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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for the study of lupus nephritis
2019, Lupus science & medicine
IF:3.7Q1
DOI:10.1136/lupus-2019-000329
PMID:31245017
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在理解狼疮和狼疮性肾炎分子发病机制中的应用 | scRNA-seq技术的高通量特性加速了生物系统和疾病中的发现 | NA | 探讨scRNA-seq技术在狼疮和狼疮性肾炎研究中的应用 | scRNA-seq技术及其在狼疮和狼疮性肾炎中的应用 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing in Precision Medicine
2019, Cancer treatment and research
DOI:10.1007/978-3-030-16391-4_9
PMID:31209848
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在精准医学中的应用及其对癌症研究和治疗的影响 | 单细胞基因组学是一个新兴领域，它增强了我们对癌症复杂生物系统中细胞遗传多样性的理解 | NA | 探索单细胞测序技术在精准癌症治疗中的应用潜力 | 癌症细胞的基因表达、DNA变异、表观遗传状态和核结构 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序 | NA | 基因组数据 | 单个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 83 | 2024-08-09 |
Cancer Stem Cells: Concepts, Challenges, and Opportunities for Cancer Therapy
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9524-0_4
PMID:31175645
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研究论文 | 本文探讨了癌症干细胞（CSCs）的概念、挑战及其在癌症治疗中的机遇 | 利用体外和体内实验、小鼠遗传模型以及单细胞测序技术和其他‘组学’方法，不仅有助于识别新的CSC群体，还揭示并阐明了CSC的新特性 | 需要进一步研究以深入理解CSC特性和设计针对性的治疗方法 | 旨在深入理解CSC特性和特征，以促进设计针对CSC的合理治疗方案 | 癌症干细胞（CSCs）及其在肿瘤生长和异质性中的作用 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2024-08-09 |
Identification of Breast Cancer Stem Cell Related Genes Using Functional Cellular Assays Combined With Single-Cell RNA Sequencing in MDA-MB-231 Cells
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00500
PMID:31191614
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研究论文 | 本文通过功能性细胞检测结合单细胞RNA测序技术，在MDA-MB-231细胞系中识别与乳腺癌干细胞相关的基因 | 本文首次结合哺乳球形成试验和标记保留试验来富集具有不同程度乳腺癌干细胞特性的细胞，并通过单细胞RNA测序技术进行基因表达分析 | 需要进一步的实验验证来确认这些潜在乳腺癌干细胞标记物的细胞功能 | 旨在通过详细表征乳腺癌干细胞来增进对肿瘤进展机制的理解，并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌干细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MDA-MB-231细胞系中的多个细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 85 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis Reveals Regional Reprogramming During Adaptation to Massive Small Bowel Resection in Mice
2019, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2019.06.001
PMID:31195149
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率分析，揭示了小鼠在大量小肠切除后适应过程中的区域重编程现象 | 首次描述了小肠上皮细胞在短肠综合征后重编程其区域身份的能力 | NA | 研究小肠在短肠综合征后适应过程中的分子变化 | 小鼠小肠上皮细胞在50%近端小肠切除后的分子变化 | 数字病理学 | 短肠综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠远端小肠上皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 86 | 2024-08-09 |
Human Dendritic Cell Subsets, Ontogeny, and Impact on HIV Infection
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.01088
PMID:31156637
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综述 | 本文综述了树突状细胞（DCs）的分类、发育及其在HIV感染中的作用 | 利用单细胞测序和多参数流式细胞术等高维度方法，重新分类了浆细胞样DCs和重新评估了肠道常规DCs及巨噬细胞的来源 | NA | 探讨DCs的当前研究进展及其发育过程，以及这些知识如何影响我们对DCs在HIV感染中作用的认识 | 树突状细胞及其在HIV感染中的作用 | NA | HIV感染 | 单细胞测序、多参数流式细胞术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2024-08-09 |
NormExpression: An R Package to Normalize Gene Expression Data Using Evaluated Methods
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00400
PMID:31114611
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研究论文 | 本文介绍了一个名为NormExpression的R包，用于使用评估方法对基因表达数据进行标准化 | 提出了一种新的评估指标AUCVC，并结合mSCC评估了14种常用标准化方法，确保了指标和数据集的一致性 | NA | 旨在建立指导标准化方法评估的原则，并提供一个框架帮助研究人员选择最佳标准化方法 | 基因表达数据的标准化方法及其评估 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据评估了14种常用标准化方法 | NA | NA | NA | NA |
| 88 | 2024-08-09 |
Tracking tumor evolution one-cell-at-a-time
2019, Molecular & cellular oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.1080/23723556.2019.1590089
PMID:31131309
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学研究了口腔鳞状细胞癌中表型性肿瘤内异质性对药物诱导肿瘤演化的影响 | 采用单细胞转录组学技术，从单细胞层面追踪肿瘤演化 | NA | 探究肿瘤内异质性对药物治疗反应的影响 | 口腔鳞状细胞癌中的肿瘤内异质性 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自患者的原代细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 89 | 2024-08-09 |
Alternative polyadenylation of single cells delineates cell types and serves as a prognostic marker in early stage breast cancer
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0217196
PMID:31100099
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研究论文 | 本研究探讨了单个癌细胞和肿瘤微环境细胞中的选择性多聚腺苷酸化（APA）现象，并分析了其在不同细胞类型中的生理意义及其作为早期乳腺癌预后标志物的潜力 | 首次在单细胞水平上研究了APA模式，并发现其在不同细胞类型中的差异表达，特别是在乳腺癌中的免疫特异性APA特征 | 研究样本量相对较小，仅包括11名乳腺癌患者和3名胶质母细胞瘤及1名肾细胞癌患者 | 理解APA在不同细胞类型中的生理意义，并探索其作为早期乳腺癌预后标志物的可能性 | 单个癌细胞和肿瘤微环境细胞中的APA现象 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 515个单细胞样本来自11名乳腺癌患者，以及来自3名胶质母细胞瘤和1名肾细胞癌患者的scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-09 |
Investigating Cell Fate Decisions with ICGS Analysis of Single Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9224-9_12
PMID:31062314
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研究论文 | 本文探讨了使用迭代聚类和指导基因选择（ICGS）分析方法来定义单细胞RNA-Seq数据中多样化的干细胞和多能前体细胞群体的异质性 | 介绍了ICGS工具，该工具能够揭示新的承诺、过渡和亚稳态前体细胞状态 | NA | 探索新的分析工具在单细胞转录组分析中的应用，以深入了解细胞状态的调控生物学 | 干细胞和多能前体细胞的异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | ICGS | RNA-Seq数据 | 涉及造血和胚胎肾前体细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 91 | 2024-08-09 |
Lineage Inference and Stem Cell Identity Prediction Using Single-Cell RNA-Sequencing Data
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9224-9_13
PMID:31062315
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研究论文 | 本文介绍了一种使用单细胞RNA测序数据进行谱系推断和干细胞身份预测的先进分析流程 | 开发了适用于多种生物过程的谱系树构建和干细胞身份预测方法 | NA | 解决单细胞RNA测序数据分析中的技术挑战，开发稳健的统计和计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的罕见细胞类型发现、细胞异质性表征、干细胞识别和谱系树构建 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 92 | 2024-08-09 |
Epigenetic Regulation of IL-17-Induced Chemokines in Lung Epithelial Cells
2019, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/2019/9050965
PMID:31080358
|
research paper | 研究探讨了IL-17通过表观遗传机制在肺上皮细胞中诱导CXCR2配体产生的机制 | 首次展示了IL-17诱导的CXCR2配体产生依赖于组蛋白乙酰化，特别是通过抑制HDAC5，并且这一过程严格依赖于BET家族 | NA | 揭示IL-17在肺上皮细胞中通过表观遗传调控CXCR2配体产生的机制 | 人原代支气管上皮细胞和永生化的人及小鼠上皮细胞系 | digital pathology | lung disease | single-cell RNA-seq | NA | RNA | 涉及人原代支气管上皮细胞和永生化的人及小鼠上皮细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2024-08-09 |
High-Order Correlation Integration for Single-Cell or Bulk RNA-seq Data Analysis
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00371
PMID:31080457
