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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-05 |
cellHarmony: cell-level matching and holistic comparison of single-cell transcriptomes
2019-12-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz789
PMID:31529053
|
研究论文 | 本文介绍了cellHarmony，一个用于单细胞转录组分析和比较的新工具 | cellHarmony采用社区聚类和对齐策略有效匹配单细胞转录组，能够揭示细胞特异的基因表达差异 | NA | 研究目的在于定义疾病相关细胞群体内外的变化，理解人类疾病的分子发病机制 | 研究对象为正常和疾病状态下的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 潜在涉及数十个细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-07 |
High-throughput sequencing of the transcriptome and chromatin accessibility in the same cell
2019-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0290-0
PMID:31611697
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SNARE-seq的方法，能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性 | SNARE-seq方法能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性，实现了转录调控与其输出结果的直接匹配 | NA | 开发一种能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性的方法 | 新生和成年小鼠大脑皮层的细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠大脑皮层5,081个细胞，成年小鼠大脑皮层10,309个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-05 |
Neurog3-Independent Methylation Is the Earliest Detectable Mark Distinguishing Pancreatic Progenitor Identity
2019-01-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.048
PMID:30620902
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研究论文 | 本文展示了Neurog3独立的甲基化是区分胰腺祖细胞身份的最早可检测标志 | 通过单细胞RNA-seq和轨迹分析，揭示了Myt1与Neurog3的共表达在胰腺细胞命运选择中的作用 | 研究中甲基化状态的变化与能否定义的亚群体之间的关系尚不明确 | 探讨Neurog3细胞在胰腺发育中的细胞命运选择机制 | 胰腺内的Neurog3表达祖细胞及其甲基化状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq，轨迹分析 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-05 |
Quantitative Clonal Analysis and Single-Cell Transcriptomics Reveal Division Kinetics, Hierarchy, and Fate of Oral Epithelial Progenitor Cells
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.015
PMID:30472156
|
研究论文 | 本文探讨了口腔上皮祖细胞的分裂动力学、层级和命运 | 通过定量克隆分析和单细胞转录组学，揭示了口腔上皮祖细胞的独特分裂特性和细胞组织模型 | 没有提供具体的临床数据支持研究结果 | 了解口腔上皮祖细胞在稳态和疾病中的角色 | 口腔上皮祖细胞（OEPCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-05 |
Cell-Type-Specific Complement Expression in the Healthy and Diseased Retina
2019-11-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.10.084
PMID:31775049
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研究论文 | 该文章探讨了健康和病态视网膜中细胞类型特异性的补体表达。 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了小鼠视网膜中11种细胞类型的补体表达特征。 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类视网膜的情况。 | 揭示视网膜中不同细胞类型的补体表达及其在视网膜疾病中的作用。 | 小鼠视网膜细胞，特别是11种细胞类型的补体表达。 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 约92,000个小鼠视网膜细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics reveal polyclonal memory T-cell responses in skin with positive abacavir patch test results
2019-11, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2019.09.013
PMID:31574267
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-05 |
Molecular Classification and Comparative Taxonomics of Foveal and Peripheral Cells in Primate Retina
2019-02-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.01.004
PMID:30712875
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研究论文 | 本研究通过165,000个单细胞RNA-seq分析了猕猴视网膜中心和周边细胞的分子分类及比较分类学 | 首次提供了猕猴中心视网膜和周边视网膜的全面细胞分类，并探讨了其在功能上的显著差异 | 该研究主要基于猕猴视网膜数据，可能无法完全代表其他物种的情况 | 探讨猕猴视网膜中中心和周边细胞的功能差异及其对人类眼病的关联 | 猕猴的视网膜细胞，特别是中心的小视网膜区和周边区域 | 数字病理学 | 人类视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 165,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder
2019-01-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-07931-2
PMID:30674886
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研究论文 | 本文提出了一种深度计数自编码器网络用于单细胞RNA测序数据的去噪 | 引入了一种考虑计数分布、过度离散和稀疏性的深度计数自编码器网络，使用负二项噪声模型处理数据 | 本文未提及具体的局限性 | 开发一种可扩展的方法来对单细胞RNA测序数据进行去噪 | 单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 深度计数自编码器 | RNA测序数据 | 数百万个细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-05 |
Helicobacter pylori infection and gastric cancer biology: tempering a double-edged sword
2019-Jul, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-019-03044-1
PMID:30783683
|
研究论文 | 本研究探讨了幽门螺杆菌感染与胃癌生物学之间的关系 | 提出幽门螺杆菌研究可作为微生物相关致癌模型的范例，并探讨其在胃癌中的复杂性 | 尚未完全阐明幽门螺杆菌感染对胃癌的机制及难以运用于更难处理的器官 | 研究幽门螺杆菌在胃癌发病机制中的作用 | 幽门螺杆菌对胃及其他器官的致癌影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | 三维类器官模型 | 分子生物学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-05 |
SCINA: A Semi-Supervised Subtyping Algorithm of Single Cells and Bulk Samples
2019-07-12, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes10070531
PMID:31336988
|
研究论文 | 本研究开发了SCINA，一个半监督模型，用于单细胞和大样本的分类。 | SCINA利用期望最大化算法，结合已有的基因特征进行分析，提供了不同于传统方法的新方法论和生物学见解。 | 本研究在于模型的应用依赖于事先建立的基因特征，可能限制其在某些数据集上的通用性。 | 解决单细胞RNA测序数据分析中的主观性和准确性问题。 | 包括小鼠大脑的单细胞RNA测序数据和基因工程小鼠模型中的细胞群体变化。 | 数字病理学 | 肾癌 | scRNA-Seq，流式细胞术/CyTOF数据 | 半监督模型 | 基因表达数据 | 应用于多种数据集，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-05 |
Single-Cell Allele-Specific Gene Expression Analysis
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9057-3_11
PMID:30758826
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞等位基因表达分析的生物信息学框架SCALE | SCALE框架能够在考虑技术偏差等因素的情况下，估计全基因组的等位基因爆发动力学 | 没有提到具体的局限性 | 研究等位基因在单细胞RNA测序中的表达特征 | 小鼠胚泡单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-05 |
Building a Human Thymus: A Pointillist View
2019-11-19, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2019.10.003
PMID:31747579
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序分析稀有样本，探讨人类胎儿早期的胸腺基质细胞类型及其相关的T淋巴细胞发展 | 阐明了早期人类胎儿中胸腺基质细胞类型和T淋巴细胞的发育过程 | 样本稀有，可能限制结果的普遍适用性 | 研究胸腺基质细胞的来源及早期T淋巴细胞的形成 | 早期人类胎儿的胸腺相关细胞 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 稀有样本 | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-07 |
Single cell census of human kidney organoids shows reproducibility and diminished off-target cells after transplantation
2019-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-13382-0
PMID:31784515
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了四个人诱导多能干细胞系衍生的肾类器官，共450,118个单细胞，展示了类器官组成和发展与人类胎儿和成人肾脏的相似性，并研究了移植后非目标细胞的减少情况。 | 首次使用单细胞RNA测序技术评估肾类器官的重复性和质量，并发现移植可以减少非目标细胞的数量。 | 文章中提到不同iPSC系之间的细胞比例存在变异性，主要由非目标细胞引起。 | 评估人诱导多能干细胞衍生的肾类器官的重复性和减少非目标细胞的生成。 | 人诱导多能干细胞衍生的肾类器官及其移植后的细胞组成。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 450,118个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-07 |
Coopted temporal patterning governs cellular hierarchy, heterogeneity and metabolism in Drosophila neuroblast tumors
2019-09-30, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50375
PMID:31566561
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学、克隆分析和数值建模，研究了果蝇神经母细胞瘤中被重新利用的幼虫期时间模式基因网络，揭示了这些基因如何触发肿瘤细胞的层次性分裂模式并诱导可预测的细胞异质性。 | 首次揭示了时间模式基因在神经母细胞瘤中的重新利用机制，及其对肿瘤细胞层次结构、异质性和生长特性的调控作用。 | NA | 探究儿童肿瘤进展的驱动因素，特别是神经母细胞瘤中的细胞层次结构和异质性。 | 果蝇神经母细胞瘤中的时间模式基因及其在肿瘤发展中的作用。 | 数字病理学 | 儿童肿瘤 | 单细胞转录组学 | 数值模型 | 转录组数据 | 涉及二十个幼虫期时间模式基因 | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-07 |
Evaluation of tools for highly variable gene discovery from single-cell RNA-seq data
2019-07-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bby011
PMID:29481632
|
研究论文 | 本文比较了六种软件包中的七种高变异基因（HVG）方法，以评估其在单细胞RNA测序数据中发现高变异基因的能力 | 本文首次系统比较了多种HVG方法的重复性和差异性，并提出了相应的建议 | 文章指出HVG分析需要比差异表达基因（DEG）分析更大的样本量 | 评估不同软件工具在单细胞RNA测序数据中发现高变异基因的能力 | 六种软件包中的七种高变异基因（HVG）方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 文章未具体说明样本量大小 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-07 |
Molecular and anatomical organization of the dorsal raphe nucleus
2019-08-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.46464
PMID:31411560
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、原位杂交、解剖追踪和空间相关性分析，研究了小鼠背侧缝核的转录和空间细胞特征 | 揭示了至少18种不同的神经元亚型和5种血清素能神经元亚型，其中包括一种优先支配基底神经节的血清素能神经元亚型 | NA | 阐明背侧缝核的分子组织结构 | 小鼠背侧缝核的细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 39,411个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of lung adenocarcinoma reveals heterogeneity of immune response-related genes
2019-02-21, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.121387
PMID:30821712
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺腺癌中的免疫反应相关基因的异质性 | 发现IFN-γ信号通路基因在单个癌细胞中异质表达并与MHC II类基因共同调控，以及肿瘤特异性抗原在单细胞中的表达异质性 | 尚未完全探索影响临床结果和患者选择的异质性类型 | 研究肺腺癌中单细胞水平免疫反应相关基因的异质性及其对免疫治疗效果的影响 | 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据和细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及肺腺癌患者和细胞系的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-Seq analysis identifies a putative epithelial stem cell population in human primary prostate cells in monolayer and organoid culture conditions
2019, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
PMID:31317052
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在单层和类器官培养条件下的人类原代前列腺上皮细胞中的细胞群体 | 首次在单层和类器官培养条件下识别出一种潜在的上皮干细胞群体，并验证了其在不同培养条件下的存在 | 研究仅限于从同一患者获取的样本，且样本数量有限 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和比较单层和类器官培养条件下的人类原代前列腺上皮细胞中的细胞群体 | 人类原代前列腺上皮细胞在单层和类器官培养条件下的细胞群体 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 从同一患者获取的样本，以及来自5名额外患者的前列腺上皮样本 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of fate-mapped macrophages reveals heterogeneity, including stem-like properties, during atherosclerosis progression and regression
2019-02-21, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.124574
PMID:30830865
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和遗传命运图谱技术，首次分析了在小鼠动脉粥样硬化进展和消退过程中，由CX3CR1+前体细胞衍生的斑块细胞的特征 | 研究揭示了比传统M1和M2极化状态更为复杂的巨噬细胞激活状态，并发现了一个意外的增殖性单核细胞簇，具有类似干细胞的特征 | NA | 探讨动脉粥样硬化进展和消退过程中巨噬细胞的异质性和特征 | 小鼠动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-07 |
Molecular characterization of foveal versus peripheral human retina by single-cell RNA sequencing
2019-07, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2019.05.001
PMID:31075224
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对来自三个供体的人类视网膜中央凹和周边区域的神经视网膜进行了分子特征分析 | 首次详细比较了中央凹和周边视网膜细胞的转录组特征，并发现了与年龄相关性黄斑变性相关的转铁蛋白在周边样本中的富集 | 研究仅限于三个供体的样本，可能限制了结果的普遍性 | 探索人类视网膜中央凹与周边区域细胞的分子差异 | 人类视网膜的中央凹和周边区域的神经视网膜细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了8,217个细胞，其中3,578个来自中央凹，4,639个来自周边区域 | NA | NA | NA | NA |