单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
41	2024-08-09	Quantitative single-cell transcriptomics 2018-07-01, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/ely009 PMID:29579145	综述	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的基本原理、实验协议及其数据处理方法	NA	NA	帮助选择适合研究问题的实验和计算方法	单细胞RNA测序技术及其数据处理方法	数字病理学	NA	scRNA-seq	NA	文本	NA
42	2024-08-09	The impact of single-cell RNA sequencing on understanding the functional organization of the immune system 2018-07-01, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/ely003 PMID:29547972	综述	本文讨论了单细胞RNA测序技术在免疫学中的影响和应用	单细胞转录组技术提供了免疫细胞转录状态的高维度评估，成功应用于发现新的免疫细胞类型、揭示造血谱系、识别调控免疫反应的基因模块以及研究淋巴细胞抗原受体多样性	NA	探讨单细胞RNA测序技术在理解免疫系统功能组织中的作用	免疫系统的功能多样性和免疫细胞的协调反应	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
43	2024-08-09	Isoform-level gene expression patterns in single-cell RNA-sequencing data 2018-07-15, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/bty100 PMID:29490015	研究论文	本研究提出并应用了一种基于混合建模的新方法ISOP，用于在单细胞isoform水平表达数据中表征来自同一基因的isoform对的表达模式	本研究首次关注单细胞水平上的isoform水平表达模式，并提出了ISOP方法来表征这些模式	研究中发现的剩余模式可能是由于转录爆发、drop-out和随机生物异质性的影响	旨在表征单细胞RNA测序数据中的isoform水平表达模式	单细胞RNA测序数据中的isoform对表达模式	生物信息学	乳腺癌	单细胞RNA测序	混合建模	单细胞isoform水平表达数据	16,562个isoform对来自4,929个基因
44	2024-08-09	Single-Cell Sequencing of the Healthy and Diseased Heart Reveals Cytoskeleton-Associated Protein 4 as a New Modulator of Fibroblasts Activation 2018-07-10, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.117.030742 PMID:29386203	研究论文	本文介绍了一种从成年小鼠心脏组织中获取高质量RNA的方法，用于健康和病变心脏的自动单细胞测序。	本文首次将单细胞测序技术应用于成年心脏组织，揭示了细胞骨架相关蛋白4作为纤维母细胞激活的新调节因子。	NA	研究健康和病变心脏中转录组差异以及基因表达的细胞类型特异性变化。	成年小鼠心脏组织的单细胞RNA测序。	数字病理学	心血管疾病	单细胞测序	NA	RNA	成年小鼠心脏组织
45	2024-08-09	Epigenetic regulation in B-cell maturation and its dysregulation in autoimmunity 2018-07, Cellular & molecular immunology IF:21.8Q1 DOI:10.1038/cmi.2017.133 PMID:29375128	综述	本文综述了B细胞成熟过程中的表观遗传调控及其在自身免疫疾病中的失调	利用新一代测序、单细胞测序和DNA甲基化测序等现代技术，深入理解B细胞生物学及其在自身免疫发展中的作用	NA	总结表观遗传修饰在B细胞激活和分化中的研究进展，特别是在自身免疫条件下	B细胞的表观遗传调控及其在自身免疫疾病中的作用	NA	自身免疫疾病	下一代测序, 单细胞测序, DNA甲基化测序	NA	DNA	NA
46	2024-08-09	Clustering single cells: a review of approaches on high-and low-depth single-cell RNA-seq data 2018-07-01, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/elx044 PMID:29236955	综述	本文综述了在高深度和低深度单细胞RNA测序数据上进行细胞类型聚类的不同方法	研究发现，基于PCA的算法最适合低读取深度数据集，而基于基因聚类和双聚类算法在高通量数据集上表现更好	目前尚不清楚不同的计算细胞类型识别方法是否更适合于一种或另一种实验范式	探讨不同深度单细胞RNA测序数据的细胞类型聚类方法的适用性	单细胞RNA测序数据中的细胞类型	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	PCA, 基因聚类, 双聚类	RNA测序数据	大量单细胞
47	2024-08-09	Comparative analysis of single-cell RNA sequencing data from mouse spermatogonial and mesenchymal stem cells to identify differentially expressed genes and transcriptional regulators of germline cells 2018-07, Journal of cellular physiology IF:4.5Q1 DOI:10.1002/jcp.26303 PMID:29194616	研究论文	本研究通过比较单细胞RNA测序数据，分析了小鼠精原干细胞和间充质干细胞中差异表达基因及调控生殖细胞转录的因子	本研究首次鉴定了1,584个上调的差异表达基因，并识别了12个基础转录因子和3个序列特异性转录因子，以及两个重要的蛋白质相互作用网络中的蛋白质复合物	NA	揭示精原干细胞生物学的分子机制，并为细胞类型转换方法和生殖细胞的生产提供候选因子	小鼠精原干细胞和间充质干细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	12个精原干细胞和16个间充质干细胞
48	2024-08-09	Experimental design for single-cell RNA sequencing 2018-07-01, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/elx035 PMID:29126257	研究论文	本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）实验设计的一般考虑因素和两种最流行的方法	scRNA-seq技术为细胞系统的异质性表征开辟了新途径	scRNA-seq是一项相对较新的技术，领域正在快速发展	探讨单细胞RNA测序实验设计的考虑因素和方法	单细胞RNA测序技术	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA序列	NA
49	2024-08-09	Application of single-cell sequencing in human cancer 2018-07-01, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/elx036 PMID:29106464	综述	本文综述了单细胞测序技术在人类癌症研究中的应用，并讨论了该领域当前面临的挑战	单细胞测序技术能够揭示肿瘤内部的细胞异质性，有助于识别影响临床结果的关键分子特性	单细胞测序技术在实验室中的应用仍面临一些挑战，包括数据分析的复杂性和成本问题	探讨单细胞测序技术在精准医学中的应用，以提供基于个体分子表型的靶向治疗	人类癌症细胞的分子表型和异质性	数字病理学	癌症	单细胞测序	NA	细胞	大量细胞
50	2024-08-09	Global and targeted approaches to single-cell transcriptome characterization 2018-07-01, Briefings in functional genomics IF:2.5Q3 DOI:10.1093/bfgp/elx025 PMID:29028866	研究论文	本文探讨了单细胞转录组表征的两种主要方法：定量逆转录PCR（RT-qPCR）和RNA测序	介绍了单细胞转录组分析的新方法，使得对细胞数量有限的样本（如早期胚胎细胞）和细胞群体异质性（如血液细胞或神经元）的研究成为可能	NA	探索单细胞转录组表征的新方法，以更好地理解细胞功能	单细胞转录组	分子生物学	NA	RT-qPCR, RNA测序	NA	转录组	单细胞