单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 913 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-05 |
Multiplexed, Sequential Secretion Analysis of the Same Single Cells Reveals Distinct Effector Response Dynamics Dependent on the Initial Basal State
2019-May-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201801361
PMID:31065513
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研究论文 | 该文章展示了一种基于微芯片的多重、序列化的分泌分析方法，用于研究单个免疫细胞的效应器响应动态. | 文章创新性地提出了一种在同一单细胞上进行10重分泌测定的方法，揭示了基于初始基础状态的不同效应器响应动态 | 样本数量和时间点可能限制了对更广泛免疫反应的全面理解 | 研究不同激活模式下单个人类巨噬细胞对特定刺激物的响应动态 | 单个免疫细胞，尤其是人类巨噬细胞 | 数字病理学 | NA | 微芯片基础的分泌分析 | NA | 蛋白质分泌数据和单细胞RNA测序数据 | 大约5000个单细胞，在4个时间点同时测量 | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-05 |
Learning mutational graphs of individual tumour evolution from single-cell and multi-region sequencing data
2019-Apr-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-019-2795-4
PMID:31023236
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研究论文 | 本文介绍了一种新的计算框架TRaIT，用于推断肿瘤进化的突变图 | TRaIT是首个支持单细胞和多区域测序数据的同一统计框架，能够捕获复杂的进化现象 | 文中未提及具体的局限性 | 研究旨在重建个体肿瘤的进化模型 | 研究对象为通过单细胞和多区域测序获取的癌症数据集 | 数字病理学 | 肿瘤 | 测序 | 突变图模型 | 基因组数据 | 涉及多区域和单细胞测序的数据集，具体样本量未说明 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-05 |
Ex vivo Dynamics of Human Glioblastoma Cells in a Microvasculature-on-a-Chip System Correlates with Tumor Heterogeneity and Subtypes
2019-Apr-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.201801531
PMID:31016107
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研究论文 | 这篇文章评估了来自十名胶质母细胞瘤患者的BTSCs在微血管芯片系统中的动态 | 建立了微血管芯片系统作为PVN模型，揭示了泰BTSCs的运动特征与肿瘤异质性和亚型之间的关系 | 样本数量较小，仅涵盖十名患者，可能限制了研究结果的普适性 | 研究人类胶质母细胞瘤细胞在微血管环境中的动态与肿瘤异质性之间的关系 | 十名胶质母细胞瘤患者的脑肿瘤干细胞(BTSCs) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 细胞 | 10名患者，合计21,750个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-05 |
SAFE-clustering: Single-cell Aggregated (from Ensemble) clustering for single-cell RNA-seq data
2019-04-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty793
PMID:30202935
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAFE-clustering的单细胞RNA-seq数据聚类方法 | SAFE-clustering是一种灵活、准确且稳健的聚类方法，通过集成多种聚类方法的结果构建共识解 | NA | 提高单细胞RNA-seq数据的细胞类型聚类的准确性 | 多个单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | 聚类算法 | 数据集 | 12个数据集，单细胞数量从49到32,695不等 | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of the Ciona larval brain
2019-04-15, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2018.09.023
PMID:30392840
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研究论文 | 该文章描述了使用单细胞RNA测序对Ciona幼虫大脑的转录组进行了分析 | 首次利用单细胞RNA测序技术对Ciona幼虫大脑的转录组进行全面剖析 | 仅关注特定类型的大脑细胞，可能无法全面代表整个大脑的基因表达特征 | 探索脊椎动物中枢神经系统的发育与连接 | Ciona robusta幼虫的单个脑细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从整个Ciona幼虫大脑中分离的单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-08-05 |
Phenotypic Landscape of Schizophrenia-Associated Genes Defines Candidates and Their Shared Functions
2019-04-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.01.048
PMID:30929901
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research paper | 这篇文章定义了与精神分裂症相关的候选基因及其功能 | 通过突变斑马鱼的同源基因，创建了一幅表型图谱，揭示了与精神分裂症相关基因的相互作用和共享功能 | 研究可能局限于斑马鱼模型，结果是否适用于人类仍需进一步验证 | 探索与精神分裂症相关的基因及其共同功能 | 132个与精神分裂症相关的人类基因的斑马鱼同源基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 脑活动图谱、脑结构差异、行为异常特征 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-05 |
Infectious Disease Risk in Dialysis Patients: A Transdisciplinary Approach
2019, Canadian journal of kidney health and disease
IF:1.6Q3
DOI:10.1177/2054358119839080
PMID:31065378
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评论 | 本文探讨了感染性疾病在终末期肾病患者中的风险以及其与单基因病因之间的关系 | 结合全外显子测序和新技术，研究不同单基因原因的慢性肾病/终末期肾病的分子机制 | 这并不是文献的系统综述，观点受到作者个人看法的影响 | 深入了解感染过程与终末期肾病之间的相互作用，帮助开发靶向治疗策略 | 重点研究单基因病因引起的终末期肾病患者的感染性并发症 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 全外显子测序（WES）、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-05 |
TSEE: an elastic embedding method to visualize the dynamic gene expression patterns of time series single-cell RNA sequencing data
2019-Apr-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-019-5477-8
PMID:30967106
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研究论文 | 提出了一种利用弹性嵌入方法可视化时间序列单细胞RNA测序数据的算法 | 开发了时间序列弹性嵌入(TSEE)算法，通过整合实验时间信息来增强对时间序列scRNA-seq数据的可视化 | NA | 旨在开发一种算法以可视化时间序列单细胞RNA测序数据 | 时间序列单细胞RNA测序数据，主要用于人类和斑马鱼的发育过程 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 弹性嵌入(EE) | 时间序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-05 |
A diffusion-based microfluidic device for single-cell RNA-seq
2019-03-27, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c8lc00967h
PMID:30815639
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研究论文 | 本文介绍了一种基于扩散的微流体设备，用于单细胞RNA测序 | 提出的MID-RNA-seq设备通过扩散试剂交换方案简化了单细胞RNA测序的执行 | NA | 开发一个低输入、高效率的单细胞RNA测序平台 | 单细胞样本的转录组研究 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-05 |
Human beta cells generated from pluripotent stem cells or cellular reprogramming for curing diabetes
2019-Mar, Regenerative engineering and translational medicine
IF:2.2Q3
DOI:10.1007/s40883-018-0082-y
PMID:30984818
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评论 | 本文探讨了使用人类β细胞治疗和治愈糖尿病的方法 | 提出了通过人类多能干细胞定向分化和细胞重编程生成功能性β细胞的新方法 | 依赖于发现有效的转录因子组合，该过程可能存在挑战 | 研究糖尿病治疗中β细胞的生成 | 人类β细胞及其在糖尿病治疗中的应用 | 干细胞工程 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-05 |
scRNA-Seq reveals distinct stem cell populations that drive hair cell regeneration after loss of Fgf and Notch signaling
2019-01-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.44431
PMID:30681411
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研究论文 | 该文章通过scRNA-Seq研究支持细胞如何驱动毛细胞再生 | 揭示了五种不同的支持细胞类型及其在毛细胞分化中的基因调控网络 | 缺乏对哺乳动物毛细胞再生过程中的具体因素的详细探讨 | 研究支持细胞向毛细胞分化的机制 | 斑马鱼的毛细胞及其支持细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-05 |
Lineage Tracing: Computational Reconstruction Goes Beyond the Limit of Imaging
2019-Feb-28, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.14348/molcells.2019.0006
PMID:30764600
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综述 | 本文介绍了计算生物学方法与传统谱系追踪的结合，以克服成像方法的局限性 | 提出了单细胞RNA测序谱系分析、DNA条形码或遗传伤痕分析等新颖的计算方法 | 成像基础的谱系追踪方法在可扩展性和缺乏分子信息方面存在限制 | 探讨细胞谱系追踪在生物过程研究中的应用 | 细胞及其后代的命运追踪 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, DNA条形码 | NA | RNA序列数据 | 涉及多种细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-05 |
CellFishing.jl: an ultrafast and scalable cell search method for single-cell RNA sequencing
2019-02-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1639-x
PMID:30744683
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研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序的新方法CellFishing.jl，用于搜索相似细胞和检测重要基因 | CellFishing.jl提供了一种高精度和高通量的细胞搜索方法，且速度明显快于现有最先进的软件 | NA | 提升单细胞RNA测序数据中细胞搜索的效率和精度 | 多个单细胞RNA测序数据集中的细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | NA | 超过一百万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-05 |
IRIS-EDA: An integrated RNA-Seq interpretation system for gene expression data analysis
2019-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006792
PMID:30763315
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研究论文 | 本文介绍了一种名为IRIS-EDA的RNA-Seq数据分析集成工具，旨在简化基因表达数据的分析和解释。 | IRIS-EDA首次提供了根据FAIR数据原则加速提交数据和结果到NCBI的基因表达数据库的框架。 | NA | 开发一个用户友好的平台，以进行RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据的计算分析。 | RNA-Seq和单细胞RNA-Seq数据的基因表达分析。 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-05 |
Dermal Condensate Niche Fate Specification Occurs Prior to Formation and Is Placode Progenitor Dependent
2019-01-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.034
PMID:30595537
|
研究论文 | 本文揭示了皮肤凝聚物前体的命运规范在形成之前发生，并且依赖于皮肤板的前体 | 研究确定了皮肤凝聚物的未聚集前体及其分子时序，为皮肤发育提供了新的见解 | 对细胞命运转变具体时序的理解仍然不够全面，可能需要进一步研究y | 研究皮肤凝聚物前体的命运规范及其发育轨迹 | 本文研究了皮肤凝聚物前体及其在发育过程中的角色 | 数字病理学 | NA | 3D和4D显微镜观察，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Reveals a Hair Follicle Dermal Niche Molecular Differentiation Trajectory that Begins Prior to Morphogenesis
2019-01-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.032
PMID:30595533
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研究论文 | 本文描述了在毛囊发育和再生过程中，毛囊真皮细胞的分子分化轨迹 | 文章通过单细胞RNA测序和体内方法揭示了毛囊真皮细胞在形态发生之前的转录状态序列 | 由于缺乏对没有组织学差异的细胞的定量分子区别的理解，分子和细胞事件的描绘仍然具有挑战性 | 研究毛囊发育过程中的细胞和分子事件 | 关注毛囊真皮凝聚体细胞的转录状态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-05 |
cellHarmony: cell-level matching and holistic comparison of single-cell transcriptomes
2019-12-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkz789
PMID:31529053
|
研究论文 | 本文介绍了cellHarmony，一个用于单细胞转录组分析和比较的新工具 | cellHarmony采用社区聚类和对齐策略有效匹配单细胞转录组，能够揭示细胞特异的基因表达差异 | NA | 研究目的在于定义疾病相关细胞群体内外的变化，理解人类疾病的分子发病机制 | 研究对象为正常和疾病状态下的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 潜在涉及数十个细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-07 |
High-throughput sequencing of the transcriptome and chromatin accessibility in the same cell
2019-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-019-0290-0
PMID:31611697
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNARE-seq的方法，能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性 | SNARE-seq方法能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性，实现了转录调控与其输出结果的直接匹配 | NA | 开发一种能够在单个细胞核水平上同时测序转录组和染色质可及性的方法 | 新生和成年小鼠大脑皮层的细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 新生小鼠大脑皮层5,081个细胞，成年小鼠大脑皮层10,309个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-05 |
Neurog3-Independent Methylation Is the Earliest Detectable Mark Distinguishing Pancreatic Progenitor Identity
2019-01-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.048
PMID:30620902
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研究论文 | 本文展示了Neurog3独立的甲基化是区分胰腺祖细胞身份的最早可检测标志 | 通过单细胞RNA-seq和轨迹分析，揭示了Myt1与Neurog3的共表达在胰腺细胞命运选择中的作用 | 研究中甲基化状态的变化与能否定义的亚群体之间的关系尚不明确 | 探讨Neurog3细胞在胰腺发育中的细胞命运选择机制 | 胰腺内的Neurog3表达祖细胞及其甲基化状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq，轨迹分析 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-05 |
Quantitative Clonal Analysis and Single-Cell Transcriptomics Reveal Division Kinetics, Hierarchy, and Fate of Oral Epithelial Progenitor Cells
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.015
PMID:30472156
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研究论文 | 本文探讨了口腔上皮祖细胞的分裂动力学、层级和命运 | 通过定量克隆分析和单细胞转录组学，揭示了口腔上皮祖细胞的独特分裂特性和细胞组织模型 | 没有提供具体的临床数据支持研究结果 | 了解口腔上皮祖细胞在稳态和疾病中的角色 | 口腔上皮祖细胞（OEPCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |