单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-09	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Novel Markers of Male Pituitary Stem Cells and Hormone-Producing Cell Types 2018-12-01, Endocrinology IF:3.8Q2 DOI:10.1210/en.2018-00750 PMID:30335147	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术研究了雄性小鼠垂体中的干细胞和激素产生细胞类型，并鉴定了新的标记基因	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了垂体中干细胞和激素产生细胞的新标记基因，并通过体内验证展示了其应用价值	文章指出，由于转录组注释不完整，某些仅生成3'转录本末端序列的单细胞RNA测序平台可能会产生假阴性结果	研究垂体中干细胞和激素产生细胞的调控机制及其标记基因	7周龄C57BL/6雄性小鼠的垂体细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNAseq）	NA	转录组数据	约13,663个细胞，来自6个完整的垂体腺
42	2024-08-09	Effective Soil Extraction Method for Cultivating Previously Uncultured Soil Bacteria 2018-12-15, Applied and environmental microbiology IF:3.9Q2 DOI:10.1128/AEM.01145-18 PMID:30291118	研究论文	本文介绍了一种基于新土壤提取物（NSE）的新型培养基——密集土壤提取培养基（ISEM），使用80%甲醇，用于高效分离先前未培养的细菌和新分类候选菌株	开发了一种新型培养基ISEM，能够分离出49%的先前未培养细菌和55%的新分类候选菌株	在维持纯培养物通过传代培养方面仍存在困难	通过发现新的表型、生理和功能特性以及未知基因的作用，扩展对先前未培养细菌的知识	先前未培养的土壤细菌	NA	NA	元基因组学和单细胞测序	NA	NA	总共检测了258个分离物
43	2024-08-09	The adult human testis transcriptional cell atlas 2018-12, Cell research IF:28.1Q1 DOI:10.1038/s41422-018-0099-2 PMID:30315278	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析了约6500个年轻成人睾丸细胞，揭示了成人睾丸转录细胞图谱及其在精子发生中的作用	发现了五种微环境/体细胞类型，重建了精子发生的计算模型，并识别出五个离散的转录/发育精子干细胞状态，包括一个新的早期精子干细胞状态	NA	研究成人精子发生的平衡机制及其与微环境的相互作用	成人睾丸细胞及其在精子发生中的转录和表观遗传特征	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	计算模型	转录组数据	约6500个睾丸细胞
44	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing reveals diverse intratumoral heterogeneities and gene signatures of two types of esophageal cancers 2018-12-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2018.09.017 PMID:30223068	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了368个来自三种食管鳞状细胞癌（ESCC）和两种食管腺癌（EAC）的单细胞，揭示了这两种癌症在细胞转录组层面的差异和肿瘤内细胞异质性	首次通过单细胞RNA测序技术详细区分了ESCC和EAC的细胞类型和状态，并发现了NOTCH信号通路在ESCC中的特异性激活	NA	揭示食管鳞状细胞癌和食管腺癌的细胞转录组差异及其对治疗策略的影响	食管鳞状细胞癌（ESCC）和食管腺癌（EAC）的单细胞	数字病理学	食管癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	368个单细胞
45	2024-08-09	Dissecting LncRNA Roles in Renal Cell Carcinoma Metastasis and Characterizing Genomic Heterogeneity by Single-Cell RNA-seq 2018-12, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2 DOI:10.1158/1541-7786.MCR-17-0776 PMID:30082482	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序分析了肾细胞癌及其转移样本中的长非编码RNA（lncRNA）表达谱，揭示了lncRNA在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）转移中的作用及其功能。	首次详细分析了lncRNA在ccRCC转移中的作用，并发现了与ccRCC转移相关的lncRNA（CMAL），这些lncRNA参与细胞粘附、免疫反应和细胞增殖。	研究主要集中在lncRNA的表达和功能分析上，尚未进行临床验证和治疗应用的实验。	探索lncRNA在肾细胞癌转移中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力。	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）及其转移样本中的lncRNA。	数字病理学	肾细胞癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	分析了来自原发性肾细胞癌和配对转移性肾细胞癌样本的单细胞RNA测序数据，涉及超过10,000个基因和1,874个lncRNA。
46	2024-08-09	Advancing insights into stem cell niche complexities with next-generation technologies 2018-12, Current opinion in cell biology IF:6.0Q1 DOI:10.1016/j.ceb.2018.06.012 PMID:30031324	综述	本文综述了利用下一代技术，如单细胞转录组分析、3D体外培养和4D体内显微镜技术，对成体组织特异性干细胞及其微环境的复杂相互作用的理解进展	利用先进的单细胞转录组分析、3D体外培养和4D体内显微镜技术，深入研究干细胞与其微环境的复杂相互作用	NA	探讨干细胞与其微环境的复杂相互作用，以更好地理解干细胞在组织维持和再生中的作用	成体组织特异性干细胞及其微环境	NA	NA	单细胞转录组分析, 3D体外培养, 4D体内显微镜	NA	转录组数据, 显微图像	NA
47	2024-08-09	iS-CellR: a user-friendly tool for analyzing and visualizing single-cell RNA sequencing data 2018-12-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/bty517 PMID:29982379	研究论文	iS-CellR是一个基于网络的Shiny应用程序，旨在为用户提供友好的单细胞RNA测序数据综合分析平台	iS-CellR通过提供一个易于访问的图形用户界面，使用户无需编程技能即可进行复杂的单细胞RNA测序分析	NA	开发一个用户友好的工具，用于分析和可视化单细胞RNA测序数据	单细胞RNA测序数据	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	Shiny应用程序	数据	NA
48	2024-08-09	Detection of HPV E7 Transcription at Single-Cell Resolution in Epidermis 2018-12, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2018.06.169 PMID:29964033	研究论文	本研究使用单细胞RNA测序技术检测了表达HPV16 E7基因的小鼠角质形成细胞中HPV16-E7 mRNA的表达	本研究首次在单细胞水平上敏感且特异性地检测到HPV16-E7 mRNA，并发现E7 mRNA拷贝数与E7诱导基因表达增加相关	NA	探讨HPV感染与鳞状细胞癌发展之间的可能联系	表达HPV16 E7基因的小鼠角质形成细胞	数字病理学	鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA	表达HPV16 E7基因的小鼠角质形成细胞
49	2024-08-09	Ontogeny and Biology of Human Small Airway Epithelial Club Cells 2018-12-01, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1 DOI:10.1164/rccm.201710-2107OC PMID:29874100	研究论文	研究人类小气道上皮杯状细胞的发育和生物学特性	揭示了人类杯状细胞的分子表型和生物学功能，并识别出基底细胞作为杯状细胞的前体细胞	NA	定义人类小气道上皮杯状细胞的发育和生物学特性	人类小气道上皮杯状细胞	NA	NA	单细胞转录组分析	NA	单细胞转录组数据	从正常人肺中通过支气管镜和刷取样的小气道上皮细胞