单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Spatial and Temporal Turnover of Keratinocyte Differentiation Regulators
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00775
PMID:31552090
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据，分析了22,338个人类包皮角质形成细胞的转录调控，揭示了角质形成细胞分化调控因子的空间和时间变化 | 识别了在角质形成细胞分化过程中协同表达变化的转录因子组，并展示了这些转录因子在超级增强子中的预测结合富集与分化状态的转变一致 | NA | 研究角质形成细胞分化过程中的动态基因调控 | 人类包皮角质形成细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 22,338个人类包皮角质形成细胞 |
| 62 | 2024-08-09 |
Cross-Species Analysis of Single-Cell Transcriptomic Data
2019, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2019.00175
PMID:31552245
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综述 | 本文综述了跨物种单细胞转录组数据分析的计算方法发展 | 探讨了跨物种单细胞数据比较的新计算方法，有望深入理解细胞层面的进化作用 | 跨物种比较受多种生物和技术因素影响，如批次效应和基因进化关系 | 开发详细的细胞类型系统发育树，描述跨物种细胞类型的进化和发育关系 | 跨物种的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 涉及多个物种和分类群的单细胞 |
| 63 | 2024-08-09 |
High-Dimensional Immunophenotyping with Fluorescence-Based Cytometry: A Practical Guidebook
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9650-6_1
PMID:31522410
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research paper | 本文提供了一个关于如何成功设计和执行基于荧光的复杂免疫表型分析面板的实用指南 | 本文解决了常见的误解和注意事项，并讨论了与这些数据集的质量控制和分析相关的挑战 | NA | 提供基于荧光的高维度单细胞免疫表型分析的实用指南 | 基于荧光的流式细胞术在免疫系统复杂性研究中的应用 | NA | NA | 荧光基流式细胞术 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 64 | 2024-08-09 |
Postoperative metastasis prediction based on portal vein circulating tumor cells detected by flow cytometry in periampullary or pancreatic cancer
2019, Cancer management and research
IF:2.5Q3
DOI:10.2147/CMAR.S210332
PMID:31496801
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研究论文 | 本研究评估了通过流式细胞术检测门静脉循环肿瘤细胞在预测术后转移中的价值 | 本研究首次采用流式细胞术结合激光共聚焦显微镜和单细胞测序技术，验证了门静脉循环肿瘤细胞在预测胰腺或壶腹部肿瘤术后转移中的作用 | NA | 评估流式细胞术检测门静脉循环肿瘤细胞在预测术后转移中的价值 | 39名胰腺或壶腹部肿瘤患者的门静脉血和外周血样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 流式细胞术 | NA | 血液样本 | 39名患者 |
| 65 | 2024-08-09 |
Cnidofest 2018: the future is bright for cnidarian research
2019, EvoDevo
IF:4.1Q1
DOI:10.1186/s13227-019-0134-5
PMID:31508195
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研究论文 | 本文报道了2018年珊瑚虫模型系统会议（Cnidofest）的内容，涵盖了珊瑚虫生物学的多个方面及现代研究技术的进展 | 会议强调了微流控技术和单细胞转录组学在珊瑚虫模型中的应用 | NA | 提供Cnidofest 2018会议中展示的令人兴奋的研究概述，并讨论未来研究的机会 | 珊瑚虫生物学的多个方面，包括基因组学、发育、神经生物学、免疫学、共生、生态学和进化 | NA | NA | 微流控技术、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-09 |
A Tool for Visualization and Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data Based on Text Mining
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00734
PMID:31447887
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研究论文 | 本文介绍了一种基于文本挖掘的单细胞RNA测序数据可视化和分析工具 | 该工具采用TF-IDF模型进行数据转换，适用于处理稀疏和零膨胀的单细胞数据，并展示了其在区分不同细胞类型方面的优越性 | NA | 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的新型计算流程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | TF-IDF | 文本 | 数千个细胞 |
| 67 | 2024-08-09 |
The single-cell sequencing: new developments and medical applications
2019, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-019-0314-y
PMID:31391919
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术的最新进展及其在肿瘤学、微生物学、神经学、生殖学、免疫学、消化系统和泌尿系统中的应用 | 介绍了单细胞测序技术在多个医学领域的最新应用 | NA | 探讨单细胞测序技术在医学领域的应用 | 单细胞的基因组、转录组及其他多组学特征 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组等多组学数据 | NA |
| 68 | 2024-08-09 |
Growth Hormone Promotes in vitro Maturation of Human Oocytes
2019, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2019.00485
PMID:31396155
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研究论文 | 本研究探讨了生长激素（GH）在体外成熟（IVM）人卵母细胞中的作用 | 首次系统研究了生长激素在人卵母细胞IVM中的应用，并通过单细胞RNA测序分析了其对基因表达的影响 | 研究仅限于特定的生长激素浓度和特定的人卵母细胞样本 | 提高人卵母细胞体外成熟的成功率 | 人卵母细胞及其在体外成熟过程中的基因表达 | 生殖医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了不同浓度的生长激素处理的人卵母细胞样本 |
| 69 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of T Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9728-2_16
PMID:31396939
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研究论文 | 本文提供了一个实验和计算工作流程，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析T细胞 | 介绍了使用scRNA-seq技术研究T细胞异质性的新途径，并讨论了其在T细胞生物学中的未来方向 | 讨论了当前方法在T细胞生物学中的局限性 | 探索T细胞的异质性，并提供一个可重现的生物信息学管道 | T细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 从基于板的排序T细胞中提取的数据，使用流式细胞术和全长转录组协议如Smart-Seq2 |
| 70 | 2024-08-09 |
Characteristics of a novel cell line ZJU-0430 established from human gallbladder carcinoma
2019, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-019-0911-1
PMID:31367188
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研究论文 | 本文介绍了从人胆囊癌中建立的新型细胞系ZJU-0430的特性 | 建立了新的胆囊癌细胞系ZJU-0430，并对其进行了全面的体外和体内特性分析 | NA | 建立胆囊癌细胞系以研究胆囊癌的分子发病机制 | 胆囊癌细胞系ZJU-0430 | NA | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序, 光学和电子显微镜, DNA含量分析, 细胞遗传学分析, 短串联重复(STR)DNA指纹分析, 免疫表型特征分析, 异种移植 | NA | 细胞 | NA |
| 71 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing-Based Computational Analysis to Describe Disease Heterogeneity
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00629
PMID:31354786
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其在疾病异质性研究中的应用 | 介绍了scRNA-seq技术在不同条件下对分子特征识别的稳健性及其在科研和临床应用中的潜力 | NA | 探讨scRNA-seq技术在疾病异质性研究中的应用及其分析框架的性能稳健性 | 单细胞RNA测序技术和其分析框架 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 72 | 2024-08-09 |
Pipeliner: A Nextflow-Based Framework for the Definition of Sequencing Data Processing Pipelines
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00614
PMID:31316552
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研究论文 | 介绍了一个基于Nextflow的框架Pipeliner，用于定义和处理各种类型的测序数据 | Pipeliner框架结合了Nextflow脚本语言和Anaconda包管理器，提供了模块化的计算工作流程，便于扩展和维护 | NA | 开发一个灵活且用户友好的数据预处理平台，用于处理高吞吐量测序技术产生的数据 | Pipeliner框架及其在批量RNA测序、单细胞RNA测序和数字基因表达数据处理中的应用 | 生物信息学 | NA | Nextflow, Anaconda | NA | 测序数据 | 使用玩具数据集进行演示 |
| 73 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing for the study of lupus nephritis
2019, Lupus science & medicine
IF:3.7Q1
DOI:10.1136/lupus-2019-000329
PMID:31245017
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的发展及其在理解狼疮和狼疮性肾炎分子发病机制中的应用 | scRNA-seq技术的高通量特性加速了生物系统和疾病中的发现 | NA | 探讨scRNA-seq技术在狼疮和狼疮性肾炎研究中的应用 | scRNA-seq技术及其在狼疮和狼疮性肾炎中的应用 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA |
| 74 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing in Precision Medicine
2019, Cancer treatment and research
DOI:10.1007/978-3-030-16391-4_9
PMID:31209848
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在精准医学中的应用及其对癌症研究和治疗的影响 | 单细胞基因组学是一个新兴领域，它增强了我们对癌症复杂生物系统中细胞遗传多样性的理解 | NA | 探索单细胞测序技术在精准癌症治疗中的应用潜力 | 癌症细胞的基因表达、DNA变异、表观遗传状态和核结构 | 数字病理学 | 癌症 | 下一代测序 | NA | 基因组数据 | 单个细胞 |
| 75 | 2024-08-09 |
Cancer Stem Cells: Concepts, Challenges, and Opportunities for Cancer Therapy
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9524-0_4
PMID:31175645
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研究论文 | 本文探讨了癌症干细胞（CSCs）的概念、挑战及其在癌症治疗中的机遇 | 利用体外和体内实验、小鼠遗传模型以及单细胞测序技术和其他‘组学’方法，不仅有助于识别新的CSC群体，还揭示并阐明了CSC的新特性 | 需要进一步研究以深入理解CSC特性和设计针对性的治疗方法 | 旨在深入理解CSC特性和特征，以促进设计针对CSC的合理治疗方案 | 癌症干细胞（CSCs）及其在肿瘤生长和异质性中的作用 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-08-09 |
Identification of Breast Cancer Stem Cell Related Genes Using Functional Cellular Assays Combined With Single-Cell RNA Sequencing in MDA-MB-231 Cells
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00500
PMID:31191614
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研究论文 | 本文通过功能性细胞检测结合单细胞RNA测序技术，在MDA-MB-231细胞系中识别与乳腺癌干细胞相关的基因 | 本文首次结合哺乳球形成试验和标记保留试验来富集具有不同程度乳腺癌干细胞特性的细胞，并通过单细胞RNA测序技术进行基因表达分析 | 需要进一步的实验验证来确认这些潜在乳腺癌干细胞标记物的细胞功能 | 旨在通过详细表征乳腺癌干细胞来增进对肿瘤进展机制的理解，并识别新的治疗靶点 | 乳腺癌干细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | MDA-MB-231细胞系中的多个细胞样本 |
| 77 | 2024-08-09 |
Single-Cell Analysis Reveals Regional Reprogramming During Adaptation to Massive Small Bowel Resection in Mice
2019, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2019.06.001
PMID:31195149
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研究论文 | 本研究通过单细胞分辨率分析，揭示了小鼠在大量小肠切除后适应过程中的区域重编程现象 | 首次描述了小肠上皮细胞在短肠综合征后重编程其区域身份的能力 | NA | 研究小肠在短肠综合征后适应过程中的分子变化 | 小鼠小肠上皮细胞在50%近端小肠切除后的分子变化 | 数字病理学 | 短肠综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠远端小肠上皮细胞 |
| 78 | 2024-08-09 |
Human Dendritic Cell Subsets, Ontogeny, and Impact on HIV Infection
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.01088
PMID:31156637
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综述 | 本文综述了树突状细胞（DCs）的分类、发育及其在HIV感染中的作用 | 利用单细胞测序和多参数流式细胞术等高维度方法，重新分类了浆细胞样DCs和重新评估了肠道常规DCs及巨噬细胞的来源 | NA | 探讨DCs的当前研究进展及其发育过程，以及这些知识如何影响我们对DCs在HIV感染中作用的认识 | 树突状细胞及其在HIV感染中的作用 | NA | HIV感染 | 单细胞测序、多参数流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 79 | 2024-08-09 |
NormExpression: An R Package to Normalize Gene Expression Data Using Evaluated Methods
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00400
PMID:31114611
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研究论文 | 本文介绍了一个名为NormExpression的R包，用于使用评估方法对基因表达数据进行标准化 | 提出了一种新的评估指标AUCVC，并结合mSCC评估了14种常用标准化方法，确保了指标和数据集的一致性 | NA | 旨在建立指导标准化方法评估的原则，并提供一个框架帮助研究人员选择最佳标准化方法 | 基因表达数据的标准化方法及其评估 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据评估了14种常用标准化方法 |
| 80 | 2024-08-09 |
Tracking tumor evolution one-cell-at-a-time
2019, Molecular & cellular oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.1080/23723556.2019.1590089
PMID:31131309
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学研究了口腔鳞状细胞癌中表型性肿瘤内异质性对药物诱导肿瘤演化的影响 | 采用单细胞转录组学技术，从单细胞层面追踪肿瘤演化 | NA | 探究肿瘤内异质性对药物治疗反应的影响 | 口腔鳞状细胞癌中的肿瘤内异质性 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自患者的原代细胞 |