单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2024-08-09 |
RNA-seq in Skeletal Biology
2019-08, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-019-00517-x
PMID:31093870
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综述 | 本文综述了最先进的转录组分析方法及其在骨骼生物学领域的最新应用 | 介绍了单细胞RNA测序等先进技术在识别骨骼组织中新细胞类型的应用 | NA | 综述转录组分析方法在骨骼生物学中的应用 | 骨骼生物学中的基因和转录因子 | NA | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小动物模型、大动物模型、人类组织和细胞 |
| 602 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct dynamic behavior of sex chromosomes during early human embryogenesis
2019-07, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.23162
PMID:31094050
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了1607个来自99个人类早期胚胎的单细胞，揭示了性染色体在人类早期胚胎发育中的动态行为 | 首次系统地比较了男性与女性胚胎在胚胎基因组激活后的性染色体表达差异，揭示了性染色体在早期胚胎发育中的动态表达和沉默过程 | 研究样本量有限，且仅使用了现有的单细胞RNA测序数据 | 探讨性染色体在人类早期胚胎发育中的分子机制及其对胚胎发育的影响 | 人类早期胚胎的性染色体表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1607个单细胞来自99个人类早期胚胎 |
| 603 | 2024-08-09 |
Tubular cell and keratinocyte single-cell transcriptomics applied to lupus nephritis reveal type I IFN and fibrosis relevant pathways
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0386-1
PMID:31110316
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本，揭示了I型干扰素和纤维化相关通路 | 首次应用单细胞RNA测序技术于狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本，揭示了I型干扰素反应和纤维化相关通路 | NA | 研究狼疮性肾炎的分子和细胞过程，以及其异质性 | 狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 604 | 2024-08-09 |
Regulation of Feeding-Related Behaviors by Arcuate Neuropeptide Y Neurons
2019-06-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/en.2019-00056
PMID:31089694
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综述 | 本文综述了下丘脑弓状核中的神经肽Y（NPY）神经元在调节与进食相关行为中的作用 | 结合遗传小鼠模型和化学遗传学及光遗传学技术，揭示了NPY神经元在能量消耗、产热、身体活动、食物寻求行为及焦虑控制中的额外功能 | NA | 探讨NPY神经元在个体生存回路中潜在的交互途径中的整合作用 | 下丘脑弓状核中的NPY神经元及其在行为控制中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 605 | 2024-08-09 |
Novel insights into cell cycle regulation of cell fate determination
2019-Jun, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B1900197
PMID:31090272
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综述 | 本文综述了细胞周期调控在细胞命运决定中的最新进展 | 利用高分辨率表观基因组分析、单细胞转录组学和细胞周期报告系统提供了新的见解 | NA | 探讨细胞周期调控在细胞命运决定中的作用及其在转化医学中的潜在应用 | 干细胞/祖细胞的自我更新和多谱系分化能力 | NA | NA | 高分辨率表观基因组分析、单细胞转录组学 | NA | 表观基因组数据、转录组数据 | NA |
| 606 | 2024-08-09 |
Oncogenes and Clotting Factors: The Emerging Role of Tumor Cell Genome and Epigenome in Cancer-Associated Thrombosis
2019-Jun, Seminars in thrombosis and hemostasis
IF:3.6Q1
DOI:10.1055/s-0039-1687891
PMID:31096313
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研究论文 | 探讨肿瘤细胞基因组和表观基因组在癌症相关血栓形成中的新兴作用 | 提出癌症可能作为促凝复合体运作，其中单个细胞及其主导群体表达不同的促凝表型，对止血系统产生净影响 | NA | 研究癌症进展的生物学和遗传学方面与癌症相关血栓形成机制之间的联系 | 胶质母细胞瘤的多形性，以及肿瘤细胞基因组和表观基因组在癌症相关血栓形成中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 胶质母细胞瘤样本 |
| 607 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiles and Clinically Useful Properties of Human Mesenchymal Stem Cells of Adipose and Bone Marrow Origin
2019-06, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/0363546519848678
PMID:31100005
