单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 161 - 172 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-09 |
Building and Regenerating the Lung Cell by Cell
2019-01-01, Physiological reviews
IF:29.9Q1
DOI:10.1152/physrev.00001.2018
PMID:30427276
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研究论文 | 本文探讨了哺乳动物肺部细胞和分子机制在肺形态发生中的作用 | 利用单细胞RNA测序数据和高分辨率成像技术，揭示了肺部细胞类型的显著异质性及其在肺发育中的基因表达 | NA | 研究肺部细胞多样性、肺形成和功能以及肺器官发生中的细胞和分子途径 | 肺部细胞的多样性、肺形成和功能以及肺器官发生中的细胞和分子途径 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA |
| 162 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq analysis identifies a noncoding interleukin 4 (IL-4) RNA that post-transcriptionally up-regulates IL-4 production in T helper cells
2019-01-04, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA118.004111
PMID:30404921
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠2型辅助T细胞的转录组复杂性，发现了一种非编码的IL-4 RNA，该RNA通过后转录机制上调IL-4的产生 | 首次在单细胞水平上发现了一种非编码的IL-4 RNA，该RNA通过后转录机制调控IL-4蛋白的产生 | NA | 揭示非典型转录本如何通过后转录机制调控其对应典型基因的表达 | 小鼠2型辅助T细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 163 | 2024-08-09 |
ArrayExpress update - from bulk to single-cell expression data
2019-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky964
PMID:30357387
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研究论文 | 本文更新了ArrayExpress数据库，从批量表达数据扩展到单细胞表达数据 | 引入了新的提交工具Annotare，收集必要的元数据以解释实验，并开发了BioStudies数据库以整合不同检测模式的多组学实验数据 | NA | 更新和扩展ArrayExpress数据库，以适应基于测序技术特别是RNA-seq实验的增加以及单细胞研究的显著增长 | 功能基因组学数据，特别是基于RNA-seq的单细胞表达数据 | 功能基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 164 | 2024-08-09 |
CancerSEA: a cancer single-cell state atlas
2019-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky939
PMID:30329142
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研究论文 | 开发了CancerSEA数据库，这是一个专注于探索癌症单细胞水平上不同功能状态的首个专用数据库 | CancerSEA是首个专注于癌症单细胞功能状态的数据库，提供了14种功能状态的详细信息，并允许用户查询特定基因或基因列表在不同癌症中的功能状态关联 | NA | 构建一个专用资源以解码癌症单细胞的功能状态 | 41,900个来自25种癌症类型的单细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 41,900个癌症单细胞 |
| 165 | 2024-08-09 |
CellMarker: a manually curated resource of cell markers in human and mouse
2019-01-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky900
PMID:30289549
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research paper | 本文开发了CellMarker数据库，旨在为人类和小鼠组织中各种细胞类型提供全面准确的细胞标记资源 | 通过手动整理超过10万篇已发表的论文，收集并记录了4124条包含细胞标记信息、组织类型、细胞类型、癌症信息和来源的条目 | NA | 提供一个全面且准确的细胞标记资源，以帮助精确识别和表征细胞，特别是在单细胞水平 | 人类和小鼠组织中的各种细胞类型 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 文本 | 收集了13605个细胞标记，涵盖467种细胞类型在158个人类组织/亚组织中；以及9148个细胞标记，涵盖389种细胞类型在81个小鼠组织/亚组织中 |
| 166 | 2024-08-09 |
Targeting individual cells by barcode in pooled sequence libraries
2019-01-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky856
PMID:30256981
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研究论文 | 本文介绍了一种多重PCR方法，用于从混合单细胞序列库中选择性测序特定细胞 | 提出了一种分子富集方法，结合FACS技术，有效针对超稀有细胞类型，如AXL+SIGLEC6+树突状细胞子集，减少了单细胞测序所需的努力 | NA | 开发一种方法，从混合单细胞序列库中选择性测序特定细胞 | 人类血液细胞中的多种细胞类型 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | 序列数据 | 数千个单细胞 |
| 167 | 2024-08-09 |
Metabolic regulation of pluripotency and germ cell fate through α-ketoglutarate
2019-01-03, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201899518
PMID:30257965
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研究论文 | 本文探讨了代谢与细胞身份之间的复杂联系，特别是在早期小鼠胚胎发育模型中，从原始多能性到原始生殖细胞（PGCs）的指定 | 本文通过单细胞RNA测序和统计建模以及能量代谢的调节，展示了氧化线粒体代谢在原始多能性中的功能作用，并揭示了能量代谢与细胞状态转换的表观遗传控制之间的联系 | NA | 研究代谢与细胞身份之间的联系，特别是在早期小鼠胚胎发育中 | 早期小鼠胚胎发育中的原始多能性和原始生殖细胞（PGCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 统计建模 | RNA | NA |
| 168 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Adult Mouse Kidney: From Molecular Cataloging of Cell Types to Disease-Associated Predictions
2019-01, American journal of kidney diseases : the official journal of the National Kidney Foundation
IF:9.4Q1
DOI:10.1053/j.ajkd.2018.07.002
PMID:30241960
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 169 | 2024-08-09 |
Phylogeny and physiology of candidate phylum BRC1 inferred from the first complete metagenome-assembled genome obtained from deep subsurface aquifer
2019-Jan, Systematic and applied microbiology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.syapm.2018.08.013
PMID:30201528
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研究论文 | 本文通过从深层地下热含水层微生物群落的宏基因组中重建BRC1细菌BY40的完整基因组，进行了代谢重建和与现有基因组数据的比较分析 | 首次从深层地下含水层获得了候选门BRC1的完整宏基因组组装基因组，并提出了新的分类建议 | NA | 研究候选细菌门BRC1的系统发育和生理特性 | 候选细菌门BRC1及其成员BY40的基因组和代谢途径 | 微生物学 | NA | 宏基因组学 | NA | 基因组数据 | 单个细菌BY40的3.3Mb基因组 |
| 170 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct gene expression patterns in glucose metabolism of human preimplantation embryos
2019-Jan, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD18178
PMID:30017025
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类胚胎植入前阶段葡萄糖代谢相关基因的表达模式 | 首次在单细胞分辨率下研究了胚胎植入前阶段葡萄糖代谢的动态基因表达谱 | NA | 探究人类胚胎植入前阶段葡萄糖代谢相关基因的表达调控机制 | 人类胚胎植入前阶段的葡萄糖代谢相关基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 人类胚胎植入前阶段的多个细胞 |
| 171 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the progression of human osteoarthritis
2019-01, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2017-212863
PMID:30026257
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类骨关节炎的进展过程 | 发现了七种分子定义的软骨细胞群体，包括三种具有独特功能的新表型，并揭示了软骨祖细胞的新标记 | NA | 理解人类软骨退化和再生的分子机制，以改进骨关节炎的治疗策略 | 10名接受膝关节置换手术的骨关节炎患者的1464个软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1464个软骨细胞 |
| 172 | 2024-08-09 |
Genetic and phenotypic difference in CD8+ T cell exhaustion between chronic hepatitis B infection and hepatocellular carcinoma
2019-01, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2018-105267
PMID:29666149
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研究论文 | 本研究探讨了慢性乙型肝炎（CHB）和肝细胞癌（HCC）中CD8+ T细胞耗竭的遗传和表型差异 | 首次详细比较了CHB和HCC中CD8+ T细胞耗竭的表型、功能状态和分子机制的差异 | 研究仅基于已发表的单细胞测序数据和有限的样本，可能无法全面反映所有CHB和HCC患者的CD8+ T细胞耗竭情况 | 探索CHB和HCC中CD8+ T细胞耗竭的遗传和表型差异 | CHB和HCC患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于已发表的数据集GSE98638 |