单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 51 篇文献，本页显示第 41 - 51 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-Seq reveals cell heterogeneity and hierarchy within mouse mammary epithelia
2018-06-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA118.002297
PMID:29666189
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术结合FACS分析和主成分分析，揭示了小鼠乳腺上皮细胞的异质性和层次结构 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了乳腺上皮细胞的高度异质性，并识别出罕见的CDH5细胞亚群作为静止的乳腺干细胞 | NA | 旨在揭示小鼠乳腺上皮细胞的异质性和层次结构 | 小鼠乳腺上皮细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 |
| 42 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional profiling: a window into embryonic cell-type specification
2018-06, Nature reviews. Molecular cell biology
DOI:10.1038/s41580-018-0002-5
PMID:29666443
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学和成像技术的最新进展，并讨论了这些技术如何加深我们对哺乳动物胚胎发育的理解 | 单细胞技术的发展不仅克服了早期胚胎细胞数量极少的限制，还使细胞命运指定研究更加细致 | 当前单细胞研究面临的技术挑战和未来发展方向 | 探讨单细胞技术在哺乳动物胚胎发育研究中的应用 | 哺乳动物胚胎发育中的细胞类型指定 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 43 | 2024-08-09 |
Cancer: a CINful evolution
2018-06, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2018.03.007
PMID:29625384
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综述 | 本文综述了近期关于非整倍体和染色体不稳定（CIN）在肿瘤演化中的作用的研究进展 | 探讨了非整倍体和CIN如何通过产生基因组不稳定性和肿瘤内异质性促进肿瘤演化 | NA | 旨在回顾非整倍体和CIN的成因及其在细胞水平上提供表型变异的方式，并讨论它们与癌症进展的关联 | 非整倍体和染色体不稳定（CIN）在肿瘤演化中的作用 | NA | 癌症 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 44 | 2024-08-09 |
Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4096
PMID:29608179
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研究论文 | 本文介绍了一种基于共同变异源的分析策略，用于整合不同条件、技术和物种的单细胞转录组数据集，以识别跨数据集的共享细胞群并进行下游比较分析 | 提出了一种新的分析策略，通过整合单细胞RNA测序数据集，增强了统计能力并能共同学习不同或过渡的细胞状态 | NA | 开发一种方法来整合不同条件、技术和物种的单细胞转录组数据集，以进行比较分析 | 外周血单个核细胞、造血祖细胞和胰腺细胞的单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 外周血单个核细胞、造血祖细胞和胰腺细胞的数据集 |
| 45 | 2024-08-09 |
Simultaneous single-cell profiling of lineages and cell types in the vertebrate brain
2018-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.4103
PMID:29608178
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research paper | 本文介绍了scGESTALT方法，结合GESTALT的谱系记录能力和单细胞RNA测序的细胞类型识别，用于同时分析脊椎动物大脑发育中的细胞谱系和细胞类型 | scGESTALT方法通过可诱导系统在多个时间点编辑条形码，捕捉发育后期阶段的谱系信息，并结合单细胞RNA测序技术 | NA | 开发一种新的方法来同时分析脊椎动物大脑发育中的细胞谱系和细胞类型 | 脊椎动物大脑发育中的细胞谱系和细胞类型 | digital pathology | NA | CRISPR-Cas9 barcode editing, single-cell RNA sequencing | NA | transcriptome | 约60,000个来自幼年斑马鱼大脑的转录组 |
| 46 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals the Transcriptional Landscape and Heterogeneity of Aortic Macrophages in Murine Atherosclerosis
2018-06-08, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.117.312509
PMID:29545365
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠动脉粥样硬化中主动脉巨噬细胞的转录组图谱和异质性 | 首次揭示了动脉粥样硬化中主动脉巨噬细胞和单核细胞衍生树突状细胞的转录组图谱和表型异质性，并识别了先前未被发现的新型巨噬细胞群体及其基因表达特征 | NA | 应用单细胞RNA测序技术，无偏倚地探究和分类动脉粥样硬化中单个细胞水平的主动脉巨噬细胞异质性 | 小鼠动脉粥样硬化中的主动脉CD45+细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 从低密度脂蛋白受体缺陷（Ldlr-/-）小鼠的非病变（常规饮食）和动脉粥样硬化（11周高脂饮食）主动脉中提取的总主动脉CD45+细胞 |
| 47 | 2024-08-09 |
Understanding Alzheimer Disease at the Interface between Genetics and Transcriptomics
2018-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2018.02.007
PMID:29573818
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研究论文 | 本文探讨了遗传学和转录组学在理解阿尔茨海默病（AD）中的作用 | 本文利用转录组学方法，包括二代和三代测序、单细胞测序和生物信息学，揭示了AD风险基因与表达谱之间的关联，并提供了支持AD病理生理途径的证据 | 由于遗传关联的功能后果难以确定，机制见解和疾病管理的改进仍然有限 | 旨在通过遗传学和转录组学的综合方法，深入理解阿尔茨海默病 | 阿尔茨海默病（AD）的遗传和转录组学特征 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 二代和三代测序、单细胞测序、生物信息学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 48 | 2024-08-09 |
Spectral clustering based on learning similarity matrix
2018-06-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty050
PMID:29432517
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研究论文 | 本文介绍了一种基于学习相似矩阵的谱聚类框架，用于单细胞RNA测序数据的细胞聚类 | 提出了一种新的谱聚类方法，通过多个双随机相似矩阵学习目标矩阵，并在目标矩阵上施加稀疏结构 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据中的细胞聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 谱聚类 | 基因表达数据 | 多种模拟和真实的单细胞RNA测序数据 |
| 49 | 2024-08-09 |
scEpath: energy landscape-based inference of transition probabilities and cellular trajectories from single-cell transcriptomic data
2018-06-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty058
PMID:29415263
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研究论文 | 本文介绍了scEpath算法，该算法通过计算能量景观和概率有向图来重建发育轨迹，从单细胞转录组数据中推断细胞状态转换路径和概率 | scEpath算法通过结合单细胞能量和基于距离的度量，提供了比现有方法更稳健和准确的伪时间排序，并能高分辨率地揭示细胞状态转换的动态 | NA | 开发一种新算法，用于从单细胞转录组数据中推断细胞状态转换路径和概率 | 单细胞转录组数据中的细胞状态转换路径和概率 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 50 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptome sequencing: A new approach for the study of mammalian sex determination
2018-06-15, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2018.01.013
PMID:29371022
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序（scRNA-seq）在哺乳动物性别决定研究中的应用 | scRNA-seq技术能够全面且无偏地识别和分类细胞群，追踪细胞发育轨迹，并描述控制其分化的转录动力学 | scRNA-seq技术仍存在一些实验方法上的局限性 | 探讨scRNA-seq技术在哺乳动物性别决定研究中的应用及其未来发展 | 哺乳动物性别决定过程中的细胞群及其发育轨迹 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 51 | 2024-08-09 |
ST Spot Detector: a web-based application for automatic spot and tissue detection for spatial Transcriptomics image datasets
2018-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty030
PMID:29360929
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research paper | 本文介绍了一个名为ST Spot Detector的网络工具，用于自动检测空间转录组学图像数据集中的斑点和组织 | ST Spot Detector通过用户友好的界面自动化并简化了图像与转录组数据的校准过程 | NA | 开发一个自动化工具，以简化空间转录组学数据与图像的校准过程 | 空间转录组学图像数据集中的斑点和组织检测 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA |