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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-09 |
MetaCell: analysis of single-cell RNA-seq data using K-nn graph partitions
2019-10-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1812-2
PMID:31604482
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研究论文 | 本文介绍了一种基于K-nn图划分的方法，用于将单细胞RNA测序数据集分割成互不相交且同质的元细胞组 | 与传统的聚类分析不同，该算法专注于获取粒度更细而非最大化的组 | NA | 旨在从生物学变异中分离出采样效应，以进行稳健的单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | K-nn图划分算法 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-09 |
A systematic evaluation of single cell RNA-seq analysis pipelines
2019-10-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12266-7
PMID:31604912
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研究论文 | 本文通过模拟实验评估了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析流程中的多种方法 | 首次系统评估了多种scRNA-seq分析流程，并探讨了不同步骤间的相互作用 | NA | 评估不同scRNA-seq分析流程的性能，并确定影响分析结果的关键因素 | scRNA-seq分析流程中的映射、插补、归一化和差异表达测试方法 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列 | 基于五种scRNA-seq文库协议和九种差异表达设置进行了约3000个流程的评估 | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-09 |
Organoid single-cell genomic atlas uncovers human-specific features of brain development
2019-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1654-9
PMID:31619793
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和可及染色质分析研究了干细胞衍生的脑类器官，揭示了人类大脑发育的特定基因调控变化。 | 首次分析了人类、黑猩猩和猕猴脑类器官的细胞组成和分化轨迹，发现了人类神经发育的独特基因表达和染色质可及性变化。 | NA | 探究人类大脑发育的基因调控变化及其与黑猩猩和猕猴的差异。 | 人类、黑猩猩和猕猴的脑类器官。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、可及染色质分析、单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个个体的人类、黑猩猩和猕猴脑类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-09 |
Tensor Decomposition-Based Unsupervised Feature Extraction Applied to Single-Cell Gene Expression Analysis
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00864
PMID:31608111
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研究论文 | 本研究采用基于张量分解的无监督特征提取方法，用于整合人和小鼠中脑发育的单细胞RNA测序表达谱 | 提出了一种基于张量分解的无监督特征提取方法，能够选择不仅在人和小鼠之间一致的基因，还包括生物学上可靠的基因 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的解释性，通过无监督特征提取方法提高基因选择的准确性和生物学可靠性 | 人和小鼠中脑发育的单细胞RNA测序表达谱 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 张量分解 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-09 |
SCDevDB: A Database for Insights Into Single-Cell Gene Expression Profiles During Human Developmental Processes
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00903
PMID:31611909
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研究论文 | 本文开发了一个名为SCDevDB的数据库，用于研究人类发育过程中单细胞基因表达谱 | SCDevDB数据库不仅提供搜索和可视化功能，还考虑了收集的细胞群的生物学关系，并构建了24种不同的发育途径 | NA | 开发一个数据库，以深入研究人类发育过程中单细胞基因表达谱 | 人类发育过程中的单细胞基因表达谱 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 收集了10个人类单细胞RNA测序数据集，分为176个发育细胞群 | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-09 |
Complement in Human Pre-implantation Embryos: Attack and Defense
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.02234
PMID:31620138
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研究论文 | 本文首次全面分析了人类胚胎植入前阶段补体分子的表达和沉积情况 | 揭示了补体激活在人类胚胎植入前阶段的发生，并展示了胚胎细胞自身表达和激活C3和C5的能力 | NA | 探讨补体系统在人类胚胎植入前阶段的免疫调节作用及其对妊娠结果的影响 | 人类胚胎植入前阶段的补体分子 | NA | 妊娠并发症 | 共聚焦显微镜，单细胞RNA测序 | NA | 图像，RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Relationship between Phenotypes and Genotypes of Klinefelter Syndrome
2019, Cytogenetic and genome research
IF:1.7Q3
DOI:10.1159/000503737
PMID:31630146