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研究论文 | 本文提出了一种名为HCI的高阶相关性集成框架，用于单细胞或批量RNA-seq数据分析，通过高阶相关矩阵与模式融合分析（PFA）实现高维数据特征提取 | HCI利用高阶Pearson相关系数突出噪声输入数据集下的潜在模式，提高样本聚类的准确性和鲁棒性；PFA能从不同输入矩阵中有效识别内在样本模式 | NA | 提高样本类型量化或标记的质量，理解复杂疾病的关键步骤 | 单细胞和批量RNA-seq数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq | 高阶相关矩阵 | RNA-seq数据 | 四组单细胞RNA-seq数据集，TCGA和GEO数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 94 | 2024-08-09 |
Insights from deconvolution of cell subtype proportions enhance the interpretation of functional genomic data
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0215987
PMID:31022271
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研究论文 | 本文展示了如何从功能基因组数据中提取细胞亚型比例信息，以深入理解与表型相关的细胞变化 | 本文开发了新的工具来分析混合细胞样本，并展示了细胞亚型比例变化对功能基因组特性的疾病特异性贡献 | 本文主要集中在人类血液和老鼠肾脏两种混合细胞群体，其他组织的参考数据集不足 | 研究细胞亚型比例变化对功能基因组特性的影响 | 人类血液和老鼠肾脏的混合细胞群体 | 功能基因组学 | 哮喘和系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及两种疾病（哮喘和系统性红斑狼疮）和两种敲除小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 95 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00317
PMID:31024627
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其相关计算数据分析方法 | 介绍了多种scRNA-seq协议及其独特的特点，以及针对scRNA-seq数据分析的新算法需求 | scRNA-seq数据比批量RNA-seq数据更嘈杂和复杂，需要更精确和可重复的分析方法 | 探讨scRNA-seq技术的当前发展及其在数据分析中的应用 | 单细胞RNA测序技术和相关数据分析方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2024-08-09 |
Setting Up a Single-Cell Genomic Laboratory
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_1
PMID:31028628
|
research paper | 本文介绍了如何建立一个适合单细胞基因组学研究的实验室环境 | 本文提供了关于如何设置适合单细胞RNA测序的实验室环境的建议 | NA | 旨在指导建立适合单细胞RNA测序的实验室环境 | 单细胞RNA测序的实验室环境设置 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2024-08-09 |
Tissue Handling and Dissociation for Single-Cell RNA-Seq
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_2
PMID:31028629
|
研究论文 | 本文描述了从淋巴组织和非淋巴组织中分离人免疫细胞的组织解离协议，这些细胞随后用于单细胞方法的输入 | NA | NA | 探讨影响单细胞数据最终质量的主要因素，特别是可能影响其解释的压力信号 | 人免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-09 |
Full-Length Single-Cell RNA Sequencing with Smart-seq2
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_3
PMID:31028630
|
研究论文 | 本文介绍了如何使用Smart-seq2技术进行全长单细胞RNA测序，并提供了生成高质量数据的方法和解决方案 | Smart-seq2被认为是全长转录本表征的“黄金标准”，因其高灵敏度、精确度、较低成本、可扩展性以及易于在自动化平台上设置 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在转录水平上研究细胞异质性的应用 | 单细胞RNA测序技术及其在细胞类型鉴定和基因表达随机性分析中的应用 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 99 | 2024-08-09 |
CEL-Seq2-Single-Cell RNA Sequencing by Multiplexed Linear Amplification
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_4
PMID:31028631
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研究论文 | 本文描述了使用CEL-Seq2方法进行单细胞RNA测序的协议 | CEL-Seq2是首个使用线性RNA扩增的方法，具有灵敏度高、成本效益好且操作简便的特点 | NA | 介绍和优化单细胞RNA测序技术 | 单细胞RNA测序 | 基因组学 | NA | CEL-Seq2 | NA | RNA序列 | 排序的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 100 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq by Multiple Annealing and Tailing-Based Quantitative Single-Cell RNA-Seq (MATQ-Seq)
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_5
PMID:31028632
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MATQ-Seq的单细胞RNA测序技术，该技术基于多次退火和dC尾部的单细胞RNA测序，具有约90%的捕获效率，并能检测非多聚腺苷酸化的转录本。 | MATQ-Seq技术提高了单细胞RNA测序的准确性和敏感性，并能检测非多聚腺苷酸化的转录本。 | NA | 开发和评估一种新的单细胞RNA测序技术，以提高转录组细微异质性的检测能力。 | 单细胞RNA测序技术及其在生物过程中的应用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |