单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing with Drop-Seq
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_6
PMID:31028633
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Drop-Seq的低成本、高通量平台，用于通过将细胞封装到单个液滴中来分析数千个细胞的转录组 | Drop-Seq技术通过微流控设备将带有独特条形码的mRNA捕获微粒与细胞共同限制在液滴中，实现了单细胞转录组的高通量分析 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序技术 | 单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数千个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-09 |
Single-Cell Tagged Reverse Transcription (STRT-Seq)
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_9
PMID:31028636
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研究论文 | 本文描述了基于微流控技术的单细胞标记反转录测序（STRT-C1）方法及其步骤 | STRT-C1方法允许在单细胞水平上进行准确的、敏感的分子计数 | NA | 介绍和详细说明STRT-C1方法 | 单细胞RNA测序 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 96个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-09 |
Targeted TCR Amplification from Single-Cell cDNA Libraries
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_13
PMID:31028640
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研究论文 | 本文描述了一种从单细胞全长cDNA文库中针对TCR CDR3区域进行靶向扩增的敏感协议 | 利用RNase H依赖的PCR（rhPCR）的特异性，实现TCR等位基因的扩增和细胞条形码的添加在一个PCR步骤中完成 | NA | 开发一种新的方法来确定T细胞的特异性 | TCR CDR3区域 | 基因组学 | NA | RNase H依赖的PCR（rhPCR） | NA | cDNA | 单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-09 |
Simultaneous Profiling of mRNA Transcriptome and DNA Methylome from a Single Cell
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_21
PMID:31028648
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMT-seq的新方法，能够从单个细胞中同时分析DNA甲基化和RNA转录组 | scMT-seq方法能够从单个细胞中同时测量DNA甲基化和RNA转录水平，这在技术上是一个重大突破 | NA | 揭示单个细胞中DNA甲基化和转录水平之间的调控关系 | 单个细胞中的DNA甲基化和RNA转录组 | 数字病理学 | NA | scMT-seq | NA | DNA甲基化和RNA转录数据 | 从单个细胞中测量了0.5-1百万个CpG位点的DNA甲基化状态和10,000个基因的mRNA水平 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-09 |
Differential Expression Analysis in Single-Cell Transcriptomics
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_25
PMID:31028652
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研究论文 | 本文探讨了在单细胞转录组学中使用edgeR工具进行差异表达分析的方法 | 比较了不同工具在单细胞数据差异表达分析中的表现，发现edgeR与准似然F检验（QLF）优于其他方法 | NA | 研究单细胞转录组数据中差异表达分析的方法 | 单细胞转录组数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 两组或多组单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-09 |
A Bioinformatic Toolkit for Single-Cell mRNA Analysis
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_26
PMID:31028653
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研究论文 | 本文介绍了一个用于单细胞mRNA分析的生物信息学工具包，涵盖了从实验设计到数据处理的各个步骤 | 本文提供了一个通用的分析流程概述，并介绍了一系列现有的工具 | NA | 介绍和评估用于单细胞RNA-Seq分析的计算工具 | 单细胞RNA-Seq数据分析的各个步骤 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 多达一百万个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-09 |
Stem Cells Heterogeneity
2019, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-11096-3_1
PMID:31016591
