单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-09 |
Bayesian Inference of Allelic Inclusion Rates in the Human T Cell Receptor Repertoire
2019-11-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.09.006
PMID:31677971
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研究论文 | 本文开发并实验验证了一种完全贝叶斯推理模型，用于可靠地估计α和β TCR等位基因包含率 | 提出了一个完全贝叶斯推理模型来估计α和β TCR等位基因包含率，并提供了超过51,000个先前未发表的等位基因包含TCR序列集的数据库 | 单细胞测序技术的局限性阻碍了对这些双受体T细胞的全面计数 | 研究人类T细胞受体库中的等位基因包含率 | αβ T细胞的等位基因包含现象 | NA | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯推理模型 | 序列数据 | 超过51,000个TCR序列集，来自8名健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-09 |
Self-renewing endometrial epithelial organoids of the human uterus
2019-11-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1915389116
PMID:31666317
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研究论文 | 本研究使用已建立的器官培养协议，从人类子宫内膜活检中生成并全面分析了三维子宫内膜上皮器官（EEO）培养物 | 本研究首次详细描述了人类子宫内膜上皮器官的生成及其在激素处理下的基因表达变化 | NA | 研究子宫内膜在妊娠早期的作用及其生理和病理机制 | 人类子宫内膜上皮器官（EEO）及其在激素处理下的反应 | NA | 不孕症 | 实时定量PCR，批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自2个不同供体的子宫内膜样本 | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-09 |
Modular transcriptional programs separately define axon and dendrite connectivity
2019-11-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50822
PMID:31687928
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研究论文 | 本文研究了T4/T5神经元的转录调控程序，揭示了不同树突和轴突连接模式的转录程序 | 本文首次揭示了模块化转录程序在定义神经元连接模式中的独立控制作用 | NA | 探索神经元连接模式的转录调控机制 | T4/T5神经元的树突和轴突连接模式 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种T4/T5神经元亚型 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-09 |
DoubletDecon: Deconvoluting Doublets from Single-Cell RNA-Sequencing Data
2019-11-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.082
PMID:31693907
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DoubletDecon的方法，用于从单细胞RNA测序数据中去除双细胞捕获的技术伪影 | DoubletDecon结合了去卷积分析和独特细胞状态基因表达的识别，能够高灵敏度地识别不同类型的双细胞，并避免将有效的混合谱系和过渡细胞状态误判为双细胞 | NA | 开发一种方法来检测和去除单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同细胞复杂度的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics reveals changes in expression during hair-cell development
2019-11-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50777
PMID:31682227
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研究论文 | 本文利用单细胞纳米级 shotgun 质谱技术研究了鸡胚胎第15天椭圆囊中分化中的毛细胞的蛋白质表达动态变化 | 首次使用单细胞质谱技术揭示了毛细胞分化过程中蛋白质表达的变化，并与单细胞转录组数据相结合，提供了细胞发育特征的新见解 | NA | 探索内耳中感觉毛细胞分化过程中的蛋白质表达动态变化 | 鸡胚胎第15天椭圆囊中的毛细胞及其前体细胞 | 蛋白质组学 | NA | 单细胞 shotgun 质谱技术 | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling Reveals Sex, Lineage, and Regional Diversity in the Mouse Kidney
2019-11-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.10.005
PMID:31689386
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研究论文 | 本研究通过解剖引导的单细胞RNA测序结合原位表达研究和细胞系追踪，揭示了成年雄性和雌性小鼠肾脏的细胞多样性、显著的性别差异以及肾单位的组织和细胞组成 | 研究首次综合了单细胞RNA测序、原位表达研究和细胞系追踪，揭示了小鼠肾脏中的细胞多样性和性别差异，并创建了一个可搜索的数据库Kidney Cell Explorer | NA | 增强对哺乳动物肾脏的理解，特别是在细胞多样性和性别差异方面 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏 | 数字病理学 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-09 |
Stress-Induced Metabolic Disorder in Peripheral CD4+ T Cells Leads to Anxiety-like Behavior
2019-10-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.001
PMID:31675497
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研究论文 | 本研究探讨了外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的病理作用及其调控机制 | 首次揭示了CD4 T细胞中由应激诱导的白三烯B4触发线粒体裂变，进而导致焦虑、抑郁和社会行为异常的机制 | NA | 阐明外周CD4+ T细胞在情绪障碍中的病理作用及调控机制 | 外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的作用 | NA | 焦虑症 | 代谢组学分析，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics in complex tissues using microprobe capillary electrophoresis mass spectrometry
2019, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2019.07.001
PMID:31668233
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS）的单细胞蛋白质组学分析方法，能够在不分离或解剖整个细胞的情况下，直接对嵌入复杂组织中的单个细胞进行蛋白质组学分析 | 该技术利用微尺度样品收集和处理、分离及离子化技术的最新进展，将高分辨率质谱技术扩展到单细胞水平，揭示了胚胎细胞和神经元之间先前未知的蛋白质组学差异 | NA | 旨在扩展我们对单个细胞产生的蛋白质差异（异质性）及其对正常和受损发育贡献的理解 | 研究对象包括非洲爪蟾和斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元 | 蛋白质组学 | NA | 微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS） | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及非洲爪蟾、斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元 | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-09 |
Recent advances in understanding neocortical development
2019, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.20332.1
PMID:31681469
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综述 | 本文综述了最近在理解新皮质发育方面的突出进展，特别关注背侧前体细胞和兴奋性神经元 | 强调了神经干细胞在不同类别中的分化及其增殖和神经元产生的过程，以及最近关于神经元迁移的发现 | NA | 总结新皮质发育的最新进展，并探讨其进化和疾病机制 | 新皮质发育，特别是背侧前体细胞和兴奋性神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Mouse Heart Immune Infiltrate in Pressure Overload-Driven Heart Failure Reveals Extent of Immune Activation
2019-12-17, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠压力超负荷诱导的心力衰竭模型中心脏免疫浸润的组成和免疫激活情况 | 揭示了在心力衰竭中，除了已知的巨噬细胞和T淋巴细胞外，中性粒细胞、B细胞、自然杀伤细胞和肥大细胞等多种免疫细胞类型也参与了免疫激活 | NA | 探究压力超负荷诱导的心力衰竭中的心脏免疫反应 | 小鼠心脏中的免疫细胞亚群及其在心力衰竭中的变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-09 |
Isolation of Cardiomyocytes Undergoing Mitosis With Complete Cytokinesis
2019-12-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.314908
PMID:31648614
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研究论文 | 本研究开发了一种新技术，通过使用分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞 | 本研究提出了一种新的方法，通过分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离具有真正有丝分裂潜力的心肌细胞，这是对基于DNA含量的现有方法的替代 | NA | 深入理解心肌细胞分裂的机制，特别是那些完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞 | 从人诱导多能干细胞衍生的真正增殖的心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 荧光激活细胞分选（FACS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-09 |
Inhibiting repressive epigenetic modification promotes telomere rejuvenation in somatic cell reprogramming
2019-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901486RR
PMID:31645134
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研究论文 | 研究通过小分子筛选和实验验证，发现褪黑素能促进体细胞核转移（SCNT）重编程过程中的端粒恢复，提高克隆动物的生产效率 | 首次研究了褪黑素处理与SCNT介导重编程中端粒恢复的关系，并发现褪黑素能抑制与基因沉默相关的异染色质表观遗传修饰 | NA | 提高体细胞核转移重编程的效率，促进克隆动物的生产 | 体细胞核转移重编程过程中的端粒恢复和表观遗传修饰 | NA | NA | 单细胞RNA测序，定量FISH实验 | NA | RNA | SCNT衍生胚胎 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-09 |
Single-cell study of neural stem cells derived from human iPSCs reveals distinct progenitor populations with neurogenic and gliogenic potential
2019-Dec, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.12731
PMID:31651061
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来源于人诱导多能干细胞（iPSCs）和胎脑的神经干细胞（NSCs），揭示了神经发生和胶质发生前体细胞的异质性 | 发现了来源于iPS细胞的NSC与胎脑来源的NSC在神经发生前体细胞的异质性及自发分化潜能上的差异 | NA | 研究神经干细胞阶段细胞类型的内在异质性 | 来源于人诱导多能干细胞和胎脑的神经干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个来源于人诱导多能干细胞的神经干细胞系和一个来源于胎脑的神经干细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-09 |
A single-cell view of tissue regeneration in plants
2019-12, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2019.09.003
PMID:31655397
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综述 | 本文综述了利用先进的分子遗传学和计算技术在植物组织再生中对单个细胞的研究进展 | 通过单细胞RNA测序（ScRNA-seq）和实时成像技术，定义了再生组织中的形态发生和细胞变化，并利用迭代计算和实验方法阐明了候选机制 | NA | 探讨植物组织再生的细胞机制 | 植物组织再生中的细胞死亡、分裂、去分化和转分化过程 | 分子遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-09 |
Tumour-associated macrophage-derived interleukin-1 mediates glioblastoma-associated cerebral oedema
2019-12-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awz331
PMID:31665239
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞衍生的白细胞介素-1在胶质母细胞瘤相关脑水肿中的作用，并探讨了地塞米松对此过程的影响。 | 首次证明了地塞米松能阻断骨髓来源和脑内巨噬细胞中的白细胞介素-1产生，并抑制其下游效应，同时揭示了白细胞介素-1信号通路在胶质母细胞瘤相关脑水肿治疗中的潜在价值。 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床应用的实际效果和副作用需要进一步验证。 | 探讨胶质母细胞瘤相关脑水肿的机制及潜在治疗策略。 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关巨噬细胞、脑水肿、地塞米松治疗效果。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | 涉及骨髓来源和脑内巨噬细胞的细胞培养及小鼠模型实验。 | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-09 |
Non-templated addition and template switching by Moloney murine leukemia virus (MMLV)-based reverse transcriptases co-occur and compete with each other
2019-11-29, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.010676
PMID:31640989
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研究论文 | 本研究详细分析了基于Moloney鼠白血病病毒（MMLV）的逆转录酶在模板切换过程中的偏倚，特别是RNA模板5'端序列和性质（加帽与非加帽）对这些偏倚的影响 | 研究发现非模板添加和模板切换是同时且相互竞争的过程，这与当前对模板切换过程的理解相反 | NA | 探讨单细胞RNA测序中模板切换机制的细节及其影响因素 | Moloney鼠白血病病毒（MMLV）型逆转录酶的模板切换特性和非模板添加的组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-09 |
Dynamics of trophoblast differentiation in peri-implantation-stage human embryos
2019-11-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1911362116
PMID:31636193
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析培养的人类囊胚细胞，定义了在绒毛膜形成前的第8天至第12天植入期周围胎盘滋养层细胞的转录组图谱 | 首次详细描述了人类胚胎植入期间滋养层细胞的动态分化过程，并揭示了不同类型滋养层细胞的转录组特征 | NA | 研究人类胚胎植入期间滋养层细胞的分化动态及其转录组特征 | 人类胚胎植入期间的滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从培养的胚胎中手动挑选的3种早期胎盘细胞类型（细胞滋养层细胞、合体滋养层细胞和迁移性滋养层细胞） | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-09 |
Immunology Driven by Large-Scale Single-Cell Sequencing
2019-11, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2019.09.004
PMID:31645299
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研究论文 | 本文讨论了利用大规模单细胞多组学数据和改进的计算方法来解析免疫细胞身份的必要性 | 提出了结合大规模单细胞多组学数据和先进计算方法来深入研究免疫细胞的多样性和可塑性 | NA | 探讨如何利用大规模单细胞多组学数据和计算方法来解析免疫细胞身份 | 免疫细胞的多样性和可塑性 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 大规模 | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-09 |
Single-pollen-cell sequencing for gamete-based phased diploid genome assembly in plants
2019-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.251033.119
PMID:31649061
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研究论文 | 本文介绍了一种结合花粉原生质体分离和单细胞DNA扩增技术的新方法，用于植物配子阶段的双倍体基因组组装 | 本文首次成功利用单花粉细胞测序技术，实现了梨基因组的高效准确分相，揭示了梨参考基因组中8.12%的基因存在镶嵌式组装 | 该方法目前仅在梨这一特定植物物种中得到验证，其普遍适用性有待进一步研究 | 开发一种新的方法，用于植物配子阶段的双倍体基因组组装，并分析基因表达的等位效应 | 梨基因组及其在花粉中减数分裂期间的重组信息 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 12个花粉细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-09 |
A chemical probe of CARM1 alters epigenetic plasticity against breast cancer cell invasion
2019-10-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.47110
PMID:31657716
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研究论文 | 本文介绍了一种具有前药特性的CARM1化学探针，能够改变表观遗传可塑性，抑制乳腺癌细胞侵袭 | 发现了一种新的CARM1依赖机制，用于癌症转移，并开发了一种化学探针来靶向这一过程 | NA | 研究CARM1蛋白在乳腺癌细胞侵袭中的作用，并开发相应的化学探针 | CARM1蛋白及其在乳腺癌细胞侵袭中的作用 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |