单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 913 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-09 |
A Tppp3+Pdgfra+ tendon stem cell population contributes to regeneration and reveals a shared role for PDGF signalling in regeneration and fibrosis
2019-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-019-0417-z
PMID:31768046
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术，鉴定了一种表达微管聚合促进蛋白家族成员3（Tppp3）的细胞群作为潜在的肌腱干细胞，并探讨了血小板衍生生长因子（PDGF）信号在肌腱再生和纤维化中的共同作用。 | 首次发现Tppp3+Pdgfra+细胞群作为肌腱干细胞，并揭示了PDGF信号在肌腱再生和纤维化中的双重作用。 | 研究主要集中在实验室条件下，未来需要进一步的临床研究来验证这些发现。 | 探讨肌腱损伤后的再生机制及PDGF信号在其中的作用。 | 肌腱干细胞及其在肌腱再生和纤维化中的作用。 | 生物医学 | 肌腱损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-09 |
Stalled developmental programs at the root of pediatric brain tumors
2019-12, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-019-0531-7
PMID:31768071
|
研究论文 | 本文通过生成单细胞转录组图谱，研究了儿童脑肿瘤的起源和发展状态 | 首次生成了胚胎期脑桥和前脑的单细胞转录组图谱，并揭示了特定神经前体细胞分化障碍是这些儿童癌症的共同机制 | NA | 识别儿童脑肿瘤的脆弱发展状态 | 儿童脑肿瘤的起源和发展状态 | 数字病理学 | 儿童疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 超过65,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 303 | 2024-08-09 |
The art of using t-SNE for single-cell transcriptomics
2019-11-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13056-x
PMID:31780648
|
research paper | 本文描述了如何避免t-SNE在单细胞转录组数据分析中的常见缺陷，并开发了一种更忠实的t-SNE可视化协议 | 提出了包括PCA初始化、高学习率和多尺度相似性核的t-SNE改进协议，并在大规模数据集上使用夸张和基于下采样的初始化 | NA | 改进t-SNE在单细胞转录组数据可视化中的应用 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | t-SNE | t-SNE | RNA-seq数据 | 数千个基因和数百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 304 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals compartmental remodeling of tumor-infiltrating immune cells induced by anti-CD47 targeting in pancreatic cancer
2019-11-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-019-0822-6
PMID:31771616
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了抗CD47靶向治疗在胰腺癌中对肿瘤浸润免疫细胞隔室重塑的影响 | 首次展示了抗CD47治疗在胰腺癌中通过增加具有抗肿瘤功能的促炎性巨噬细胞和减少抗炎性巨噬细胞来重塑肿瘤内淋巴细胞和巨噬细胞隔室 | 研究结果在不同胰腺癌细胞系建立的肿瘤模型中显示出差异性反应，表明治疗效果可能受特定细胞系的影响 | 探讨靶向CD47的单克隆抗体是否能通过改变肿瘤微环境增强胰腺癌对免疫检查点抑制剂的反应 | 胰腺导管腺癌（PDAC）的肿瘤微环境及CD47靶向治疗对其影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 106例PDAC病例及多个小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 305 | 2024-08-09 |
Invariant patterns of clonal succession determine specific clinical features of myelodysplastic syndromes
2019-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13001-y
PMID:31772163
|
研究论文 | 本研究通过分析1809名骨髓增生异常综合症（MDS）患者的单细胞测序数据，推断克隆结构，并评估突变在克隆结构中的位置，以揭示MDS的临床特征 | 本研究识别了37种显著的突变组合，其中12种影响临床表型，5种与不良预后相关，并能预测对去甲基化治疗的反应 | NA | 探究骨髓增生异常综合症的克隆结构及其对临床特征的影响 | 骨髓增生异常综合症患者的克隆结构和突变组合 | NA | 骨髓增生异常综合症 | 单细胞测序 | PyClone生物分析管道 | 基因组数据 | 1809名MDS患者 | NA | NA | NA | NA |
| 306 | 2024-08-09 |
Heterogeneity of Oligodendrocytes and Their Precursor Cells
2019, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-32-9636-7_5
PMID:31760638
|
研究论文 | 本文探讨了少突胶质细胞及其前体细胞的异质性 | 通过单细胞RNA测序分析，识别出成熟的少突胶质细胞中的六个不同群体和OPCs中的一个群体，展示了这些细胞在发育和区域上的不均匀性 | NA | 研究少突胶质细胞及其前体细胞的多样性及其在中枢神经系统中的功能 | 少突胶质细胞及其前体细胞的异质性 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 307 | 2024-08-09 |
Gene Expression-Based Identification of Antigen-Responsive CD8+ T Cells on a Single-Cell Level
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.02568
PMID:31781096
|
研究论文 | 本文研究了如何在未筛选的单细胞基因表达数据中识别人类同源抗原反应性CD8 T细胞及其受体 | 开发了一种基于机器学习的分类器，能够从非选择性群体中敏感且特异地检测病毒反应性CD8 T细胞 | NA | 研究如何识别抗原反应性CD8 T细胞及其受体 | 人类同源抗原反应性CD8 T细胞及其受体 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序和qPCR | 机器学习 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 308 | 2024-08-09 |
The Tumor Suppressor Role of Zinc Finger Protein 671 (ZNF671) in Multiple Tumors Based on Cancer Single-Cell Sequencing
2019, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2019.01214
PMID:31781507
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据集（scRNA-seq）探讨了锌指蛋白671（ZNF671）在多种肿瘤中的肿瘤抑制作用 | 首次通过单细胞测序技术揭示了ZNF671在多种肿瘤中的肿瘤抑制功能，并探讨了其在异质性癌细胞群体中的作用 | 研究主要基于单细胞测序数据，可能需要进一步的实验验证 | 确定ZNF671在癌症单细胞中的功能状态及其在肿瘤中的作用 | 锌指蛋白671（ZNF671）及其在多种肿瘤中的功能 | 数字病理学 | 多种肿瘤 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞测序数据 | 涉及14种癌症相关的ZNF671单细胞测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 309 | 2024-08-09 |
TCR sequencing paired with massively parallel 3' RNA-seq reveals clonotypic T cell signatures
2019-12, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0544-5
PMID:31745340
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合TCR测序和大规模3' RNA-seq的方法，用于分析单细胞RNA测序样本中的TCR序列和相应转录组 | 该方法能够同时分析TCR序列和相应的全转录组，适用于常见的3' scRNA-seq方法，并可适应事后处理的样本 | NA | 研究与共享TCR的T细胞相关的转录组特征，特别是在食物过敏等疾病中，克隆型驱动的反应对理解基础生物学至关重要 | 免疫细胞，特别是T细胞及其抗原受体TCR | 数字病理学 | 食物过敏 | 3'单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | 免疫小鼠和食物过敏患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 310 | 2024-08-09 |
Murine single-cell RNA-seq reveals cell-identity- and tissue-specific trajectories of aging
2019-12, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.253880.119
PMID:31754020
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了年轻和老年小鼠三个组织中超过50,000个细胞，揭示了细胞身份和组织特异性衰老轨迹 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术，结合矩阵分解和最优传输方法，揭示了细胞身份和组织环境对衰老轨迹和幅度的影响 | NA | 探讨细胞身份和组织环境对哺乳动物细胞衰老轨迹的影响 | 小鼠的三个组织中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 超过50,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 311 | 2024-08-09 |
A divergent transcriptional landscape underpins the development and functional branching of MAIT cells
2019-11-22, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aay6039
PMID:31757835
|
研究论文 | 本研究通过批量和单细胞RNA测序技术，分析了小鼠和人类中伴随MAIT细胞发育各阶段转录景观的变化。 | 首次详细描述了MAIT细胞发育过程中的转录调控事件，并揭示了成熟MAIT细胞中的不同亚群。 | NA | 研究MAIT细胞发育过程中的转录调控机制。 | MAIT细胞的发育和功能分支。 | 免疫学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 312 | 2024-08-09 |
Development and validation of a metastasis-associated prognostic signature based on single-cell RNA-seq in clear cell renal cell carcinoma
2019-11-20, Aging
DOI:10.18632/aging.102434
PMID:31747386
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，开发并验证了一种基于透明细胞肾细胞癌的转移相关预后标志物 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出44个转移相关标记基因，并构建了一个包含17个关键转移相关基因的预后模型 | NA | 开发和验证一种新的预后标志物，用于预测透明细胞肾细胞癌患者的总生存期和无进展生存期 | 透明细胞肾细胞癌的单细胞表达谱和转移相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 121个细胞样本和626名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 313 | 2024-08-09 |
Non-Genetic Intra-Tumor Heterogeneity Is a Major Predictor of Phenotypic Heterogeneity and Ongoing Evolutionary Dynamics in Lung Tumors
2019-11-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.10.045
PMID:31747591
|
研究论文 | 本文分析了肺鳞状细胞癌中的基因和非基因性肿瘤内异质性（ITH），通过多区域批量和单细胞测序，探讨了其在基因组、转录组和肿瘤-免疫相互作用及组织病理学特征层面的影响。 | 研究发现非基因性异质性是影响肺肿瘤组织病理学特征异质性和进化动力学的主要因素。 | NA | 探讨基因和非基因性肿瘤内异质性对肿瘤表型和可演化性的影响。 | 肺鳞状细胞癌的肿瘤内异质性。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 多区域样本 | NA | NA | NA | NA |
| 314 | 2024-08-09 |
Neuronal maturation reduces the type I IFN response to orthobunyavirus infection and leads to increased apoptosis of human neurons
2019-Nov-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-019-1614-1
PMID:31739796
|
研究论文 | 研究使用人脑类器官（COs）探讨了不同发育阶段的神经元对拉科斯特病毒（LACV）感染的反应，发现神经元成熟度增加会提高对LACV诱导的细胞凋亡的敏感性 | 首次揭示了神经元成熟度与对LACV感染反应之间的关系，以及外源性重组干扰素在保护神经元免受病毒诱导的细胞死亡中的作用 | 研究主要集中在体外模型，未来需要进一步在体内模型中验证这些发现 | 探讨神经元对拉科斯特病毒感染的反应及其与神经元成熟度的关系 | 人脑类器官中的不同发育阶段神经元 | NA | 儿童虫媒脑炎 | 免疫组织化学、流式细胞术、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包含不同发育阶段神经元的人脑类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 315 | 2024-08-09 |
Assessment of computational methods for the analysis of single-cell ATAC-seq data
2019-11-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1854-5
PMID:31739806
|
研究论文 | 本文介绍了一个基准框架，用于评估10种计算方法在13个合成和真实数据集上的单细胞ATAC-seq数据分析能力 | 首次系统地评估了多种计算方法在单细胞ATAC-seq数据分析中的表现，并提供了最佳实践推荐 | 文章主要集中在计算方法的比较，未深入探讨生物学解释和实际应用场景 | 评估和比较不同的计算方法在单细胞ATAC-seq数据分析中的效果 | 10种计算方法和13个合成及真实数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 超过80,000个细胞的大数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 316 | 2024-08-09 |
Bulk and Single-Cell Next-Generation Sequencing: Individualizing Treatment for Colorectal Cancer
2019-Nov-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers11111809
PMID:31752125
|
综述 | 本文综述了下一代测序技术（NGS）在结直肠癌（CRC）个体化治疗中的最新进展和未来展望 | 通过多区域批量组织NGS和新兴的单细胞转录组学，结合循环游离DNA（cfDNA）的NGS，揭示了预测治疗反应和药物开发的新策略 | NA | 旨在通过集成测序系统探索基因组和转录组，以克服研究和临床挑战，推动精准肿瘤学的发展 | 结直肠癌（CRC） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组和转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-09 |
Contribution of Single-Cell Transcriptomics to the Characterization of Human Spermatogonial Stem Cells: Toward an Application in Male Fertility Regenerative Medicine?
2019-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms20225773
PMID:31744138
|
研究论文 | 本文讨论了利用单细胞转录组测序技术（scRNAseq）在人类精原干细胞（SSC）及其前体细胞定义方面的最新进展 | scRNAseq技术作为一种新的诊断工具，用于个性化调查男性不育症 | NA | 探讨单细胞转录组测序技术在人类精原干细胞及其前体细胞定义中的应用，以及其在男性生育再生医学中的潜在应用 | 人类精原干细胞（SSC）及其前体细胞 | 基因组学 | 男性不育症 | 单细胞转录组测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 318 | 2024-08-09 |
Sertoli cell-only phenotype and scRNA-seq define PRAMEF12 as a factor essential for spermatogenesis in mice
2019-11-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13193-3
PMID:31729367
|
研究论文 | 本文研究了PRAMEF12在维持小鼠精子发生中的关键作用，并通过单细胞转录组分析揭示了其对精原干细胞的影响。 | 首次揭示了PRAMEF12在精子发生中的重要作用，并通过单细胞转录组分析详细描述了其对精原干细胞状态的影响。 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证。 | 探讨PRAMEF12在精子发生中的作用及其对生殖医学的潜在影响。 | 小鼠的精子发生过程及PRAMEF12的作用。 | 生殖医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠的精子发生过程中的多个细胞状态 | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2024-08-09 |
A Bayesian mixture model for the analysis of allelic expression in single cells
2019-11-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13099-0
PMID:31729374
|
research paper | 本文提出了一种用于单细胞RNA-Seq数据中等位基因表达分析的贝叶斯混合模型方法 | 该方法通过跨细胞池化信息，提高了等位基因比例估计的准确性，并减少了采样变异性，同时不牺牲细胞间的异质性 | NA | 旨在改进单细胞水平上等位基因特异性表达的分析方法 | 单细胞RNA-Seq数据中的等位基因特异性表达 | 生物信息学 | NA | RNA-Seq | 贝叶斯混合模型 | RNA-Seq数据 | 多个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-09 |
B Cells and T Follicular Helper Cells Mediate Response to Checkpoint Inhibitors in High Mutation Burden Mouse Models of Breast Cancer
2019-11-14, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.028
PMID:31730857
|
研究论文 | 本研究通过使用三阴性乳腺癌小鼠模型，识别了免疫检查点抑制剂反应的介导机制 | 开发了新的乳腺肿瘤模型，并揭示了免疫检查点疗法通过激活T滤泡辅助细胞和B细胞来促进抗肿瘤反应 | NA | 识别免疫检查点抑制剂反应的介导机制 | 三阴性乳腺癌小鼠模型 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量mRNA测序 | NA | mRNA测序数据 | 免疫疗法治疗和未治疗的敏感及耐药小鼠模型的肿瘤样本 | NA | NA | NA | NA |