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review | 本书概述了不同器官在生理和病理条件下干细胞亚型的知识，并讨论了干细胞异质性的可能起源和后果 | 结合荧光和共聚焦显微镜与遗传先进技术，如命运谱系追踪和单细胞RNA测序，显著推进了对干细胞亚群在健康和疾病中多种新功能的发现 | 对干细胞的复杂性和动态性的理解仍然有限 | 深入了解干细胞异质性对组织稳态和疾病的影响 | 不同器官中的干细胞亚型及其在生理和病理条件下的功能 | NA | NA | 荧光显微镜、共聚焦显微镜、命运谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | NA | 超过30个章节 | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-09 |
Strategies for Converting RNA to Amplifiable cDNA for Single-Cell RNA Sequencing Methods
2019, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-13-6037-4_1
PMID:30968357
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）中分子生物学技术的特点，包括实验室开发的方法 | 介绍了无需转换为可扩增cDNA的直接从RNA扩增第一链cDNA的技术 | 讨论了现有策略的优缺点，但未详细说明新技术在实际应用中的局限性 | 旨在帮助使用单细胞转录组技术的用户理解不同方法的定量性能与其分子特征之间的关系 | 单细胞RNA测序技术及其分子生物学方法 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-09 |
Nx1-Seq (Well Based Single-Cell Analysis System)
2019, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-13-6037-4_4
PMID:30968360
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研究论文 | 本文介绍了新开发的基于孔板的单细胞转录组方法 | 提出了基于孔板的单细胞转录组方法，用于分析细胞分化和细胞异质性的连续变化 | NA | 研究细胞分化和细胞异质性的层次结构 | 单个细胞的多样性和组织微环境 | 生物技术 | NA | 单细胞基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 数百个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-09 |
An Informative Approach to Single-Cell Sequencing Analysis
2019, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-13-6037-4_6
PMID:30968362
|
综述 | 本文综述了单细胞测序分析的多层平台，主要介绍了Chromium单细胞3' RNA-seq系统及其技术特点，并比较了其他单细胞RNA-seq系统，同时描述了处理大型复杂单细胞数据集的计算方法 | 介绍了Chromium单细胞3' RNA-seq系统及其技术特点，并提供了处理稀疏数据集的信息学方法，如插补、批次效应校正、降维和聚类 | 由于单细胞RNA-seq数据深度不足，导致低表达基因的转录组信息严重缺乏，数据解释有时较为困难 | 综述单细胞测序分析的平台和技术，并探讨处理大型复杂单细胞数据集的方法 | 单细胞测序分析的平台和技术，以及处理单细胞数据集的计算方法 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 数据集 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-09 |
Tanycyte-Independent Control of Hypothalamic Leptin Signaling
2019, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2019.00240
PMID:30941008
|
研究论文 | 本研究分析了小鼠中tanycytes中leptin受体的表达及其功能 | 首次通过单分子荧光原位杂交(smfISH)、RT-qPCR、单细胞RNA测序(scRNA-Seq)和tanycytes中特异性删除leptin受体，证明了tanycytes中leptin受体的表达缺失或极低，且tanycytes不直接通过依赖leptin受体的机制调节下丘脑leptin信号 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步的人体研究来验证这些发现 | 探讨tanycytes在调节下丘脑leptin信号中的作用 | tanycytes中的leptin受体表达及其对下丘脑leptin信号的影响 | NA | NA | 单分子荧光原位杂交(smfISH)、RT-qPCR、单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of CD34+ Stem Cell-Derived Myeloid Cells Infected With Human Cytomegalovirus
2019, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2019.00577
PMID:30949159
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析，研究了人巨细胞病毒（CMV）感染的CD34+造血干细胞衍生的髓系细胞 | 利用10×基因组学平台对约7000个单细胞进行转录组分析，揭示了病毒复制发生在特定的细胞亚群中，这些细胞与CFU-GEMM多能祖细胞转录相关 | NA | 揭示人巨细胞病毒感染髓系细胞的机制 | CD34+造血干细胞衍生的髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 约7000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-09 |
PanglaoDB: a web server for exploration of mouse and human single-cell RNA sequencing data
2019-01-01, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baz046
PMID:30951143
|
研究论文 | 本文介绍了PanglaoDB，一个用于探索小鼠和人类单细胞RNA测序数据的在线数据库 | PanglaoDB提供了一个用户友好的界面，包含预处理和预计算的分析，涵盖了大多数主要的单细胞平台和协议，并建立了一个社区维护的细胞类型标记目录 | NA | 开发一个易于访问的在线数据库，以便生物学研究人员探索已发表的小鼠和人类单细胞RNA测序研究 | 小鼠和人类的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 超过400万个细胞，来自多种组织和器官，涵盖1054个单细胞实验 | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-09 |
The Impact of Heterogeneity on Single-Cell Sequencing
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00008
PMID:30881372
|
研究论文 | 本文探讨了细胞异质性对单细胞测序数据大规模分析的重要性，特别是在肿瘤学和其他疾病研究中的应用 | 本文通过整合全基因组分析和成本效益更高的下一代测序技术，揭示了细胞异质性的水平 | 这些检测可以生成极大的数据量，对数据处理和分析提出了挑战 | 研究细胞异质性对单细胞测序数据大规模分析的影响 | 单细胞测序数据中的基因表达和体细胞突变异质性 | 数字病理学 | NA | 下一代测序（NGS） | NA | 测序数据 | 大规模分析 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-09 |
webCEMiTool: Co-expression Modular Analysis Made Easy
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00146
PMID:30894872
|
研究论文 | 介绍了一个名为webCEMiTool的在线工具，用于自动化执行共表达模块分析，并进行功能分析和网络分析 | webCEMiTool是一个独特的在线工具，能够全面自动化地进行模块分析，并整合转录组数据与相互作用组信息 | NA | 开发一个易于使用的工具，用于共表达模块分析和功能分析 | 人类细胞中单细胞RNA测序数据，感染了寨卡病毒或登革热病毒 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 感染了寨卡病毒或登革热病毒的人类细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-09 |
The Space-Time Continuum of Cortical Dysplasia
2019-01, Epilepsy currents
IF:5.8Q1
DOI:10.1177/1535759718822039
PMID:30838928
|
研究论文 | 本文探讨了mTOR通路基因突变在皮质发育不良中的作用 | 通过深度测序和单细胞测序技术，揭示了mTOR激活在皮质发育不良中的具体作用机制 | NA | 研究mTOR通路基因突变在皮质发育不良中的病理机制 | 皮质发育不良（FCD）和半巨脑症（HME）患者的大脑组织 | 神经科学 | 神经发育异常 | 深度测序，单细胞测序 | NA | 基因序列数据 | 66例FCD/HME患者的大脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-09 |
20 Years of Secretagogin: Exocytosis and Beyond
2019, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2019.00029
PMID:30853888
|
综述 | 本文综述了钙结合蛋白Secretagogin在过去20年的研究进展及其在细胞信号传导中的作用 | 利用现代蛋白质组学技术，发现了大量Secretagogin的实际和潜在相互作用蛋白，揭示了其在神经细胞发育和成熟中的复杂作用 | NA | 回顾Secretagogin的最新发现，揭示其在细胞信号传导中的重要作用 | 钙结合蛋白Secretagogin及其相互作用蛋白 | NA | NA | 蛋白质组学 | NA | 蛋白质 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-09 |
Corrigendum: A Single-Cell Sequencing Guide for Immunologists
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.00278
PMID:30863399
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Oligodendrocyte Lineage Cells from the Mouse Central Nervous System
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9072-6_1
PMID:30820890
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研究论文 | 本文介绍了使用单细胞RNA测序技术研究小鼠中枢神经系统中少突胶质细胞谱系细胞异质性的方法 | 利用单细胞RNA测序技术揭示复杂组织中不同细胞状态/群体 | NA | 探索小鼠中枢神经系统中少突胶质细胞谱系细胞的异质性 | 小鼠中枢神经系统中的少突胶质细胞谱系细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-09 |
Expression Cloning of Antibodies from Single Human B Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9151-8_5
PMID:30779032
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研究论文 | 本文描述了一种从单个人类B细胞中克隆抗体的策略 | 该方法允许在单细胞水平上无偏差地表征人类抗体谱，通过从单个原代人类B细胞生成重组单克隆抗体 | NA | 研究B细胞受体在淋巴瘤发展或生存中的作用 | 人类B细胞的抗体反应性 | NA | 淋巴瘤 | RT-PCR | NA | Ig转录本 | 单个人类B细胞 | NA | NA | NA | NA |