单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 913 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
A large pool of actively cycling progenitors orchestrates self-renewal and injury repair of an ectodermal appendage
2019-09, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-019-0378-2
PMID:31481792
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、小鼠遗传学和组织损伤方法，揭示了小鼠门齿维持和修复的细胞层次结构和机制 | 发现了一组活跃分裂的上皮祖细胞在稳态下产生牙釉质产生的成釉细胞和相邻的非成釉细胞层，并在损伤后通过祖细胞增殖和Notch1表达细胞直接转化为成釉细胞来实现组织修复 | NA | 解析干细胞身份和组织结构，以理解组织更新 | 小鼠门齿的维持和修复机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of Human Lung Provides Insights into the Pathobiology of Pulmonary Fibrosis
2019-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.201712-2410OC
PMID:30554520
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人肺组织，以揭示肺纤维化发病机制中的细胞群体变化 | 发现了在肺纤维化患者中特有的一类促纤维化肺泡巨噬细胞，并识别出在肺纤维化过程中出现的稀有细胞群体，如气道干细胞和衰老细胞 | 研究样本量相对较小，且仅限于肺移植捐赠者和接受者以及一例特发性肺纤维化患者的样本 | 探究单细胞RNA测序是否能揭示肺纤维化患者肺组织中肺泡巨噬细胞、上皮细胞等细胞类型的疾病相关异质性 | 肺纤维化患者的肺组织细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 8名肺移植捐赠者、8名肺纤维化接受者及1名特发性肺纤维化患者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
Adaptive Immune Resistance Emerges from Tumor-Initiating Stem Cells
2019-05-16, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.03.025
PMID:31031009
|
研究论文 | 本文通过设计一种皮肤癌模型，研究了肿瘤起始干细胞（tSCs）如何通过适应性免疫抵抗机制克服免疫监视 | 发现tSCs通过表达CD80并结合CTLA4直接抑制细胞毒性T细胞活性，从而抵抗免疫疗法 | NA | 探讨肿瘤起始干细胞如何克服免疫监视并形成肿瘤复发的机制 | 肿瘤起始干细胞（tSCs）及其在皮肤鳞状细胞癌（SCC）中的免疫抵抗机制 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Human Embryonic Stem Cell Differentiation Delineates Adverse Effects of Nicotine on Embryonic Development
2019-04-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2019.01.022
PMID:30827876
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了尼古丁对人类胚胎干细胞（hESC）衍生的胚胎体（EB）的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了尼古丁对hESC分化的直接影响，并提供了一种新的方法来评估药物和环境毒素对人类胚胎发育的影响 | NA | 探讨尼古丁对人类胚胎发育的不良影响及其相关机制 | 人类胚胎干细胞（hESC）及其衍生的胚胎体（EB） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2024-08-07 |
Macrophages in wound healing: activation and plasticity
2019-03, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12236
PMID:30746824
|
研究论文 | 本文综述了巨噬细胞在伤口愈合中的作用，包括其激活和可塑性 | 介绍了最新的体内和转化伤口模型、巨噬细胞特异性缺失以及区分巨噬细胞亚群的新技术 | NA | 总结伤口愈合中巨噬细胞激活和功能的主要参与者，并探讨其对伤口愈合的影响 | 巨噬细胞在伤口愈合中的作用及其激活和可塑性 | NA | NA | 细胞追踪和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-07 |
Single T Cell Sequencing Demonstrates the Functional Role of αβ TCR Pairing in Cell Lineage and Antigen Specificity
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.01516
PMID:31417541
|
研究论文 | 研究通过单细胞测序分析了近10万个独特的CD4和CD8 T细胞的配对TCR序列，探讨了αβ配对在T细胞谱系和抗原特异性中的功能作用 | 首次在谱系水平上分析了αβ TCR配对对T细胞功能的影响，并利用信息论和机器学习工具展示了αβ配对在TCR-MHC相互作用中的协同作用 | NA | 探讨αβ TCR配对在T细胞谱系和抗原特异性中的功能作用 | 近10万个独特的CD4和CD8 T细胞的配对TCR序列 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | 机器学习 | 序列数据 | 近10万个独特的CD4和CD8 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-07 |
De novo gene signature identification from single-cell RNA-seq with hierarchical Poisson factorization
2019-02-22, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20188557
PMID:30796088
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为单细胞层次泊松分解（scHPF）的贝叶斯分解方法，用于从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中发现连续和离散的表达模式 | scHPF方法不需要预先归一化，并且能更好地捕捉单细胞数据的统计特性 | NA | 开发一种新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的基因特征 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达模式 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 层次泊松分解（HPF） | 基因表达数据 | 高级别胶质瘤的核心和边缘区域的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Visceral Adipose Tissue Leukocytes Reveals that Caloric Restriction Following Obesity Promotes the Accumulation of a Distinct Macrophage Population with Features of Phagocytic Cells
2019, Immunometabolism
DOI:10.20900/immunometab20190008
PMID:31396408
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析内脏脂肪组织中的白细胞，探讨肥胖后热量限制对特定巨噬细胞亚群积累的影响 | 首次揭示了肥胖后热量限制促进具有吞噬细胞特征的特定巨噬细胞亚群的积累 | 研究仅限于短期2周的热量限制效果，长期影响需进一步研究 | 探究肥胖及随后热量限制对内脏脂肪组织中白细胞亚群的影响 | 内脏脂肪组织中的白细胞，特别是巨噬细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及15种白细胞亚群的转录变化 | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-08-07 |
New insights into hematopoietic differentiation landscapes from single-cell RNA sequencing
2019-03-28, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2018-08-835355
PMID:30728144
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学在解析造血分化景观中的应用 | 探讨了单细胞分子 profiling 如何在高分辨率下绘制时间解析的分化轨迹，并挑战了我们对干细胞和祖细胞类型及其组织的先前认知 | 依赖于对转录组景观的推断，并基于某些假设 | 深入理解造血层次结构 | 造血分化过程及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-08-07 |
Beyond Fibroblast Heterogeneity: What Single-Cell RNA Sequencing Tells Us
2019-Jul, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2019-0120ED
PMID:30978296
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-08-07 |
Single-nuclei RNA-seq on human retinal tissue provides improved transcriptome profiling
2019-12-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12917-9
PMID:31848347
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序（snRNA-seq）技术对人类视网膜组织进行了转录组分析 | 本研究展示了单核RNA测序在人类冷冻组织中获取单细胞转录组的能力，相较于人类批量RNA测序或动物模型，提供了更深入的见解 | NA | 通过单核RNA测序技术解析复杂组织中的异质性 | 人类视网膜组织及其细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 6个样本，来自3名健康捐赠者，共5873个单核 | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-08-07 |
Single-cell technologies in reproductive immunology
2019-09, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13157
PMID:31206899
|
综述 | 本文综述了单细胞技术在生殖免疫学中的应用，特别是如何通过这些技术来理解母胎界面的复杂免疫环境 | 介绍了单细胞RNA测序与微流控技术结合，以及多色流式细胞术在识别新型细胞类型中的应用 | 生成的数据集具有极高的维度和大小，需要应用新的计算方法进行无偏分析 | 为生殖免疫学界提供关于复杂流式细胞术和RNA测序数据获取及分析的计算工具的概述和简要入门 | 母胎界面的免疫环境及其中的细胞类型 | 生殖免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，多色流式细胞术 | tSNE，SPADE，SPICE | 细胞分辨率的数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2024-08-07 |
Dissecting Cellular Heterogeneity Using Single-Cell RNA Sequencing
2019-Mar-31, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2019.2446
PMID:30764602
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析细胞异质性中的应用 | 介绍了scRNA-seq技术如何通过提供来自数万个单个细胞的全基因组分子轮廓来定量和无偏地表征细胞异质性 | NA | 探讨如何利用scRNA-seq数据解释观察到的细胞间变异性 | 细胞异质性 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 数万个单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2024-08-07 |
In situ 10-cell RNA sequencing in tissue and tumor biopsy samples
2019-03-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-019-41235-9
PMID:30894605
|
研究论文 | 本文介绍了一种在组织和肿瘤活检样本中进行原位10细胞RNA测序的方法 | 结合激光捕获技术和改进的预放大程序，实现了对10个微切割细胞的RNA测序，提高了单细胞RNA测序的技术可靠性和灵敏度 | NA | 开发一种新的方法来量化细胞在其原始组织环境中的个体调控状态 | 组织和肿瘤活检样本中的单个细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 10个微切割细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Lymphoma Clearance Induced by High-Dose Alkylating Agents
2019-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1393
PMID:31040105
|
研究论文 | 本文探讨了高剂量烷化剂在人类双打击淋巴瘤中清除淋巴瘤的机制 | 发现高剂量烷化剂通过诱导内质网应激，促进巨噬细胞依赖的淋巴瘤清除，这是一种新的机制 | NA | 研究高剂量环磷酰胺在人类双打击淋巴瘤中的作用机制 | 人类双打击淋巴瘤 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-07 |
Model-based understanding of single-cell CRISPR screening
2019-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10216-x
PMID:31110232
|
研究论文 | 本文介绍了MUSIC，一个集成管道，用于基于模型的单细胞CRISPR筛选数据理解 | MUSIC能够准确量化和优先处理单细胞CRISPR筛选数据中的个体基因扰动效应，并能容忍数据分析中存在的显著噪声 | NA | 开发一个集成管道，以基于模型的方法分析单细胞CRISPR筛选数据，从而阐明扰动功能和生物电路 | 单细胞CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | CRISPR筛选, 单细胞RNA测序 | 集成管道 | 单细胞数据 | 使用所有公开可用的数据进行综合测试 | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing-Based CRISPRi Screening Resolves Molecular Drivers of Early Human Endoderm Development
2019-Apr-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.03.076
PMID:30995470
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和CRISPRi筛选技术，解析了人类内胚层早期发育的分子驱动因素 | 首次将单细胞RNA测序与CRISPRi筛选相结合，全面定义了内胚层发育中基因功能丧失的表型 | NA | 研究人类内胚层发育的分子基础 | 人类胚胎干细胞向内胚层的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPRi | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-07 |
CRISPR Screening in Single Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_23
PMID:31028650
|
研究论文 | 本文描述了在单细胞水平上使用CRISPR筛选技术的当前协议 | 结合单细胞RNA测序和CRISPR技术，可以高效地研究任意数量的基因 | 研究受限于测序能力 | 探索在单细胞水平上使用CRISPR筛选技术的方法 | 单细胞中的基因 | 基因编辑 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 任意数量的基因，受限于测序能力 | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-08-07 |
Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepatocellular Carcinoma
2019-Oct-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.003
PMID:31675496
|
研究论文 | 本研究结合两种单细胞RNA测序技术，分析了肝细胞癌患者五个免疫相关部位的CD45免疫细胞转录组 | 首次揭示了LAMP3树突状细胞在肿瘤与淋巴结间的迁移潜力及其对多种淋巴细胞亚型的调控作用 | NA | 深入了解肝细胞癌的免疫微环境 | 肝细胞癌患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自五个不同部位的肝细胞癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals novel gene expression signatures of trastuzumab treatment in HER2+ breast cancer: A pilot study
2019-Jun, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000015872
PMID:31261495
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了HER2阳性乳腺癌患者在接受曲妥珠单抗治疗前后的基因表达谱变化 | 首次在单细胞水平上研究了曲妥珠单抗治疗患者的转录组特征，揭示了新的基因表达特征及其在乳腺癌和心脏毒性中的作用 | 作为一项试点研究，样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 探索曲妥珠单抗治疗HER2阳性乳腺癌的分子机制及其引起的心脏毒性 | HER2阳性乳腺癌患者在接受曲妥珠单抗治疗前后的单细胞转录组 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 461个差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |