单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 741 - 760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 741 | 2024-08-09 |
Endothelial miR-30c suppresses tumor growth via inhibition of TGF-β-induced Serpine1
2019-03-11, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI123106
PMID:30855280
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研究论文 | 研究报告了在Cdh5-CreERT2 Tgfbr2fl/fl小鼠（Tgfbr2iECKO小鼠）中，通过后生删除Tgfbr2抑制血管内皮细胞（EC）中的TGF-β信号传导，从而抑制纤维蛋白介导的血管生成和肿瘤生长 | 通过使用血管趋向性纳米颗粒传递miR-30c antagomiRs绕过TGF-β信号传导，促进PAI-1依赖的肿瘤生长和增加纤维蛋白丰度，而miR-30c模拟物则抑制肿瘤生长并促进血管定向的纤维蛋白溶解 | NA | 研究miR-30c在肿瘤微环境中通过平衡EC中的Serpine1表达作为肿瘤抑制因子的功能 | 血管内皮细胞（EC）和肿瘤生长 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，NanoString miRNA阵列 | NA | RNA | Cdh5-CreERT2 Tgfbr2fl/fl小鼠（Tgfbr2iECKO小鼠）的ECs，肺和乳腺肿瘤模型的ECs |
| 742 | 2024-08-09 |
Generation and persistence of human tissue-resident memory T cells in lung transplantation
2019-03-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aav5581
PMID:30850393
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研究论文 | 研究了人类肺组织中记忆T细胞的生成、维持及其功能 | 首次在人类肺移植受者中追踪和定位供体和受体T细胞，并揭示了T细胞在肺移植中的持久性和功能 | NA | 探讨人类肺组织中记忆T细胞的生成、维持及其功能 | 人类肺组织中的记忆T细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 从人类白细胞抗原（HLA）不相容的肺移植受者中获取的气道样本 |
| 743 | 2024-08-09 |
Evaluation of Wu et al.: Strengthening Single-Cell Bioinformatic Comparisons for Improving Organoid Differentiation
2019-03-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.02.010
PMID:30849359
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评论 | 本文是对Wu等人的论文《基于单细胞转录组学的人类PSC来源的肾脏类器官分化比较分析与改进》的同行评审过程的示例 | NA | NA | 展示对Wu等人论文的同行评审过程 | Wu等人的论文《基于单细胞转录组学的人类PSC来源的肾脏类器官分化比较分析与改进》 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 744 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Cellular Heterogeneity of Pluripotency Transition and X Chromosome Dynamics during Early Mouse Development
2019-03-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.02.031
PMID:30840884
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠早期胚胎发育过程中EPI细胞的多能性转变和X染色体动态变化 | 首次揭示了EPI细胞在多能性转变过程中的三种细胞状态，并详细描述了X染色体在雌性胚胎中的重新激活和随机失活过程 | NA | 探究小鼠早期胚胎发育过程中EPI细胞的多能性转变和X染色体动态变化的分子机制 | 小鼠早期胚胎发育过程中的EPI细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 1,724个细胞 |
| 745 | 2024-08-09 |
The Space-Time Continuum of Cortical Dysplasia
2019-01, Epilepsy currents
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/1535759718822039
PMID:30838928
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研究论文 | 本文探讨了mTOR通路基因突变在皮质发育不良中的作用 | 通过深度测序和单细胞测序技术，揭示了mTOR激活在皮质发育不良中的具体作用机制 | NA | 研究mTOR通路基因突变在皮质发育不良中的病理机制 | 皮质发育不良（FCD）和半巨脑症（HME）患者的大脑组织 | 神经科学 | 神经发育异常 | 深度测序，单细胞测序 | NA | 基因序列数据 | 66例FCD/HME患者的大脑组织 |
| 746 | 2024-08-09 |
20 Years of Secretagogin: Exocytosis and Beyond
2019, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2019.00029
PMID:30853888
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综述 | 本文综述了钙结合蛋白Secretagogin在过去20年的研究进展及其在细胞信号传导中的作用 | 利用现代蛋白质组学技术，发现了大量Secretagogin的实际和潜在相互作用蛋白，揭示了其在神经细胞发育和成熟中的复杂作用 | NA | 回顾Secretagogin的最新发现，揭示其在细胞信号传导中的重要作用 | 钙结合蛋白Secretagogin及其相互作用蛋白 | NA | NA | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | NA |
| 747 | 2024-08-09 |
Corrigendum: A Single-Cell Sequencing Guide for Immunologists
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.00278
PMID:30863399
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 748 | 2024-08-09 |
Therapeutic resistance and susceptibility is shaped by cooperative multi-compartment tumor adaptation
2019-Nov, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-019-0310-0
PMID:30824837
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研究论文 | 本文通过连续活检、下一代测序和单细胞转录组学技术，追踪了黑色素瘤自发性模型中多个细胞区室在一线治疗反应、复发和二线治疗干预期间的演变，揭示了治疗诱导的肿瘤复发中多个区室的变化及其对后续治疗效果的影响。 | 本文首次展示了治疗复发肿瘤在遗传稳定的情况下，通过肿瘤细胞分化状态、免疫浸润和细胞外基质（ECM）成分的显著变化，形成共享的抗性表型。 | 研究主要集中在黑色素瘤的自发性模型中，可能需要进一步的临床验证来证实这些发现。 | 探索肿瘤治疗抵抗和敏感性形成的机制，特别是在多区室肿瘤适应性方面。 | 研究对象包括肿瘤细胞、免疫细胞和细胞外基质等肿瘤微环境中的多个区室。 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 下一代测序、单细胞转录组学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 研究涉及多个肿瘤样本和细胞系 |
| 749 | 2024-08-09 |
SinNLRR: a robust subspace clustering method for cell type detection by non-negative and low-rank representation
2019-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz139
PMID:30821315
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研究论文 | 本文提出了一种名为SinNLRR的新型单细胞RNA测序（scRNA-seq）细胞类型检测方法，基于相似性学习的非负和低秩表示的鲁棒子空间聚类方法 | 该方法通过在相似矩阵上施加非负和低秩结构，并采用交替方向乘子法解决优化问题，提出了一种自适应惩罚选择方法以避免对参数的敏感性 | NA | 开发新的scRNA-seq聚类方法以解决细胞异质性和多样性的问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型检测 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 不同数据集 |
| 750 | 2024-08-09 |
Destin: toolkit for single-cell analysis of chromatin accessibility
2019-10-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz141
PMID:30821321
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研究论文 | 本文介绍了Destin工具包，用于单细胞染色质可及性数据的生物信息学和统计分析 | Destin通过加权主成分分析进行细胞类型聚类，并利用现有基因组注释和公开的调控组数据进行加权，优于现有方法 | NA | 开发和评估一种新的生物信息学和统计框架，用于单细胞染色质可及性数据的全面分析 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | 加权主成分分析 | 单细胞数据 | 2088个成年小鼠前脑细胞 |
| 751 | 2024-08-09 |
Compartmentalized distributions of neuronal and glial cell-surface proteins pattern the synaptic network
2019-08, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2019.01.025
PMID:30826628
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research paper | 本文总结了近期研究发现，表明来自神经元和胶质的细胞表面蛋白相互作用并协作，控制特定突触的连接性、结构和功能 | 本文强调了胶质细胞表面蛋白在塑造突触连接中的重要作用，这是以往研究中较少关注的 | NA | 探讨神经元和胶质细胞表面蛋白如何共同影响突触网络的模式 | 神经元和胶质细胞的细胞表面蛋白及其在突触连接中的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 752 | 2024-08-09 |
Cell lineage inference from SNP and scRNA-Seq data
2019-06-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz146
PMID:30820578
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研究论文 | 本文开发了一种方法，从scRNA-Seq数据中检测显著的、细胞类型特异性的序列突变，并展示了这些突变与表达数据结合可以提高重建模型的准确性 | 本文提出了一种新的方法，通过检测scRNA-Seq数据中的序列突变来重建细胞谱系，这种方法结合了表达数据，提高了模型的准确性 | 目前的方法存在局限性，如伪时间排序方法和使用CRISPR插入随机突变的方法都有其不足之处 | 开发一种新的方法来从scRNA-Seq数据中推断细胞谱系 | 研究对象包括scRNA-Seq数据和序列突变 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq | NA | RNA-Seq数据 | NA |
| 753 | 2024-08-09 |
Conserved pathway activation following xenogeneic, heterotypic fusion
2019-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201801700R
PMID:30807240
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研究论文 | 本文研究了人类间充质干细胞与小鼠心肌细胞异种融合后的转录组变化，探讨了融合过程中是否涉及保守通路的激活 | 首次记录了在融合伙伴中潜伏的少数基因在杂交种中的表达，如人类生长激素1、小鼠核糖体蛋白S27和小鼠ATP合酶H转运线粒体Fo复合体亚基C2 | NA | 探索异种融合后细胞转录组的保守通路激活 | 人类间充质干细胞与小鼠心肌细胞的异种融合细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类和小鼠的多种细胞类型 |
| 754 | 2024-08-09 |
Role of alternative polyadenylation dynamics in acute myeloid leukaemia at single-cell resolution
2019-06, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2019.1586139
PMID:30810468
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序数据分析了急性髓系白血病（AML）中不同细胞类型的选择性多聚腺苷酸化（APA）动态变化 | 首次在单细胞分辨率下探讨了AML中不同细胞类型的APA动态变化，揭示了APA在白血病发展和红细胞生成中的广泛调控作用 | NA | 探讨急性髓系白血病中不同细胞类型的选择性多聚腺苷酸化动态变化 | 急性髓系白血病患者和健康个体的骨髓单个核细胞（BMMCs） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 16,843个骨髓单个核细胞（BMMCs） |
| 755 | 2024-08-09 |
Evolution of neuronal types and families
2019-06, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2019.01.022
PMID:30826503
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综述 | 本文综述了近年来在神经元和神经系统进化方面的概念进展，特别是通过比较单细胞转录组学来定义细胞类型，并探讨了如何利用单细胞数据识别和大规模比较神经元类型及其家族 | 利用比较单细胞转录组学方法，为解决神经元进化的关键问题提供了新的研究途径 | NA | 探讨神经元和神经系统的进化问题，包括神经元起源、神经元表型的趋同进化以及从简单神经网到复杂中央神经系统的转变 | 神经元类型及其家族，特别是脊椎动物前脑不同部位的GABA能神经元家族 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 756 | 2024-08-09 |
A general computational approach to predicting synergistic transcriptional cores that determine cell subpopulation identities
2019-04-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz147
PMID:30820550
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研究论文 | 本文开发了一种新的计算方法，用于确定细胞群体中亚群的协同转录核心，这些核心决定了亚群的身份 | 该方法使用信息论度量来量化转录协同作用，并实现了一种新的算法来搜索最优协同核心，不依赖于任何候选基因或基因调控网络的先验知识 | NA | 开发一种计算方法来识别定义细胞亚群身份的转录因子协同组合 | 细胞亚群的转录因子协同组合 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 八组已发表的单细胞RNA测序数据 |
| 757 | 2024-08-09 |
Rate of Progression through a Continuum of Transit-Amplifying Progenitor Cell States Regulates Blood Cell Production
2019-04-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.01.026
PMID:30827895
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，揭示了在红细胞生成过程中，过渡放大前体细胞状态的连续性及其与细胞增殖潜能的相关性 | 首次展示了过渡放大前体细胞在红细胞生成过程中的转录组状态连续性，并揭示了糖皮质激素通过减缓这一连续性的进展来增强红细胞生成的机制 | NA | 探究红细胞生成过程中过渡放大前体细胞状态的连续性及其调控机制 | 红细胞生成过程中的过渡放大前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 758 | 2024-08-09 |
COX-2 mediates tumor-stromal prolactin signaling to initiate tumorigenesis
2019-03-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1819303116
PMID:30819896
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了正位小鼠前列腺癌模型中肿瘤微环境内的肿瘤-基质通讯，发现COX-2介导的催乳素信号传导在肿瘤发生中的作用 | 首次揭示了COX-2通过诱导肺基质细胞分泌催乳素，进而影响肿瘤细胞的微转移过程 | NA | 探究肿瘤微环境中的肿瘤-基质通讯对肿瘤发生和转移的影响 | 小鼠前列腺癌模型中的肿瘤细胞和肺基质细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个小鼠和人类癌症样本 |
| 759 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals AML Hierarchies Relevant to Disease Progression and Immunity
2019-03-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.01.031
PMID:30827681
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和基因分型技术，分析了40个骨髓抽吸样本中的38,410个细胞，揭示了急性髓系白血病（AML）的细胞类型层次结构及其与疾病进展和免疫反应的关系 | 首次大规模应用单细胞RNA测序技术于AML研究，揭示了AML细胞类型的多样性和其在疾病进展中的作用 | 研究样本仅包括16名AML患者和5名健康捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 探索AML的细胞类型层次结构及其与疾病进展和免疫反应的关系 | 急性髓系白血病（AML）患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习分类器 | RNA序列 | 38,410个细胞，来自40个骨髓抽吸样本，包括16名AML患者和5名健康捐赠者 |
| 760 | 2024-08-09 |
Quiescence Modulates Stem Cell Maintenance and Regenerative Capacity in the Aging Brain
2019-03-07, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.01.040
PMID:30827680
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研究论文 | 本文报道了衰老小鼠大脑中神经干细胞（NSCs）数量显著下降，并发现这种减少的干细胞库通过增加静止状态来保护，使得老年NSCs对再生受伤大脑更具抵抗力。 | 研究首次揭示了静止状态是老年NSCs的关键特征，并发现了通过中和微环境中的炎症信号和Wnt拮抗剂sFRP5来激活NSCs的方法。 | NA | 理解年龄相关疾病中分子基础的下降，并寻找对抗方法。 | 衰老大脑中的神经干细胞（NSCs）及其再生能力。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |