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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-05 |
Self-renewing resident cardiac macrophages limit adverse remodeling following myocardial infarction
2019-01, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-018-0272-2
PMID:30538339
|
研究论文 | 本研究表明，常驻心脏巨噬细胞在心肌梗死后的不良重塑中起到重要作用 | 通过命运追踪、联合动物实验和单细胞转录组学展示心脏巨噬细胞自我更新与血单核细胞输入的关系 | 本研究未探讨其他类型巨噬细胞在心脏修复中的潜在角色 | 探讨心脏巨噬细胞在心肌梗死后的功能分化及其自我更新能力 | 研究对象为心脏的常驻巨噬细胞及其与血单核细胞的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | Cx3cr1基础系统 | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-05 |
Infectious Disease Risk in Dialysis Patients: A Transdisciplinary Approach
2019, Canadian journal of kidney health and disease
IF:1.6Q3
DOI:10.1177/2054358119839080
PMID:31065378
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评论 | 本文探讨了感染性疾病在终末期肾病患者中的风险以及其与单基因病因之间的关系 | 结合全外显子测序和新技术，研究不同单基因原因的慢性肾病/终末期肾病的分子机制 | 这并不是文献的系统综述，观点受到作者个人看法的影响 | 深入了解感染过程与终末期肾病之间的相互作用，帮助开发靶向治疗策略 | 重点研究单基因病因引起的终末期肾病患者的感染性并发症 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 全外显子测序（WES）、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 文献综述 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-05 |
scRNA-Seq reveals distinct stem cell populations that drive hair cell regeneration after loss of Fgf and Notch signaling
2019-01-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.44431
PMID:30681411
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研究论文 | 该文章通过scRNA-Seq研究支持细胞如何驱动毛细胞再生 | 揭示了五种不同的支持细胞类型及其在毛细胞分化中的基因调控网络 | 缺乏对哺乳动物毛细胞再生过程中的具体因素的详细探讨 | 研究支持细胞向毛细胞分化的机制 | 斑马鱼的毛细胞及其支持细胞 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-05 |
Dermal Condensate Niche Fate Specification Occurs Prior to Formation and Is Placode Progenitor Dependent
2019-01-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.034
PMID:30595537
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研究论文 | 本文揭示了皮肤凝聚物前体的命运规范在形成之前发生，并且依赖于皮肤板的前体 | 研究确定了皮肤凝聚物的未聚集前体及其分子时序，为皮肤发育提供了新的见解 | 对细胞命运转变具体时序的理解仍然不够全面，可能需要进一步研究y | 研究皮肤凝聚物前体的命运规范及其发育轨迹 | 本文研究了皮肤凝聚物前体及其在发育过程中的角色 | 数字病理学 | NA | 3D和4D显微镜观察，单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis Reveals a Hair Follicle Dermal Niche Molecular Differentiation Trajectory that Begins Prior to Morphogenesis
2019-01-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.032
PMID:30595533
|
研究论文 | 本文描述了在毛囊发育和再生过程中，毛囊真皮细胞的分子分化轨迹 | 文章通过单细胞RNA测序和体内方法揭示了毛囊真皮细胞在形态发生之前的转录状态序列 | 由于缺乏对没有组织学差异的细胞的定量分子区别的理解，分子和细胞事件的描绘仍然具有挑战性 | 研究毛囊发育过程中的细胞和分子事件 | 关注毛囊真皮凝聚体细胞的转录状态变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-05 |
Neurog3-Independent Methylation Is the Earliest Detectable Mark Distinguishing Pancreatic Progenitor Identity
2019-01-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.11.048
PMID:30620902
|
研究论文 | 本文展示了Neurog3独立的甲基化是区分胰腺祖细胞身份的最早可检测标志 | 通过单细胞RNA-seq和轨迹分析，揭示了Myt1与Neurog3的共表达在胰腺细胞命运选择中的作用 | 研究中甲基化状态的变化与能否定义的亚群体之间的关系尚不明确 | 探讨Neurog3细胞在胰腺发育中的细胞命运选择机制 | 胰腺内的Neurog3表达祖细胞及其甲基化状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq，轨迹分析 | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-05 |
Quantitative Clonal Analysis and Single-Cell Transcriptomics Reveal Division Kinetics, Hierarchy, and Fate of Oral Epithelial Progenitor Cells
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.015
PMID:30472156
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研究论文 | 本文探讨了口腔上皮祖细胞的分裂动力学、层级和命运 | 通过定量克隆分析和单细胞转录组学，揭示了口腔上皮祖细胞的独特分裂特性和细胞组织模型 | 没有提供具体的临床数据支持研究结果 | 了解口腔上皮祖细胞在稳态和疾病中的角色 | 口腔上皮祖细胞（OEPCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq denoising using a deep count autoencoder
2019-01-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-07931-2
PMID:30674886
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研究论文 | 本文提出了一种深度计数自编码器网络用于单细胞RNA测序数据的去噪 | 引入了一种考虑计数分布、过度离散和稀疏性的深度计数自编码器网络，使用负二项噪声模型处理数据 | 本文未提及具体的局限性 | 开发一种可扩展的方法来对单细胞RNA测序数据进行去噪 | 单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | NA | 深度学习 | 深度计数自编码器 | RNA测序数据 | 数百万个细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-05 |
Single-Cell Allele-Specific Gene Expression Analysis
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9057-3_11
PMID:30758826
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于单细胞等位基因表达分析的生物信息学框架SCALE | SCALE框架能够在考虑技术偏差等因素的情况下，估计全基因组的等位基因爆发动力学 | 没有提到具体的局限性 | 研究等位基因在单细胞RNA测序中的表达特征 | 小鼠胚泡单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-Seq analysis identifies a putative epithelial stem cell population in human primary prostate cells in monolayer and organoid culture conditions
2019, American journal of clinical and experimental urology
IF:1.5Q3
PMID:31317052
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了在单层和类器官培养条件下的人类原代前列腺上皮细胞中的细胞群体 | 首次在单层和类器官培养条件下识别出一种潜在的上皮干细胞群体，并验证了其在不同培养条件下的存在 | 研究仅限于从同一患者获取的样本，且样本数量有限 | 旨在通过单细胞RNA测序技术识别和比较单层和类器官培养条件下的人类原代前列腺上皮细胞中的细胞群体 | 人类原代前列腺上皮细胞在单层和类器官培养条件下的细胞群体 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 从同一患者获取的样本，以及来自5名额外患者的前列腺上皮样本 | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-07 |
A conditionally immortalized Gli1-positive kidney mesenchymal cell line models myofibroblast transition
2019-01-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00460.2018
PMID:30303712
|
研究论文 | 本文通过遗传策略成功分离并培养了表达Gli1的肾间充质细胞系KGli1，该细胞系能够模拟肌成纤维细胞的转化过程 | 开发了一种新的条件性永生化Gli1阳性肾间充质细胞系，为研究健康和疾病中的间充质干细胞样前体细胞提供了新工具 | NA | 研究Gli1阳性肌成纤维细胞前体的激活机制 | Gli1阳性肾间充质细胞及其在肌成纤维细胞转化中的作用 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-07 |
Analysis of Single-Cell Gene Pair Coexpression Landscapes by Stochastic Kinetic Modeling Reveals Gene-Pair Interactions in Development
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.01387
PMID:32082359
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于随机基因表达和相互作用动力学生物物理模型的单细胞基因对共表达模式分析方法 | 开发了一种高通量计算方法来模拟基因对共表达景观，并构建了一个低维的“形状空间”来描述不同的共表达模式类型 | 将随机基因网络模型与单细胞数据整合仍然具有挑战性 | 揭示基因对在胚胎发育过程中的复杂共表达动态 | 单细胞基因对共表达模式及其在胚胎发育中的动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机数学模型 | 基因表达数据 | 数万个基因-基因相互作用模型 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of estrogen- and endocrine-disrupting chemical-induced reorganization of mouse mammary gland
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0618-9
PMID:31701034
|
研究论文 | 本研究使用手术绝经（卵巢切除）小鼠模型，分析了17β-雌二醇（E2）和多溴联苯醚（PBDEs）对乳腺组织的影响，并通过单细胞RNA测序（scRNAseq）揭示了E2和PBDEs对乳腺细胞基因表达的调控作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了E2和PBDEs对乳腺细胞基因表达的调控作用，并发现了PBDEs促进E2-AREG-EGFR-M2巨噬细胞途径 | NA | 探究绝经后雌激素和内分泌干扰化学物质对小鼠乳腺组织的重组影响 | 小鼠乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 手术绝经（卵巢切除）小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-07 |
Single T Cell Sequencing Demonstrates the Functional Role of αβ TCR Pairing in Cell Lineage and Antigen Specificity
2019, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2019.01516
PMID:31417541
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析了近10万个独特的CD4和CD8 T细胞的配对TCR序列，探讨了αβ配对在T细胞谱系和抗原特异性中的功能作用 | 首次在谱系水平上分析了αβ TCR配对对T细胞功能的影响，并利用信息论和机器学习工具展示了αβ配对在TCR-MHC相互作用中的协同作用 | NA | 探讨αβ TCR配对在T细胞谱系和抗原特异性中的功能作用 | 近10万个独特的CD4和CD8 T细胞的配对TCR序列 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | 机器学习 | 序列数据 | 近10万个独特的CD4和CD8 T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Visceral Adipose Tissue Leukocytes Reveals that Caloric Restriction Following Obesity Promotes the Accumulation of a Distinct Macrophage Population with Features of Phagocytic Cells
2019, Immunometabolism
DOI:10.20900/immunometab20190008
PMID:31396408
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析内脏脂肪组织中的白细胞，探讨肥胖后热量限制对特定巨噬细胞亚群积累的影响 | 首次揭示了肥胖后热量限制促进具有吞噬细胞特征的特定巨噬细胞亚群的积累 | 研究仅限于短期2周的热量限制效果，长期影响需进一步研究 | 探究肥胖及随后热量限制对内脏脂肪组织中白细胞亚群的影响 | 内脏脂肪组织中的白细胞，特别是巨噬细胞 | 数字病理学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及15种白细胞亚群的转录变化 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-07 |
CRISPR Screening in Single Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_23
PMID:31028650
|
研究论文 | 本文描述了在单细胞水平上使用CRISPR筛选技术的当前协议 | 结合单细胞RNA测序和CRISPR技术，可以高效地研究任意数量的基因 | 研究受限于测序能力 | 探索在单细胞水平上使用CRISPR筛选技术的方法 | 单细胞中的基因 | 基因编辑 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 任意数量的基因，受限于测序能力 | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-07 |
IL22 Inhibits Epithelial Stem Cell Expansion in an Ileal Organoid Model
2019, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2018.06.008
PMID:30364840
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研究论文 | 本文研究了白细胞介素22（IL22）在回肠类器官模型中对上皮干细胞扩张的影响。 | 首次探讨了IL22对肠道干细胞（ISCs）及其介导的组织修复的影响。 | 研究主要基于小鼠回肠类器官模型，可能与人类疾病存在差异。 | 探讨IL22在克罗恩病中对肠道干细胞的影响及其机制。 | 回肠类器官、肠道干细胞（ISCs）和过渡放大（TA）前体细胞。 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 定量逆转录聚合酶链反应、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 类器官、单细胞 | 使用小鼠回肠类器官和IL22转基因小鼠进行实验。 | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-08 |
Scavenger: A pipeline for recovery of unaligned reads utilising similarity with aligned reads
2019, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.19426.2
PMID:32913631
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Scavenger的生物信息学管道，用于利用对齐读取与未对齐读取之间的序列相似性来恢复未对齐的读取 | Scavenger采用了一种新颖的机制，通过序列相似性发现潜在的对齐位置来恢复未对齐的读取 | 尽管恢复的读取数量相对于总读取数量较少，但这些恢复的读取对下游分析（尤其是低表达基因的表达和差异表达估计）有影响 | 解决RNA-seq分析中的假阴性非对齐问题，提高对齐工具的映射敏感性 | 模拟和真实RNA-seq数据集，包括单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 序列数据 | 包括模拟和真实的RNA-seq数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-09 |
Prediction of cell position using single-cell transcriptomic data: an iterative procedure
2019, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.20715.2
PMID:32399185
|
研究论文 | 本文介绍了一种利用单细胞转录组数据预测细胞位置的迭代方法 | 通过结合单细胞转录组数据和基因参考图谱，提出了一种迭代方法来预测单个细胞的位置并重建数千个基因的空间表达谱 | NA | 开发新的算法以预测细胞位置和重建基因的空间表达谱 | 单细胞转录组数据和基因参考图谱 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 迭代方法 | 转录组数据 | 小部分基因的参考图谱 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-09 |
A new view of the mammary epithelial hierarchy and its implications for breast cancer initiation and metastasis
2019, Journal of cancer metastasis and treatment
IF:1.4Q4
DOI:10.20517/2394-4722.2019.24
PMID:32395618
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对乳腺上皮细胞的分化层次进行了深入研究，揭示了乳腺上皮细胞层次的新模型及其对乳腺癌发生和转移的影响 | 利用单细胞RNA测序技术，揭示了乳腺上皮细胞层次的新模型，打破了传统上对干细胞、祖细胞和分化细胞之间严格界限的认识 | NA | 研究乳腺上皮细胞的分化层次及其对乳腺癌发生和转移的影响 | 乳腺上皮干细胞及其下游祖细胞的分化层次 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |