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当前共找到 172 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-05 |
Building and Regenerating the Lung Cell by Cell
2019-01-01, Physiological reviews
IF:29.9Q1
DOI:10.1152/physrev.00001.2018
PMID:30427276
|
综述 | 本文综述了哺乳动物肺的细胞多样性和发育机制，探讨了单细胞RNA测序和高分辨率成像在揭示肺细胞异质性和基因表达中的作用 | 整合了最新的单细胞RNA测序数据和高分辨率成像技术，以揭示肺细胞类型的显著异质性和发育过程中的细胞选择性基因表达 | NA | 理解肺的细胞和分子机制，以揭示急性及慢性肺疾病的发病机制 | 哺乳动物肺的细胞类型和发育过程 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序，高分辨率成像 | NA | RNA测序数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-04 |
Insights from deconvolution of cell subtype proportions enhance the interpretation of functional genomic data
2019, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0215987
PMID:31022271
|
研究论文 | 本研究探讨了如何通过解卷积细胞亚型比例从功能基因组学数据中获取与表型相关的细胞变化信息 | 展示了细胞亚型比例变化对功能基因组学特性的贡献可能是疾病特异性的，并利用单细胞RNA-seq参考数据集成功估算了缺乏纯化样本参考数据的组织（如小鼠肾脏）中的细胞亚型比例 | 研究仅聚焦于人类血液和小鼠肾脏两种混合细胞群体，且对于大多数缺乏参考数据集的组织，细胞类型预测方法尚不成熟 | 增强功能基因组学数据的解释，通过分析细胞亚型比例变化来理解其与表型的关联 | 人类血液和小鼠肾脏组织样本 | 功能基因组学 | 哮喘和系统性红斑狼疮 | 解卷积分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达和DNA甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-02-28 |
A conditionally immortalized Gli1-positive kidney mesenchymal cell line models myofibroblast transition
2019-01-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00460.2018
PMID:30303712
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研究论文 | 本研究通过遗传策略分离出一种条件性永生的Gli1阳性肾脏间充质细胞系（KGli1），用于模拟肌成纤维细胞转化过程 | 开发了首个能够维持间充质干细胞样特性、响应hedgehog通路激活并展示TGF-β诱导肌成纤维细胞分化的Gli1阳性肾脏细胞系 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证仍需进一步实验 | 研究肾脏纤维化中Gli1阳性间充质干细胞样细胞向肌成纤维细胞转化的机制 | 条件性永生的Gli1阳性肾脏间充质细胞系（KGli1） | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2025-10-06 |
Transcriptional Heterogeneity in Naive and Primed Human Pluripotent Stem Cells at Single-Cell Resolution
2019-01-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.12.099
PMID:30673604
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类初始态和始发态多能干细胞在转录水平的异质性 | 首次在单细胞分辨率下揭示人类初始态多能干细胞中存在具有始发态特征的中间亚群，并发现跨物种保守的多能性调控轴 | 未深入验证已识别标记基因的功能机制 | 解析人类初始态和始发态多能干细胞的转录组特征差异 | 人类初始态和始发态多能干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2025-10-06 |
The Emergence and Functional Fitness of Memory CD4+ T Cells Require the Transcription Factor Thpok
2019-01-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.12.019
PMID:30638736
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了转录因子Thpok在记忆CD4+ T细胞生成和功能适应性中的关键作用 | 首次发现Thpok转录因子通过拮抗Blimp1和Runx3表达来保护记忆细胞免于功能失调，连接了记忆细胞分化和功能适应性这两个先前未关联的免疫属性 | 研究主要关注急性病毒感染模型，在慢性感染或其他疾病背景下的适用性需要进一步验证 | 阐明控制记忆CD4+ T细胞从早期抗原应答细胞中产生的转录调控机制 | 病毒特异性CD4+ T细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing of iPSC-Dopamine Neurons Reconstructs Disease Progression and Identifies HDAC4 as a Regulator of Parkinson Cell Phenotypes
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.10.023
PMID:30503143
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研究论文 | 通过单细胞测序分析iPSC来源的多巴胺神经元，重建帕金森病进展过程并发现HDAC4是疾病表型的关键调控因子 | 利用单细胞转录组分析揭示帕金森病进展的基因表达轴，首次发现HDAC4在疾病进程中的上游调控作用 | 研究仅针对GBA-N370S PD风险变异的iPSC衍生神经元，未涵盖其他帕金森病遗传变异类型 | 解析帕金森病进展机制并识别潜在治疗靶点 | 携带GBA-N370S PD风险变异的iPSC来源多巴胺神经元 | 单细胞组学 | 帕金森病 | 单细胞转录组测序 | 假时间分析 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-10-06 |
Identification of Embryonic Neural Plate Border Stem Cells and Their Generation by Direct Reprogramming from Adult Human Blood Cells
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.11.015
PMID:30581079
|
研究论文 | 通过直接重编程将成体人类血细胞转化为诱导神经板边界干细胞，并鉴定其胚胎起源 | 首次实现从成体人类血细胞直接重编程获得神经板边界干细胞，并确定其起源于胚胎前脑后脑区域 | 研究主要基于体外实验，尚未进行体内功能验证 | 探索神经板边界干细胞的起源及其在再生医学中的应用潜力 | 人类成纤维细胞、血细胞、小鼠胚胎神经褶、人多能干细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 直接重编程, 基因编辑 | NA | 基因表达数据 | 人类成纤维细胞和血细胞，E8.5小鼠胚胎神经褶 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis of CD8 + T-cell memory inflation
2019, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.15115.1
PMID:31448339
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究持续病毒感染诱导的CD8+T细胞记忆膨胀现象 | 首次在脾脏和肠道不同部位对记忆膨胀T细胞进行单细胞转录组比较分析，定义了区分脾脏记忆膨胀与肠道组织驻留记忆T细胞的基因表达模块 | 研究仅限于MCMV感染模型，未验证其他持续病毒感染情况 | 阐明持续病毒感染和疫苗诱导的CD8+T细胞记忆膨胀的转录调控机制 | MCMV感染小鼠的病毒特异性CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，四聚体分选 | NA | 单细胞转录组数据 | MCMV感染小鼠的脾脏和肠道上皮内淋巴细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2025-10-06 |
Trans-ethnic association study of blood pressure determinants in over 750,000 individuals
2019-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-018-0303-9
PMID:30578418
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研究论文 | 一项跨种族多组学研究，通过大规模基因组关联分析重新阐释血压的遗传结构 | 发现208个新的常见血压SNPs和53个罕见变异，在45个组织中检测到4,043个血压关联，并通过小鼠肾脏单细胞RNA测序识别肾小管细胞中上调的血压基因 | NA | 识别血压稳态相关的基因、组织、表型组和药物背景 | 来自百万退伍军人计划(MVP)和合作研究的776,078名参与者 | 基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 转录组关联研究(TWAS), 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床表型数据 | 最多776,078名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析, 转录组关联分析 | NA | NA |
| 10 | 2025-10-06 |
Cell Type- and Sex-Dependent Transcriptome Profiles of Rat Anterior Pituitary Cells
2019, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2019.00623
PMID:31620083
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了大鼠垂体前叶细胞的细胞类型和性别依赖性转录组特征 | 首次在大鼠垂体前叶细胞中揭示了细胞类型特异性和性别依赖性的转录组特征，发现了许多新的遗传标记 | 研究仅针对青春期后大鼠，未涵盖其他发育阶段 | 探究垂体前叶不同细胞类型的转录组特征及其性别差异 | 大鼠垂体前叶细胞 | 单细胞生物学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫细胞化学 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过6,800个新鲜分散的垂体前叶细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape in mammary epithelium reveals bipotent-like cells associated with breast cancer risk and outcome
2019, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-019-0554-8
PMID:31428694
|
研究论文 | 通过无标记算法分析人类乳腺上皮单细胞RNA测序数据，发现与乳腺癌风险和预后相关的双能干细胞样状态 | 开发无标记计算框架识别乳腺上皮中的新型双能干细胞样状态，解决了单细胞数据高丢失率导致的干细胞识别难题 | 未明确说明样本规模和具体技术平台的详细信息 | 识别人类乳腺上皮中的干细胞样状态及其与乳腺癌的关联 | 人类乳腺上皮细胞 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | scRNA-Seq, FACS | 无标记算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2025-10-06 |
Spatially resolved transcriptomics reveals plant host responses to pathogens
2019, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-019-0498-5
PMID:31624491
|
研究论文 | 开发了一种名为GaST-seq的低成本空间转录组学方法，用于研究植物组织对病原体的空间响应 | 提出了GaST-seq这一新型空间转录组学工作流程，成本仅为现有测序方法的一小部分，能够同时获取宿主和病原体的空间转录组 | 植物模型系统的适用性仍具挑战性，现有转录组学方法稀疏可用 | 研究植物宿主对病原体的空间响应机制 | 拟南芥叶片及其对细菌分子flagellin-22和真核病原体Albugo laibachii感染的响应 | 空间转录组学 | 植物病害 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | Illumina | 空间转录组学 | Illumina TruSeq | GaST-seq（网格辅助空间转录组测序）工作流程 |
| 13 | 2025-10-06 |
Seq-Well: A Sample-Efficient, Portable Picowell Platform for Massively Parallel Single-Cell RNA Sequencing
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_8
PMID:31028635
|
研究论文 | 介绍Seq-Well这一低成本、便携式皮孔平台，用于大规模并行单细胞RNA测序 | 开发了一种简单便携的皮孔平台，能够从多样化的低输入临床样本中同时分析数千个细胞的转录组 | NA | 开发一种高效、低成本的单细胞RNA测序平台 | 单细胞转录组 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 数千个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | Seq-Well | 使用带有独特条形码的mRNA捕获珠和细胞共限制在皮孔中，通过半透膜密封实现高效细胞裂解和mRNA捕获 |
| 14 | 2025-10-06 |
Genomic encoding of transcriptional burst kinetics
2019-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0836-1
PMID:30602787
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研究论文 | 本研究通过等位基因敏感的单细胞RNA测序揭示了哺乳动物基因转录爆发动力学的基因组编码机制 | 首次在转录组范围内量化内源性基因的爆发频率和大小，发现增强子主要控制爆发频率而核心启动子控制爆发大小的新机制 | 研究主要基于小鼠和人类基因，可能需要在其他物种中验证；单细胞RNA测序技术本身存在技术噪音 | 探究顺式调控序列如何编码转录爆发动力学 | 小鼠和人类内源性基因 | 基因组学 | NA | 等位基因敏感的单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Microglia throughout the Mouse Lifespan and in the Injured Brain Reveals Complex Cell-State Changes
2019-01-15, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2018.11.004
PMID:30471926
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠生命周期和脑损伤中的小胶质细胞状态变化 | 首次系统揭示小胶质细胞在整个生命周期和脑损伤条件下存在至少9种转录组学不同状态 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探索小胶质细胞在不同生理和病理状态下的分子和功能特征 | 小鼠小胶质细胞 | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过76,000个小胶质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Metabolic regulation of pluripotency and germ cell fate through α-ketoglutarate
2019-01-03, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201899518
PMID:30257965
|
研究论文 | 本研究探讨了α-酮戊二酸通过代谢调控在多能性维持和生殖细胞命运决定中的功能机制 | 揭示了线粒体三羧酸循环活性通过IDH2介导的α-酮戊二酸产生调控表观遗传机制的新途径 | 研究基于小鼠早期胚胎发育模型，在人类系统中的适用性需要进一步验证 | 探索代谢与细胞身份决定之间的分子联系机制 | 小鼠早期胚胎发育过程中的幼稚多能性细胞和原始生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 统计建模, 能量代谢调控 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-10-07 |
Topological Methods for Visualization and Analysis of High Dimensional Single-Cell RNA Sequencing Data
2019, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:30963074
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研究论文 | 应用拓扑数据分析方法Mapper可视化单细胞RNA测序数据，同时捕捉细胞聚类结构和连续基因表达拓扑 | 将拓扑数据分析与基因共表达网络分析相结合，在可视化中揭示基因共表达模块的差异表达模式 | NA | 开发能够保留单细胞RNA测序数据内在连续结构的可视化方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Mapper（拓扑数据分析方法） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-07 |
Parameter tuning is a key part of dimensionality reduction via deep variational autoencoders for single cell RNA transcriptomics
2019, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:30963075
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研究论文 | 本文评估了深度变分自编码器在单细胞RNA测序数据降维中的参数调优重要性 | 揭示了参数调优对变分自编码器性能的关键影响，发现未经调优的模型性能可能显著低于传统方法 | 研究基于模拟数据，可能无法完全反映真实scRNA-seq数据的复杂性 | 评估变分自编码器在单细胞RNA测序数据降维中的性能表现 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | 模拟数据集，包含数千至数万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the progression of human osteoarthritis
2019-01, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2017-212863
PMID:30026257
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示人类骨关节炎的软骨细胞分子程序和谱系进展模式 | 识别了人类OA软骨中七种分子定义的软骨细胞群体，包括三种新表型；发现了增殖性软骨细胞、前肥大软骨细胞和肥大软骨细胞之间的潜在转变；定义了软骨祖细胞的新标志物 | 样本仅来自10名接受膝关节置换手术的OA患者，样本量相对有限 | 理解人类软骨退化和再生的分子机制，改进骨关节炎治疗策略 | 人类骨关节炎患者的软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 计算分析 | 单细胞转录组数据 | 10名患者中的1464个软骨细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2024-08-07 |
More than one antibody of individual B cells revealed by single-cell immune profiling
2019, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-019-0137-3
PMID:31839985
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研究论文 | 本研究通过单细胞免疫图谱技术，揭示了个体B细胞中存在多种抗体的可能性 | 发现了单个B细胞中存在多种Ig特异性的现象，挑战了传统的“一个细胞一个抗体”规则和CSR机制 | NA | 验证和定义单细胞转录组水平上的经典免疫学概念 | B细胞及其产生的抗体 | 免疫学 | NA | Chromium单细胞免疫图谱技术和Sanger测序 | NA | 转录组 | 数百至数千个单个B细胞 | NA | NA | NA | NA |