单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
281	2024-08-09	Chronic Stress Induces Activity, Synaptic, and Transcriptional Remodeling of the Lateral Habenula Associated with Deficits in Motivated Behaviors 2019-12-04, Neuron IF:14.7Q1 DOI:10.1016/j.neuron.2019.09.005 PMID:31672263	研究论文	本文研究了慢性压力（CS）对侧缰核（LHb）神经元的活动、突触和转录重塑，以及这些变化与动机行为缺陷的关联	首次揭示了CS诱导的LHb神经元超活动与被动应对（PC）增加的关联，并利用单细胞转录组学识别了一组可作为PC增加小鼠生物标志物的基因	NA	探讨慢性压力对侧缰核神经元的活动、突触和转录重塑及其与动机行为缺陷的关系	侧缰核（LHb）神经元及其与腹侧被盖区（VTA）和背缝核（DR）的神经连接	神经科学	抑郁症	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	小鼠
282	2024-08-09	Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a microfluidic phase-switch device 2019-Dec-02, The Analyst DOI:10.1039/c9an00823c PMID:31688860	research paper	本文介绍了一种新型微流控相变装置，用于提高单细胞转录组测序的效率，特别适用于细胞数量有限的珍贵样本。	设计了一种集成多个单细胞隔离室的微流控装置，实现了近100%的单细胞捕获率和极低的细胞损失，并采用了一种新的相变方法将单细胞封装到皮升大小的水凝胶液滴中。	NA	提高单细胞转录组测序的效率和可及性。	单细胞转录组测序，特别是细胞数量有限的珍贵样本。	digital pathology	NA	RNA-seq	NA	text	数十个hESCs（H9）
283	2024-08-09	Unravelling fibrosis using single-cell transcriptomics 2019-12, Current opinion in pharmacology IF:4.0Q1 DOI:10.1016/j.coph.2019.09.004 PMID:31670054	综述	本文综述了单细胞转录组学在揭示纤维化疾病发病机制中的应用	单细胞转录组学技术使得在纤维化背景下对个体致病细胞群体的研究达到了前所未有的分辨率	NA	探讨单细胞转录组学如何推动对纤维化疾病发病机制的理解	纤维化疾病及其治疗靶点的精确识别	单细胞转录组学	纤维化	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
284	2024-08-09	Preclinical development of T-cell receptor-engineered T-cell therapy targeting the 5T4 tumor antigen on renal cell carcinoma 2019-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-019-02419-4 PMID:31686124	研究论文	本研究开发了一种针对肾细胞癌中5T4肿瘤抗原的T细胞受体工程化T细胞疗法，并通过单细胞RNA测序和功能测试验证了其有效性	首次探索了5T4作为T细胞受体工程化T细胞疗法的目标，并成功开发了针对该抗原的T细胞疗法	NA	开发和验证针对5T4肿瘤抗原的T细胞受体工程化T细胞疗法	5T4肿瘤抗原特异性的T细胞克隆及其功能	免疫疗法	肾细胞癌	单细胞RNA测序	T细胞受体工程化T细胞	RNA	七对独特的TRA-TRB配对
285	2024-08-09	Single-cell sequencing and its applications in head and neck cancer 2019-12, Oral oncology IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.oraloncology.2019.104441 PMID:31689639	综述	本文综述了单细胞测序技术在头颈癌研究中的应用及其在基因组、转录组和表观基因组层面的技术和计算进展	单细胞测序技术为理解肿瘤生物学中的细微差异提供了新途径，通过识别不同的细胞亚群、解析肿瘤微环境中的信号传导以及描述细胞基因组突变和拷贝数异常	NA	探讨单细胞测序技术在头颈癌研究和临床实践中的应用	头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞亚群及其基因组、转录组和表观基因组特征	数字病理学	头颈癌	单细胞测序	NA	基因组、转录组、表观基因组数据	NA
286	2024-08-09	Bayesian Inference of Allelic Inclusion Rates in the Human T Cell Receptor Repertoire 2019-11-27, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2019.09.006 PMID:31677971	研究论文	本文开发并实验验证了一种完全贝叶斯推理模型，用于可靠地估计α和β TCR等位基因包含率	提出了一个完全贝叶斯推理模型来估计α和β TCR等位基因包含率，并提供了超过51,000个先前未发表的等位基因包含TCR序列集的数据库	单细胞测序技术的局限性阻碍了对这些双受体T细胞的全面计数	研究人类T细胞受体库中的等位基因包含率	αβ T细胞的等位基因包含现象	NA	NA	单细胞测序	贝叶斯推理模型	序列数据	超过51,000个TCR序列集，来自8名健康个体
287	2024-08-09	Self-renewing endometrial epithelial organoids of the human uterus 2019-11-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.1915389116 PMID:31666317	研究论文	本研究使用已建立的器官培养协议，从人类子宫内膜活检中生成并全面分析了三维子宫内膜上皮器官（EEO）培养物	本研究首次详细描述了人类子宫内膜上皮器官的生成及其在激素处理下的基因表达变化	NA	研究子宫内膜在妊娠早期的作用及其生理和病理机制	人类子宫内膜上皮器官（EEO）及其在激素处理下的反应	NA	不孕症	实时定量PCR，批量RNA测序，单细胞RNA测序	NA	RNA	来自2个不同供体的子宫内膜样本
288	2024-08-09	Modular transcriptional programs separately define axon and dendrite connectivity 2019-11-05, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.50822 PMID:31687928	研究论文	本文研究了T4/T5神经元的转录调控程序，揭示了不同树突和轴突连接模式的转录程序	本文首次揭示了模块化转录程序在定义神经元连接模式中的独立控制作用	NA	探索神经元连接模式的转录调控机制	T4/T5神经元的树突和轴突连接模式	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	八种T4/T5神经元亚型
289	2024-08-09	DoubletDecon: Deconvoluting Doublets from Single-Cell RNA-Sequencing Data 2019-11-05, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.082 PMID:31693907	研究论文	本文介绍了一种名为DoubletDecon的方法，用于从单细胞RNA测序数据中去除双细胞捕获的技术伪影	DoubletDecon结合了去卷积分析和独特细胞状态基因表达的识别，能够高灵敏度地识别不同类型的双细胞，并避免将有效的混合谱系和过渡细胞状态误判为双细胞	NA	开发一种方法来检测和去除单细胞RNA测序数据中的双细胞	单细胞RNA测序数据中的双细胞	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	不同细胞复杂度的单细胞RNA测序数据集
290	2024-08-09	Single-cell proteomics reveals changes in expression during hair-cell development 2019-11-04, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.50777 PMID:31682227	研究论文	本文利用单细胞纳米级 shotgun 质谱技术研究了鸡胚胎第15天椭圆囊中分化中的毛细胞的蛋白质表达动态变化	首次使用单细胞质谱技术揭示了毛细胞分化过程中蛋白质表达的变化，并与单细胞转录组数据相结合，提供了细胞发育特征的新见解	NA	探索内耳中感觉毛细胞分化过程中的蛋白质表达动态变化	鸡胚胎第15天椭圆囊中的毛细胞及其前体细胞	蛋白质组学	NA	单细胞 shotgun 质谱技术	NA	蛋白质组和转录组数据	多个单细胞样本
291	2024-08-09	Single-Cell Profiling Reveals Sex, Lineage, and Regional Diversity in the Mouse Kidney 2019-11-04, Developmental cell IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.devcel.2019.10.005 PMID:31689386	研究论文	本研究通过解剖引导的单细胞RNA测序结合原位表达研究和细胞系追踪，揭示了成年雄性和雌性小鼠肾脏的细胞多样性、显著的性别差异以及肾单位的组织和细胞组成	研究首次综合了单细胞RNA测序、原位表达研究和细胞系追踪，揭示了小鼠肾脏中的细胞多样性和性别差异，并创建了一个可搜索的数据库Kidney Cell Explorer	NA	增强对哺乳动物肾脏的理解，特别是在细胞多样性和性别差异方面	成年雄性和雌性小鼠的肾脏	数字病理学	慢性肾脏疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	成年雄性和雌性小鼠的肾脏样本
292	2024-08-09	Stress-Induced Metabolic Disorder in Peripheral CD4+ T Cells Leads to Anxiety-like Behavior 2019-10-31, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2019.10.001 PMID:31675497	研究论文	本研究探讨了外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的病理作用及其调控机制	首次揭示了CD4 T细胞中由应激诱导的白三烯B4触发线粒体裂变，进而导致焦虑、抑郁和社会行为异常的机制	NA	阐明外周CD4+ T细胞在情绪障碍中的病理作用及调控机制	外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的作用	NA	焦虑症	代谢组学分析，单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
293	2024-08-09	Single-cell proteomics in complex tissues using microprobe capillary electrophoresis mass spectrometry 2019, Methods in enzymology DOI:10.1016/bs.mie.2019.07.001 PMID:31668233	研究论文	本文介绍了一种基于微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS）的单细胞蛋白质组学分析方法，能够在不分离或解剖整个细胞的情况下，直接对嵌入复杂组织中的单个细胞进行蛋白质组学分析	该技术利用微尺度样品收集和处理、分离及离子化技术的最新进展，将高分辨率质谱技术扩展到单细胞水平，揭示了胚胎细胞和神经元之间先前未知的蛋白质组学差异	NA	旨在扩展我们对单个细胞产生的蛋白质差异（异质性）及其对正常和受损发育贡献的理解	研究对象包括非洲爪蟾和斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元	蛋白质组学	NA	微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS）	NA	蛋白质组学数据	涉及非洲爪蟾、斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元
294	2024-08-09	Recent advances in understanding neocortical development 2019, F1000Research DOI:10.12688/f1000research.20332.1 PMID:31681469	综述	本文综述了最近在理解新皮质发育方面的突出进展，特别关注背侧前体细胞和兴奋性神经元	强调了神经干细胞在不同类别中的分化及其增殖和神经元产生的过程，以及最近关于神经元迁移的发现	NA	总结新皮质发育的最新进展，并探讨其进化和疾病机制	新皮质发育，特别是背侧前体细胞和兴奋性神经元	NA	NA	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	NA
295	2024-08-09	Single-Cell Sequencing of Mouse Heart Immune Infiltrate in Pressure Overload-Driven Heart Failure Reveals Extent of Immune Activation 2019-12-17, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.119.041694 PMID:31661975	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠压力超负荷诱导的心力衰竭模型中心脏免疫浸润的组成和免疫激活情况	揭示了在心力衰竭中，除了已知的巨噬细胞和T淋巴细胞外，中性粒细胞、B细胞、自然杀伤细胞和肥大细胞等多种免疫细胞类型也参与了免疫激活	NA	探究压力超负荷诱导的心力衰竭中的心脏免疫反应	小鼠心脏中的免疫细胞亚群及其在心力衰竭中的变化	数字病理学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠和人类样本
296	2024-08-09	Isolation of Cardiomyocytes Undergoing Mitosis With Complete Cytokinesis 2019-12-06, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.314908 PMID:31648614	研究论文	本研究开发了一种新技术，通过使用分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞	本研究提出了一种新的方法，通过分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离具有真正有丝分裂潜力的心肌细胞，这是对基于DNA含量的现有方法的替代	NA	深入理解心肌细胞分裂的机制，特别是那些完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞	从人诱导多能干细胞衍生的真正增殖的心肌细胞	NA	心血管疾病	荧光激活细胞分选（FACS），单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	NA
297	2024-08-09	Inhibiting repressive epigenetic modification promotes telomere rejuvenation in somatic cell reprogramming 2019-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.201901486RR PMID:31645134	研究论文	研究通过小分子筛选和实验验证，发现褪黑素能促进体细胞核转移（SCNT）重编程过程中的端粒恢复，提高克隆动物的生产效率	首次研究了褪黑素处理与SCNT介导重编程中端粒恢复的关系，并发现褪黑素能抑制与基因沉默相关的异染色质表观遗传修饰	NA	提高体细胞核转移重编程的效率，促进克隆动物的生产	体细胞核转移重编程过程中的端粒恢复和表观遗传修饰	NA	NA	单细胞RNA测序，定量FISH实验	NA	RNA	SCNT衍生胚胎
298	2024-08-09	Single-cell study of neural stem cells derived from human iPSCs reveals distinct progenitor populations with neurogenic and gliogenic potential 2019-Dec, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms IF:1.3Q4 DOI:10.1111/gtc.12731 PMID:31651061	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来源于人诱导多能干细胞（iPSCs）和胎脑的神经干细胞（NSCs），揭示了神经发生和胶质发生前体细胞的异质性	发现了来源于iPS细胞的NSC与胎脑来源的NSC在神经发生前体细胞的异质性及自发分化潜能上的差异	NA	研究神经干细胞阶段细胞类型的内在异质性	来源于人诱导多能干细胞和胎脑的神经干细胞	干细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	多个来源于人诱导多能干细胞的神经干细胞系和一个来源于胎脑的神经干细胞系
299	2024-08-09	A single-cell view of tissue regeneration in plants 2019-12, Current opinion in plant biology IF:8.3Q1 DOI:10.1016/j.pbi.2019.09.003 PMID:31655397	综述	本文综述了利用先进的分子遗传学和计算技术在植物组织再生中对单个细胞的研究进展	通过单细胞RNA测序（ScRNA-seq）和实时成像技术，定义了再生组织中的形态发生和细胞变化，并利用迭代计算和实验方法阐明了候选机制	NA	探讨植物组织再生的细胞机制	植物组织再生中的细胞死亡、分裂、去分化和转分化过程	分子遗传学	NA	单细胞RNA测序（ScRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
300	2024-08-09	Ontogenic Changes in Hematopoietic Hierarchy Determine Pediatric Specificity and Disease Phenotype in Fusion Oncogene-Driven Myeloid Leukemia 2019-12, Cancer discovery IF:29.7Q1 DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1463 PMID:31662298	研究论文	本研究探讨了融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的年龄特异性及其对疾病表型的影响	首次揭示了融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的年龄依赖性作用，并发现关键转录因子的活性差异	NA	研究融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的作用及其与年龄的关系	融合致癌基因、儿童急性髓系白血病、关键转录因子	数字病理学	白血病	染色质可及性分析、单细胞转录组分析	NA	转录组数据	使用诱导性转基因小鼠模型进行分析