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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2024-08-09 |
Kinetics of adult hematopoietic stem cell differentiation in vivo
2018-11-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20180136
PMID:30291161
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研究论文 | 本文通过结合诱导性谱系追踪、流式细胞术和单细胞RNA测序技术,研究了成年造血干细胞在体内的分化动力学 | 揭示了成年造血干细胞在体内快速分化为主要造血谱系和细胞类型的基本动力学差异 | NA | 研究成年造血干细胞在体内的分化动力学 | 成年造血干细胞的分化过程 | NA | NA | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 主要包含长期和一些短期造血干细胞 |
62 | 2024-08-09 |
Type 2 innate lymphoid cells in the induction and resolution of tissue inflammation
2018-11, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.12702
PMID:30294962
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综述 | 本文综述了2型先天淋巴细胞(ILC2s)在组织炎症诱导和消退中的作用及其调控机制 | 探讨了ILC2的激活调控机制,包括转录因子和代谢途径,以及外部信号如细胞因子、脂质介质、激素和神经肽的影响 | NA | 理解调控ILC2多样性和功能的组织特异性途径,以开发针对过敏性疾病的潜在疗法 | 2型先天淋巴细胞(ILC2s)及其在组织炎症中的作用 | NA | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
63 | 2024-08-09 |
The deployment of cell lineages that form the mammalian heart
2018-11, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-018-0086-9
PMID:30266935
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综述 | 本文综述了哺乳动物心脏形成过程中不同心脏细胞类型的起源及其谱系关系 | 近年来单细胞转录组学结果开始揭示细胞异质性和早期发育轨迹 | 遗传追踪实验与克隆分析相比需要谨慎,将单细胞转录组学信息与细胞在体内的位置及其谱系历史相对应是一个当前挑战 | 探讨心脏细胞类型的多样性起源及其谱系关系,以理解先天性心脏畸形的起源并为再生医学中产生心脏组织提供基础 | 哺乳动物心脏形成过程中的心脏细胞类型及其谱系关系 | NA | 先天性心脏畸形 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
64 | 2024-08-09 |
Generation of Functional Hepatocytes from Human Adipose-Derived MYC+ KLF4+ GMNN+ Stem Cells Analyzed by Single-Cell RNA-Seq Profiling
2018-11, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/sctm.17-0273
PMID:30272835
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研究论文 | 本文描述了一种新型的人类脂肪组织来源的间充质干细胞(MSCs),并通过单细胞RNA测序分析将其诱导为功能性肝细胞 | 发现了一种新型的人类脂肪组织来源的间充质干细胞(M-ADSCs),具有表观遗传多能性,并能被有效诱导为肝细胞样细胞 | NA | 研究细胞移植在终末期肝病中的应用,并探索新型间充质干细胞的诱导机制 | 人类脂肪组织来源的间充质干细胞及其诱导为肝细胞的过程 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
65 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic transcriptome profiling in human early neural differentiation
2018-11-01, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giy117
PMID:30239706
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了人类早期神经分化过程中动态的转录组特征 | 本研究首次识别了在神经分化各阶段对中枢神经系统谱系承诺贡献最大的亚群,并鉴定了潜在的新型转录因子 | NA | 探究神经谱系中细胞命运决定和亚群特化的调控网络 | 人类早期神经分化过程中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六个连续的重编程和神经分化时间点的单细胞 |
66 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics reveals distinct inflammation-induced microglia signatures
2018-11, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.201846171
PMID:30206190
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序和多色流式细胞术,全面分析了脂多糖(LPS)注射小鼠大脑中微胶质细胞的转录组特征 | 本文首次揭示了在炎症条件下微胶质细胞的独特激活特征,这些特征与神经退行性疾病相关的特征有显著差异 | NA | 研究微胶质细胞在神经炎症过程中的作用及其在中枢神经系统疾病中的潜在应用 | 微胶质细胞在脂多糖注射小鼠大脑中的转录组特征 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 脂多糖注射的小鼠大脑样本 |
67 | 2024-08-09 |
Co-expression in Single-Cell Analysis: Saving Grace or Original Sin?
2018-11, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2018.07.007
PMID:30146183
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评论 | 本文讨论了单细胞RNA测序数据中细胞类型特异性基因共表达的可重复性及其对解释细胞类型特异性基因表达的影响 | NA | NA | 探讨单细胞RNA测序数据中细胞类型特异性基因共表达的可重复性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型特异性基因共表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
68 | 2024-08-09 |
CellBIC: bimodality-based top-down clustering of single-cell RNA sequencing data reveals hierarchical structure of the cell type
2018-11-30, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky698
PMID:30102368
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研究论文 | 本文开发了CellBIC算法,用于基于基因表达分布的双峰性对单细胞RNA测序数据进行自上而下的层次聚类 | CellBIC算法在保持细胞层次结构的同时,优于传统的自下而上层次聚类方法和其他近期开发的聚类算法 | NA | 开发新的聚类算法以更好地识别单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
69 | 2024-08-09 |
Histone Variant H2A.Z Is Required for the Maintenance of Smooth Muscle Cell Identity as Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2018-11-13, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了组蛋白变体H2A.Z在维持血管平滑肌细胞身份中的关键作用 | 首次揭示了H2A.Z在控制血管疾病中细胞身份的作用,并提出了其作为干预节点的潜力 | NA | 探索组蛋白变体在血管疾病中控制细胞身份的作用 | 人类动脉中的血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及疾病和正常的人类血管组织样本 |
70 | 2024-08-09 |
T Cell-Dependent Affinity Maturation and Innate Immune Pathways Differentially Drive Autoreactive B Cell Responses in Rheumatoid Arthritis
2018-11, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.40578
PMID:29855173
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研究论文 | 本研究探讨了类风湿性关节炎(RA)中抗瓜氨酸蛋白抗体(ACPA)和类风湿因子(RF)阳性B细胞通过不同分子机制打破耐受性的情况 | 通过单细胞RNA测序分析了ACPA+和RF+ B细胞的免疫球蛋白谱和转录程序,发现这两种B细胞具有不同的转录调控网络 | NA | 研究ACPA+和RF+ B细胞在类风湿性关节炎中打破耐受性的分子机制 | ACPA+和RF+ B细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 2,349个B细胞来自6名RA患者和1名健康供体 |
71 | 2024-08-09 |
Localization of migraine susceptibility genes in human brain by single-cell RNA sequencing
2018-11, Cephalalgia : an international journal of headache
IF:5.0Q1
DOI:10.1177/0333102418762476
PMID:29498289
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,定位了人类大脑中与偏头痛易感基因表达相关的特定细胞类型 | 首次通过单细胞转录组学技术,确定了特定大脑细胞类型中偏头痛易感基因的表达富集 | NA | 理解偏头痛易感基因在人类大脑特定细胞类型中的表达 | 偏头痛易感基因在人类大脑中的表达情况 | 数字病理学 | 偏头痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 2,039个单独的人类大脑细胞 |
72 | 2024-08-09 |
SEGtool: a specifically expressed gene detection tool and applications in human tissue and single-cell sequencing data
2018-11-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbx074
PMID:28981576
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEGtool的工具,用于从RNA测序数据中自动和自适应地检测特定表达基因(SEGs) | SEGtool基于模糊c均值、Jaccard指数和贪婪退火方法,能够忽略数据分布,优于主要为微阵列数据开发的现有工具 | NA | 研究特定表达基因的识别,以探索基因功能、生物发育、疾病机制和生物标志物的发现 | 人类组织和单细胞测序数据中的特定表达基因 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 模糊c均值、Jaccard指数、贪婪退火方法 | RNA-seq数据、单细胞测序数据 | 在Genotype-Tissue Expression (GTEx)人类组织数据集中检测到3181个SEGs,以及在胚胎细胞的单细胞测序数据中识别出多个SEGs |