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研究论文 | 本文探讨了脂肪和骨髓来源的人间充质干细胞在单细胞和批量细胞水平上的特征和差异，并研究了这两种细胞在治疗骨关节炎中的临床结果，为更精确的临床应用提供指导。 | 本文通过单细胞RNA测序分析和临床试验的元分析，揭示了脂肪来源干细胞在转录组异质性、能量产生依赖性和免疫抑制能力方面的优势。 | NA | 探索脂肪和骨髓来源的人间充质干细胞的特征和差异，并研究其在治疗骨关节炎中的临床效果。 | 脂肪来源干细胞（ADSCs）和骨髓间充质干细胞（BMSCs）。 | 细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自同一供体的ADSCs和BMSCs |
| 608 | 2024-08-09 |
MARS-seq2.0: an experimental and analytical pipeline for indexed sorting combined with single-cell RNA sequencing
2019-06, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0164-4
PMID:31101904
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研究论文 | 本文介绍了MARS-seq2.0，一种结合索引排序和单细胞RNA测序的实验和分析流程 | MARS-seq2.0在成本、重复性和减少污染方面进行了改进，结合了亚微升反应体积、酶混合物的优化和增强的分析流程 | NA | 开发一种高效的集成流程，用于索引排序和大规模并行单细胞RNA测序，以识别不同组织和疾病中的独特细胞类型 | 人类组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过100万个细胞 |
| 609 | 2024-08-09 |
Low ambient humidity impairs barrier function and innate resistance against influenza infection
2019-05-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1902840116
PMID:31085641
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研究论文 | 研究低湿度环境对小鼠流感感染屏障功能和先天抵抗力的影响 | 首次揭示了低湿度环境通过影响黏膜纤毛清除、先天抗病毒防御和组织修复，增强小鼠对流感病毒的易感性 | 研究仅限于特定基因型的小鼠模型，可能不适用于所有人群 | 探究低湿度环境对宿主流感病毒感染防御和疾病结果的影响 | Mx1同源小鼠在低湿度环境下的流感病毒感染反应 | NA | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Mx1同源小鼠 |
| 610 | 2024-08-09 |
Comments on the model parameters in "SiFit: inferring tumor trees from single-cell sequencing data under finite-sites models"
2019-05-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1692-5
PMID:31096998
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 611 | 2024-08-09 |
Hydro-Seq enables contamination-free high-throughput single-cell RNA-sequencing for circulating tumor cells
2019-05-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10122-2
PMID:31092822
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Hydro-Seq的高通量单细胞RNA测序技术，用于循环肿瘤细胞的无污染分析 | Hydro-Seq技术具有高细胞捕获效率和污染去除能力，能够成功对666个来自21名乳腺癌患者的循环肿瘤细胞进行高通量单细胞RNA测序 | NA | 开发一种新的技术以提高循环肿瘤细胞的单细胞RNA测序效率和减少血液细胞污染 | 循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 666个循环肿瘤细胞，来自21名乳腺癌患者 |
| 612 | 2024-08-09 |
High-Throughput Single-Cell Transcriptome Profiling of Plant Cell Types
2019-05-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.054
PMID:31091459
|
research paper | 本文利用高吞吐量的Drop-seq方法对拟南芥根部的超过12,000个细胞进行单细胞转录组分析 | 首次广泛应用单细胞转录组测序技术于植物细胞类型分析，揭示了不同细胞类型及其标记基因，并展示了环境条件对植物发育过程的影响 | NA | 展示单细胞RNA测序技术在植物发育过程分析中的应用及其对外部刺激的响应 | 拟南芥根部的细胞类型及其在不同环境条件下的变化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过12,000个细胞 |
| 613 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Sequencing Identifies Activation of TP53 and STAT1 Pathways in Human T Lymphocyte Subpopulations in Response to Ex Vivo Radiation Exposure
2019-May-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms20092316
PMID:31083348
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，分析了人类淋巴细胞亚群在体外辐射暴露后3小时的基因表达变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了不同T淋巴细胞亚群在伽马射线暴露后的基因表达差异 | 研究仅限于体外实验，且样本量相对较小 | 探讨空间辐射暴露对人类细胞DNA损伤及损伤反应的机制 | 人类T淋巴细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约700个辐射暴露细胞和700个非辐射对照细胞 |
| 614 | 2024-08-09 |
Distinct modes of cell competition shape mammalian tissue morphogenesis
2019-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1199-y
PMID:31092920
|
research paper | 本文通过活体成像、谱系追踪、单细胞转录组学和遗传学方法，揭示了在小鼠皮肤发育过程中，两种细胞竞争机制如何依次塑造和维持分层组织的结构。 | 首次在小鼠皮肤发育中识别出两种细胞竞争机制，并展示了这些机制如何动态调整以适应组织结构复杂性的增加。 | NA | 探究细胞竞争在哺乳动物组织形态发生中的作用及其进化普遍性。 | 小鼠皮肤发育过程中的细胞竞争机制。 | 生物学 | NA | 活体成像、谱系追踪、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 615 | 2024-08-09 |
Multiplexed single-cell RNA-seq via transient barcoding for simultaneous expression profiling of various drug perturbations
2019-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aav2249
PMID:31106268
|
研究论文 | 本文开发了一种通过短暂转染短条形码寡核苷酸的通用样本条形码方法，用于同时分析多个样本的单细胞RNA测序 | 提出了一种新的单细胞RNA测序方法，通过短暂转染条形码寡核苷酸，实现了对多个样本的同时分析 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序方法，以同时分析多个样本 | 单细胞RNA测序技术在多个样本中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 48个药物处理样本 |
| 616 | 2024-08-09 |
Alternative polyadenylation of single cells delineates cell types and serves as a prognostic marker in early stage breast cancer
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0217196
PMID:31100099
|
研究论文 | 本研究探讨了单个癌细胞和肿瘤微环境细胞中的选择性多聚腺苷酸化（APA）现象，并分析了其在不同细胞类型中的生理意义及其作为早期乳腺癌预后标志物的潜力 | 首次在单细胞水平上研究了APA模式，并发现其在不同细胞类型中的差异表达，特别是在乳腺癌中的免疫特异性APA特征 | 研究样本量相对较小，仅包括11名乳腺癌患者和3名胶质母细胞瘤及1名肾细胞癌患者 | 理解APA在不同细胞类型中的生理意义，并探索其作为早期乳腺癌预后标志物的可能性 | 单个癌细胞和肿瘤微环境细胞中的APA现象 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 515个单细胞样本来自11名乳腺癌患者，以及来自3名胶质母细胞瘤和1名肾细胞癌患者的scRNA-seq数据 |
| 617 | 2024-08-09 |
The barcode, UMI, set format and BUStools
2019-11-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz279
PMID:31073610
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研究论文 | 介绍了一种名为Barcode-UMI-Set（BUS）的格式，用于表示单细胞RNA-seq实验读数的伪对齐 | 提出了一种新的BUS格式，适用于所有单细胞RNA-seq技术，并展示了BUS文件的高效生成能力 | NA | 开发一种模块化、技术特定且健壮的单细胞RNA-seq分析工作流程 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 618 | 2024-08-09 |
What has single-cell RNA-seq taught us about mammalian spermatogenesis?
2019-09-01, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioz088
PMID:31077285
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在哺乳动物精子发生研究中的应用及其揭示的分子机制 | 单细胞RNA测序技术揭示了精子发生过程中先前未被发现的细胞类型间的分子异质性 | NA | 探讨单细胞RNA测序数据在精子发生研究中的当前价值和未来应用潜力 | 哺乳动物的精子发生过程及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 619 | 2024-08-09 |
Single-Cell Virus Sequencing of Influenza Infections That Trigger Innate Immunity
2019-07-15, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/JVI.00500-19
PMID:31068418
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研究论文 | 本文开发了一种新方法，通过确定单个感染流感病毒细胞中的转录组和全长病毒基因序列，评估病毒群体中的遗传变异如何影响病毒基因表达和先天免疫激活的异质性 | 首次使用长读长PacBio测序技术来确定感染单个细胞的病毒序列，提供了病毒突变如何影响单个细胞感染过程的完整图景 | 病毒遗传变异只能部分解释细胞间病毒基因表达和先天免疫诱导的变异性 | 研究流感病毒感染细胞中病毒基因表达和先天免疫激活的异质性 | 感染流感病毒的单个细胞 | NA | 流感 | PacBio测序 | NA | 序列数据 | 多个感染流感病毒的单个细胞 |
| 620 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis of the Liver Epithelium Reveals Dynamic Heterogeneity and an Essential Role for YAP in Homeostasis and Regeneration
2019-07-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.04.004
PMID:31080134
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肝脏上皮细胞在稳态和损伤后的异质性，并揭示了YAP在肝脏稳态和再生中的关键作用 | 发现了在稳态和损伤后，胆道上皮细胞存在显著的异质性，这种异质性反映了YAP依赖的程序的波动激活 | NA | 探索肝脏上皮细胞在稳态和损伤后的异质性及其分子机制 | 肝脏上皮细胞，特别是肝细胞和胆道上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |