单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
761	2024-08-09	Single-cell RNA-seq of cultured human adipose-derived mesenchymal stem cells 2019-02-26, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/sdata.2019.31 PMID:30806636	研究论文	本研究对来自三名供体的24,358个培养的人类脂肪源间充质干细胞进行了大规模单细胞转录组测序	提供了高质量的数据集，有助于解析培养的ADSCs的种群内异质性以及在单细胞分辨率下探究任何感兴趣谱系的谱系启动模式	NA	探究脂肪源间充质干细胞的临床应用潜力	培养的人类脂肪源间充质干细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	24,358个培养的人类脂肪源间充质干细胞
762	2024-08-09	Integration of single-cell RNA-seq data into population models to characterize cancer metabolism 2019-02, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1006733 PMID:30818329	研究论文	本文提出了一种名为单细胞通量平衡分析（scFBA）的计算框架，用于将单细胞转录组数据转化为单细胞代谢通量数据，并通过肺癌和乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据进行验证	首次将单细胞RNA测序数据集成到群体模型中，以表征癌症细胞的代谢特性，揭示细胞间的代谢相互作用	目前的模型主要描述细胞群体的平均行为，掩盖了肿瘤发生和药物抗性中的固有异质性	旨在通过计算模型弥合代谢数据与生物功能之间的差距，并揭示细胞群体中的代谢异质性	肺癌和乳腺癌患者的单细胞转录组数据	数字病理学	肺癌, 乳腺癌	单细胞RNA测序	通量平衡分析（FBA）	转录组数据	肺癌和乳腺癌患者的细胞样本
763	2024-08-09	Single-Cell RNA Sequencing of Oligodendrocyte Lineage Cells from the Mouse Central Nervous System 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9072-6_1 PMID:30820890	研究论文	本文介绍了使用单细胞RNA测序技术研究小鼠中枢神经系统中少突胶质细胞谱系细胞异质性的方法	利用单细胞RNA测序技术揭示复杂组织中不同细胞状态/群体	NA	探索小鼠中枢神经系统中少突胶质细胞谱系细胞的异质性	小鼠中枢神经系统中的少突胶质细胞谱系细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	NA
764	2024-08-09	SuperCT: a supervised-learning framework for enhanced characterization of single-cell transcriptomic profiles 2019-05-07, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkz116 PMID:30799483	研究论文	本文提出了一种基于监督学习的单细胞转录组特征增强分析框架SuperCT	该框架通过训练可扩展的监督分类器，实现了对单细胞表达谱输入后立即揭示单细胞身份的功能，相比传统方法具有更高的准确性、鲁棒性、兼容性和可扩展性	NA	提高单细胞转录组数据分析的效率和准确性	单细胞转录组数据	机器学习	NA	单细胞RNA测序	监督学习分类器	转录组数据	多个单细胞RNA测序数据集
765	2024-08-09	The role of astroglia in Alzheimer's disease: pathophysiology and clinical implications 2019-04, The Lancet. Neurology DOI:10.1016/S1474-4422(18)30490-3 PMID:30795987	研究论文	本文探讨了星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的病理生理作用及其临床意义	研究焦点从神经元转向胶质细胞和神经炎症，利用干细胞衍生的星形胶质细胞进行体内研究，探索人类疾病，并尝试开发星形胶质细胞生物标志物和靶向疗法	使用啮齿动物模型可能不足以完全模拟人类疾病，因为啮齿动物的星形胶质细胞在形态、功能和基因表达上与人类有显著差异	理解星形胶质细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用，并开发新的生物标志物和药物靶点	星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的功能和病理作用	NA	阿尔茨海默病	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	涉及人类和啮齿动物的星形胶质细胞
766	2024-08-09	hESC-Derived Thalamic Organoids Form Reciprocal Projections When Fused with Cortical Organoids 2019-03-07, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2018.12.015 PMID:30799279	研究论文	本文描述了一种从人胚胎干细胞（hESCs）分化出特定区域的丘脑类器官（hThOs）的方法，并通过融合丘脑和皮质类器官来研究它们之间的相互投射	首次探索了人类丘脑的三维（3D）类器官模型，并开发了一种3D系统来创建丘脑和皮质之间的相互投射	NA	研究人类丘脑的发育和脑内电路组织的建模及相关疾病	人胚胎干细胞分化的丘脑类器官和皮质类器官	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	类器官	NA
767	2024-08-09	Revolutionizing immunology with single-cell RNA sequencing 2019-03, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-019-0214-4 PMID:30796351	综述	本文介绍了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其在免疫学中的应用	scRNA-seq技术能够比传统方法更详细地识别细胞异质性	介绍了scRNA-seq技术的优缺点	探讨scRNA-seq在免疫学中的潜在应用和未来创新	免疫细胞的异质性	NA	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
768	2024-08-09	Dissecting Cell Lineages: From Microscope to Kaleidoscope 2019-02-21, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2019.01.054 PMID:30794779	研究论文	Gehart等人（2019）利用单细胞转录组学与动态双色荧光技术，实时解析成年哺乳动物细胞轨迹，特别是肠道内分泌细胞的分化过程	揭示了新的细胞谱系特征和细胞身份的转变，并在类器官实验中发现了通过该方法鉴定的转录调控因子的特定作用	NA	解析成年哺乳动物细胞轨迹，特别是肠道内分泌细胞的分化过程	成年哺乳动物的细胞谱系和肠道内分泌细胞的分化	单细胞转录组学	NA	单细胞转录组学，动态双色荧光	NA	转录组数据	NA
769	2024-08-09	[Identification and single-cell sequencing analysis of rare tumor cells in malignant pleural effusion of lung cancer patients] 2019-Feb-20, Yi chuan = Hereditas DOI:10.16288/j.yczz.18-182 PMID:30803947	研究论文	本研究通过单细胞测序方法分析肺癌患者恶性胸腔积液中的转移性肿瘤细胞	首次采用单细胞测序技术研究肺癌患者恶性胸腔积液中的转移性肿瘤细胞，并分析其拷贝数变异模式	NA	探讨肿瘤异质性及转移机制	肺癌患者恶性胸腔积液中的转移性肿瘤细胞	数字病理学	肺癌	单细胞测序	NA	细胞	具体样本数量未提及
770	2024-08-09	Expression Cloning of Antibodies from Single Human B Cells 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9151-8_5 PMID:30779032	研究论文	本文描述了一种从单个人类B细胞中克隆抗体的策略	该方法允许在单细胞水平上无偏差地表征人类抗体谱，通过从单个原代人类B细胞生成重组单克隆抗体	NA	研究B细胞受体在淋巴瘤发展或生存中的作用	人类B细胞的抗体反应性	NA	淋巴瘤	RT-PCR	NA	Ig转录本	单个人类B细胞
771	2024-08-09	Studying Cancer Heterogeneity by Single-Cell RNA Sequencing 2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-9151-8_14 PMID:30779041	研究论文	本文介绍了一种名为mcSCRB-seq的高灵敏度和强大的基于平板单细胞RNA测序方法，用于研究癌症细胞的转录组数据	mcSCRB-seq方法具有高灵敏度、简便的工作流程、低单细胞成本且无需特殊设备	该方法在临床样本中的应用仍然具有挑战性	通过单细胞RNA测序技术研究癌症异质性	癌症细胞的基因表达变异	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	未具体说明样本数量
772	2024-08-09	Tissue Repair in the Mouse Liver Following Acute Carbon Tetrachloride Depends on Injury-Induced Wnt/β-Catenin Signaling 2019-06, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1002/hep.30563 PMID:30762896	研究论文	研究了在小鼠肝脏中，急性四氯化碳损伤后组织修复依赖于损伤诱导的Wnt/β-Catenin信号通路	发现内皮细胞是急性四氯化碳毒性后Wnt的主要来源，并且Wnt/β-Catenin信号通路在恢复组织完整性中起重要作用	NA	探讨Wnt/β-Catenin信号通路在急性肝脏毒性后组织修复中的作用	小鼠肝脏在急性四氯化碳损伤后的Wnt基因表达和信号传导	NA	NA	原位杂交、单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
773	2024-08-09	Microdiversity and temporal dynamics of marine bacterial dimethylsulfoniopropionate genes 2019-05, Environmental microbiology IF:4.3Q2 DOI:10.1111/1462-2920.14560 PMID:30761723	研究论文	研究评估了在蒙特利湾为期三周的时间内，海洋细菌中与气候相关的二甲基硫代丙酸酯（DMSP）基因的多样性和丰度，以及这些基因与浮游植物群落组成的关系	首次展示了特定细菌DMSP降解群组与浮游植物种类之间的相关性	NA	研究海洋细菌中DMSP基因的多样性和时间动态，以及这些基因与浮游植物群落的关系	海洋细菌中的DMSP基因及其与浮游植物群落的关系	NA	NA	元基因组装和单细胞测序	NA	基因序列	为期三周的时间跨度，2014年9月至10月在蒙特利湾
774	2024-08-09	Multimodal Single-Cell Analysis Reveals Physiological Maturation in the Developing Human Neocortex 2019-04-03, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2019.01.027 PMID:30770253	研究论文	本文通过结合单细胞RNA测序和神经递质受体激动剂引起的细胞内Ca2+升高测量，揭示了发育中的人类新皮层中细胞类型的生理异质性	首次将生理反应特性与分子细胞身份相结合，揭示了单细胞转录组学未能捕捉到的多样性	NA	研究发育中的人类新皮层中细胞类型的生理成熟过程	人类新皮层中的前体细胞和新生神经元	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个单细胞样本
775	2024-08-09	Emerging approaches and technologies in transplantation: the potential game changers 2019-04, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/s41423-019-0207-3 PMID:30760918	综述	本文综述了三种新兴技术在器官移植领域的应用，旨在解决终身免疫抑制和扩大供体池的关键挑战	介绍了单细胞RNA测序技术、纳米技术和CRISPR/Cas9基因编辑技术在移植医学中的创新应用	NA	探讨新兴技术如何改变传统器官移植方法，以解决移植医学中的关键挑战	器官移植中的免疫抑制和供体池扩展问题	NA	NA	单细胞RNA测序技术、纳米技术、CRISPR/Cas9基因编辑技术	NA	单细胞RNA测序数据	NA
776	2024-08-09	The transcription factor Duxbl mediates elimination of pre-T cells that fail β-selection 2019-03-04, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20181444 PMID:30765463	研究论文	本文研究了转录因子Duxbl在T细胞发育中对未通过β选择的前T细胞的消除作用	首次识别出Duxbl在β选择前高重组活性阶段的特异性表达，并揭示了Duxbl通过诱导凋亡来调控β选择	NA	探讨T细胞发育中β选择失败的细胞命运及其调控机制	前T细胞和转录因子Duxbl	NA	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	Duxbl转基因小鼠
777	2024-08-09	Defining Macrophages in the Heart One Cell at a Time 2019-03, Trends in immunology IF:13.1Q1 DOI:10.1016/j.it.2019.01.010 PMID:30745266	研究论文	本研究通过结合遗传命运图谱和单细胞转录组学技术，揭示了健康心脏和心肌梗死后心脏中不同巨噬细胞群体的扩展和分化情况	本研究首次通过单细胞转录组学技术详细分析了心脏巨噬细胞在健康和心肌梗死后的功能和变化	NA	探讨心脏巨噬细胞在心肌梗死后的损伤和修复中的双重作用	心脏巨噬细胞	NA	心血管疾病	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
778	2024-08-09	Single-Cell Analysis of Diverse Pathogen Responses Defines a Molecular Roadmap for Generating Antigen-Specific Immunity 2019-02-27, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2019.01.001 PMID:30772378	研究论文	本文通过使用荧光病原体结合大规模单细胞RNA测序技术，全面分析了多种病原体感染后48小时内先天免疫反应的特征	发现罕见抗原阳性细胞在免疫接种后24小时即显示出病原体特异性的转录程序，并揭示了NK细胞驱动的IFNγ反应在病原体激活中的作用	NA	揭示先天免疫细胞类型和途径，以指导强健的适应性免疫反应，并可能促进安全有效疫苗的进一步开发	多种病原体感染后的先天免疫反应	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	多种病原体感染的淋巴结细胞
779	2024-08-09	Resolving Cell Fate Decisions during Somatic Cell Reprogramming by Single-Cell RNA-Seq 2019-02-21, Molecular cell IF:14.5Q1 DOI:10.1016/j.molcel.2019.01.042 PMID:30772174	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了体细胞重编程过程中细胞命运的连续性	开发了SOT方法分析细胞命运连续性，并揭示了细胞在重编程过程中分为重编程潜力（RP）和非重编程（NR）两类的新模型	NA	揭示体细胞重编程过程中细胞命运决策的普遍分叉模型	体细胞重编程过程中的细胞命运连续性	生物技术	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	超过150,000个单细胞
780	2024-08-09	Human Fetal TNF-α-Cytokine-Producing CD4+ Effector Memory T Cells Promote Intestinal Development and Mediate Inflammation Early in Life 2019-02-19, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2018.12.010 PMID:30770246	研究论文	本文研究了人类胎儿肠道中肿瘤坏死因子-α（TNF-α）CD4CD69 T效应记忆（Tem）细胞的作用，发现这些细胞在胎儿肠道发育中起到促进作用，但在早产儿中可能导致炎症。	发现了人类胎儿肠道中一种独特的TNF-α产生CD4 T细胞群体，这些细胞在胎儿肠道黏膜发育中起到促进作用，但也可能在早产儿中引发炎症。	NA	探讨人类胎儿肠道中TNF-α产生CD4 T细胞在肠道发育和早期生命中的炎症作用。	人类胎儿肠道中的TNF-α产生CD4 T细胞及其在肠道发育和炎症中的作用。	免疫学	肠道炎症	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA