | 揭示未治疗成人胶质瘤中超突变过程的新理解，并为胶质瘤治疗的免疫疗法提供临床意义 | 未经治疗和治疗后的超突变胶质瘤 | 数字病理学 | 脑瘤 | 全外显子测序（WES），全转录组测序（WTS），单细胞测序（SCS） | NA | 基因组数据 | 涉及未经治疗和治疗后的超突变胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 871 | 2024-08-09 |
Network Inference from Single-Cell Transcriptomic Data
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-8882-2_10
PMID:30547403
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研究论文 | 本文探讨了利用单细胞转录组数据进行网络推断的优势和方法 | 利用单细胞转录组数据可以识别更复杂的非线性基因依赖关系，并推断特定条件下的调控网络 | NA | 研究如何利用单细胞转录组数据增强基因调控网络的推断 | 单细胞转录组数据中的基因依赖关系和调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大量单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 872 | 2024-08-09 |
Better Being Single? Omics Improves Kidney Organoids
2019, Nephron
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000496009
PMID:30554217
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术比较分析了两种肾脏类器官分化协议，并基于这些数据开发了一种新的分化协议以减少非肾脏细胞类型 | 开发了一种新的分化协议，旨在减少非肾脏细胞类型，同时不影响类器官上皮细胞的功能 | 文章指出，现有的分化协议未能产生纯净或全面的肾脏细胞，且存在非肾脏细胞类型的污染 | 比较不同肾脏类器官分化协议，并改进其功能 | 人类肾脏类器官及其分化协议 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及两种肾脏类器官分化协议的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 873 | 2024-08-09 |
Simultaneous multiplexed amplicon sequencing and transcriptome profiling in single cells
2019-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0259-9
PMID:30559431
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研究论文 | 描述了一种名为DART-seq的技术，该技术能够在单细胞水平上同时进行多重扩增子测序和转录组分析 | DART-seq技术具有多功能性，能够在单细胞中同时进行多重扩增子测序和转录组分析 | NA | 开发和应用DART-seq技术，以在单细胞水平上同时进行多重扩增子测序和转录组分析 | 非A尾的片段dsRNA病毒转录本和感染细胞的转录组，以及B淋巴细胞的天然配对可变区域重链和轻链扩增子和转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 874 | 2024-08-09 |
Single-cell and single-molecule epigenomics to uncover genome regulation at unprecedented resolution
2019-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0290-x
PMID:30559489
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观点 | 本文探讨了单细胞和单分子表观基因组技术在揭示基因组调控和动态方面的最新进展 | 介绍了这些技术如何用于识别新的基因调控模式，并强调了表观基因组技术在理解细胞多样性和发现基因调控机制中的重要性 | NA | 探讨单细胞和单分子表观基因组技术在基因调控研究中的应用 | 单细胞和单分子表观基因组技术 | 表观基因组学 | NA | 单细胞和单分子表观基因组技术 | NA | 表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 875 | 2024-08-09 |
Insights Into Local Orbital Immunity: Evidence for the Involvement of the Th17 Cell Pathway in Thyroid-Associated Ophthalmopathy
2019-05-01, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/jc.2018-01626
PMID:30517642
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研究论文 | 本研究探讨了甲状腺相关眼病（TAO）中眼眶免疫微环境与疾病发展的关联，并发现Th17细胞途径在TAO中的重要作用。 | 首次揭示了TAO眼眶微环境中Th17和Th2细胞反应的增加，以及CD34+眼眶成纤维细胞在促进Th17细胞表型中的作用。 | NA | 研究甲状腺相关眼病（TAO）中眼眶免疫微环境与疾病发展的关联。 | TAO和对照组的眼眶结缔组织。 | NA | 甲状腺相关眼病 | 单细胞测序、多色流式细胞术、共培养实验和western blotting | NA | 细胞 | TAO和对照组的眼眶结缔组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 876 | 2024-08-09 |
GABA promotes β-cell proliferation, but does not overcome impaired glucose homeostasis associated with diet-induced obesity
2019-03, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201801397R
PMID:30509117
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研究论文 | 本研究探讨了γ-氨基丁酸（GABA）对健康和糖耐量受损/肥胖小鼠β细胞的影响，发现GABA能增加β细胞数量，但对高脂饮食诱导的胰岛素抵抗和糖耐量受损无改善作用。 | 本研究首次揭示了GABA在单细胞水平上对β细胞增殖的影响，并发现GABA处理后β细胞中特定基因表达的变化。 | 研究未探讨GABA对β细胞功能长期影响的机制，且样本量较小。 | 探讨GABA对β细胞增殖及糖代谢的影响。 | 健康和糖耐量受损/肥胖小鼠的β细胞。 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本 | NA | NA | NA | NA |
| 877 | 2024-08-09 |
Mesenchymal Precursor Cells in Adult Nerves Contribute to Mammalian Tissue Repair and Regeneration
2019-02-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.024
PMID:30503141
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研究论文 | 本文提供了证据，表明受伤的外周神经提供了间充质前体细胞的储备，这些细胞可以直接参与小鼠指尖再生和皮肤修复 | 本文首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，识别出在正常和受伤的成年神经中转录上不同的间充质细胞群，包括具有间充质前体细胞特征的神经嵴来源的细胞 | NA | 研究外周神经在调节组织修复和再生中的作用 | 间充质前体细胞在成年神经中的作用及其对组织修复和再生的贡献 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 878 | 2024-08-09 |
High-throughput single-cell transcriptomics on organoids
2019-02, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2018.11.002
PMID:30504008
|
研究论文 | 本文探讨了在类器官系统中使用高通量单细胞转录组学技术进行高分辨率分析的方法 | 结合单细胞基因组学和类器官技术，为个性化医疗带来深远影响 | NA | 分析和操控人类发育，生成疾病特定模型 | 从人类干细胞培养的三维组织（类器官） | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | RNA | 涉及大脑、肠道、肝脏和肾脏等组织的类器官细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 879 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing in ovarian cancer: a new frontier in precision medicine
2019-02, Current opinion in obstetrics & gynecology
IF:2.2Q2
DOI:10.1097/GCO.0000000000000516
PMID:30507625
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序数据在指导卵巢癌治疗决策中的进展、应用和挑战 | 单细胞测序技术提供了表征卵巢癌肿瘤组织异质性的手段，并有机会确定影响临床结果的关键分子特性 | 大多数研究使用的是批量样本，导致数据代表所有细胞的平均值 | 提高对肿瘤细胞异质性的理解，以指导个性化癌症治疗 | 卵巢癌的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 880 | 2024-08-09 |
Autocrine regulation of mesenchymal progenitor cell fates orchestrates tooth eruption
2019-01-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1810200115
PMID:30509999
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研究论文 | 本文研究了牙囊中的间充质祖细胞在牙齿萌发过程中的自分泌调节机制 | 揭示了PTHrP-PPR自分泌信号如何维持牙囊中间充质祖细胞的生理细胞命运，以建立功能性牙周附着装置并协调牙齿萌发 | NA | 探讨牙囊中间充质祖细胞的身份及其如何受PTHrP-PPR信号调控 | 牙囊中的间充质祖细胞及其在牙齿萌发中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了tamoxifen-inducible小鼠进行细胞谱系分析 | NA | NA | NA | NA |