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了克氏综合征（KS）患者与正常男性和女性对照组在外周血单个核细胞（PBMCs）中的基因表达差异 | 首次在单细胞水平上揭示了克氏综合征患者PBMCs中细胞类型的分子特征及其与临床表型的关联 | 研究样本仅限于一名中国男性克氏综合征患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨克氏综合征的基因型与表型之间的关系 | 克氏综合征患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了24,439个细胞，分为5种免疫细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of Mesp1-induced skeletal myogenic development
2019-12-03, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2019.09.140
PMID:31590918
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和其他策略分析了Mesp1诱导的骨骼肌发育过程 | 揭示了Mesp1+衍生物在多能性和中胚层到间充质和骨骼肌发育过程中的异质性 | NA | 探究头和躯干/四肢肌肉发育过程的差异 | Mesp1+骨骼肌衍生物 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了多西环素诱导的Mesp1表达的胚胎干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-09 |
Using single-cell transcriptomics to understand functional states and interactions in microbial eukaryotes
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0098
PMID:31587645
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研究论文 | 本文讨论了如何通过单细胞转录组学分析来揭示原生生物的生物学特性 | 利用单细胞转录组学技术深入研究微生物真核生物的功能状态和相互作用 | NA | 探讨单细胞转录组学在理解微生物真核生物生物学特性中的应用 | 微生物真核生物的功能状态、生理状态及与其他生物的相互作用 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-09 |
Uncovering microbial inter-domain interactions in complex communities
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0087
PMID:31587646
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research paper | 本文讨论了epicPCR技术在揭示复杂微生物群落中真核生物和细菌间相互作用的应用 | epicPCR技术能够以单细胞分辨率恢复给定环境中完整的相互作用网络 | 文章指出epicPCR在操作的微观尺度、高吞吐量和探索性质方面存在挑战和局限 | 揭示微生物群落中的跨域相互作用 | 真核生物和细菌的相互作用 | NA | NA | epicPCR | NA | DNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-09 |
Combined cultivation and single-cell approaches to the phylogenomics of nucleariid amoebae, close relatives of fungi
2019-11-25, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2019.0094
PMID:31587649
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研究论文 | 本文通过传统培养和单细胞基因组（SCG）及单细胞转录组扩增方法，研究了核衣壳阿米巴（Opisthokonta）的系统发育基因组学 | 采用SCG扩增技术识别了可能属于Chlamydiales和Rickettsiales的细菌内共生体，并基于264个保守蛋白质和74个单拷贝蛋白质域的数据集进行了系统发育基因组学分析 | 核衣壳阿米巴的多样性和进化历史仍了解不足 | 旨在克服核衣壳阿米巴多样性和进化历史了解不足的限制 | 核衣壳阿米巴的基因组和转录组数据 | 系统发育学 | NA | 单细胞基因组（SCG）和单细胞转录组扩增方法 | NA | 基因组和转录组数据 | 三个物种的基因组和转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-09 |
Absence of HIF1A Leads to Glycogen Accumulation and an Inflammatory Response That Enables Pancreatic Tumor Growth
2019-11-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-18-2994
PMID:31585939
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研究论文 | 研究HIF1A缺失对胰腺肿瘤生长的影响及其机制 | 发现HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞通过积累糖原和分泌炎症细胞因子，启动替代的细胞因子和树突状细胞驱动的血管生成途径 | 研究仅在异种移植小鼠模型中进行，可能需要进一步的人体研究验证 | 探讨HIF1A在胰腺肿瘤血管生成中的作用及其替代途径 | HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞及其在肿瘤生长中的作用 | NA | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及HIF1A缺失的胰腺肿瘤细胞和小鼠肿瘤基质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Uniparental Embryos Reveals Parent-of-Origin Effects on Human Preimplantation Development
2019-Nov-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2019.09.004
PMID:31588047
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，系统地研究了人类双亲和单亲胚胎从1细胞到桑椹胚阶段的转录组特征，揭示了父母基因组对早期胚胎发育的影响 | 首次系统地分析了单亲胚胎的单细胞转录组，并发现了父母特异性表达基因及其在胚胎发育中的作用 | NA | 探究父母基因组对人类早期胚胎发育的贡献 | 人类双亲和单亲胚胎的单细胞转录组 | 基因组学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多个双亲和单亲胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-09 |
DC3 is a method for deconvolution and coupled clustering from bulk and single-cell genomics data
2019-10-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12547-1
PMID:31601804
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research paper | 本文介绍了一种名为DC3的方法，用于从批量和单细胞基因组数据中进行解卷积和耦合聚类 | DC3方法能够同时识别不同的亚群，将单细胞分配到这些亚群（即聚类），并将批量数据解卷积为亚群特异性数据 | NA | 解决基因组学中在细胞水平上表征和解释异质混合物的重要问题 | 批量和单细胞基因组数据，如HiChIP、RNA-seq和ATAC-seq | genomics | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, scHi-C, HiChIP | NA | bulk and single-cell genomics data | NA | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-09 |
Cell Type Purification by Single-Cell Transcriptome-Trained Sorting
2019-10-03, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.08.006
PMID:31585086
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研究论文 | 本文提出了一种名为GateID的计算方法，通过结合单细胞转录组学和FACS指数排序，利用细胞的天然属性如细胞大小、粒度和线粒体含量来纯化选择的细胞类型。 | GateID方法无需事先了解细胞类型标记，可以直接利用细胞的天然属性进行细胞类型的纯化。 | NA | 开发一种无需抗体或转基因构建的新方法来纯化细胞类型。 | 细胞类型的纯化方法 | 分子与细胞生物学 | NA | FACS | NA | 转录组 | 多种细胞类型从斑马鱼肾骨髓和人类胰腺中提取 | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-09 |
Contribution of adipogenesis to healthy adipose tissue expansion in obesity
2019-10-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI129191
PMID:31573549
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研究论文 | 本文探讨了脂肪生成在肥胖中健康脂肪组织扩张的作用 | 强调了通过脂肪生成招募新脂肪细胞对健康脂肪组织分布和重塑的重要性，并讨论了单细胞RNA测序分析在识别脂肪组织中组织驻留前体细胞群体方面的最新进展 | NA | 探讨脂肪生成在肥胖中健康脂肪组织扩张的作用，并可能为肥胖与代谢疾病脱钩提供新策略 | 白色脂肪组织（WAT）的扩张和重塑机制 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals a Developmental Hierarchy in Langerhans Cell Histiocytosis
2019-Oct, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-19-0820
PMID:31575563
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的细胞层次结构 | 研究揭示了跨不同临床范围患者中14种细胞亚群的一致组成，表明这些细胞亚群受关键转录调控因子的共同发育层次驱动 | NA | 探索朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的细胞发育层次 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症中的细胞亚群 | 数字病理学 | 朗格汉斯细胞组织细胞增生症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 多个患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-09 |
X-chromosome upregulation is driven by increased burst frequency
2019-10, Nature structural & molecular biology
IF:12.5Q1
DOI:10.1038/s41594-019-0306-y
PMID:31582851
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析了小鼠体细胞和胚胎细胞中X染色体上调的转录动力学，证实了X染色体通过提高爆发频率实现上调的现象。 | 首次详细解析了X染色体上调的机制，特别是通过提高爆发频率来实现这一过程。 | NA | 探究X染色体上调的机制，特别是转录动力学方面的细节。 | 小鼠体细胞和胚胎细胞中的X染色体基因表达。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠体细胞和胚胎细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals regulatory mechanism for trophoblast cell-fate divergence in human peri-implantation conceptuses
2019-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3000187
PMID:31596842
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研究论文 | 本研究通过体外共培养系统模拟人类胚胎植入前发育，分析了476个滋养层细胞的转录组，揭示了调控滋养层细胞发育的遗传网络 | 首次揭示了T-box转录因子3（TBX3）在调控细胞滋养层（CT）向合体滋养层（ST）分化中的关键作用 | NA | 研究人类胚胎植入前发育过程中滋养层细胞发育和分化的调控机制 | 人类胚胎植入前发育过程中的滋养层细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 476个滋养层细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-09 |
[Progress in single-cell analysis of hematopoiesis]
2019, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology
DOI:10.11406/rinketsu.60.1075
PMID:31597830
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research paper | 本文探讨了单细胞分析技术在血液生成机制研究中的进展 | 利用下一代测序技术进行单细胞转录组和表观基因组分析以及基于细胞条形码的谱系追踪，揭示了细胞群体的广泛异质性，并提出了新的连续模型 | NA | 深入理解正常和异常血液生成机制，并开发新的血液疾病治疗方法 | 血液生成过程中的细胞类型和分化阶段 | NA | NA | 下一代测序技术 | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |