单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-09	Deconstructing Adipogenesis Induced by β3-Adrenergic Receptor Activation with Single-Cell Expression Profiling 2018-08-07, Cell metabolism IF:27.7Q1 DOI:10.1016/j.cmet.2018.05.025 PMID:29937373	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术分析了在β3-肾上腺素受体激活下，附睾白色脂肪组织（eWAT）和腹股沟白色脂肪组织（iWAT）中基质/血管细胞的异质性	首次通过单细胞RNA测序技术全面且无偏地解析了β3-肾上腺素受体激活诱导的脂肪生成过程中基质细胞的异质性，并揭示了不同亚群间的功能交互	NA	探究β3-肾上腺素受体激活对脂肪生成的影响及其机制	附睾和腹股沟白色脂肪组织中的基质/血管细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	超过33,000个基质/血管细胞
42	2024-08-09	A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Aging Drosophila Brain 2018-08-09, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2018.05.057 PMID:29909982	研究论文	本文展示了整个成年果蝇大脑在生命周期内的单细胞转录组图谱	首次提供了果蝇大脑在衰老过程中细胞类型和调控状态多样性的详细图谱	NA	研究大脑中细胞类型的多样性和调控状态在衰老过程中的变化	果蝇大脑的单细胞转录组	数字病理学	NA	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	87个初始细胞集群
43	2024-08-09	Linking transcriptional and genetic tumor heterogeneity through allele analysis of single-cell RNA-seq data 2018-08, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.228080.117 PMID:29898899	研究论文	本文介绍了一种名为HoneyBADGER的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据中识别拷贝数变异和杂合性丢失，以研究癌症进展中的遗传和转录异质性关系	HoneyBADGER方法能够整合等位基因和标准化表达信息，识别和推断单个细胞中的亚克隆特异性改变，并重建潜在的亚克隆结构	NA	研究癌症进展中遗传和转录异质性之间的关系	单细胞RNA测序数据中的拷贝数变异和杂合性丢失	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	计算方法	RNA测序数据	多个肿瘤类型的单细胞
44	2024-08-09	Single-cell RNA sequencing for the study of development, physiology and disease 2018-08, Nature reviews. Nephrology DOI:10.1038/s41581-018-0021-7 PMID:29789704	研究论文	本文探讨了单细胞RNA测序技术在研究发育、生理和疾病中的应用	单细胞RNA测序技术能够揭示细胞群体中的异质性，区分复杂细胞群体中的所有细胞类型	尽管技术不断进步，但仍存在一些限制需要克服	提高对正常和疾病相关生理过程的理解，并发现新的治疗途径	单细胞RNA测序技术在发育、生理和疾病研究中的应用	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	单个细胞
45	2024-08-09	A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Mouse Glomerulus 2018-08, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.2018030238 PMID:29794128	研究论文	本研究使用基于纳米液滴的高通量转录组测序技术，对纯化的野生型小鼠肾小球细胞进行了单细胞转录组分析	首次揭示了健康肾小球细胞群中的细胞异质性，并发现了新的标记基因和亚群	NA	全面表征肾小球细胞的基因表达，并为健康和疾病状态下肾小球功能的单细胞水平解析奠定基础	小鼠肾小球的细胞类型及其基因表达	数字病理学	NA	基于纳米液滴的高通量转录组测序	NA	转录组	近13,000个单细胞
46	2024-08-09	Single-Cell Transcriptomics Meets Lineage Tracing 2018-Aug-02, Cell stem cell IF:19.8Q1 DOI:10.1016/j.stem.2018.04.014 PMID:29754780	综述	本文讨论了基于转录组的细胞谱系轨迹预测算法、单细胞遗传谱系追踪以及这些技术在干细胞和癌症研究中的结合应用	近年来，技术的发展使得单细胞转录组学与遗传谱系追踪策略得以结合	单细胞转录组学提供的详细表型信息并不一定能反映遗传关系	重建组织或生物体内细胞间的谱系关系	细胞谱系关系及其在干细胞和癌症研究中的应用	NA	NA	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
47	2024-08-09	BCseq: accurate single cell RNA-seq quantification with bias correction 2018-08-21, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gky308 PMID:29718338	research paper	本文提出了一种名为BCseq的稳健模型，用于从单细胞RNA测序（scRNA-seq）中准确量化基因表达	BCseq通过数据自适应方式校正scRNA-seq的固有偏差，有效去除技术噪声，并通过加权考虑相似细胞来挽救丢失数据	NA	提高scRNA-seq数据分析的鲁棒性，准确检测差异表达基因和细胞亚型分类	单细胞RNA测序数据中的基因表达量化	digital pathology	NA	scRNA-seq	BCseq	基因表达数据	NA
48	2024-08-09	SigEMD: A powerful method for differential gene expression analysis in single-cell RNA sequencing data 2018-08-01, Methods (San Diego, Calif.) DOI:10.1016/j.ymeth.2018.04.017 PMID:29702224	研究论文	本文提出了一种名为SigEMD的新方法，用于单细胞RNA测序数据中的差异基因表达分析	SigEMD结合了数据插补方法、逻辑回归模型和基于地球移动距离的非参数方法，以精确高效地识别差异表达基因，并通过基因互作网络信息调整最终的差异表达基因状态，减少假阳性	NA	开发新的方法来识别单细胞RNA测序数据中的差异表达基因	单细胞RNA测序数据中的差异基因表达	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	逻辑回归模型	RNA测序数据	NA
49	2024-08-09	B-cell receptor reconstruction from single-cell RNA-seq with VDJPuzzle 2018-08-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/bty203 PMID:29659703	研究论文	本文介绍了一种名为VDJPuzzle的新型生物信息学工具，用于从单细胞RNA测序数据中重建B细胞受体的完整序列并提取VDJ区域的体细胞突变	开发了VDJPuzzle工具，能够从单细胞RNA测序数据中重建B细胞受体的完整序列，并提取VDJ区域的体细胞突变	NA	开发一种新的生物信息学工具，用于从单细胞RNA测序数据中重建B细胞受体的序列	B细胞受体的序列重建和VDJ区域的体细胞突变提取	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	117个人类B细胞和200个小鼠B细胞