单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 47 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-08-09 |
Single cell RNA sequencing of human liver reveals distinct intrahepatic macrophage populations
2018-10-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-06318-7
PMID:30348985
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术绘制了人类肝脏的细胞景观图，并识别了多种肝内细胞类型 | 首次提供了人类肝脏中8444个实质和非实质细胞的转录组图谱，并详细描述了肝内单核细胞/巨噬细胞的特定亚群 | NA | 揭示人类肝脏的细胞组成及其免疫微环境 | 人类肝脏中的细胞类型及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 五个新鲜的人类肝脏组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 22 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of the Mammalian Heart
2018-10-12, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.118.313531
PMID:30355162
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2024-08-09 |
Quantitative assessment of cell population diversity in single-cell landscapes
2018-10, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.2006687
PMID:30346945
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为sc-UniFrac的框架，用于在单细胞转录组景观中统计量化细胞群体的组成多样性 | sc-UniFrac框架能够敏感且稳健地量化模拟和实验数据集中的细胞群体身份和数量 | NA | 开发一种方法来定量和统计地定义跨数据集的细胞群体结构的比例变化 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体多样性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2024-08-09 |
Holo-Seq: single-cell sequencing of holo-transcriptome
2018-10-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1553-7
PMID:30333049
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为Holo-Seq的单细胞全转录组测序方法，该方法克服了现有单细胞RNA测序技术的预扩增偏差、丢失链来源信息以及无法同时观察小RNA和mRNA双转录组的问题 | Holo-Seq技术具有与批量RNA测序相同的定量准确性和均匀覆盖率，并能同时观察单细胞中的小RNA和mRNA | NA | 开发一种新的单细胞测序技术，以克服现有技术的局限性 | 人类肝细胞癌单细胞的小RNA和mRNA双转录组 | 基因组学 | 肝细胞癌 | 单细胞全转录组测序 | NA | 转录组数据 | 32个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 25 | 2024-08-09 |
Single-Cell Transcriptomics of Traced Epidermal and Hair Follicle Stem Cells Reveals Rapid Adaptations during Wound Healing
2018-10-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.09.059
PMID:30332640
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，追踪并分析了表皮和毛囊干细胞在伤口愈合过程中的转录适应性 | 首次揭示了Lgr5和Lgr6表达的毛囊和表皮干细胞在伤口愈合中的分子反应和功能适应性 | NA | 探讨不同干细胞在伤口愈合中的响应和适应机制 | 表皮和毛囊干细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2024-08-09 |
RNA Velocity: Molecular Kinetics from Single-Cell RNA-Seq
2018-10-04, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2018.09.026
PMID:30290149
|
研究论文 | 本文通过应用RNA转录和剪接的动力学模型，从单细胞RNA测序数据中预测单个细胞的mRNA水平变化 | 提出了一种新的方法来预测单细胞RNA测序数据中的mRNA水平变化 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中的分子动力学 | 单细胞的mRNA水平变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 动力学模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27 | 2024-08-09 |
PDGFRβ Cells Rapidly Relay Inflammatory Signal from the Circulatory System to Neurons via Chemokine CCL2
2018-10-10, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2018.08.030
PMID:30269986
|
研究论文 | 本文研究了PDGFRβ细胞在系统性炎症中通过分泌趋化因子CCL2快速传递信号至神经元的过程 | 首次揭示了PDGFRβ细胞作为外部刺激的初始感应器，通过分泌CCL2向中枢神经系统传递信号 | NA | 探讨PDGFRβ细胞在系统性炎症中对神经元兴奋性的影响 | PDGFRβ细胞、神经元、趋化因子CCL2 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了Pdgfrb-Cre;Ccl2小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-08-09 |
The origin-of-cell harboring cancer-driving mutations in human glioblastoma
2018-Oct, BMB reports
IF:2.9Q3
PMID:30269745
|
研究论文 | 本研究通过多种测序技术在三重匹配样本中识别了神经干细胞（NSCs）在人类胶质母细胞瘤（GBM）中的克隆关系，提供了NSCs作为GBM驱动突变起源细胞的直接证据 | 首次直接证明了人类SVZ中的神经干细胞（NSCs）是GBM驱动突变的起源细胞 | NA | 确定人类胶质母细胞瘤（GBM）中驱动突变的起源细胞，以理解GBM的本质并开发有效的治疗靶点 | 人类胶质母细胞瘤（GBM）及其起源细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 测序技术 | NA | 组织样本 | 三重匹配样本（肿瘤-自由SVZ、肿瘤和正常组织）来自人类患者 | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics of 20 mouse organs creates a Tabula Muris
2018-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0590-4
PMID:30283141
|
研究论文 | 本文介绍了来自模式生物小鼠的单细胞转录组数据集，包含来自20个器官和组织的超过10万个细胞 | 这些数据为细胞生物学提供了一个新的资源，揭示了在未充分表征的细胞群体中的基因表达，并允许直接和受控地比较跨组织共享细胞类型的基因表达 | NA | 构建一个转录组细胞生物学的图谱 | 小鼠的20个器官和组织的单细胞转录组数据 | 单细胞测序 | NA | 微流控液滴3'-端计数和基于荧光激活细胞分选的全长转录本分析 | NA | 转录组数据 | 超过10万个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2024-08-09 |
Regulatory cocktail for dopaminergic neurons in a protovertebrate identified by whole-embryo single-cell transcriptomics
2018-10-01, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.317669.118
PMID:30228204
|
研究论文 | 本文通过全胚胎单细胞RNA测序技术，识别了原脊椎动物中多巴胺能神经元的调控混合物 | 本文首次通过功能操作和单细胞RNA测序技术，识别了特定细胞身份的调控混合物 | NA | 识别原脊椎动物中多巴胺能神经元的调控机制 | 原脊椎动物的中枢神经系统中的多巴胺能神经元 | NA | NA | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-08-09 |
Identifying core biological processes distinguishing human eye tissues with precise systems-level gene expression analyses and weighted correlation networks
2018-10-01, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddy239
PMID:30239781
|
研究论文 | 本研究整合了公开的健康人眼组织RNA-seq数据集及其他数十种组织数据，通过差异表达、聚类和基因本体论富集工具分析了不同眼组织（角膜、视网膜、视网膜色素上皮-脉络膜复合体）与其他人体组织的生物学过程和泛表达关系，并构建了首个人类加权基因相关网络以突出已知的生物途径和眼基因疾病富集。 | 首次构建了人类加权基因相关网络，并整合了小鼠视网膜的单细胞RNA-seq数据进行验证和发现。 | NA | 旨在识别区分人眼组织的核心生物学过程，并通过精确的系统级基因表达分析和加权相关网络进行研究。 | 人眼组织的基因表达模式及其与其他人体组织的比较。 | 基因表达分析 | NA | RNA-seq | 加权基因相关网络 | 基因表达数据 | 包含多个健康人眼组织及数十种其他组织的RNA-seq数据集，以及小鼠视网膜的单细胞RNA-seq数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 32 | 2024-08-09 |
Single Cell and Open Chromatin Analysis Reveals Molecular Origin of Epidermal Cells of the Skin
2018-10-08, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.08.010
PMID:30220568
|
研究论文 | 本文研究了转录因子ΔNp63在表皮细胞命运指定过程中对Krt8+前体细胞转录组和开放染色质区域的深刻影响 | 揭示了ΔNp63依赖和非依赖的程序如何调控表皮细胞系的形成，以及ΔNp63如何通过直接上调Wnt配体、Frizzled受体和转录因子来促进Wnt信号传导 | NA | 探讨胚胎前体细胞如何协调细胞命运指定并建立转录和信号传导能力 | 表皮细胞的分子起源 | 发育生物学 | NA | ATAC-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 开放染色质区域 | Krt8+前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 33 | 2024-08-09 |
A post-ingestive amino acid sensor promotes food consumption in Drosophila
2018-10, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-018-0084-9
PMID:30209352
|
研究论文 | 研究通过定量喂食实验，发现特定氨基酸能快速促进果蝇的食物摄入，并揭示了DH44神经元作为氨基酸感应器通过CG13248转运蛋白增强食物摄入的机制。 | 首次发现DH44神经元作为氨基酸感应器，并通过CG13248转运蛋白介导氨基酸对食物摄入的促进作用。 | NA | 探讨动物如何评估潜在蛋白质来源并确保膳食氨基酸摄入，以维持蛋白质稳态。 | 果蝇Drosophila melanogaster的食物摄入行为及其背后的神经机制。 | NA | NA | 钙成像 | NA | 图像 | 涉及三种氨基酸（L-谷氨酸、L-丙氨酸和L-天冬氨酸）及其D-对映体和其他17种天然L-氨基酸的组合。 | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2024-08-09 |
A novel role for Lyl1 in primitive erythropoiesis
2018-10-11, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.162990
PMID:30185409
|
研究论文 | 本研究探讨了Lyl1在原始红细胞生成中的作用 | 首次证明Lyl1在维持原始红细胞生成中的功能 | NA | 确定Lyl1是否能在原始红细胞生成中发挥作用 | Lyl1基因敲除小鼠和表达Cre重组酶的小鼠 | NA | NA | 单细胞RNA测序, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 胚胎样本, 人类红白血病细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 35 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Sequential Cell Fate Transition during Human Spermatogenesis
2018-10-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.08.007
PMID:30174296
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了人类精子发生过程中的细胞命运转换顺序 | 首次建立了人类精子发生过程中细胞分化的层次模型，并鉴定了多个阶段特异性的标记基因 | NA | 揭示人类精子发生过程中的细胞发育景观 | 人类睾丸细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 层次模型 | RNA测序数据 | 2,854个正常精子发生供体的睾丸细胞和174个非阻塞性无精子症（NOA）供体的睾丸细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 36 | 2024-08-09 |
Resident Breast T Cells: The Troops Are Already There
2018-10, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2018.07.006
PMID:30077643
|
research paper | 研究了组织驻留记忆T细胞在乳腺癌进展中的作用，并通过单细胞RNA测序技术在三阴性乳腺癌患者中识别T细胞，展示了其预测生存的预后价值 | 首次通过单细胞RNA测序技术在三阴性乳腺癌患者中识别T细胞，并证明了其在预测生存中的预后价值 | NA | 探讨组织驻留记忆T细胞在乳腺癌进展中的作用及其预后价值 | 组织驻留记忆T细胞在三阴性乳腺癌患者中的作用 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 37 | 2024-08-09 |
Publisher Correction: Global characterization of T cells in non-small-cell lung cancer by single-cell sequencing
2018-Oct, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-018-0167-7
PMID:30093729
|
correction | 更正文章中关于非小细胞肺癌中单细胞测序的T细胞全球特征分析的错误 | NA | NA | 更正先前发表文章中的统计错误和标签错误 | 非小细胞肺癌中的T细胞 | NA | lung cancer | single-cell sequencing | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 38 | 2024-08-09 |
Exploring parasite heterogeneity using single-cell RNA-seq reveals a gene signature among sexual stage Plasmodium falciparum parasites
2018-10-01, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2018.08.003
PMID:30096287
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对165个受感染的红细胞进行转录组分析，揭示了恶性疟原虫在性阶段特有的基因特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，成功区分了恶性疟原虫的有性和无性阶段，并验证了五个先前未定义的配子体阶段特异性基因 | 研究样本量较小，仅包括165个受感染的红细胞 | 探索疟原虫在不同生命周期阶段的基因表达和调控 | 恶性疟原虫在红细胞内发育周期的单个受感染红细胞 | 数字病理学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 165个受感染的红细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 39 | 2024-08-09 |
Atherosclerosis in the single-cell era
2018-10, Current opinion in lipidology
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/MOL.0000000000000537
PMID:30020199
|
综述 | 本文综述了在单细胞时代下，利用高参数技术如质谱流式细胞术（CyTOF）和单细胞RNA测序（scRNAseq）分析免疫细胞在动脉粥样硬化发展中的作用 | 介绍了通过CyTOF和scRNAseq技术发现的新免疫细胞亚群及其潜在功能 | 酶消化导致的细胞死亡和scRNAseq转录组深度的限制 | 探讨免疫细胞在动脉粥样硬化中的作用及新技术在其中的应用 | 动脉粥样硬化的小鼠动脉壁中的免疫细胞 | NA | 心血管疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF）, 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 10-30种免疫细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 40 | 2024-08-09 |
Analyzing Circulating Tumor Cells One at a Time
2018-10, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2018.05.004
PMID:29891227
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在揭示循环肿瘤细胞（CTCs）分子特性方面的应用 | 介绍了单细胞测序技术在癌症研究中的新进展，特别是对罕见细胞如CTCs的研究 | 每种单细胞测序技术都有其需要克服的缺点 | 探讨单细胞测序技术在癌症研究中的应用 | 循环肿瘤细胞（CTCs） | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |